Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name PLA2G12A
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Callithrix jacchus
Full Name N/A
Also known as CASP6
Coordinate chr3:86263916-86312849
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PLA2G12A

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PLA2G12AP1 chr7:24582714-24583847 - Intragenic
 N/A UCSC
PLA2G12AP2 chr20:13396570-13397685 + Intergenic
 N/A UCSC
PLA2G12AP3 chr20:1873033-1873551 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_035293149.1
CCGGCGCAGGCGCACAGGGGACGGTCGCTGCCCATGGGGAGCGGAAGCGTCTCTGCGACGGCGCTGTCTCTCAGAGGCGGGTCCAGTAAAGCCAGCGAGGCCCTGCTGGCCATCGGGGAAGGAGGCGTGGATATGGAGCCGGCGGCTGCAAAGCCCCGGGCCCGCGCCGCTGCCTAGCGCGTCCCGGGGGTTCCGTGGGGACGCGCCTGCCGCCGCAGCTCCGGGACCTGTAGAACCCCGCGCTGCGCGGATGGCCCTGCTCCCGCTCCCCGCGCTCATCCTGCTCCTCCTCACGGCCGCTGTTGTCAGGTGCCAGGAGCAGGCCCAGACCACCGACTGGAGGGCCACCCTGAAGACCATCCGTAACGGCGTTCACAAGATAGACACGTACCTGAACGCCGCCTTGGACCTCTTGGGAGGCGAGGATGGTCTCTGCCAGTATAAATGCAGTGACGgaTCTAAGCCTTTCCCACGTTATGGTTATAAACCCTCCCCACCGAATGGATGTGGCTCTCCACTGTTTGGTGTTCATCTTAATATTGGTATCCCTTCCCTGACAAAATGCTGCAACCAACACGATAGGTGCTATGAGACCTGTGGCAAAAGCAAGAATGACTGCGACGAGGAGTTCCAGTATTGCCTCTCCAAGATCTGTCGAGATGTACAGAAAACACTAGGACTAACTCAGCATGTTCAGGCCTGTGAAACAGCAGTGGAACTCTTGTTTGACAGTGTTATACATTTAGGTTGTAAACCATATCTGGACAGCCAGCGAGCCGCATGCAGGTGTCATTATGAAGAAAAAACCGATCTTTAGGAGATGCTGACAGCTGGTGACCGAAGAAGACCGAAGAACATAACCTTTGACAAATAACTAATGTTTTTACAACATAAAACTGCCTTATTTTTGTGAAAGGATTATTTTGAGACCTTAAAATAACTTATATCTTGATCTTaaaacctcaaagaaaaaaagggagataaTAAGGGGAGGGCACGCTTGTCTTCTGAGGTATCTTCCTGGGCACTGCCCCCTTAGTATGCCAAATGTCTTGACCAGTATCAAAAGCAAGTGCTCATTAAGGGGAGAATTTTTGGAAAGAAGAATATATAACTTAGTTTTCACACctatatttaccaaaaaaagatcaaatataaaattcattataAGGTCTGTTCAACattatcttatttggaaatatgggAAAATCATCACTTACAAGTATTTGTttactacaaaattttaaatacacgTTTAAGCCTAGAAGGAAcggacttaaaaaaattttttttctctcttaattaCACATACGTAATTAAAATACAACATAATATTTGTTGTTTCTCTGTAGCCCGTTGAGCATAGAGTAAGTCACATTTCTATTAGGACTACTTACAAGGACAAGGTTTTCATTTTTCCAGTTGTAAAATTGGAACCATCTGCTGATAACCTCGTAGAGAGCAAACCCAGGATATTTAAATATCATATGCCTTGAAGGTGATGTGAATGCAATTCAGAAGTATAGCCACTCCCATTTTATGAGCTACTCACATGATAAATGTCCTATTTTGCTATAACCTTTGCCAAATTGGAGTAAAGATGGACTTGAtgagataaatgaaaagatatttaacatAATTCATCAAGGCACTATTTGCTGTTTATTTCCCAGCATTTATTCCTTATAGTAGATTTTTTAAAGACTGTAACCTTTTACTAACTGTGGTCTTACTCTAATTTGTGCTTgacactgctttttaaaaatcctttaactGGAGCCAAAGGGATGGAAAAGGCAAGACAGAAATGACTGCCTTTTACAGATCTCTTATTTACATTGAAAATTATTACCATATGTTTAGAGCAAATCCCAGAAAACTTCAGCAGCTTCTGAAGACATCTATGAATGTTGAAAACTTTTCAATCTCTTGGAATGTTGAGTTTTGTTCCTAGACTGGTCTTTGCTTACTGCTGTTGTTAACCTTTCCCTTGTGCAGGCCCTCAAGCCATGTGTAGCCTTTGGGTAACCCATGGCCAAAGGTATTAAGATGAACTGAGTTTCAAAGTCAGAGAAGGACAGCATAGGGAGAGGTggttctttgtaagtcattacaGGTAGAACagggcagaagaaaaaatattttctggagaAAGGGCCATGTTCCTCACTTTGGAGATGTGTCATTGCCAGGAACCTAATATCATCCAACTTGAATTGGTCTGCTCTATTGAGACAAGGCACATGTATGCCTTGTGGCTAATTGAGCAAACAAACTGGGATTCCATTTAAATGTTTGGAACTCTCAATTGATACTTTATTTCAAACCTTTATAAAAGGTACAGTTTTGTAAGCCATTATTAACACTTAATGcttataggctgggtgcagtggctcgcgctgtaatcccagcagtttgggaggctgaggcgggtggattacttgaggtcagcagtttgagaccagctggccaacatggcaaaatgctgtctactaaaaatacaaaaatttgccaggcgtggtggcacatgcctgtagtcacaactacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccaggaggcagaggttgcagtgtgccaagattgtgccactgcactccagcctgggcaacagagcgacactctgtcttaaaaacaacttAATGATTTATCAATATTTATTACTGAAATACTTCTCCAGGTAAGTTTAAACTTATAATGAATTCATGGATTTTCTTAGCAGCATTGGCTTTCTCAAAAGGACAAACTCAGTatctttgtaaaatataattaattcatgatcacaaattatacaaaaatcagtagaagTGGTTTTTTATattcagataaaaaaaaacttggaataattttagacttacagaaaagttgcagagATACATGAAGAGCTTCTGTGTACCACTCACTCAGTTCTCCCAGTGTTAACCTTTTATTTAACCATGAAGCATTTGTCAGAAGCTAAGAAACTAACATTGGTAATTACTGTTAATggaacttgattttatttttcagattgcactagtttttttattgtcattttccttttccaggatCCAGTCTAGGATACCACACTGAATTAGTCATCATGCCTAATCAGCCCCTGGTCGTGATAGTTCCACagtctgtctttgttttttatgaccttgacagttttgaggagtactggtcaggtGTTTTATAGAATGTAACTCAATTTGGGTTGTCTGATGTTTTCCTCAATATTAGAATGGGGTTATGGATTTTTAGGAAGAATATCAGAGGTGAAGGTCCTTCTCACTGCATCATGTCAGGAGTTATATGCTATCAGCTTGATGGTATATTAACTTTGGGCACTTGGTAAGGTAGTGTCTGTTGGTTTTCGCTGCTGAAAATTActgtttattttccctttccaACTTTGgttctttggaaaacagtcacTAAGTCCAGTCATGGGAGGTGGTGGGTGGTGAAGATTACATTCAACCTTCTAGAAATGGGAATATCCATAGATAGTACTTGGAATTTTTCTGTATAGAAAATTTGTCTCTCCCTCCCACTGTTTACATCAGTATGGactcatgtatattttatattttgggtaacacagtatttattttgttgcttacgTTGTCCAGCTTGGTTATTAGGAATCCTGTCATGCTTGGTGCCTATGTTCCTTTGATGTGCCTATCCTTTTGAATATTGagcacttccttcctttctggcactacaagattctccaggttcatcttgTATATTCACTGCCTCAGCCCTAGAATTGACCCCTGCTCCAAAgagccctggttccttttgtTGGAGAATGAtacaagaaaccaagatctgggcacTAGAGGTGCTTGTTGCTACTGGGATGTCACTCTTTGTAGCACAGTGGAGAAACATGTATGTGTATTAAtccatgcatgcatacacacttataattattatatgtgTGTACAAAGCTAAACGTGAGTTTGGACTGCCATCTTCAACTCAAAATTTGTCCCACAATTTTGTGGCATATATTTAGGTTTTAAAGttgatattttccccattgaCAGAATAAACTCATTAAAAgagcaaaaaa