Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name PGK1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m13_p_9) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rousettus aegyptiacus
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m13_p_9:40008203-40035511
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PGK1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PGK1P3 scaffold_m13_p_15:19370887-19372555 - Intragenic
 N/A UCSC
PGK1P2 scaffold_m13_p_1:127472234-127472831 + Intergenic
 N/A UCSC
PGK1P1 scaffold_m13_p_1:104802485-104803707 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>PGK1_x3
gggggcggggcggCCGGTTCGGCTGGCTATAATCGTTCCGCACGCGTTCCGCTTCGGTCTCTGCCACTGACTGATCCTCTGCTCCTGGTAGCTGCTGTATTGCTAGGATGTCGCTTTCTAACAAACTGACTCTGGACAAGCTGGATGTGAAGGGGAAGCGGGTCGTTATGAGCCCAGGAAGACAGCCCTAGTCGCCCTTTCGGGGTGGATCCACCGAGGAAAGCCTCAGGTTGCTGGGACGCATTTTGCCAACTTTCTTTTTCCTGCCATGCAGTTCCGGCGCCTTCAGCTCTTAGTTGGCGAGGCGGGACGTAAGGCTTAACCTGCAAATCTCTAGGCCCCAAGAGTGGACTTCAATGTTCCTATGAAGAACAATCAGATAACAAATAACCAGAGGATTAAGGCTGCCATCCCAAGTATCAAATTCTGCTTGGACAATGGAGCCAAGTCAGTTGTTCTTATGAGCCACTTGGGCCGCCCTGATGGCGTTCCCATGCCTGACAAGTACTCCTTGGAGCCAGTTGCTGCAGAACTCAAATCTCTGCTGGGCAAGGATGTTTTGTTCTTGAAGGACTGTGTAGGCCCCGAAGTGGAGAAAGCTTGTGCTGATCCGGCTGCTGGGTCTGTCATCCTGCTGGAGAACCTTCGCTTTCATGTGGAGGAAGAAGGGAAGGGAAAAGATTCTTCTGGGAACAAGGTTAAAGCTGAGCCAGCTAAAATAGAAGCCTTCCGAGCTTCACTTTCCAAATTAGGGGATGTCTATGTCAATGATGCTTTTGGCACTGCTCATCGAGCCCACAGCTCCATGGTAGGAGTTAATCTGCCACAGAAAGCTGGAGGTTTTTTGATGAAGAAGGAACTAAACTACTTTGCCAAGGCCTTGGAAAGCCCAGAGCGACCCTTCCTGGCCATCCTGGGCGGAGCGAAAGTTGCAGACAAGATCCAACTAATCAACAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGATTGGTACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTGATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTTACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCTACTGTAGCTTCTGGCATACCTCCTGGCTGGATGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAGAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCGCCAGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGACCTGTGGGCGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGAGGGACCAAAGCCCTCATGGATGAAGTGGTGAAAGCCACTTCCAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTGGTGGAGACACTGCCACTTGCTGTGCCAAATGGAACACAGAGGATAAAGTCAGCCATGTGAGCACTGGGGGTGGTGCCAGTTTAGAGCTCCTGGAAGGTAAAGTCCTTCCTGGGGTGGATGCTCTCAGCAATATTTAGTCCTTTCTGCCTTTTGGTTCCTGTGCATATCCTGTAAATCAATTTAGCGCTTTCCACATCTCCACTTGGTATTAACTAAAATCTTCCCCCATGTCAGGATTCAGCTAGTGGCCCAGAGATGCAGCATCAGGAACCCTTAAGCAGTTGCACAGTATCTCAGTTCATCTTTACTGCATCCTGCATTTGCCTACATTCTTCAAGATCCCATTTGAATTTCTTAGTGAATAAACCATTGTGCATTCTAGAGTGCATGTATTTATATTTTGCCTGTTAAAAGAAAGTGAGCTGTTAGCTTAGTTCTCTTTTTAGAATAGCTTATTCTGATTAGCTTTGTCATTGTTTCACTACTCAGCATGGAAACAAGATGAAATTCAAATTGTAGGGAGGGAGGGAGATGAAGTTTGTGATCTATTAAATAAATAATAAAAGTATCCATTGAAACTGG
>PGK1_x4
gaggctgggggcggggcggCCGGTTCGGCTGGCTATAATCGTTCCGCACGCGTTCCGCTTCGGTCTCTGCCACTGACTGATCCTCTGCTCCTGGTAGCTGCTGTATTGCTAGGATGTCGCTTTCTAACAAACTGACTCTGGACAAGCTGGATGTGAAGGGGAAGCGGGTCGTTATGAGAGTGGACTTCAATGTTCCTATGAAGAACAATCAGATAACAAATAACCAGAGGATTAAGGCTGCCATCCCAAGTATCAAATTCTGCTTGGACAATGGAGCCAAGTCAGTTGTTCTTATGAGCCACTTGGGCCGCCCTGATGGCGTTCCCATGCCTGACAAGTACTCCTTGGAGCCAGTTGCTGCAGAACTCAAATCTCTGCTGGGCAAGGATGTTTTGTTCTTGAAGGACTGTGTAGGCCCCGAAGTGGAGAAAGCTTGTGCTGATCCGGCTGCTGGGTCTGTCATCCTGCTGGAGAACCTTCGCTTTCATGTGGAGGAAGAAGGGAAGGGAAAAGATTCTTCTGGGAACAAGGTTAAAGCTGAGCCAGCTAAAATAGAAGCCTTCCGAGCTTCACTTTCCAAATTAGGGGATGTCTATGTCAATGATGCTTTTGGCACTGCTCATCGAGCCCACAGCTCCATGGTAGGAGTTAATCTGCCACAGAAAGCTGGAGGTTTTTTGATGAAGAAGGAACTAAACTACTTTGCCAAGGCCTTGGAAAGCCCAGAGCGACCCTTCCTGGCCATCCTGGGCGGAGCGAAAGTTGCAGACAAGATCCAACTAATCAACAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGATTGGTACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTGATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTTACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCTACTGTAGCTTCTGGCATACCTCCTGGCTGGATGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAGAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCGCCAGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGACCTGTGGGCGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGAGGGACCAAAGCCCTCATGGATGAAGTGGTGAAAGCCACTTCCAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTGGTGGAGACACTGCCACTTGCTGTGCCAAATGGAACACAGAGGATAAAGTCAGCCATGTGAGCACTGGGGGTGGTGCCAGTTTAGAGCTCCTGGAAGGATGAGAACACTCTTGAAGGAATCAAATCAGCTACATTTCTGAATGCAAGAAATGGGGCAGCAGTGGTGTGGAGGTAGAGGGCCTAATGTCTACTCTTCTATTAAATCCCACTTTATGACAGACATTGTGATAGGTACTTTATTTTAAATTTTAATCTGTTGCACATGACCATATTTAAAAAGTCAAGGCTTATAAAAATTCCTActtcccagaggtgaccatgttcagttcttagcttttttttttttgatatttacattcatgtttctaatatgcttatGGGAAGATTAGCTTCCTTATAGCCTGTTTCACAATATGTCCCCTACTTAATTCTCTCAATACAGTTTTGTCATAATTCTAGATTACCTTGTGATCAtaaatgctattcacagctgagttatgttatactatgattacatttacttatgtaccttttaattttcttggagttaatgatagtttaaaagttttttttctatgtacctctcactgattcattcttaatatatttaaacatatgag
>PGK1_x6
ATGTCGCTTTCTAACAAACTGACTCTGGACAAGCTGGATGTGAAGGGGAAGCGGGTCGTTATGAGAGTGGACTTCAATGTTCCTATGAAGAACAATCAGATAACAAATAACCAGAGGATTAAGGCTGCCATCCCAAGTATCAAATTCTGCTTGGACAATGGAGCCAAGTCAGTTGTTCTTATGAGCCACTTGGGCCGCCCTGATGGCGTTCCCATGCCTGACAAGTACTCCTTGGAGCCAGTTGCTGCAGAACTCAAATCTCTGCTGGGCAAGGATGTTTTGTTCTTGAAGGACTGTGTAGGCCCCGAAGTGGAGAAAGCTTGTGCTGATCCGGCTGCTGGGTCTGTCATCCTGCTGGAGAACCTTCGCTTTCATGTGGAGGAAGAAGGGAAGGGAAAAGATTCTTCTGGGAACAAGGTTAAAGCTGAGCCAGCTAAAATAGAAGCCTTCCGAGCTTCACTTTCCAAATTAGGGGATGTCTATGTCAATGATGCTTTTGGCACTGCTCATCGAGCCCACAGCTCCATGGTAGGAGTTAATCTGCCACAGAAAGCTGGAGGTTTTTTGATGAAGAAGGAACTAAACTACTTTGCCAAGGCCTTGGAAAGCCCAGAGCGACCCTTCCTGGCCATCCTGGGCGGAGCGAAAGTTGCAGACAAGATCCAACTAATCAACAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGATTGGTACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTGATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTTACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCTACTGTAGCTTCTGGCATACCTCCTGGCTGGATGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAGAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCGCCAGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGACCTGTGGGCGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGAGGGACCAAAGCCCTCATGGATGAAGTGGTGAAAGCCACTTCCAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTGGTGGAGACACTGCCACTTGCTGTGCCAAATGGAACACAGAGGATAAAGTCAGCCATGTGAGCACTGGGGGTGGTGCCAGTTTAGAGCTCCTGGAAGGTAAAGTCCTTCCTGGGGTGGATGCTCTCAGCAATATTTAG