Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name SMS
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Monodelphis domestica
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr4:45747419-45811757
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from SMS

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SMSP1 chr1:449695224-449699393 + Intergenic
 ENSMODG00000013869 UCSC
SMSP2 chr4:348850659-348854235 - Intragenic
 N/A UCSC
SMSP3 chrX:60064537-60064683 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_007493425.2
TCCCTCCCGTGTGACTGAGCAACCCGGCGCTCTGCAGCTGCGGGGCTGGCTCGCTAGTGCGCGcgccctctttctctctcccttttctctcctctcctcctggcTCGTCCCTCCCTCCCCGGCCTCAAATAGCGAAGCGCACTCGCCAGTGCAGCCTAACACACACACGCGCACTCACACAGACACACGCGCATACACACGCACTCACGGTTGCACACGCAGcagaagcaagcaagcaagcagcagcagcagcggccgCCTCCACCAGGCATGGCACTGGGCTCTACCTCATTATGGCAGCCGCGCGACACAACACCCTCGACTTCCAGCTCTGTGCTAAAGcTGATGGAGATGCCATTCTTAAAGGTCTACAGTCTGTTTTTGAAGAGCAGGCAATGACAGAAACAATTCACACTTGGGAAGATCATGGATATTTAGCAACCTACATTAATAAAAATGGCAGttttgCCAGTCTGAGAATTTACCCACATGGATTGGTGTTGATGGATGTACAGAGTTACAACAAtgatttgaaaggaaaagaagaaattgacaatctacTAAACAAgctagaagaaagaatgaaagaactaTGTCAGGGCAATATTGGAAGGTTAAAACGATTGCCGGCTCTCGTACGAGGAGGCAAGATCGATAAGTATTGGCCTACAGCTGATGGACGCCTGGTGGAATATGACATAGATGAAGTTGTATATGATGAAGATTCACCTTATCAGAACATTAAAATTCTGCATTCGAAGCAGTTTGGAAATATCCTTATCCTCAGTGGGGATGTCAATTTGGCAGAGAGTGATTTGGCGTATACACAAGCCATAATGGGCAGTGGGAAGGAAGATTACACTGACAAAGAAGTGCTGATTCTAGGCGGTGGAGATGGGGGTATATTATATGAAATAGTCAAATTGAAACCAAAGATGGTCACTATGGTAgagATTGACCAAATGGTGATTGACGGGTGTAAGAAATACATGCGTAAAACATGTGGAGATGTCTTAGACAATCTTAAAGGAGAGTGCTATCAGGTTCTAATAGAAGACTGTATTCCAGTACTGAAGAGGTATGCCAAAGAAGGGAGAATGTTTGATTATGTGATTAATGATCTGACAGCTGTTCCAATCTCCACATCTCCAGAAGAAGATTCCACGTGGGAATTTCTCAGACTGATCCTTGACCTTTCAATGAAAGTATTGAAACATGATGGAAAATACTTTACACAGggGAACTGTATCAATTTGACTGAAGCCTTGACTCTCTACGAAGAACAACTTAGCCGGCTTTATTGTCCTGTGGAATTCTCAAAGGAAATTGTATGTGTTCCCTCATACATGGAATTgTGGGTATTTTACACTGTTtggaagaaaactgaattttGAAGATTACTCTTGCCTGCATATTGCCATCTTGAACCTTTTAAATTATATGCTCTAGAAGATTCTGAAATTAGTCATTCTATTGATTGTGAATTccttaaaagtttttttattattattttaatttaaaaagcaaatggaaaatgtatattttgatGAGCTCTAGGGTGTTATTTTTTGAAAGTCAACTTAAAGATGAATTGGCAGCACTGCTGCTGAATGCACTGAACCTTTTAGAATGTGATCTTTGTATTTCTCTGTTAATGTAGGCTTTTGTGGTAGAGCTTCATTAGTGTGGTgtgtgggtggatggatgggtgaATATGGATGTATGtatggaagagagaggaaaagaatgggTATGTAtggagtatcttttttttttctttaaatttcattcCTAAGGGaaccagaaaaaaagatttttttttccttttccaaaagtTGATTCTGTTTTAGAGATTGGGTTAAAGGAGACTTTAAGGAGAATAACAGTACtttcattataaaaatttttttgtgtgttttaaaaaaaatctactcttTAATACTCTGGTCCCGTAAAACAAATTTTTCTTTGCTTGGTgtagttcttcttttttttttttaaacgtatgtatttatgtatgcatacatatagttCCATTAACCAATTTCTACAATAGATAAtcgttcccttccttcctctttggctccctcctttctcccctatCCCACTACACGTGCAAATTTTTCTTGTGAATCTAGAACCTGAACTGAAGCTAGTAAAGGTACTGTTGTTACTATCAGATTGAAAGTCAAAACGTGCTCCCTTATCCACTCTGATGTGAGATGTTGAAATGAGGCTTTCTTTGGATATCCATCCGGGAAGTTGACAGGAGTATATTTGTTACAGAATCTAAATAAGTTCATTATGTACAGAAGAGAACCGAATAGCCAAAACTCTTACACTTCTCACATTGTTAAGGGAAGGTGTGGATATGTATCAGCTTTCCAAGTTCAGCATTTCACAGAGGCCACACAAATCTGATCATTGAGATTGTATGTTTATCCAAGTTAAGATTTGAGATTTCAAAGTTAAGATCTCCTCCCTTGGACTTTTCTACCTATATCTTTGTGAAAAGTTTATTGAGTTTGCTAACTGGGTCATTTCATGTATGGTAACTGTTATAAGCTAACCATTTACTGTAAATGAGATTCTGTATGACgaggaaaaaagaattttttttataatgcttatgggagaatttttttttttgaagaaacgATTTCCTTAAAAAACTGAAGTGTTTTATTTAACTACTTGGTTTATTggagtgggagggaagagaagagatatTAATGGTTCCTCTTATTAAGTATATAGGATAAAACAGGATGTTGTATCTGGACCTGTCTTTTAACCAAGAAATAGTTTTGTTGTATTACACATGTAGTAAAATTTGTCTTTGACAGCCTTTGTGTAATGAATGAGCTTATCTTTGAGAATGCTTGCAGAGCAGAGCAAAGGCTGGGTATaatgttcatatatatgtgtatatttatatgtgaacGTTAtagaatatacacacatacaaattaTACACACATAATGTATAATGGTGCTGTTAATGTTCAAATTACCATTTGAGTTGAACAGTGGGAGGGAGCATTTTTCTTCACCATTGAAAAATCCACTGCCACCCAGAAGCATCTTGAAATATGTGACCAGCATTTAGGCATAACTTTGACATTGAACTTAACAAGATCAGATCAACTTGTGGGCTAAAGAGGGTCATCCAGTGATCAATGTGGAAGCACAGGTCCTGCTGCAAAGATAGCAAGTTAGAAGTGTGTGTGGTGGGTTTGGACATTCAGGTCCCTGGAAGGTACATTCAGTGCAAAGGtatatggggtgggggggagggagatcaAGTGGGGAGGTGGGtgggagagtgggagggagagggaaaaatgtGTTGTGTGACGCTAACAATGCACACAACTCCTATAATTTTCTTATTGTCATTATTTGTGTGGAGAAAGAATGActtttgcttttcaaaatattttgtagttacTATAAAAAGATGGGCATGCAAATACTGAATACTGGTGACTTTATTTGCTATTGCTAAAGAGATTCTGAAGAAATGTTTAAAGAATGAAGCACTgtcattttaagatttatttttaatgctgTAGTGTAAAATTTAAAGTTCGATTCCCTCTGTACAGTGAGCTTTTTGATTGAACATACTATAGAGCGCAATATAGACTTTTTTACAATGAAAGGAAAATGTGGACATAGTTTTGAGCTCAACTCCACACCTGTCAACAAGTACCAAGAATTCGTTCatgtttatttgtattctttGCACCAAATGCTGCTTCCACCTAGAAATGtgattaagtatttaaaaaaaaaaaaacttgattgaTAGTGATTTGACTGTGCTTGACAAGAAAGACTGCTGGCAATGTATCTGCTGCCTTAGTGCAGTGCATATATTAAATAAAGGTATGCTATGACCACT