Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name SUB1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Pongo abelii
Full Name N/A
Also known as RPO2TC1
Coordinate chr5:33166187-33184716
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from SUB1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SUB1P4 chr16:4901740-4902419 - Intragenic
Intragenic
 ENSPPYG00000041503 UCSC
SUB1P1 chr8:7880147-7883422 - Intergenic
 N/A UCSC
SUB1P2 chr14:55847743-55847980 + Intergenic
 N/A UCSC
SUB1P3 chr16:14202559-14203054 + Intragenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001133102.1
CGAGCGAACGAGCAAGAGGGTGTTCGACTGCTAGAGCCGAGCGAAGCGATGCCTAAATCAAAGGAACTTGTTTCTTCAAGCTCTTCTGGCAGTGATTCTGACAGTGAGGTTGACAAAAAGTTAAAGAGGAAAAAGCAAGTTGCTCCAGAAAAACCTGTAAAGAAGCAAAAGACAGGTGAAACTTCGAGAGCTCTGTCATCTTCTAAACAGAGCAGCAGCAGCAGAGATGATAACATGTTTCAGATTGGGAAAATGAGGTACGTTAGTGTTCGCGATTTTAAAGGCAAAGTGCTAATTGATATTAGAGAATATTGGATGGATCCTGAAGGTGAAATGAAACCAGGAAGAAAAGGTATTTCTTTAAATCCAGAACAATGGAGCCAGCTGAAGGAACAGATTTCTGACATTGATGATGCAGTAAGAAAACTGTAAAATTCGAGCCATATAAATAAAACCTGTACTGTTCTAGTTGTTTTAATCTGTCTTTTTACATTGGCTTTTGTTTTCTAAATGTTCTCCAAGCTATTGTATGTTTGGATTGCAGAAGAATTTGTAAGATGAATACTTTTTTTTAATGTGCATTATTAAAAATATTGAGTGAAGCTAATTGTCAGCTTTATTAAAGATTGCTTTGTGTGCCCACCACCTAGTGTAAAATAAAATCAAGTAATACAATCTTAACTGTTGTGGCCTTTTTTGATCATAAGAGTTGGTACTGTTTAAGGCCAAAAGTAACAGTTTTTATAGATCTTTTAGTTTCAACTCAGCTTTTACAATAAAAAGGATTTGTATTGCATTGAGTTTATAAACTTTTGGTTTGTGAACTTCATATTTGATCTTTTCTCTACCAATCAAATGTCTAGGCTTGTTTGACTTCAACCCCAATGGTTTTTCACTCTTTTTATTTTGTTTACTTCATTTTCCTTTAATAACTTAATCTCTTCATGTTCAGTTTTTACTTCACTCTTCATTCTTTTCTTTGATTATGGTATGCTTATTTGGAAAGTCAGTGAAACTGTCAAAATGTTATCTCAGTAAGATACTTATATGAGAACTACAATCACCGAATCTACTGTATTCAATATTAGCAGATCTAATTTGATAAACAACATGGCTTGTGTGAAAACTGAGCAGGTGTTTGTTTACCCATAGTGTTCTGTGTAGTTATTGCTTAGTCTGCAGAAAATAATGACTTAGATGAGATGTCTGACTTGCTTTCACTTATTAAGCATGTTCACCATGGGATGATGTCTGTAACATCAGATATTGTTCAACTAGACTAGGATTTAATAAAAATTGTGAAAGCTTACTGGCCTAACATTTTATTTTATAATATTGAGTATGAATTATATGTAGCCAGAGATGTCATTAAGCTTTACTGTTACAGTAGGTAATATGGTTAGTTTGTAGGGGAAAGAGCATATGAGCACATGCTTGTGTATTTTGGCCTTTGCCCCAGTAGAACAGACCAATGGCATTCTAGATTTGATGATACTAAGTTTTAGCAGACACTAGTAAGTGGTTTGTACCATACTGATGAAGCAGACAGATTGAGGCACAGATTTTAGTGGCTTTGTGGCAATAAGTAGGGCATGGTGTGCCTTAGGAAAAGAATGTTTATAAAGGGAATTATAACTGAAATTAAAGGCGGCGGCAGTGAAGAGGAAATAATTCTCTTCTATCTAAATGATATACACATGATATTTTGAGATTTTTATAACAGCAGTGGAACACAATTCTAGGTAGAGTAGAAAAAGGAAAGGTTTAAAGACATATGAAAGATTCTTGTTGACAAATTATTTTTGGTAGCAAATCTCAATGGTTACCTGCTATTAAGGGCTGCCATATTAGAGTTTTGCACTATTTTGCTACCAAGTTTGATTCGTACATCTAAAACATTTTGTAGTAGCTTGTCAAGGACTTAATTTGAAAATCATTTGCCAGGCCACATAGTTATCAATTTTTTTTTTCTAGCAGCTATTCTGTTGTATTTCTAAACCATTTTTTTGATGACTTTTTAAAGTTTGCCAGGCCACATAGTTATCAATTTTTTTTTTTTCTAGGAGCTATTCTGTTGTATTTCTAAACCATTTTTTAGATGACGTTTTAAAGTATATTTAGCAGTAACCTTAAGAGGTTCAAAGTGGTAAATCTCTTGTAATTTAGCCTTCATCAAATAATAGGTACCAGTGTATTAAAAATACGTATTTTTTTTTTTgcagccccttgaaccagagtaggttcagagaaactccCAAAATTTGTACTTCAGACACATCATGCTTGATTGGTAACTTCCCTCCTTTTTTGGGGAACATGTTTGTGTCCTGTTAACTTAATTGGGTAGATTTTTAAATATTTCTTATTTTTGGCACACAGAAAGGGTAGTTAGAGTACAGAACTTTGATTTTTGGTGTAGATGCAGAGGGAATGATGGGTAAATTTCCTAGGTTTATATGAATTTAGGGGGTGTATGCATTTTGAAACAATCTACTAACAGATGGTGCTGAAATCTATTACCTACGTGTTTTCTAGTTTTTTAGCATTATGTTAATGAAGCCTCCATATAAGGAGTGTTTCTCTGGCACAGTTGGTAAGTTGACTGCTAACTTCATTTAAATGTGTTACTGGATATGCAGTATACTGAAATTATTAATCAGTTTGTGTATAGGAAAAGAACTGGGTTAAAAGAAGCAAATTGTTCTGAAAAGAAAGTATAGATTAATTTTGTTTTCTGTTTAAATTTTATCTCCTTGGTAAAGATTTTTTTCTCCTAGGCAGAAAACTTGGCATTTTTAGGCATAGATACCTTACCTTACCATGCCAAAATGAATTTAATTCCAGTACTCAGGTTTTTCCCTTTAACAGACTCTATGTGTATCAGGGCTTTCTAATGGGTTTTTCCTCTTAGTTTTTAAAATGTGAGCAGCATTTGACCAATTTCCAGTGCTCTTAGCATTTTACTTAAAAGAACAACCACTACAAAAGAAAATCTTTGTAATTTGATTGTCTTTTGCTTTGCTTCATTAATGCCTAAGAACTTAAGAATACTCCTACCTCATTAGCTACTCAAGATGCTGTGACGATCAAATCTATTCTACATAATGTGTTTAGAAACAAAGACTTGGGTGAAAAATGAAATAAGTATATTCTGACTTGGCTATTGAGGGGAAAATTCAGTATTAAGTGTTCCTCACAAGAGATATGTTAGCAGAATACTGTAAAAGTTTGAAATTTTTAAAAAGTACTTAAATTTAGGTATCCTGAAATTCTTTGCAGTTCATTTTTTATGGCAGTTAATCCAGTGAAACACTCAAAAGTTTTTTCTTTTTTTTTAAAGTGGTGTTTTTCCAGATGAACTCTAGGGTGAACATTCACATAATCACAAATATGTAATTCTGTAATTGTGGAATGCTTGTATGCTTTGTTTTCGTACATCTTCCATGGAGATGTCTGAATATAATACTCCATCTGTGAATATTTTAAATGTTGAAATAAAAGTAAGAAATG