RCPedia: Genes

Summary

Gene Name	SBNO1	Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie	Equus caballus
Full Name	strawberry notch homolog 1
Also known as	-
Coordinate	chr8:25743908-25796075
Strand	-
Gene summary	N/A

Retrocopy(s) from SBNO1

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
SBNO1P1	chr4:30497515-30499154	-	Intergenic	N/A	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_005612641.3
ATGGTGGAGCCAGGGCAAGATTTACTGCTTGCTGCTTTGAGTGAAAGTGGAATTAGTCCGAATGACCTCTTTGATATCGATGGTGGAGACGCAGGACTTGCCACTCCAACACCTACCCCTCCGGTTCAGCAGTCAGTGCCACTTAGTGCGCTAGAACTAGGCTTGGAGACTGAAGCAGCAGTTCCTGTTAAACAAGAACCAGAGACGGTACCCACTCCAGCACTATTAAATGTTAGGCAGCCTCCATCTACGACAACGTTTGTGCTGAATCAAATAAATCAGCTTCCGACCTTGGGATCTACAATTGTAATGACTAAAACACCACCTGTAACAACGAATCGGCAAACCATTACTTTAACAAAGTTTATCCAGACTACTGCAAACACACGCCCTTCAGTCTCAGCACCAGCAGTACGAAATGCCATGACCTCTGCACCTTCAAAAGACCAGGTTCAACTGAAGGACCTACTAAAAAATAATAGTCTGAATGAACTCATGAAACTGAAGCCACCGGCTAATATTGCTCAACCAGTTGCAACAGCAGCCACTGATGTAAGCAATGGTACAGTAAAGAAAGAGTCTTCTAATAAAGAAGTAGCAAGAATATGGATAAATGACATGAAGATGAGAAGTTTTTCCCCGACCATGAAGGTCCCTGTTGTGAaagaggaagatgaaccagaggaagaagatgaagaagaaatgGGCCATGCGGAAACCTATGCAGAGTATATGCCAATAAAATTAAAAATTGGCCTGCGTCACCCAGATGCTGTTGTGGAAACTAGTTCTTTATCCAGCGTTACTCCTCCTGATGTTTGGTACAAAACATCCATTTCTGAAGAAACCATTGATAATGGCTGGTTGTCAGCATTACAGCTTGAGGCAATTACATATGCTGCCCAGCAACATGAAACATTCCTACCTAATGGAGATCGTGCTGGCTTCTTAATAGGTGATGGTGCCGGTGTAGGAAAAGGAAGAACGATAGCAGGGATCATCTATGAAAATTATTTGTTGAGTAGAAAAAGAGCATTGTGGTTCAGTGTTTCAAATGATTTGAAGTATGATGCTGAAAGAGATTTGAGGGATATTGGAGCAAAAAACATTTTGGTCCATTCATTAAATAAGTTTAAATATGGAAAAATTTCTTCCAAGCATAATGGGAGCGTGAAAAAGGGTGTTATTTTTGCTACATATTCTTCCCTCATTGGTGAAAGTCAGTCTGGCGGTAAATATAAAACTAGGTTAAAACAGCTTCTACATTGGTGCGGGGATGACTTCGATGGAGTGATAGTGTTTGATGAATGTCATAAAGCAAAAAACCTATGTCCTGTTGGTTCTTCAAAGCCAACCAAGACAGGCTTAGCAGTTTTAGAGCTTCAGAACAAATTGCCAAAAGCCAGAGTTGTTTATGCTAGTGCCACTGGTGCTTCTGAACCACGAAACATGGCCTATATGAACCGTCTTGGAATATGGGGCGAGGGAACTCCATTTAGAGAATTCAGTGATTTTATTCAAGCAGTAGAGCGGAGAGGTGTTGGTGCCATGGAAATAGTTGCTATGGATATGAAGCTTAGAGGAATGTACATTGCTCGACAGCTGAGCTTTACTGGAGTGACCTTCAAAATTGAGGAAGTTCTTCTTTCTCAGAGCTATGTTAAAATGTATAACAAAGCAGTCAAACTGTGGGTCATTGCCCGAGAGCGGTTTCAGCAAGCTGCCGATCTGATCGATGCTGAACAAAGAATGAAGAAATCCATGTGGGGTCAGTTCTGGTCTGCTCACCAGAGATTTTTCAAATACTTGTGCATAGCATCCAAAGTTAAAAGGGTTGTGCAGCTAGCTCGTGAAGAAATCAAGAATGGAAAATGTGTTGTAATTGGTCTGCAGTCTACGGGAGAAGCTAGAACATTAGAAGCCTTGGAAGAGGGTGGAGGAGAATTGAATGATTTTGTTTCAACTGCCAAAGGAGTGTTGCAGTCACTCATTGAAAAACACTTCCCTGCTCCAGACAGGAAGAAACTTTATAGTTTACTAGGAATCGATTTGACAGCTCCAAGTAACAACAGTTCACCAAGAGATAGTCCTTGTAAAGAAAATAAAATAAAGAAGCGGAAAGGTGAAGAAATAACTCGAGAAGCCAAAAAAGCACGAAAATTAGGTGGCCTTACCGGTAGCAGTTCTGATGATAGTGGAAGTGAATCTGATGCCTCTGATAATGAAGAAAGTGACTACGAGAGCTCTAAAAACATGAGTTCTGGAGATGACGATGATTTCAACCCATTTAGAGATGAGTCTAGTGAGGATGATGAAGATGATCCTTGGTTAATCAGAAAAGACCACaagaaaaacaaagataaaaaaaaaaagaaaaGTATAGATCCAGATTCTATTCAAAGTGCCTTATTAGCATCAGGTCTTGGATCAAAACGACCTAGTTTTTCATCTACACCAGTTATTTCACCTGCTCCTAACAGTGTACCAGCTAACAGTAACACCAACAGTAGCAGTAGCCTTATAACAAGTCAGGACGCCGTGGAAAGGGCGCAGCACATGAAGAAAGACCTTCTTGAGAAACTAGAAAAATTAGCTGAAGACCTTCCTCCTAATACCCTGGATGAACTTATTGATGAACTTGGTGGCCCTGAGAATGTAGCTGAGATGACTGGCCGCAAGGGGAGGGTTGTAAGCAATGATGATGGAAGCATATCTTATGAGTCAAGATCTGAACTTGATGTCCCTGTGGAAATACTAAATATCACGGAAAAACAAAGATTTATGGATGGCGATAAGAATATTGCTATCATCTCAGAAGCTGCCAGCTCTGGTATTTCGTTACAAGCAGATCGGAGAGCTAAAAATCAAAGGCGAAGAGTACACATGACTTTGGAATTACCCTGGAGTGCTGATAGAGCAATTCAGCAATTTGGACGAACTCATAGATCTAACCAAGTTACTGCTCCCGAATATGTCTTTCTGATTTCCGAATTGGCAGGAGAGCAAAGATTTGCATCTATTGTTGCTAAAAGACTTGAAAGTTTGGGGGCGCTTACACATGGTGACAGAAGAGCAACAGAATCCAGAGATCTGAGCAGGTTTAACTTTGATAATAAGTATGGAAGAAATGCTTTAGAAATTGTCATGAAATCCATTGTAAACCTAGATTCACCTATGGTGTCACCACCTCCAGACTATCCTGGAGAATTCTTTAAAGATGTTCGACAAGGACTGATAGGAGTTGGCCTGATAAATGTAGAAGATCGCTCGGGAATCCTTACTTTAGATAAAGATTATAACAACATAGGAAAATTCTTGAATAGAATTTTGGGCATGGAAGTGCATCAGCAGAATGCATTATTTCAGTATTTTGCAGACACACTCACTGCAGTTGTTCAAAATGCAAAAAAAAATGGGAGATATGATATGGGAATCTTAGATCTTGGATCAGGGGATGAAAAAGTAAGGAAAAGTGATGTTAAGAAGTTTCTGACTCCAGGATATTCAACCTCTGGCCATGTAGAGTTATACACGATTAGTGTAGAGAGGGGCATGTCCTGGGAGGAAGCTACCAAGATTTGGGCCGAGCTGACAGGACCAGATGATGGCTTTTACTTGTCATTGCAAATAAGAAACAACAAGAAAACTGCTATCTTAGTTAAAGAAGTGAACCCTAAAAAGAAGCTTTTCTTAGTTTATAGACCAAATACTGGGAAACAGCTCAAATTAGAAATTTATGCTGATCTAAAAAAGAAATATAAGAAGGTAGTATCTGATGATGCCCTGGTCCATTGGTTAGATCAGTATAATTCATCTGCAGATACTTGTACTCATGCTTATTGGCGTGGCAATTGCAAAAAAGCAAGTTTGGGATTGGTTTGTGAAATAGGTCTTCGTTGCCGCACATATTATGTATTATGTGGCTCAGTACTGAGTGTCTGGACAAAAGTTGAGGGTGTTTTAGCATCTGTCAGTGGCACAAACGTGAAAATGCAGATAGTTCGGCTAAGAACGGAGGATGGACAGCGGATTGTAGGTTTGATCATTCCTGCAAATTGTGTCTCTCCTCTTGTAAATCTCCTGTCAACTTCAGACCAGTCTCAACAGCTTGCTGTCCAACAGAAACAGCTCTGGCAGCAGCGTCACCCCCAGAGCATCGCCAACTTGAGCAACGCATAAGAACAGACAGGTTTCAACATGGATGTATCTGAAATGCTGTTGAAGCATATCATTTGCATAAAAATCAGGGACAGTTTCCAAAGAATTATAATTTTTTTCAGTTGTGCTCTCTCTAGTTAATTTTTTGGGGAATAAGGACAAACCTGGAATAGATAGCAAAACTGAAAGTCAGCGGTGCCGATGGTGGCCCACATGTCTTCCCTTTGCTTCCCCATGGTACTTCCCATCTGCTTTCACTCTGGGCGAGCAGAGGACTCTGTGTGTGTGCGTGTGTGTCAGTCTGTTTGTTTACTTCTGAGTTTCTTAAAAGCTACAAACCACAATTGGTTTAAAAATGCTTGGAACTTCCCAAACTGGCTTTACTTTTACGTTATCCAGTGCTCAGGGTTAACGCAGTCCATCCATGCCATTGCTGTGGGAGTTATCCCCAGATGCATGTGTTTGAGTCTATAAATATAGCAAATATATATTGATTTCTTTTTCCAACTTAATAATAGGTTTATTAAAGCATGAAATGAAAGTTGCGTATCCTGCATTCAGGTTCTTTTCTGGTTTTTGTTCTGACAGTGCATGTCTCTGAAAGCATGCGTAAACAAGATTAACACAGAAGTCAAGTGACAGAAACGTGTGTCGATGTACAGCATTGGTTATTGCATTTTTATAGTGTTTATACCTGGGTGTTGCTTCTAACCCTGCGAGTCCCTTTCCCCCCTACCTCCCCATTCTCCTTGCCCCCGGTTTCTTGTCAAGGTAATGAGTACATACTTTTTTTTGTGATAAAACTCTTAAAAGTTAATTTTAACATATTAATAGTATTCCTA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