Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name PAPOLA
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr1) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Monodelphis domestica
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr1:325153029-325229151
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PAPOLA

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PAPOLAP2 chr4:395317372-395317555 - Intergenic
 N/A UCSC
PAPOLAP1 chr2:238999015-239001165 + Intragenic
 ENSMODG00000001969 UCSC
PAPOLAP3 chr4:400823855-400826037 + Intragenic
 N/A UCSC
PAPOLAP4 chr7:47216553-47220857 + Intergenic
 N/A UCSC
PAPOLAP5 chr8:113929226-113933524 - Intragenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_007473616.1
AGCAGATCATGCCCAGGGTGCCTGTGGCGGCGGCTGCGGGGGGGAAGTGACTGGGCGGTGCCGGCGCGAGGGACGATGCCGTTTCCAGTTACAACCCAGGGATCACAACAAACACAACCGCCACAGAAGCATTATGGCATTACCTCTCCCATCAGTTTAGCGGCCCCCAAAGAGACAGACTGCATACTCGCACAGAAACTAATTGAAACCCTAAAGCCCTTTGGGGTttttgaagaggaagaggaactGCAGCGCAGGAttttaattttgggaaaattaAATAACCTGGTAAAAGAATGGATACGGGAAATCAGTGAAAGCAAGAATCTTCCACAGTCTGTAATTGAAAATGTTGGAGGAAAAATTTTTACATTTGGATCCTACAGATTAGGAGTTCATACAAAAGGTGCTGATATTGATGCATTGTGTGTTGCACCAAGACATGTTGACCGAAGTGACTTTTTCACCTCATTCTATGAAAAATTGAAGCTACAAGAAGAAGTAAAAGATTTGAGGGCTGTTGAAGAGGCATTTGTACCAGTTATCAAGCTATGTTTTGATGGTATAGAGATTGATATTTTGTTTGCAAGATTAGCACTGCAGACTATTCCTGAAGATTTGGACCTTCGTGATGACAGTCTACTAAAAAATTTAGATATTAGATGCATAAGAAGTCTTAATGGTTGCAGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTACCAAACATTGACAACTTCAGGTTAACTCTGAGAGCTATCAAACTTTGGGCCAAACGCCACAACATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGTGGTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTATCCAAATGCAATAGCATCAACTCTTGTACAtaaatttttcttggtattttctaAATGGGAATGGCCAAATCCAGTGCTATTGAAACAACCTGAAGAATGCAATCTTAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGGGTAAACCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCATACCCACAACAGAATTCTACGTACAATGTGTCCGTTTCTACACGGATGGTCATGGTTGAGGAGTTTAAACAAGGTCTTGCTATCACAGATGAAATTTTGCTGAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCCAACTTCTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTAGCAAGTGCACCAACAGAAAAGCAGCGACTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAAATCCGAATCCTGGTTGGAAGTTTGGAGAAGAACGAATTTATTACACTGGCTCATGTGAATCCTCAGTCATTTCCAGCACCGAAAGAAAATCCTGACAAGGAAGAATTTCGTACAATGTGGGTGATTGGATTagtgtttaaaaaaacagaaaactctGAAAACCTCAGTGTTGACCTTACATATGACATTCAGTCTTTTACAGATACAGTTTATAGGCAAGCAATAAACAGCAAGATGTTTGAGATGGATATGAAAATTGCTGCAATGCATGTAAAAAGAAGGCAACTTCATCAACTCCTACCTAATCATGtgcttcagaaaaagaaaaagCATTCATCAGAAGTTCGATTGACAGCTCTAAATGACAGCAGTCTAGATTTGTCTATGGATAGTGACAACAGCATGTCTGTGCCTTCTCCTACCAGTGCTATGAAGACCAGTCCATTGAATAGTTCTGGCAGCTCTCAGGGAAACAGTCCTGCTCCAGCTGTAACAGCAGCATCTGTGACCAACATCCAGGCAACTGAGGTTTCTGTGCCACAAGTAAATTCCAGTGAAAGCTCAGGGGGTACTTCAAGTGAAAGCATTCCTCAAACTGCCACGCAGCCAGCCATTTCTCCACCACCAAAGCCTACGGTCTCCAGAGTTGTTTCCTCAACACGTCTGGTAAACCAACCACCAAGACCTTCAGGAAACACAGCAACAAAAGTTCCTAATCCTATAGTAGGAGTCAAAAGGACATCTTCACCTCATAAAGAAGAGAGTcccaagaaaaccaaaacagaGGAGgaTGAGACAAGTGAAGATGCCAACTGTCTTGATTTGATTGAACATGATAAACAGGAAACTAAGGAACAACTTGATACAGAAACAAGTACAACTCAATCTGAAACTCTTCAGACAGCGGCTCCTCTGTTGGCTGCTCAGAAAACATCCAGTACAGACCTTTCAGATATCCCTGCTCTCCCTGCAAATCCTATTCCTGTTATCAAGAATTCAATAAAACTGAGATTGAACCGGTAAAAACAACCTCAGGGGTCCATAAACAATATCTGCCAACTCAACCTGTTGTCTTCTAATGCTAAAAAGGAGAATGGAGGGTGCAAGactagacatgactgaaaatggatTTAGGTTTATTTGGTGAACCTCCCTTACTGGGCTAATCAGCACTTGATCGGAAGTCCAGGTTAGTATGTGAAGCCAGGAGTACTATTAGTAATGTGTTAGCAACAGTTGCATTAACTATTTCAAAGGATTActgcctttaaaagaaaaaaaaagaggaaataaacctCAAGTTATATTTGTATCCATATTTAACATCTGATTGGATTTCTGTTTGATGCATTGTTTGAAAAATTTGCAATACAAACTGGCATAAGAATTCCTTATATTGATGATGcacttttatgtattttttattagAAAGTAGAACTAATTTTAGATCTTGAGCttgatgcatttttattttttcctgaagttTCTTCATCATTATTCTATAAATTGGATAACATTGTACAGTGGTTATACTATTGTACTTGAGACAAATGATAAGGGTACATCTAGTTCAGTCCCATTGAAGTAGCCATAACccttaaaaatgaaatgttatatctttggggtatgtgacatattaaaagaataattgggaaatagttggtTTTGAATGGGACACGATTAAGAAGTagtatattggttttatttataaagttttatagTGCATACAAATCAGCGGTCAAACAAACaaatccttttttcctttgagCTAACAAAGTTCTGTTCTCTTTCCttcaatcttttctcttttattcccttttttcagTTTGTATGCACACAATAGGGACaatttcataaaaaaattaatgccaGTATTTTCTTAAGCCATGATGTAAAACAAACCACCCTGTGGCCACATGGCACAAAACACCAAATTTTGGTCTTATATGCTTCAAACTTTTGGGTGACTAAGTGGTGCCTGTAAAAGCATAACATCTCTTGGGATGGCCATTTGATCACTAATATAAAGTTTTGTACGTACACTCCATAGATTTCCTGCTGCAGCCAAGTAAAACATTTCAAATTTTGAACATAAAGGCAAAGCTATTTTctccaagaatttaaaaactaatttttatttttagatggcTCACCAAAAATTTGTCAATAAATTTTAGATAGAAAAaaagcatactttaaaaaatcatttctagcAAGCACTTGACATCTAGTCAGCTCTCTTtactccttttttgttttattcttcagTCCTATCAAAAAGATTTAGGAGcttctttctttaaaaggaatttttaaatccttcctgattGCAACAGAAATTACCAGTATTTAGAAAATGTGAGGGATACCAGATGTAGATAGCAAACTTAAACTTAGTTACTTTTTCTtaatctggggggaaaaaaaagcaaaaccaacaaaaaccttCCCATATTTTCTGATTAGCATGTTTTATGAATCCCCCATTGTGCTCCATCTTATTACATGTGCATTTTTCATGTTAAACTGCAATTACTTACACTCTTCCACTGtccttctaaattaattttataaagttggAGTGTAGTTTCTTTTTCCCCTTAGGCTATGCAGTAATTGAGGCTTTCTTTTCACCATTTCTTTAAGATGTCTAGTatacaatatttctatttccCTTATCTCCTGCCCTGTGCAGCCACCTTGCCCTCCCTTTCTACCACCTATGAAAAGATGATTATACTAACAGTTGAAGCGTACAAGGTGTCTGTGTATTTTGTGTAGCTATGGAGTTTAGATCGAAATTGCCAGGCACAAATTTAGTCTTGTCATTTTGTTTAcacattggggaaaataaaattcagtttaTTAAACGTTTCATGTAACTGCACCCAAGTTTTTCCAAGCAGGAAACTTGGAATTTTTCTGTATAGTGACTTTTTAATTCTAGTTTTCATAATCTGGAGATCAGACTGTTGCTTTCGCATGATGTACGTAGTGTCTCATGACTGGAGTTtgctttgttttatagtatctGTACTCCTTGTATTTTTCAAGAGCTATTTTGTAAACAGATGATGTATTTCTCCAttgaaaacacaataaaaaacAGCACAATCCCA
>XM_007473617.1
AGCAGATCATGCCCAGGGTGCCTGTGGCGGCGGCTGCGGGGGGGAAGTGACTGGGCGGTGCCGGCGCGAGGGACGATGCCGTTTCCAGTTACAACCCAGGGATCACAACAAACACAACCGCCACAGAAGCATTATGGCATTACCTCTCCCATCAGTTTAGCGGCCCCCAAAGAGACAGACTGCATACTCGCACAGAAACTAATTGAAACCCTAAAGCCCTTTGGGGTttttgaagaggaagaggaactGCAGCGCAGGAttttaattttgggaaaattaAATAACCTGGTAAAAGAATGGATACGGGAAATCAGTGAAAGCAAGAATCTTCCACAGTCTGTAATTGAAAATGTTGGAGGAAAAATTTTTACATTTGGATCCTACAGATTAGGAGTTCATACAAAAGGTGCTGATATTGATGCATTGTGTGTTGCACCAAGACATGTTGACCGAAGTGACTTTTTCACCTCATTCTATGAAAAATTGAAGCTACAAGAAGAAGTAAAAGATTTGAGGGCTGTTGAAGAGGCATTTGTACCAGTTATCAAGCTATGTTTTGATGGTATAGAGATTGATATTTTGTTTGCAAGATTAGCACTGCAGACTATTCCTGAAGATTTGGACCTTCGTGATGACAGTCTACTAAAAAATTTAGATATTAGATGCATAAGAAGTCTTAATGGTTGCAGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTACCAAACATTGACAACTTCAGGTTAACTCTGAGAGCTATCAAACTTTGGGCCAAACGCCACAACATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGTGGTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTATCCAAATGCAATAGCATCAACTCTTGTACAtaaatttttcttggtattttctaAATGGGAATGGCCAAATCCAGTGCTATTGAAACAACCTGAAGAATGCAATCTTAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGGGTAAACCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCATACCCACAACAGAATTCTACGTACAATGTGTCCGTTTCTACACGGATGGTCATGGTTGAGGAGTTTAAACAAGGTCTTGCTATCACAGATGAAATTTTGCTGAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCCAACTTCTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTAGCAAGTGCACCAACAGAAAAGCAGCGACTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAAATCCGAATCCTGGTTGGAAGTTTGGAGAAGAACGAATTTATTACACTGGCTCATGTGAATCCTCAGTCATTTCCAGCACCGAAAGAAAATCCTGACAAGGAAGAATTTCGTACAATGTGGGTGATTGGATTagtgtttaaaaaaacagaaaactctGAAAACCTCAGTGTTGACCTTACATATGACATTCAGTCTTTTACAGATACAGTTTATAGGCAAGCAATAAACAGCAAGATGTTTGAGATGGATATGAAAATTGCTGCAATGCATGTAAAAAGAAGGCAACTTCATCAACTCCTACCTAATCATGtgcttcagaaaaagaaaaagCATTCATCAGAAGTTCGATTGACAGCTCTAAATGACAGCAGTCTAGATTTGTCTATGGATAGTGACAACAGCATGTCTGTGCCTTCTCCTACCAGTGCTATGAAGACCAGTCCATTGAATAGTTCTGGCAGCTCTCAGGGCAGAAACAGTCCTGCTCCAGCTGTAACAGCAGCATCTGTGACCAACATCCAGGCAACTGAGGTTTCTGTGCCACAAGTAAATTCCAGTGAAAGCTCAGGGGGTACTTCAAGTGAAAGCATTCCTCAAACTGCCACGCAGCCAGCCATTTCTCCACCACCAAAGCCTACGGTCTCCAGAGTTGTTTCCTCAACACGTCTGGTAAACCAACCACCAAGACCTTCAGGAAACACAGCAACAAAAGTTCCTAATCCTATAGTAGGAGTCAAAAGGACATCTTCACCTCATAAAGAAGAGAGTcccaagaaaaccaaaacagaGGAGgaTGAGACAAGTGAAGATGCCAACTGTCTTGATTTGATTGAACATGATAAACAGGAAACTAAGAAAACATCCAGTACAGACCTTTCAGATATCCCTGCTCTCCCTGCAAATCCTATTCCTGTTATCAAGAATTCAATAAAACTGAGATTGAACCGGTAAAAACAACCTCAGGGGTCCATAAACAATATCTGCCAACTCAACCTGTTGTCTTCTAATGCTAAAAAGGAGAATGGAGGGTGCAAGactagacatgactgaaaatggatTTAGGTTTATTTGGTGAACCTCCCTTACTGGGCTAATCAGCACTTGATCGGAAGTCCAGGTTAGTATGTGAAGCCAGGAGTACTATTAGTAATGTGTTAGCAACAGTTGCATTAACTATTTCAAAGGATTActgcctttaaaagaaaaaaaaagaggaaataaacctCAAGTTATATTTGTATCCATATTTAACATCTGATTGGATTTCTGTTTGATGCATTGTTTGAAAAATTTGCAATACAAACTGGCATAAGAATTCCTTATATTGATGATGcacttttatgtattttttattagAAAGTAGAACTAATTTTAGATCTTGAGCttgatgcatttttattttttcctgaagttTCTTCATCATTATTCTATAAATTGGATAACATTGTACAGTGGTTATACTATTGTACTTGAGACAAATGATAAGGGTACATCTAGTTCAGTCCCATTGAAGTAGCCATAACccttaaaaatgaaatgttatatctttggggtatgtgacatattaaaagaataattgggaaatagttggtTTTGAATGGGACACGATTAAGAAGTagtatattggttttatttataaagttttatagTGCATACAAATCAGCGGTCAAACAAACaaatccttttttcctttgagCTAACAAAGTTCTGTTCTCTTTCCttcaatcttttctcttttattcccttttttcagTTTGTATGCACACAATAGGGACaatttcataaaaaaattaatgccaGTATTTTCTTAAGCCATGATGTAAAACAAACCACCCTGTGGCCACATGGCACAAAACACCAAATTTTGGTCTTATATGCTTCAAACTTTTGGGTGACTAAGTGGTGCCTGTAAAAGCATAACATCTCTTGGGATGGCCATTTGATCACTAATATAAAGTTTTGTACGTACACTCCATAGATTTCCTGCTGCAGCCAAGTAAAACATTTCAAATTTTGAACATAAAGGCAAAGCTATTTTctccaagaatttaaaaactaatttttatttttagatggcTCACCAAAAATTTGTCAATAAATTTTAGATAGAAAAaaagcatactttaaaaaatcatttctagcAAGCACTTGACATCTAGTCAGCTCTCTTtactccttttttgttttattcttcagTCCTATCAAAAAGATTTAGGAGcttctttctttaaaaggaatttttaaatccttcctgattGCAACAGAAATTACCAGTATTTAGAAAATGTGAGGGATACCAGATGTAGATAGCAAACTTAAACTTAGTTACTTTTTCTtaatctggggggaaaaaaaagcaaaaccaacaaaaaccttCCCATATTTTCTGATTAGCATGTTTTATGAATCCCCCATTGTGCTCCATCTTATTACATGTGCATTTTTCATGTTAAACTGCAATTACTTACACTCTTCCACTGtccttctaaattaattttataaagttggAGTGTAGTTTCTTTTTCCCCTTAGGCTATGCAGTAATTGAGGCTTTCTTTTCACCATTTCTTTAAGATGTCTAGTatacaatatttctatttccCTTATCTCCTGCCCTGTGCAGCCACCTTGCCCTCCCTTTCTACCACCTATGAAAAGATGATTATACTAACAGTTGAAGCGTACAAGGTGTCTGTGTATTTTGTGTAGCTATGGAGTTTAGATCGAAATTGCCAGGCACAAATTTAGTCTTGTCATTTTGTTTAcacattggggaaaataaaattcagtttaTTAAACGTTTCATGTAACTGCACCCAAGTTTTTCCAAGCAGGAAACTTGGAATTTTTCTGTATAGTGACTTTTTAATTCTAGTTTTCATAATCTGGAGATCAGACTGTTGCTTTCGCATGATGTACGTAGTGTCTCATGACTGGAGTTtgctttgttttatagtatctGTACTCCTTGTATTTTTCAAGAGCTATTTTGTAAACAGATGATGTATTTCTCCAttgaaaacacaataaaaaacAGCACAATCCCA