Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name PPID
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m13_p_16) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rousettus aegyptiacus
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m13_p_16:32516466-32527206
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PPID

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PPIDP3 scaffold_m13_p_10:31482255-31482589 + Intergenic
N/A UCSC
PPIDP1 scaffold_m13_p_3:142870242-142871321 + Intergenic
N/A UCSC
PPIDP2 scaffold_m13_p_9:34697807-34698865 - Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>PPID_x1
ACGCCGGAAGTGACTCATCAGCGCCGCTGCCAGGTCTTCGCCGAGAGACGTGTCGTAAGTTTTCAGCTCCTGGAGGCCACCAGGTACTCTGAGACCGCTTCCAAACGCGACTGCAAGTCAAAATGTCGCATCCTTCCCCCCAGGCTAAGCCCTCCAACCCAAGTAACCCCCGGGTCTTTTTTGACGTAGACATTGGAGATGAGCGAGTTGGTCGAATTGTCTTAGAATTGTTTGCAGATATTGTACCCAAAACTGCAGAAAATTTTCGTGCATTGTGTACGGGAGAAAAAGGCATTGGACCCACCACTAGGAAACCTCTCCATTTCAAAGGATGCACATTCCATCGAATTATTAAGAAATTTATGATTCAAGGTGGAGACTTCTCAAATCAGAATGGGACAGGTGGAGAAAGTATTTATGGTGAAAAATTTGAAGATGAAAATTTCTATTATAAGCATGATCAGGAGGGTTTGTTGAGCATGGCAAATGCAGGCTGCAATACAAATGGTTCTCAGTTCTTTATCACAACAGTTCCGACTCCTCATTTGGATGGGAAACATGTGGTATTTGGCCAAGTGATTAAAGGAATGGGTGTGGCAAGAATTCTGGAAAATGTAGAAGTGAAAGGTGAAAAACCAGCCAAAGTAAGTAAAAAGTTAGAGTGAAACACATTTATTATCTTAGTTACCATCTTAAAGAATTAAGTAAAAGGATCAAATTGTTAGCTGGAAAAATGTTAGAATGACTTGGTATATAGAAGCATGGATCTCCCACTTTTACTTTTAAACTGTTTTCTACAAGGAAAAGATTAGAGTTGTTAGAAGGTTATTATTTCAACATCAGTCTTGGTGATGTAAGTCTTCCTATACCTGTAAAACTTTGTCAGAACGTGTCCTAGTACATAGTAGAAAGAAGACAGGGAATGAAAAATCCTGTCTGTATACATTCCGCCATTTACTTGGTGGTTTTGTCTTATTTAAGTTTCCTTATCCTATATAAATTACTTAAGGGTTTAGACTAGATTGCGTTCTAAATGCCTATGGGTCAAAGTGCCCATGTTACTACCCATCCCAGTTGGTAGAGTTGCGTGTGAGTAGGTATTTGTAAGGAAAATTATTTGGAGAATAAAATTTCAGCTTATTTTGTGTACACTGAGCTGCTGAATATCAATAAAATACTTTTGTAAAATAGTGATGTTGTTGTATTATGTGGAAGTATGAAAGGCTGTTCTTGTAATTAGAGCAGATAGATGAGCCTTTTAATGTCAATCATTTTAGAAGTGACTTGGACAGTGTTGCGTGTGACTTGCAAATGTATATCTTTTAAACTCAGACTTTTTTTACATGTATCATTAATATAGTAGTGCAATTCTACAATTTAGGATTATTTTTACAGTTGTGCGTTATTGCAGAATGTGGAGAATTGAAGGAAGGGGATGACTGGGGAATATTCCCAAAAGATGGTTCTGGTGACAGTCATCCAGATTTCCCCGAGGATGCAGATATAGATTTAAAAGATGTGAGTACTTTCAGATCAATTTAACTTTAATTTCTTAAATTACTAAAAATACTTATTTAGCACTAAAAGTTTGAGGTTTTTTTTGTATTAGTCTTTCTAATGATAGAACTTAGCATTAAACCATGTTACTTATTAAAGTCTGACATATTTGTATTTTATACAGGTAGATAAAATATTATTAATAACAGAAGACTTAAAAAACATTGGAAATACATTTTTCAAATCTCAGAACTGGGAGATGGCCATTAAAAAATATAAAAAAGTTTTAAGGTAATATTTttaataaattacacttaagaacttcaaaattgaattatgaaataaaattcaagaattGTTTATTGTATTTTTGGCATACTACTTGCAGAGTAACCAAATGTGTTGAAATAGTTGTATTTTTGTCACCTCCAGCTTAtttgaaaaatttcacgatacagaaaagttgaaatgaaaaaataatacataaagactactactcatgtatcctgaccttcattcactagttaactttgctatatttgtttctgtagaatcattttgaaaggaagttgcagatactatgacatttcacccctaaatattttagcaagtatttcttaagaaacaaggacatacttctaggtaacctcagtaccattaagacatccccaaaatagcattgatacaatattatctgatgtaatccataatcaaatttcctcaattatttcaaatatttttactccagagtctattgttttgttttttgtctctagcttcctataatctttaatagagcttaaaaaaactttactttttttattcatttgcattttgtagagtcttaagtaggtcgtcttatagaataccatctgtattggattgcttcttcaggattaggtttagtttaaatatttgacaagaggacttacgtaggcgatgtatatatttcctgtggtatcacatattgaaggcacatgtcagtttagcctattttgagttctggcacttgattcaagtgtcagccagatgtctgttataaaagtaccttttcccccttgtaaataagtattctataaggtgatactgtgagattgtatgtatatccagtttctaacttttcattcagtggttttatgtcattaaagatccttgcctgtattagttattacattaatggttgcagaactgtgattttctaattttatcactcattcaacagttattagccagcatgcttcccctcttctctccttttttaatatcactataaacctgtagttttttttttttttcatttcaacctattattatactgttatcatcgtttcttttgacactcaaagggttccagatttttccagtggaagccctcttttctacatcctgttgacttgttcctcttagtttgtgatcacttgacttgctttctggcacaggatgctccaggctcatcttacacctaaccttgtttccagatccggtatcagcattttctctaaggagccctgattcttttcagtggggaatagatttaggaagcatattctgagggtcaggtatgctcattgtttctgagcccctttcagtggacagagctaggaaCAATATTAAATTACAATTGAAAACCAAAACTACAGAATTCTTCCCCTACATTCCATTCCCTCACAGTGAGAACCTGGTTCTAAACATAATTACATTGGGAAGTGCATAACAGACCTGGTTTTCAAAAACAAAGTGCGTAATTATCTTTAGATTGGGGATTATTCTTAAATCTACCTCTTTGAACACGGTGGGAAAAAGTTGGAACAAATAAAAAGTTATCTAAAGAAAATGtaataaaaatattgtgatcattaagaatattaatattagtattTGATGAGCATTTTATATCAAGCATAACACTTGACATAGTTAAGAAGCAGAATAAGTCTTATGTAGCATTACATGCCACTTTCATTACTGTGTTCTCCAGATATGTGGAAAGTTCAAAGGCTGTTATTGGGAAAGCAGATAAGTCGAAGCTGCAACCTGTAGCTTTAAGCTGCATGCTGAATATTGGTGCTTGTAAACTGAAGATGTCAAATTGGCAGGGAGCAATTGACAGTTGTTTGGAGGTAAGTCTGTTTGATGTCTAACTTTTTGAAAGAGATTAATATCAACTTGAACAAAAGCAATTTTATATACATTTTATATCTTATAGGACCTAATGAGACTCAAGGAAAGATAATGTATGTCATTTTATCTCTAAATATTTTGGACCTTCAGTTCTTCTTAATCCATTTACTTAGCTTATATTAATATCTATGAAAATACAACTTTTTCTTAAAGCACACATATCAGCTCATTCATTTAACATATGGAACCCCTATTATGTGCTAGGCATAGAAGACAAAGCCAGGAATGATTAAGAATGTGGGTTGTGGAGTCAGACGTGGTTTTTTTAATTAGAAATATCATACACTTAATATTTCTTtaactttgtgatcttgggtaagttcctaaatttaggcaatattgatttttttttttttatatgttaaatggaaataatacttgcctcttgggattgttacaaagattatataacataggtaaaacatttagtacagtgttgggcacatgttgaacacctaacagaGACTAGATATTTTAGTTAAAAGAAAAACCTATACCCTCAAGGAATTTTTTATTTGGCTCTTATATTTGGCTCTTTAAAGCCAGAAAGGTGGTAGCATTACCTTCCTTAAATAGAACAATTATGACTCTCTCCCTCTTGTATAGTTTGTTTGAAAATTTTTCTCAACTAAACTTTGTATTTTAGAAAGACCATCATTgtgggattcactggagtgtttagagaggttgcctgcagggagttgctatgtgctgttgacaatctcagtgtaggaacctagtaagaggagtttactggaacctgaaagagaaacagctttctcttccttgtcctttttgcaccctctactgacaaaacttaactggcacaggagagagatttacaggccccagctccattatcatagagcagtgaagggttgatatggagctgacaggcaacacattgaAATATAACATATATTTAATATTAAGTATTTAGAAAAAATATTTTTATAATTTTTGTAGGCTCTTGAAATAGACCCATCGAATACCAAAGCACTGTACCGTAGAGCTCAAGGATGGCAAGGATTAAAAGAATTTGATCAAGCATTGGTAAATTTTGTTGTAAACTTCAATATTTTAAAATACATAACCACCTTCATAAATCATACACCTAATATTTCTTAAAAATTTTTTTCCAATTAAAGGCTGATCTTAAGAAAGCTCAGGAGATAGCACCGGAAGATAAAGGTAAATTGGTAGCTTTTGTGATAAAAATTCATTTTGTCCTTTAAGAATTCATCCTTATGAACCATTGAACTCATTGCCACTTAGATatttatttgttcagcagatattacagaatgcctgccattgggcca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>PPID_x5
ATGTCGCATCCTTCCCCCCAGGCTAAGCCCTCCAACCCAAGTAACCCCCGGGTCTTTTTTGACGTAGACATTGGAGATGAGCGAGTTGGTCGAATTGTCTTAGAATTGTTTGCAGATATTGTACCCAAAACTGCAGAAAATTTTCGTGCATTGTGTACGGGAGAAAAAGGCATTGGACCCACCACTAGGAAACCTCTCCATTTCAAAGGATGCACATTCCATCGAATTATTAAGAAATTTATGATTCAAGGTGGAGACTTCTCAAATCAGAATGGGACAGGTGGAGAAAGTATTTATGGTGAAAAATTTGAAGATGAAAATTTCTATTATAAGCATGATCAGGAGGGTTTGTTGAGCATGGCAAATGCAGGCTGCAATACAAATGGTTCTCAGTTCTTTATCACAACAGTTCCGACTCCTCATTTGGATGGGAAACATGTGGTATTTGGCCAAGTGATTAAAGGAATGGGTGTGGCAAGAATTCTGGAAAATGTAGAAGTGAAAGGTGAAAAACCAGCCAAATTGTGCGTTATTGCAGAATGTGGAGAATTGAAGGAAGGGGATGACTGGGGAATATTCCCAAAAGATGGTTCTGGTGACAGTCATCCAGATTTCCCCGAGGATGCAGATATAGATTTAAAAGATGTAGATAAAATATTATTAATAACAGAAGACTTAAAAAACATTGGAAATACATTTTTCAAATCTCAGAACTGGGAGATGGCCATTAAAAAATATAAAAAAGTTTTAAGATATGTGGAAAGTTCAAAGGCTGTTATTGGGAAAGCAGATAAGTCGAAGCTGCAACCTGTAGCTTTAAGCTGCATGCTGAATATTGGTGCTTGTAAACTGAAGATGTCAAATTGGCAGGGAGCAATTGACAGTTGTTTGGAGGCTCTTGAAATAGACCCATCGAATACCAAAGCACTGTACCGTAGAGCTCAAGGATGGCAAGGATTAAAAGAATTTGATCAAGCATTGGCTGATCTTAAGAAAGCTCAGGAGATAGCACCGGAAGATAAAGCTATCCAGGCTGAACTTCTGAAAGTCAAACAAAAGATAAAGGCACAGAAAGATAAAGAGAAGGCAGCCTATGCAAAAATGTTTGCTTAA