Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name PTEN
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_15) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Myotis myotis
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_15:26626068-26710383
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PTEN

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PTENP1 scaffold_m19_p_2:202837963-202838778 - Intragenic
N/A UCSC
PTENP2 scaffold_m19_p_2:68318158-68319367 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>PTEN_x1
ATGTGAGCAAATAACTGATTGAAATGTTCTGATTTATTTTTTTTGCTAGTATTTTTATGTCATGCTAGCAAATCTTATCTATGAACTGTATTGCATATTTAGTCTCAAAATACTTATAGAGCATTTAAGAGTGCTGCACATTGATCAAAAGTAAGCTTGATATTTCTGAAGCTTGATTGAGAATAAAATGTGTTTAGATAATAACTTGGATGCCATTACCTGGTAAAGTATGATCTTTGCTTTTATAATAGATAAAGATTATTTTTTGATATGGATTTTAATTTAAGTAATTAAGATTAGTCAGAGGTTCTTTTATTCAGAAGACAAAAGACTTGAAAATCAGTGACAAATTTAATTTGTGTGGTAAATTTGAAAGCAAAAGTGAACTCTTGGGAGAACTTTTACAGTGATTTTTCAAGAGATTTATTTCTTTGTACAGTAAATATGGCAAAATGTTTCTTGCAAAGAAATTTTGTACATTCCTCTGTCTCCAAAAAGGGAAAACCAAAACCATTCCAAGATAGATGGGAAAACTCATTTTAAAGAGCCTCTATTGAGGGAGATAAAACTTAATGTGAAAAATTTATTCTAGTTATAATAATTTTTAAGCCAGGGAGATTCTCTTTTTAATTCAACTTCAAAACAGACACAAGTGATCATATCCATTATTTTCAACTGCATAGTTACATTGATGCCTGATCCCTTTGCCCCTTCCTTTTTCTTGTTGTATATGTCTGTGACTTTTTTGCATTATATCTAATGATGCCAAAGTACTGTTTATTGGTTGTAGTTTAAAAATTATATTAGTGCATGATTTTGGTGACTGTTGGTTATGATAGATTGACTTATATTTCtgtactagaggcccagtacacgaaatttgtgcaagagtaggccttcctttctccggctctccgcaccggcttccctccgggacctgggcttccctctggccgctggcaggcacccaggacccgggcttccctcacagcctcgcttcatccggaaggttgtctggaaggacgtctggtctaattagcatattacacttttattattatagaTACGGTGTGTACCCTGGGTTAATAGCACTGGAATGAATTCCAGAGCGGAGGACCCGAGATGTTTACTTTGTTTCATCCTTTCATCATGTAGGGAAAATTTGCTTCTGCTGATTAAAATCATAGAAGGTAAATTGGTTTTCACTGACAAGAATAAATGCAGGGCAGCACAGGAAAAGAGGTTGAATTGGAAGAAAACCATATAGAAGTGGATAAAATTAAAATAACAGTTGCAGGAGCAGTGGTAGAAATTTAAAACAGGGTTGATGAGCAGCAGCCATTTTGATAGTGGAAAAGAAATCAGGTAAGAAGAATTTAAGAAAATAGAGAAGCTGTGTAATGTGGCACCATAACACTAGGTTTAAGCTAGAAGCTCTCAAACCATGTTATACACCTTTTAAAAATATGGTGAAAGCTATAAATATTCTCTCAAAACGTGCATAGTATACATGAACATAAAATTGtttttttaaaaaatatgtatttttattgatttcagaaagggagagagagcgagagatagaaacatcagtgatgagagaggcttgttaatcggctgcctcttgcatgccccacactggggatcgagcccgcaacccgggcatgtgccctgaccaggaatcgaactgtgacctcctggttcataggtcaatgatcagctactgagccacgccagctgggcCATAAAATTGTTCTTAACAGattttaactgcactgaaaactattttttaaacatagaatgtgaaagaaatcttcttaagaattatttctcctttttttttcccatgcaaaaatcagtgactatgccctggctgggtggctcagttgattggagcattgtcccctatacagaaaggttgcaggctggatccctggttggggtgtgaacggaggcaactgattgatgattccctcttattgcatcagtgtttctctctttctcccttcctctttaaaatcaataaaaacatcctcaggtgaggattaaaaaaaaatcagtgaccactttttgagaatgataactaaatctaagtgttacaaattaaccaaaattaagcatttgttctgctcaatagtaaattttaatgcaagggctgctattacttagcttttaaataacacatgaaagtattccattttctttgacttggcaacctttctgtcatctttgatagccaatcagttttgacttactttttttggtcaaaacaagtgctgaaaatcttatcttaaaaacgaatgaaaggacaaatggaatctgtagattctttctacagtgttgtgtcaagaaataagaattttctaagactctgcagataaattcatattgattttgctttctagttaataagatcatttttggcaagatcctggcctaatgctatgttgggaaggaaaggattatgactacacattttagttttaagaatgaagagttaaactataaaagagttcagttgatggcagcaaaattctggctatagatttgtcttctgaaagccattgaacttgtgtgtaccaaagaagttgcttctacttcttaacaaaaccttttaaggaccccttgattgaaagtcttgacttttatgactttggcaattttcacaacagtagaTTtttcatgacgaatcctcttgcataggctatgatttaaggcttggcactcatgaggcagtcgaatactttcacagcaatagataagatttctctcaggattgatggtagagtcgtgcacctcagtgtatactgatgaacaaagtagagtcacagtgaatgcacaactcctgtcttttaaccaaagcagcaaaaccagatgttttgccaggtattaaggtatactatctgtctctacagaatactgagatttcttcaggagagtgtctttagttttttttcccccccaaagagacttcaccattctgaaaatgttgatatcccttgaagtttccaaaaagaactctaaaatagagttttttctttgattatgtcaccatggatgtatttgatgaaaattagtagctggctaagctgagaagtcatatgctgaaggaaagtggtatttctaagcctttcatggcttgcttcatagttttaggaaatagaaaatgtatttgttttaaatgaataaaaattgtttgatagagatactgcaacagtctttctattacaagctacaaatacgtttgatcacttctgaggtatttgctttcaccacattcaactgtgtgacttttttgcttggttggcattacagccagcagcctggtagcatgctttagtcaagaattttaagtttgccgaccactgGTTTAGCCTTTTCTAACTCAACTGTACTCTCACATGTTTGATCATTTTCCCCTCTTCCCTCCCTCTTACATCTCCACCCCAACCCCTAAACACGCACACACATATGCTCCCTTTCTGATGCaggtgcttctgcaggatagttaactgaatgcttctgatagtgagaactagccatagaagaagcacttgggaaattacatctcatcatgttcagagttaaaagtaaaacccaagtattcttcagctttattatactttattttctctaaGTTAGATCCAAGAGACGTCTCCATAATAAAAAAGTGAGGGCATACTTTAACTTATATTGTCAATTCTGTTTCTCCGTAGAGGAGAAATTTGATGAAATGGGACATTGTTATTAAATAGGGGCCACAGTGAAAATATAGCAGAGAAATATTTATTTAAAGAAAATGTGAAGTTTGTCATATAATAGTAAAGTTTGTCGTGTTGAGTGTAATAGCACCCACATCATTGGCAGAACTTTTCTAGGCACAGCATATTCTTCATCCTCTTATGGATTGGATTTTCTCCCAAGTAAAAGGTATTGAGTTTAAAAAATGGAGTTTGTGCATACTGTTAAGGATGTATGCAGTAACATTATATTTAACTGTCACATGATATTAAGATTCAGAGTTGAGTAATTTAGCCAGAATTGATGACTTTTAGCATCTTGGAATAAAATAATTCAAATCTGTGCTTAGTTCATGATTGATTAATATACCTGGACCATTTTGGGGGATGAATTATTCACAGGCTCTAAAGGAGTATCCTAATGTGTATATTTACCCCTTTACCCCTGTGTATATTTTAAAAGGAAAAGAGGAATTTATGAATAGTTGTGTTGACAAAGCTTATCTTACTAAATGTTCTCATTTGCATTTTAGGTTGAAGCAACATTAGAAAGCTAAATACAGTGGATAAAAGTCATAGGATTTTCTTTTTTGAAGGAATGTttcttattttatagatgataaaacaggctcagaaagatgaaatgctttgattaagattatgcagttaatgacagcagagTGAAATTTTAGTTCCCCAGCACACTGTTGATCTTCCTTCTATACTGTTAagttcacaaatcctgaaattgcaaaagaattttgaggctgttcagaattaatctctgtacagggtcaaactcttcttaaaggtcatgtagtgctgatgaaattggcctatcttgaaaggttcctcagtttatacccttctttacagatgctagggcatttaatgacccttgatttaagaagTTAAAAACGTTCAAATATATTACATGTTTACCTAATAGTTGGAGTAAGTACTAATGAAATAATATATATTTTTAAAAAAACTTTCttattgatgagggagagaaaggaagtgagtgggggggggcatcaatttttatcgttccacttatttaaatgcattcattggttgattcttctttttaaatagattttattgattttttacagagaggaagggagaaggttagagagttagaaacatcaatgagagagaaacattgatcagcggtctcctgcacactccctactgggtatgtgcctgcaaccaaggtacatgcccttgaccagaatcgaacctgggacccttgagtccgcaggccagtgctctatccactgagccaaaccagttagggcattggttgattcttgtatatgccttgactgggaatcaaacccgcaaccttggtgtatcaggacgatgttctaatcaactgagctacctggtcagggctgaaataatatatTTTTAAATTTTAAAGACTGTAACTTCATCATAAGAGAACTTAGCTGAGCTTTAGCTGTTGTTATACAACTATGGAATTATTCCAGAGAAGTATGTTATAATGAATATAATTGATTATCAAAGGTACTTTTATTCGTAAAACATCTACTGTTGGATATATCCTCTTCCAATATTTCCTTTTAGGTTGTGTCTGTAGGTTTGCATTTTTATAATTGTGAACCACTGTTATAGGAGATACATACATTTTACCATTTTTTAGTTGTGTTTGATTAATTTTATTAGAACTGACTTTAATGTTGTTTTGCTTATATTCTTAATTTTAATTATAGAGAAACATTAGAAGGCTGAATAAAATTGTGTTCTGGTGACATTTATATAGGAACAGAACGCTGCTTCTCTTTCTCCTCCTTCTTCCTCTCCTCCTCTACCTTCTCTTCTCCTTCCCTCTCTTTTCTCTTTCCCCCTACCTCCCCGTTTCCATGAAAGAGGAGCcagatgtcatattttggtgaagaatttatagactgcagagattctccccaaaataatctggtgcagagtcttgacatttcctcagctgacttaatgcaaattaggtgccagagtggtgggcgccaggttatcataaaatgtgccattgtgttagtaatgtccaaataatactttaaggttctgaatgtttggtagaagtcaaagtacaactcataactcctataaagaaaaatgttttctgagagtgagataacttcttgaggaaaggaagactatctttcattcactaatttataagaaggcaactgcgttacacctccATAGGGCAACTCCTAGGGTGGTTTTCCATTTAGTCCTGTGCCTCACAATGTGTGTGTTTGCACTTATGTTTCAGAATTGTAATCAGTAACTCACAATATTTATTGTAAGCGATGAATAAAGAGTTAAAACATCCTATAAGTACTGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGAATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACCTGCAATCCTCATTTTGTGGTCTGCCAGCTCAAGGTGAAGATATATTCCTCCAGTTCAGGACCCACACGTCGGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAACCATTGCCTGTGTGTGGTGACATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGCTAAAGAAGGACAAAATGTTTCATTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACGTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATTGATAGTATTTGCAGTATAGAGCGATCAGATAATGACAAGGAATATCTAGTACTCACTTTAACAAAAAATGATCTCGACAAAGCAAATAAAGACAAGGCCAATCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCATCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGGTATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATTACGAAAGTCTGAATTTTTTTTTTTTTTTTATGAAGAGGGATAAAACACCATGAAAACAAACTTGAATAAACTGAAAATGGACCtttttttttttttttttttttttAATGGCAATAGGACATTGTGTCAGATTACCAGATATAGGAACAATTCTCTTTTCCTGACCAATCTTGTTTTACCCTATACATCCACAGGGTTTTGACACTTGTTGTCCAGTTGAAAAAAGATTGTGTAACTGTGTCATGTATATACCTTTTTGTGTCAAAAGAACATTTAAAATTCAATTAGGATAAATAAAAATGGCACTTTCCCATTTT
>PTEN_x2
ATGACAGCCATCATCAAGGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATACCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTTGACCTATATTTATCCAAACATTATTGCTATGGGGTTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGTGTATACAGGAACAATATTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTATGTGCTGAAAGACATTATGATACCGCCAAATTTAACTGCAGAGTTGCACAGTATCCTTTTGAAGACCATAATCCACCACAACTAGAACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGACGACAATCATGTTGCAGCAATTCACTGTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTGTAATGATTTGTGCATATTTGTTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGAATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACCTGCAATCCTCATTTTGTGGTCTGCCAGCTCAAGGTGAAGATATATTCCTCCAGTTCAGGACCCACACGTCGGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAACCATTGCCTGTGTGTGGTGACATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGCTAAAGAAGGACAAAATGTTTCATTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACGTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATTGATAGTATTTGCAGTATAGAGCGATCAGATAATGACAAGGAATATCTAGTACTCACTTTAACAAAAAATGATCTCGACAAAGCAAATAAAGACAAGGCCAATCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCATCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGGTATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATTACGAAAGTCTGA