Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name RTRAF
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_1) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Myotis myotis
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_1:185934786-185956293
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from RTRAF

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RTRAFP1 scaffold_m19_p_1:114342502-114343072 + Intragenic
N/A UCSC
RTRAFP3 scaffold_m19_p_1:171998951-171999598 + Intragenic
N/A UCSC
RTRAFP2 scaffold_m19_p_1:159079939-159080194 - Intergenic
N/A UCSC
RTRAFP4 scaffold_m19_p_2:193467038-193467773 + Intergenic
N/A UCSC
RTRAFP5 scaffold_m19_p_3:236669-237301 + Intragenic
N/A UCSC
RTRAFP6 scaffold_m19_p_4:51640874-51641220 + Intergenic
N/A UCSC
RTRAFP7 scaffold_m19_p_6:78811559-78812286 - Intergenic
N/A UCSC
RTRAFP8 scaffold_m19_p_7:38555187-38555922 + Intragenic
N/A UCSC
RTRAFP9 scaffold_m19_p_10:37244460-37245184 + Intergenic
N/A UCSC
RTRAFP10 scaffold_m19_p_17:25377613-25378170 - Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>RTRAF_x2
ctcctctccCGGCCGGAGCCCGGGGGACAGAGCGGGAAGCCGGGACCATGTTCCGCCGCAAGCTGACGGCCCTCGACTACCACAACCCCGCCGGCTTCAACTGCAAAGATGAAACGGAATTTAGAAACTTTATTGTTTGGCTTGAAGACCAGAAAATCAGACACTACAAGATTGAAGACAGAGGTAATTTAAGAAACATCCACAGCAGTGACTGGCCCAAGTTCTTTGAAAAGTATCTCACAGATGTTAGCTGTCCTTTCAAGATTGAAGATCGACAAGAAGCAATTGACTGGCTTCTTGGTTTAGCCGTTAGACTTGAATATGGAGATAACGCTGAAAAATATAAGGACTCAGTATCTGATAATACAAAAAATGCTGACAATGCAGCTAAAAATGCAGAGCCATTGATCAATTTGGATGTTAATAATCCTGATTTTAAGGCTGGTGTAATGGCTTTGGCTAACCTTCTTCAGATTCAACGTCATGATGATTACCTGGTAATGCTTAAGGCAATTCGCATTTTGGTCCAGGAACGCCTGACACAGGATGCAGTTGCTAAAGCAAATCAAGCAAAAGAGGTATGTATTTTTTTAAGTAAAATCTAAAGTAATTATTAATGAAAGTTTCTTCTGGTGTTGTCATGGGTCAAACCCTGCATGTTACTGCTTAAGATACCCATTCTGTGTTAGAACTGCCCAGAGAAAGGATAGCTTACTTCAAGGGGATTGAATGTGGTTTCTAAGCAAATTGTGTCTAACCATTTTGAGTGAAAAATGAACTCATGTTTATCTCCCTTCACACCTTAGAGAAGCTGCCAATGGCACATCCAGTCTACCAGTGTAAACCACTGCATCTACCTAGTTGAAGTTTATTTAAAGGAATGTGCACTTGTGAAATATTCTGGGTTATTTTGACTAATTGCTGGGGAACAGGACACAACCTCTCAATATTTTCCTTTTTGACCTAAATCCTACGTTTGTTCTTTTGTTTCTTCAGAGAAATCTCATTTTACCTTTTCTATTTCCTAGCATAAAACCTaagtaacttgcataaggtcacctagtggatacgtggttgagacaaggattcaagtggtggttcacaTGAGCTAGTTGATGATCTAGGTGATTTGGGGATAGAGAGGCTACTAGAGTGTGAGGTTCAGGGTACAGGTGACTAAAACTCATCTTAGTATTCTACTATCTAATAATTCTGAGAAGTTTTTAGATAAATTGTACCATAAATCTAAATGTCCCAAAAGTCTCATTGACTATGGGGCAATACAGAGAATGTCCTCATGGGTTAGCAGCAGCTGCCTGATAATGCCCCCTTCCTGCTGTACAGATGTTGCAGCGACAGCCTTTGTTGGTACAACCACCATCCTGAACCCTGGTCCTTTTTTTTTTTTTTTGCCTCCATCAGTTCCCCAATGTCATTTGTCTTCTATTAAAAGGTTATTGATGCCAGGTAAGTGTACTCCCTCTAAAAGACAGTTTCTTTTAAAGGTTCTTACTGGCTTATTAATTATGTGTGAATCCAGCCACTGGAAATTGGGCTAAAAGTCAGCTTATTTCTCCCACACTATAAACAGAGAGTAAATTCATTTGGTAAAGCTATGGTTTGGAAGGCAGTGCAAATAAGGACAGAGCCAAATCACTGCTGCTCTTTACAAAGTAAAATTTAGTTTTATTCTCAGTGCTCCAAATAAATCTTAGTTTTAATGTCATCTCAAAAGATTCTATGCTATAAATAATAATACAGTGGAGAAGTTTTACAGTTGTGTTCTTGTTTGTAACTGTTCATAACTAGCATGTGGTCATCTTCAGCCATAGAGGTATTTTTTTGGTGTTTGGGCAAAGGGGAAAGGGAGCCTCTGGTACAGCCTAGCACAGTACATTTCTACTCTTTAGTTTTGCTCACTGAGTTTCCATACCTGTTTGTTTCTATACTTACATAGTGTGTTTATTAGCTATTTTGAAGCAGATGGAACCTAGGTAGATTTTTATTAATAGATTAGGCAAGAATTGAGTAGTGACAACTTAGCATTTATAGCATTGAAGTATCACTATGGTTTAGATTCTATTCAAAGTAACTTCAAAATGAACTGTTGAAAGTTAAATTATATATATTACATATAATCTGTTAAAATTTCTGGCTGAAAAAGTATGTTTTAGGTTTGTGCAATTTGCAGACAAATTAATGTGCTTAGGAAAGTAATATTAAAAGTAGTCCTATTCCATTTGCCCTGTACTCTGCTGCTTACTGTAGGTAAAACAGAATAATAGCAGCCCTGCAGTAGTGACAGGGGCACTACAGCAAAAAGGAGCTATTTTATATGCCTGGTCTTAAAGGATTGGATGGGTTATGGAATTAGCCTCCCACTATATTTAAAGGCCATTCTTTCCTCACCGGTTATAGTAGGGAAAACAAACATCAAAATGCAAATTTAAGAGAACTCTCATTCCTCTTGCTACTGTGACTAAAAGGGTTAAAATAATAGCTAGCTGCTCTTTAGTTTTAGATAAAAGAGATGATACTTAACTATCGCCTCATTTTGTCCATTTTTTTTAAAGGGGTTGCCTGTTGCTTTAGACAAGCATATTCTTGGTTTTGACACAGGAGGTAAGTGATTTTGTTTTGATGATTAATTCAAAATATTTTAGAAACTTGGTGAACATTTTGGGGGAAATGAGTGGTCTGAAATATAAAAGTTATTAATTTTGCCATGTTTCTTATAAATAGATGCAGTTCTTAATGAAGCGGCTCAAATTCTGCGATTGCTGCATATAGAAGAGCTCAGAGAGCTACAGACAAAAATTAATGAAGCCATAGTAGCTGTTCAGGCAATTATTGCTGATCCAAAGACAGACCACAGACTGGGGAAAGTTGGGAGATGAACCTGTTAGGATCTCAGCGTCTCACCTGTTTAGTGCAGTTGGGAACCATGCACGCTGTGGTATGTGTTTCAAAATCAAACATCACATTTTCAAGGGAAGAGTCCCAGAAAATTGACTATGTTTGAGAGATTTACCATCATTGCTTTTTCTTTAATAAAGTTTGGGAAAGCAG
>RTRAF_x3
ATGTTCCGCCGCAAGCTGACGGCCCTCGACTACCACAACCCCGCCGGCTTCAACTGCAAAGATGAAACGGAATTTAGAAACTTTATTGTTTGGCTTGAAGACCAGAAAATCAGACACTACAAGATTGAAGACAGAGGTAATTTAAGAAACATCCACAGCAGTGACTGGCCCAAGTTCTTTGAAAAGTATCTCACAGATGTTAGCTGTCCTTTCAAGATTGAAGATCGACAAGAAGCAATTGACTGGCTTCTTGGTTTAGCCGTTAGACTTGAATATGGAGATAACGCTGAAAAATATAAGGACTCAGTATCTGATAATACAAAAAATGCTGACAATGCAGCTAAAAATGCAGAGCCATTGATCAATTTGGATGTTAATAATCCTGATTTTAAGGCTGGTGTAATGGCTTTGGCTAACCTTCTTCAGATTCAACGTCATGATGATTACCTGGTAATGCTTAAGGCAATTCGCATTTTGGTCCAGGAACGCCTGACACAGGATGCAGTTGCTAAAGCAAATCAAGCAAAAGAGGGGTTGCCTGTTGCTTTAGACAAGCATATTCTTGGTTTTGACACAGGAGATGCAGTTCTTAATGAAGCGGCTCAAATTCTGCGATTGCTGCATATAGAAGAGCTCAGAGAGCTACAGACAAAAATTAATGAAGCCATAGTAGCTGTTCAGGCAATTATTGCTGATCCAAAGACAGACCACAGACTGGGGAAAGTTGGGAGATGA