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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name PRPF40A
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Monodelphis domestica
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr4:155313955-155375796
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PRPF40A

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PRPF40AP2 chr5:162346133-162346856 + Intergenic
 N/A UCSC
PRPF40AP1 chr3:3547687-3547860 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_007494174.2
GCGCGCGCGCATCCTGTCCCAGCCACCGCTAACGCTAGAAGCTGCTTCCCCCCCTCCTGGCTCCCAGGCGGCCTCTGGTTTGTGGGGCGTGCGTAACTCGGGTGGGGGGTAAAGGGGGCAGCCCCCCCCACTGCCCCTCCCCCTACGGGGTGAGGTGGCTTTTAAGCCCGGGAGGCTGGGGCCTACGTACTCTTGTCTTCCCCGGGGGAAGTTGGTGGAGTTTTCCCGGCGGGGGACTCGGCGCAGAAACTTCCTccgtccccctccccccctccatgCAGGCGACGCCGAGCGAGGCCGAGGCCGGGGGCGAATCGCCGCAGAGCTGCGTGCAAGCGGCGCGCTCTGATTGGACGGCGGGGAAGCCAGTCAGCTTATTGGCCCCGCTGATCCCGCCCCGCAGCTCCGGGCAGCCTCTACCCTTTGGCCCCAGCGGGCGCCAGCCACTCAGATCGCTCCTTGTTGGAATGTGTAGCGGCAGCGGCCGCCGCCGGAGCAGCCTCAGCCCGACGATGAGGCCGGGGACGGGAGCCGAGCGTGGAGGCCTCATGATGGGACACCCTGGCATGCATTATCCACCCATGGGAATGCACCCTATGGGTCAGAGAGGAAATATGCAACCTGTACCTCATGGAATGATGCAGCAAATGATGCCCCCTATGGGAGGTCCTCCAATGGGACAAATGCCTGGAATGATGTCTTCAGTCATGCCTGGGATGATGATGACTCATATGTCTCAGGCTAGCATACAGCCTGCTTTACCGCCAGGAGTAAACAATATGGATGTAGCAGTAGgtgcAACATCTGGCACACAAAAATCAATGTGGACTGAACATAAATCTCCTGATGGAAGGACTTACTATTATAACACAGAAACAAAGCAATCTACCTGGGAAAAACCTGATGATCTCAAAACACCTGCTGAGCAATTATTATCTAAATGCCCCTGGAAGGAGTACAAATCTGACTCTGGAAAGCCTTATTATTACAATTCTCAAACAAAAGAATCTCGTTGGGCCAAACCCAAGGAACTCGAGGATCTTGAAGGATACCAGAATACCATTGTTGCTGGGAGTCTTATTACAAAATCAAACCTGCATGCTATGATCAAAGCTGAAGAAAGCAGTAAAGAAGAATCTACCACAACATCGGCTGCCCCAGTTCCTACAACAGAAATTACAACTACAATGAGTACAATGGCTGCTGCTGAAGCTGCAGCTGCTGTTGTCGCGGCTGCAGCTGCTGCAGCAGCCGCTGCTGCTGCAGCCAATGCCAGTGCTAATGCTACCATTTCGACTCCTTCCTCCATTGTTGCTTCAACTACACCAATTGTCACTGAGCCTGAAGTTACTTCCATTGTTGCTACTGTCATAGATAATGACAATACAGTAACTATTTCAACTGAGGAACAAGCACAACTTGTTACACCTATTGTTCATGAACAAAGTGTAGAAGTATCTAGCAATGTGCCAGAAGAAACTTCAAAGCAGGAGGCTTCAGTAGATTTCACTcccaaaaaggaggaagaagatagTCAACCTGCTAAAAAAACATATACTTGGAATACAAAAGAAGAAGCAAAGCAAGCTTTTAAAGAATTGTTAAAAGAAAAGAGAGTACCATCTAATGCCTCATGGGAGCAAGCaatgaaaatgattattaatgaTCCCCGATACAGtgcCCTGGCAAAACTTAGTGAAAAAAAGCAAGCCTTTAATGCATATAAAGtccaaacagagaaagaagaaaaagaagaagcaagATCAAAATATAAGGAAGCTAAGGAATCCTTTCAACGGTTTCTTGAAAACCATGAAAAGATGACTTCCACGACCAGATATAAaAAAGCTGAACAAATGTTTGGAGAGATGGAAGTATGGAATGCAATATCAGAGCGAGATCGTCTTGAAATTTATGAAGAtgtcttgttttttctttcaaaaaaagaaaagGAACAAGCAAAGCAACTGCgaaagagaaattgggaagccTTAAAAAATATACTTGACAACATGGCTAATGTTACCTATTCCACTACATGGTCTGAAGCCCAGCAATACCTGATGGATAACCCTACCTTTGCCGAAGATGAGGAACTACAaaacATGGACAAAGAAGATGCATTGATATGTTTTGAAGAACATATCCGGGctttagaaaaagaagaggaagaagaaaaacagaagagtTTGTTAAGAGAAAGAAGGCGTCAACGTAAAAATAGAGAATCTTTTCAGatatttttagATGAGTTGCATGAACATGGACAGCTGCATTCTATGTCATCTTGGATGGAGTTATATCCAACAATTAGTTCTGATATTAGATTCACCAACATGCTCGGTCAGCCTGGATCAACTGCACTTGATCTTTTCAAGTTTTATGTTGAAGATCTAAAAGCACGTTATCATGAtgaaaagaagataataaaagaCATCCTAAAGGATAAAGGATTTCTGGTTGAAGTAAATACTACTTTTGAAGATTTTGTTGCAGTAATAAGTTCAACCAAAAGATCGACAACATTAGATGCTGGAAACATCAAATTGGCTTTTAATAGTttgtTAGAAAAGGCAGAAGCCCGTGAGAGGGAACGAGAAAAGGAGGAGGCGCGAAAGATGAAACGAAAAGAGTCTGCATTTAAGAGTATGTTGAAACAGGCTGCTCCTCCAATAGAATTGGATGCAGTCTGGGAagatATCCGGGAAAGATTTGTAAAGGAACCAGCATTTGAGGATATCACTCTAGAGTCTGAACGAAAAAGGATATTTAAGGATTTCATGCATGTGCTTGAGCATGAATGTCAGCACCATCATTCAAAGAACAAGAAACAttctaaaaaatctaaaaaacatCACAGGAAACGTTCCCGTTCTCGATCGGGCTCAGATTCAGATGATGATGACAGCCATTCAAAGAAAAAGAGGCAGCGGTCAGAGTCCCGATCTGCTTCAGAACGTTCTTCTAGTGCTGAGTCTGAGAGAAGttacaagaaatcaaaaaagcataagaagaaaagcaagaagaggaGACATAAATCTGATTCTCCAGAGTCTGATGCTGATCGagagaaggataaaaaagaaaaagaacgagaaaatgaaaaggatagaACTAGGCAGAGATCAGAATCAAAACACAAATCACccaaaaaaaagactggaaaggattCTGGTAATTGGGATACTTCTGGCAGTGAACTGAGTGAAGGGGAATTAGAAAAACGGAGAAGGACCCTCTTGGAACAACTGGATGATgatcaataaattaattatacCAAATATATGTTTACAGTATAATTAAAAATGTCTAGTTCAGGACAGGGATTCTGATGTTTTAAATTCCATTGAAGCAACACTGGGTTTTAATTATATCACAGGAAGTCGTGCATCTAAGTAATGTTACAGTGGAGTTGACTTTAAATctgcaaaagagaaggaaattcaaaagtgAACACAAAAACTTTTGATTCTGTATAGAGAATCATTTTCATATCATCACTCTGAAGCCCCTTTTTAGGGTACagcaaaatggattagagatGGTGATTTCTTGATGACCACAGATGTCCCTACTTTTGTGTTCTAAAGTCAATGCCACAACGATAGATTTTTGAGGTGGTTTGAAATTTGCAGAAGTTGGATTTTGAAGATATAATGAAACCTTTTTTGATGCATAGTGGTACAAAAAAAGCACCAGCAACTGATCAAAATGCTTTTTTGTGCACTTCCTAACTGGTTTAACTGATGTGAATTTTTATGGTGAACTAAAAAAATAGGTGTTTTTTGATGGAAACCCTTAACTAGAGTAGTGCTAATGGGCACTGCTGTATCATAGCCACCATTGTTAATTTTAAGAGCATCTGGATGAATAAAACAAAAGGCTATTGTGAGGGCATTATTTGAACATCTATTTTGAGgcgatgtttaaaaaaaattaacatcaaatcagattgtaaattaatttaaatatgttGCCTTAAGGACCTACTAAAGAATGTGCCACCAAATTTTAAGTGACAGTTGCAATATCCTtgtctaaaaaaaaatcaatgtcgacttaaacattttctttaacaaaagttgtcttgatttaaaacaaaaaaatcagatcTCTTTccgtctttctctctttctcttgctttctctctctcactgtcttttttttttttttaatatcctctgTCCAGTTTTTCATTGAGGAAAACTTTTCCCTACTCAGTGAGAAGTATTGACTTCTGTGGTACACATTCTAAAGCATTTctgatttgaatatttttgtacatttttatcGATTATTAAACCTTCTCTTCTAGCGTGTACTAGTATTTATTTCTACTTGAAATACGCTGTACAGCTCTAACAGAAATATGGATATTTTATGATTCAGTTAAGCAACAATGTGATGTATTTACTCTAAGCCCGTCGAAGTTTCACTTAATAATTCATCTTCCTTTCCCATGTAGTTTACTTCTCTTTTCTAATGATACTTATAAGAGTACTTATACATAAATCAGTGCATATGAGGCCCCTTTATTTGTGCTTCAATCTAAAATGTTCATACATAATTTTTTTGTGAGAAGTTGGTTTAAGCAAAGCTAGAGGCAACATTTTACATGCTTGCTTCTAGAAGTTGGTATTTGTCACTTGAAAGATAAAACTGGCTAtagcatatttttttttgttgttgttatcaggGAGCACTTCTTGTACAAGAAATTGTTTCACATTAAATAAAGCATACCCCACATCTGGTGTTAAAGTATATATTAGGTACCCATCAgtcattattttattcattaattttggtCATTTTGTGGACCCTTATTTTGAGTTGTGTTACAAAAATTAAGAGACTATTTTACCCCCGTGTTCACCATCTTAAAAAAGTTGAAAGTGGTTAGTGTTAACCAGGAAAAATGTTACTGAGACATCACTAACTAATGTTATCATACAACAAAGCCATGAAAAGCTTTGTGACTATTCCCAacttttcttctt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>XM_016433634.1
CGCGCGCGCGCATCCTGTCCCAGCCACCGCTAACGCTAGAAGCTGCTTCCCCCCCTCCTGGCTCCCAGGCGGCCTCTGGTTTGTGGGGCGTGCGTAACTCGGGTGGGGGGTAAAGGGGGCAGCCCCCCCCACTGCCCCTCCCCCTACGGGGTGAGGTGGCTTTTAAGCCCGGGAGGCTGGGGCCTACGTACTCTTGTCTTCCCCGGGGGAAGTTGGTGGAGTTTTCCCGGCGGGGGACTCGGCGCAGAAACTTCCTccgtccccctccccccctccatgCAGGCGACGCCGAGCGAGGCCGAGGCCGGGGGCGAATCGCCGCAGAGCTGCGTGCAAGCGGCGCGCTCTGATTGGACGGCGGGGAAGCCAGTCAGCTTATTGGCCCCGCTGATCCCGCCCCGCAGCTCCGGGCAGCCTCTACCCTTTGGCCCCAGCGGGCGCCAGCCACTCAGATCGCTCCTTGTTGGAATGTGTAGCGGCAGCGGCCGCCGCCGGAGCAGCCTCAGCCCGACGATGAGGCCGGGGACGGGAGCCGAGCGTGGAGGCCTCATGGTGAGTGAAATGGAGAACCGCCCTCCACCGCGGGGTCCCGGGAACGGGGAGCGGAGACTGTCCAGCTCAAGCCTCTGCTCCAGCCCATGGGCCTCTGCGGACGGCTACCTGAGGAGACGGCCCTCGATGGGACACCCTGGCATGCATTATCCACCCATGGGAATGCACCCTATGGGTCAGAGAGGAAATATGCAACCTGTACCTCATGGAATGATGCAGCAAATGATGCCCCCTATGGGAGGTCCTCCAATGGGACAAATGCCTGGAATGATGTCTTCAGTCATGCCTGGGATGATGATGACTCATATGTCTCAGGCTAGCATACAGCCTGCTTTACCGCCAGGAGTAAACAATATGGATGTAGCAGTAGgtgcAACATCTGGCACACAAAAATCAATGTGGACTGAACATAAATCTCCTGATGGAAGGACTTACTATTATAACACAGAAACAAAGCAATCTACCTGGGAAAAACCTGATGATCTCAAAACACCTGCTGAGCAATTATTATCTAAATGCCCCTGGAAGGAGTACAAATCTGACTCTGGAAAGCCTTATTATTACAATTCTCAAACAAAAGAATCTCGTTGGGCCAAACCCAAGGAACTCGAGGATCTTGAAGCTATGATCAAAGCTGAAGAAAGCAGTAAAGAAGAATCTACCACAACATCGGCTGCCCCAGTTCCTACAACAGAAATTACAACTACAATGAGTACAATGGCTGCTGCTGAAGCTGCAGCTGCTGTTGTCGCGGCTGCAGCTGCTGCAGCAGCCGCTGCTGCTGCAGCCAATGCCAGTGCTAATGCTACCATTTCGACTCCTTCCTCCATTGTTGCTTCAACTACACCAATTGTCACTGAGCCTGAAGTTACTTCCATTGTTGCTACTGTCATAGATAATGACAATACAGTAACTATTTCAACTGAGGAACAAGCACAACTTGTTACACCTATTGTTCATGAACAAAGTGTAGAAGTATCTAGCAATGTGCCAGAAGAAACTTCAAAGCAGGAGGCTTCAGTAGATTTCACTcccaaaaaggaggaagaagatagTCAACCTGCTAAAAAAACATATACTTGGAATACAAAAGAAGAAGCAAAGCAAGCTTTTAAAGAATTGTTAAAAGAAAAGAGAGTACCATCTAATGCCTCATGGGAGCAAGCaatgaaaatgattattaatgaTCCCCGATACAGtgcCCTGGCAAAACTTAGTGAAAAAAAGCAAGCCTTTAATGCATATAAAGtccaaacagagaaagaagaaaaagaagaagcaagATCAAAATATAAGGAAGCTAAGGAATCCTTTCAACGGTTTCTTGAAAACCATGAAAAGATGACTTCCACGACCAGATATAAaAAAGCTGAACAAATGTTTGGAGAGATGGAAGTATGGAATGCAATATCAGAGCGAGATCGTCTTGAAATTTATGAAGAtgtcttgttttttctttcaaaaaaagaaaagGAACAAGCAAAGCAACTGCgaaagagaaattgggaagccTTAAAAAATATACTTGACAACATGGCTAATGTTACCTATTCCACTACATGGTCTGAAGCCCAGCAATACCTGATGGATAACCCTACCTTTGCCGAAGATGAGGAACTACAaaacATGGACAAAGAAGATGCATTGATATGTTTTGAAGAACATATCCGGGctttagaaaaagaagaggaagaagaaaaacagaagagtTTGTTAAGAGAAAGAAGGCGTCAACGTAAAAATAGAGAATCTTTTCAGatatttttagATGAGTTGCATGAACATGGACAGCTGCATTCTATGTCATCTTGGATGGAGTTATATCCAACAATTAGTTCTGATATTAGATTCACCAACATGCTCGGTCAGCCTGTTTTTTCATTAGGATCAACTGCACTTGATCTTTTCAAGTTTTATGTTGAAGATCTAAAAGCACGTTATCATGAtgaaaagaagataataaaagaCATCCTAAAGGATAAAGGATTTCTGGTTGAAGTAAATACTACTTTTGAAGATTTTGTTGCAGTAATAAGTTCAACCAAAAGATCGACAACATTAGATGCTGGAAACATCAAATTGGCTTTTAATAGTttgtTAGAAAAGGCAGAAGCCCGTGAGAGGGAACGAGAAAAGGAGGAGGCGCGAAAGATGAAACGAAAAGAGTCTGCATTTAAGAGTATGTTGAAACAGGCTGCTCCTCCAATAGAATTGGATGCAGTCTGGGAagatATCCGGGAAAGATTTGTAAAGGAACCAGCATTTGAGGATATCACTCTAGAGTCTGAACGAAAAAGGATATTTAAGGATTTCATGCATGTGCTTGAGCATGAATGTCAGCACCATCATTCAAAGAACAAGAAACAttctaaaaaatctaaaaaacatCACAGGAAACGTTCCCGTTCTCGATCGGGCTCAGATTCAGATGATGATGACAGCCATTCAAAGAAAAAGAGGCAGCGGTCAGAGTCCCGATCTGCTTCAGAACGTTCTTCTAGTGCTGAGTCTGAGAGAAGttacaagaaatcaaaaaagcataagaagaaaagcaagaagaggaGACATAAATCTGATTCTCCAGAGTCTGATGCTGATCGagagaaggataaaaaagaaaaagaacgagaaaatgaaaaggatagaACTAGGCAGAGATCAGAATCAAAACACAAATCACccaaaaaaaagactggaaaggattCTGGTAATTGGGATACTTCTGGCAGTGAACTGAGTGAAGGGGAATTAGAAAAACGGAGAAGGACCCTCTTGGAACAACTGGATGATgatcaataaattaattatacCAAATATATGTTTACAGTATAATTAAAAATGTCTAGTTCAGGACAGGGATTCTGATGTTTTAAATTCCATTGAAGCAACACTGGGTTTTAATTATATCACAGGAAGTCGTGCATCTAAGTAATGTTACAGTGGAGTTGACTTTAAATctgcaaaagagaaggaaattcaaaagtgAACACAAAAACTTTTGATTCTGTATAGAGAATCATTTTCATATCATCACTCTGAAGCCCCTTTTTAGGGTACagcaaaatggattagagatGGTGATTTCTTGATGACCACAGATGTCCCTACTTTTGTGTTCTAAAGTCAATGCCACAACGATAGATTTTTGAGGTGGTTTGAAATTTGCAGAAGTTGGATTTTGAAGATATAATGAAACCTTTTTTGATGCATAGTGGTACAAAAAAAGCACCAGCAACTGATCAAAATGCTTTTTTGTGCACTTCCTAACTGGTTTAACTGATGTGAATTTTTATGGTGAACTAAAAAAATAGGTGTTTTTTGATGGAAACCCTTAACTAGAGTAGTGCTAATGGGCACTGCTGTATCATAGCCACCATTGTTAATTTTAAGAGCATCTGGATGAATAAAACAAAAGGCTATTGTGAGGGCATTATTTGAACATCTATTTTGAGgcgatgtttaaaaaaaattaacatcaaatcagattgtaaattaatttaaatatgttGCCTTAAGGACCTACTAAAGAATGTGCCACCAAATTTTAAGTGACAGTTGCAATATCCTtgtctaaaaaaaaatcaatgtcgacttaaacattttctttaacaaaagttgtcttgatttaaaacaaaaaaatcagatcTCTTTccgtctttctctctttctcttgctttctctctctcactgtcttttttttttttttaatatcctctgTCCAGTTTTTCATTGAGGAAAACTTTTCCCTACTCAGTGAGAAGTATTGACTTCTGTGGTACACATTCTAAAGCATTTctgatttgaatatttttgtacatttttatcGATTATTAAACCTTCTCTTCTAGCGTGTACTAGTATTTATTTCTACTTGAAATACGCTGTACAGCTCTAACAGAAATATGGATATTTTATGATTCAGTTAAGCAACAATGTGATGTATTTACTCTAAGCCCGTCGAAGTTTCACTTAATAATTCATCTTCCTTTCCCATGTAGTTTACTTCTCTTTTCTAATGATACTTATAAGAGTACTTATACATAAATCAGTGCATATGAGGCCCCTTTATTTGTGCTTCAATCTAAAATGTTCATACATAATTTTTTTGTGAGAAGTTGGTTTAAGCAAAGCTAGAGGCAACATTTTACATGCTTGCTTCTAGAAGTTGGTATTTGTCACTTGAAAGATAAAACTGGCTAtagcatatttttttttgttgttgttatcaggGAGCACTTCTTGTACAAGAAATTGTTTCACATTAAATAAAGCATACCCCACATCTGGTGTTAAAGTATATATTAGGTACCCATCAgtcattattttattcattaattttggtCATTTTGTGGACCCTTATTTTGAGTTGTGTTACAAAAATTAAGAGACTATTTTACCCCCGTGTTCACCATCTTAAAAAAGTTGAAAGTGGTTAGTGTTAACCAGGA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