Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Cox16
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr6) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name cytochrome c oxidase assembly factor COX16
Also known as -
Coordinate chr6:105195387-105214366
Strand -
Gene summary Predicted to be involved in mitochondrial cytochrome c oxidase assembly. Predicted to be integral component of mitochondrial inner membrane. Orthologous to human COX16 (cytochrome c oxidase assembly factor COX16). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Cox16

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Cox16P1 chr2:141553612-141553949 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_006240298.3
GACTTCCGGGGGAGGGAGGAAGCGGGAGTATGTTAAGACTAATGGATTTAGTTTCAATCATGGAGGTCTGTCAGGTGAGGACCTAGCTCCCAAAGCCAGCGCTGAGTCTACAACTTCTCCTAAGAGGTGTTCCGGCCGGCGTTGGGGTCTCTGCGGAGGCGGCTAAATCGGCCGCAGTTTCTGCCATGGTTGCGCCCGCTGTGTTGCGCGCTCTGCGTAAGAACAAGACCCTTCGCTATGGAGTTCCCATGTTGTTGCTGGTTGTTGGTGGTTCTTTTGGTCTTCGCGAATTTTCACAAATCCGATATGATGCTGTGACAATTAAGATTGATCCTGAATTGGAGAAAAAATTGAAAGTGAATAAAATAACTTTAGAGTCAGAGTATGAGttagctagaacatggattatggacttccactttgtttctggcaactgcttggaccatggacatcaatataacctctggtggtagtacagaccacagacgtcaacatggacctcttttccagtatgggccacggacactatcatggttcttggtggtagcacaggccccagatatcaatgtggcctctgggccataggccatagatactcatatatcttggtaagcagtccagtccatgtacatcacctcagtttcaagcaggagtacagaccaccagcatccacatggcctccaatggtaacacagtcgatgggcatcaacatgttcttcgtgggatatggacttctatacggtttctgatgaaaccttggactacagacatccacatggcttctgttagcagcatggacaacaaacctacacatgctctccaacagcagctgagaccatagatattaatatggctcttggccaaagcacggaccataggcaccttcatggacttcagaggcagcataggtcctagatcaatattgtcaaccaacagcCTGAGTTTCCCTACCTATCTATTCCTGAGAATGGGATCTGTCCTCATTTCCCTGGAATCTTTCCTTTTTTTCCCCCTAGTTTTGGGACTCCCCCAAATAACAGGACCATGGACCTAAAAGTTTCAAATGTCCATCcatataactttgatttttgaacggaaccatatggcttcggaaccactctacttattttttcctgacttataacctccctttcctgatatctttgcatcagtataggatgaggggtgccagaaattgctgtcctttacaatataaaggaggatttaagtagttcttttcataaagtgaaattactcgtttgttttggggagtatctgttgttctttcccccaaaagtgactgcaagttttgttttgttttgttttgtttgccaaggttcattttctgctcataatgagacaaagcattagtaaaAAGtgtagacttacatttttcaaaatgtactttagtaagtgtacttaaaagttataacctttcttctagcccaccacccaccagaggtagtggaaaggaaaggttagtagggcaaaggagaacgtggacctgtttagaaatagttctttggagtgaatccaatctatattatcaaggagtcagcagttcagttcacacaaatcagcagcagtagctcgatcaactcataaacaccattcacgaatcagcaatgggagtttgatccagaagaaaccatgaggttctgccaattggcctggggccatgaaattagcaagaagctgatggaacagaaccagaagttctttggtgcatttctctctatgaagtcatgaaaaacagtggtcagcaaagagtggcaaggcaaaccaataccacacagtgttctccactgtctgttgggttatatttatgcccttttcaaacatcacatgttttctcaagtgtccgctgtagcaaaacatcacatgcctccttttcaggtagcttccagaaaaacaccatgtttgtgttctcagccaaacatcctcccatgtgtccgcttcagcaaaaacataagatagcccccccatcttatgacacagctgactctccaaagaagctagaacatttcactttaTGtccccctttctgtttaaaaaaaaatacctttttaaaaacaatattaatctatacttaatagaaacaatcataagaaccataaaactagaactttacaaaacaccttaaacaatcagcctatgtgcatgatagtcaaacaacaaaacgttaaatttctatcagtatacaataattaaccaaaacaacctaccatcctagatagtaacaaccataacacatcaaatgaacaaagcaatcccaacttaaaggacaatagtacttttatacatacttgatttttgctgaattggagtgatgatttttttttgtttgtttgttttgagccagaggaaatgggaatggttagttttaaaaaagctagcagtttttgcattatccagtctcagtgttgtctctcaagtcggtgttgtttgtcaagaccctgtgttgtctgtctagtctctgtattctgtcaagtccgtgtgatcgatcatttgggttagcccttttgaagttggtttgcacgtatgttttggagaaattagtaataaagacagtcagagagtgaatcacttgggctatttgtgaagacattcatgtctcagctgataagaggttttccctggtaagacctaatttttataagttttgttggtaaccatattttttcattccctctagatacataaacataaccatgtcttcatcttaaaaccactgcaggattccaccataaagatgttagcacatctttatagtatattgtttggcctagttcctcagttttttgttttgttttgtttttggtaacccagtgtctctcagctgctgttgttctttttttttttttttttaaccaacattaacaaagcattatttgttcctggggttttttactctccctttttgtttaataagcatctcttgtaaggtataattggctctttctataactgcttgtcctgtggtattatgtgatattccagtaatctcgtttatattgtaatatgcaaagaattgcttcatcttattggatacacatgggggagaattgtcaggttgaattatacaggtatccccataattgcccttatttcgaataatgtgtaactacacagtcagtcttttcagaacttaaagcagttgcccattgaaaccctaagtatttgtcaatggtatggtgtatatacctttgttttccaaattctgtaaaatgggaaacatccatctgccaaatgtcattttttggtacctcctggggttgtgatcagcaggtaatagagtttggttgtatagagaacatatagcacatttttattattattttttggtttgttgcttaatgatggaaacatttttaaaacttttaaaacaattttgttaatatgtttttcatggaaattggaagctttttagcataatttttaaaattagtatttttttagttaatggaccgggcaaacctgtatgagagcaagtatgagtaatgtataatagataatttttacttttgatgacttgttttaattgtataaataacaaggttaaatttgagttatcgggtacaaatttaattatctctatatgtaaaacaactcctttttgcatataaagaattagtaattaaagttaagagattcaggataatctaataataccgtaagtattacatataattttgatttttgaactgatgtatatggaattttgatcaccttattttgtctgacttgcaatctatcatacccattttgtatgtatcagtataaaatgttggtgccttgggaattggtgttttttttttttttttacagtatgtggacaaatgtcttttttataaactgtatacatttactttttgaataattgttagtaattttacccaaggacttgttatcagttctttgtcaatttttattgatcacccataatgacataatcttataatttgtaagagtaactacaattttggccggatctgtttctgataattaaaataattttattttacctttta