Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name ATP5F1C
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_1) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_1:144948213-144966440
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from ATP5F1C

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
ATP5F1CP1 scaffold_m19_p_3:146863314-146864224 - Intergenic
 N/A UCSC
ATP5F1CP2 scaffold_m19_p_4:170534996-170536007 - Intergenic
 N/A UCSC
ATP5F1CP4 scaffold_m19_p_7:76888593-76889623 + Intergenic
 N/A UCSC
ATP5F1CP3 scaffold_m19_p_5:20228661-20229642 + Intragenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>ATP5F1C_x1
GAGGCTGAAAAAGAAAGCGGGATAGGAGTGGGCGTGGGGAAGCTCTTGCACATGCGCAGTGAGGCCTGTCTCACCGACCTTCAGCGGGGCCGTATACCACCATGTTTTCTCGGGCGGGCGTCGTAGGGGTCTCGGCCTGGGCGGTGCAGCCACAATGGATCCAAGTTCGAAATATGGCAACTCTGAAAGATATTACCAGGCGACTGAAGTCAATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAAATGGTAGCAGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAAAGGGAGCTGAAACCAGCTCGAGTGTATGGAATAGGATCTTTGGCTCTATATGAAAAGGCTGATATTAAGGGCCCTGAAGAAAAGAAGAAACACCTCCTTATCGGTGTATCCTCAGATAGAGGGCTTTGTGGTGCTATCCATTCCTCAGTCGCTAAACAGATGAAAAATGAGGTGGCTACGCTCACAGCAGCTGGGAAAGAAGTTAAGATTGTTGGAATTGGAGATAAAATCAGGGGTATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAGTTTCTGGTGACATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAACCCCCTACTTTTGGAGATGCATCAGTCATTGCCCTAGAATTACTAAATTCTGGGTATGAATTTGATGAAGGATCTATCATCTTTAATCGATTCAGGTCTGTCATCTCCTACAAAACAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCTCTTAATACTATTGCAAGTGCTGAGAGCATGAGTATCTATGATGACATTGATGCTGACGTACTGCAGAATTACCAGGAATACAGTCTGGCCAACATCATTTACTATTCTCTGAAGGAATCCACCACGAGTGAGCAAAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCGAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGACTTTGACCTTCAACCGCACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAGGAGCTGATTGAAATCATCTCTGGTGCTGCAGCTCTGTGAGTACTTGTAGATTGCCTTCCGAGAGTTTTTGTTCTCGTATCTATATGTCTGTTAGTTAACCTTTGGATGTTTAAAAGTTTTAGGATTTGTTTTGTGTGTTAAAGATGCAGTGATCAGTTTCTTAGTCTTATATCCCTACTGTTAGTATATAAAAATTTGGTGAAAATGGAATGTCTGGTTTATTATTGTCAGGCTTAGTTTCTTATTTTAGGAATCAATATATTGCTAGCTTTCACTTTCCTAAAGCATTAGGAATAGGGATGTGGATAATTCAGTATCATTTATAAAATCTCTCTTTTAAGTTTTTTTATATCAGTACCATAAGATAGCGTACCACTTTCCTCAAGAGAATATTGTTTGTGAAACCAGGATTAAGATAATGAGACTTCTATTAAAAAAATTATTAATTGCACACTCACTATATGCAGAGTATAATTGTTAATGAATGTGATCCTTGCAAGGCATTTGTTGTCTAACAGGATTAAACAATGCAGATAATTGTGATGAAGGATCAAATGTGTAGAAGTGTCTTTGACTCGCTCTTTGTCCCTTCCTACTAATTGGTCACCAAGTTCTCTAAGTTTTACTTTCTGAATAGCCCATGACTTTCCCCTTTATGCTTGTTTAATGCAGATCCTTGTCATTTCTCTCCAGAATTAAAAAATATGTATTTTGAGAGTCCTTGAAGTACCTAACCCTGTGCTAGGCACTGAGGATGTAGCAGTGACAATATTTGCCCTCAAAAAAGCTCACAGCCTTAACAGGGAGGATAGACATTATATTTGAAATTGTAGTAGAATGGAAGTCAGCAAACTGAGGCACAGAGCCAAGAATGGTTTTCTTTTACTTTATTATTtttattgatttgagggagaaacatcgatttgttgttccacttatttatgcattcattgattgtttcttgtgtgtgtcctgaccgtatgtcgaaccacaaccttggtatatctggagaacactctaaccaactgagttaccagccagggcCTGGTTTTCATATTTTTAAAGGGTTATAAAAAGagagatagtatgtgacccacaaagcctcaagtacttactgtcagccattcacagaaaaaattgctgacccAGTGACAGAGTGGTATGACGAAGATAATAGAACCCATTCTCTCATATTCCACAGAAACAGCTTCACTTGATGTATGTGTATATGAACCTATGGTTtctggccaccaacactctgtagtctagcctcttaccagtgccatttctcacttccctgaaacttgagccacactgatctacttccagttctacaaacatatcatgctctttcaccttcagagtggcacgtgtctttccctcaaatgtcattcttttctctccttgcacccttggtacttcattggactgactcctgtttatccttcctaacttagctgggggaatcctttcctccagaaagccctcttgcatagtttaggtggggtacctctctgcagcatcctgtgcttccctttatcagcacttaacattttattaggaattgcctttctgtgctcctacggcttaggagggactgactgtcttacttttgtaggcccatcacctgcacatacttcctcaataaattgtggtcaagtgaatgaaAAACATGCCATCATAAGTATATTAAGAACTGGAAGTTCAGAAGAGGGAGAAGTAATATTTTATTGATTATGTGAAAACATAGGTCCGTGTTTAAGAATTAAGGAAGGTTCATCACTAAGGTGAAATTTAAATTGGTTCTTAAGGATTGTCTCTCGAGGATAGAAACTGGGGAGAATGCTCAAGAGACACAAATAAAACCTACTGAGACCATTCTATAAGTTACTAGTTGTATCCATCGGCTTTGCTATCTTAAGGATCCTTCCTTGATGACTAACCCATCACTCAGCCTGGTCACTAATGTTTTAGTAGCATCATAGACTACTGTGCAATGTGTGGCCCTGCCACTTAATGTCTTGTTAAACTTGGTTAAGATACGCCTCTGCAACTCAATTTTGTCATCTAGAACATGGGGACTAATTCAAGGATTAAATAATTATATTACTCATTATCCTGCTTGTTATATGTCTTAATGCCAATGCTAAGCCAGTTTCTTTTTGGATGGCAAGTGTGGGAAGGCCTGAAGGAAAGACTGCATTCTGAAGGTTCAGGGGGCTGTAAGACACAGAGAACCAGGGTTCTTTTCTTGCTTTTAAAAAAGGAAAGCTAGAAATAAAGTGTTGAGGATACACCTTATGCCAAATTGCAGACTAGAGTCTTTCTAGATTAGAAATGTGGGAAACTTGACTACAAAGCAGCAAATCAACGGAAATAAGGAGCAGAAGATTAAGACATAAAACTGAGAATAAAAGGACTCCAATAATTGGAAATTATTAAATTGTCACCCTTTAGAAAGGCCTTCTACATCCTTTGTAAAAAGTCAGCTCTGgccctgatcagtatggcttgttggttgggtgttgtcctgcaaagcaaaaggtcgctggtttgattcctggtcagggcacatgggcacctccagttggaggtgcaccagaggcaactgatctatgtttctcatatagatgtttctttatttgtttttctccttcccttcccctctctttaaaaataaacaaTCTTTTTAAAAAAGGTAGCTCTATAGTCCCAAGGTTGGATTGTTTTTATGAGTGGACTTGCATGCTTTCTAACATATCAGTTTATTCTGGTTAAAGACTTTAATGATGTTTAACACAAACACATTTGGCTCTTTAGTAACAAAATAAAAAGCATGAATAAACCACAATATTTGAGGTGTCAAATATTAGTTGCCAGCCTAAAATTTATAATATATTGTATGCTATTTATAGGAAAAGTGATTTCAATTATACTTTCAGTCTTGACTACTTGCATGAATATGGCTTTATTGCTTCTAACCAGATTGAGATCTGTAACTTTTTTTATATACTGATTGACTCTGTTTTAAAGGAGTATTTTGGTAAGTATGTGATATTCTCAAGGTAACAAATAAGTAAACAGACTTCTTTAGTTGGAAATTGTACATGAATTAACTAGCATGGATTGCCCTTTGACCAGCTTGTTTGTGTTTGTCTTTTTCTTCTAATATAATAACCAGGGATTAATGAAAATCGAGTTTCGTCCTCAGACAAGAGGTAAAGTGGTAATATTTCACACACTCTCCCCATACTCCTTTCAGAAAATTTACCCGCCGTTAGAGCTGAAGATAATTTAGCAGCGGTGACACTGATGAGAGGTTTAGATTGCTAGGCCTGTTTACAGTAGCAGCCAACTTATGGGAGCACATGGGTGGGTAATGCTGGGGAGCTAGTTTGAGATATTAAATATAGATTGGGGGAAAGTGATGGATCTCAAGCTtaaacaacagcaagattctcatctttttatgtgttcatgccattaggatatcacattctgaaaactctgtcagatactctcaagaataagactgaagtagacaaataacattattatggaagtggtcttgccctcatggatttcatgaacgggtccccagaccaaaatttgagaaccactAGTGTAGAGTAACATGTAAACTCAGTTCTTTAACCCCCACTTTTAAATATGAGTCATCTCTTTCAAAGTTTTTATAGGCTGCTATTATAACATTTATTAAAATAATGCCATGGGTTAATAGAAACAACAAAGAACCAAAGAATTAAAATACAAGCTATGTTAAATCCCAACTAAAACCCCAAAGTATCTAATGTGTTCATTCATAAGCTAATTAAAAAGCCCAAGAAAGACAAGACACCCAATATAATACTCAAAAACAATTGGCAATTTTCAGTTATCAAAAGAGTGGATTTTGCATTTTATATTCTTTTCTCAAGAAAAAATTTTTTGAGTGTTGTATAACATATATATATAAAGATACAAAAATACATTATAAACTTCTAACAATGGCTGTAGGTACATTACCTTGCATGTTTCTCATAGGCCATTGGTTGGTTATGGTACGTGACAAAAACATATGTCAGCTGTATGGTAACATACAAGCAACACTCCCTGTATTATCTCTTGATGTCATTATTTTTTCCAAAAATACTGCTTAATTTTTATTCCATACTTTGTTTTTCAGGTAAAGAAGAAAAATTCAGCCAGCTGATTTGTTTTTAGCTTAACTGCTGTCCTGGTCAGAAGAAATTGTTGGTCCATTGTTTAAATTACCAAAGACAGCAAGATATTTGTAAATTATCTTACAATAAACAGCTTAC
>ATP5F1C_x3
ACCACCATGTTTTCTCGGGCGGGCGTCGTAGGGGTCTCGGCCTGGGCGGTGCAGCCACAATGGTATGGCAGCTTGCGGATCCAAGTTCGAAATATGGCAACTCTGAAAGATATTACCAGGCGACTGAAGTCAATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAAATGGTAGCAGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAAAGGGAGCTGAAACCAGCTCGAGTGTATGGAATAGGATCTTTGGCTCTATATGAAAAGGCTGATATTAAGGGCCCTGAAGAAAAGAAGAAACACCTCCTTATCGGTGTATCCTCAGATAGAGGGCTTTGTGGTGCTATCCATTCCTCAGTCGCTAAACAGATGAAAAATGAGGTGGCTACGCTCACAGCAGCTGGGAAAGAAGTTAAGATTGTTGGAATTGGAGATAAAATCAGGGGTATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAGTTTCTGGTGACATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAACCCCCTACTTTTGGAGATGCATCAGTCATTGCCCTAGAATTACTAAATTCTGGGTATGAATTTGATGAAGGATCTATCATCTTTAATCGATTCAGGTCTGTCATCTCCTACAAAACAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCTCTTAATACTATTGCAAGTGCTGAGAGCATGAGTATCTATGATGACATTGATGCTGACGTACTGCAGAATTACCAGGAATACAGTCTGGCCAACATCATTTACTATTCTCTGAAGGAATCCACCACGAGTGAGCAAAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCGAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGACTTTGACCTTCAACCGCACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAGGAGCTGATTGAAATCATCTCTGGTGCTGCAGCTCTGTGAGTACTTGTAGATTGCCTTCCGAGAGTTTTTGTTCTCGTATCTATATGTCTGTTAGTTAACCTTTGGATGTTTAAAAGTTTTAGGATTTGTTTTGTGTGTTAAAGATGCAGTGATCAGTTTCTTAGTCTTATATCCCTACTGTTAGTATATAAAAATTTGGTGAAAATGGAATGTCTGGTTTATTATTGTCAGGCTTAGTTTCTTATTTTAGGAATCAATATATTGCTAGCTTTCACTTTCCTAAAGCATTAGGAATAGGGATGTGGATAATTCAGTATCATTTATAAAATCTCTCTTTTAAGTTTTTTTATATCAGTACCATAAGATAGCGTACCACTTTCCTCAAGAGAATATTGTTTGTGAAACCAGGATTAAGATAATGAGACTTCTATTAAAAAAATTATTAATTGCACACTCACTATATGCAGAGTATAATTGTTAATGAATGTGATCCTTGCAAGGCATTTGTTGTCTAACAGGATTAAACAATGCAGATAATTGTGATGAAGGATCAAATGTGTAGAAGTGTCTTTGACTCGCTCTTTGTCCCTTCCTACTAATTGGTCACCAAGTTCTCTAAGTTTTACTTTCTGAATAGCCCATGACTTTCCCCTTTATGCTTGTTTAATGCAGATCCTTGTCATTTCTCTCCAGAATTAAAAAATATGTATTTTGAGAGTCCTTGAAGTACCTAACCCTGTGCTAGGCACTGAGGATGTAGCAGTGACAATATTTGCCCTCAAAAAAGCTCACAGCCTTAACAGGGAGGATAGACATTATATTTGAAATTGTAGTAGAATGGAAGTCAGCAAACTGAGGCACAGAGCCAAGAATGGTTTTCTTTTACTTTATTATTtttattgatttgagggagaaacatcgatttgttgttccacttatttatgcattcattgattgtttcttgtgtgtgtcctgaccgtatgtcgaaccacaaccttggtatatctggagaacactctaaccaactgagttaccagccagggcCTGGTTTTCATATTTTTAAAGGGTTATAAAAAGagagatagtatgtgacccacaaagcctcaagtacttactgtcagccattcacagaaaaaattgctgacccAGTGACAGAGTGGTATGACGAAGATAATAGAACCCATTCTCTCATATTCCACAGAAACAGCTTCACTTGATGTATGTGTATATGAACCTATGGTTtctggccaccaacactctgtagtctagcctcttaccagtgccatttctcacttccctgaaacttgagccacactgatctacttccagttctacaaacatatcatgctctttcaccttcagagtggcacgtgtctttccctcaaatgtcattcttttctctccttgcacccttggtacttcattggactgactcctgtttatccttcctaacttagctgggggaatcctttcctccagaaagccctcttgcatagtttaggtggggtacctctctgcagcatcctgtgcttccctttatcagcacttaacattttattaggaattgcctttctgtgctcctacggcttaggagggactgactgtcttacttttgtaggcccatcacctgcacatacttcctcaataaattgtggtcaagtgaatgaaAAACATGCCATCATAAGTATATTAAGAACTGGAAGTTCAGAAGAGGGAGAAGTAATATTTTATTGATTATGTGAAAACATAGGTCCGTGTTTAAGAATTAAGGAAGGTTCATCACTAAGGTGAAATTTAAATTGGTTCTTAAGGATTGTCTCTCGAGGATAGAAACTGGGGAGAATGCTCAAGAGACACAAATAAAACCTACTGAGACCATTCTATAAGTTACTAGTTGTATCCATCGGCTTTGCTATCTTAAGGATCCTTCCTTGATGACTAACCCATCACTCAGCCTGGTCACTAATGTTTTAGTAGCATCATAGACTACTGTGCAATGTGTGGCCCTGCCACTTAATGTCTTGTTAAACTTGGTTAAGATACGCCTCTGCAACTCAATTTTGTCATCTAGAACATGGGGACTAATTCAAGGATTAAATAATTATATTACTCATTATCCTGCTTGTTATATGTCTTAATGCCAATGCTAAGCCAGTTTCTTTTTGGATGGCAAGTGTGGGAAGGCCTGAAGGAAAGACTGCATTCTGAAGGTTCAGGGGGCTGTAAGACACAGAGAACCAGGGTTCTTTTCTTGCTTTTAAAAAAGGAAAGCTAGAAATAAAGTGTTGAGGATACACCTTATGCCAAATTGCAGACTAGAGTCTTTCTAGATTAGAAATGTGGGAAACTTGACTACAAAGCAGCAAATCAACGGAAATAAGGAGCAGAAGATTAAGACATAAAACTGAGAATAAAAGGACTCCAATAATTGGAAATTATTAAATTGTCACCCTTTAGAAAGGCCTTCTACATCCTTTGTAAAAAGTCAGCTCTGgccctgatcagtatggcttgttggttgggtgttgtcctgcaaagcaaaaggtcgctggtttgattcctggtcagggcacatgggcacctccagttggaggtgcaccagaggcaactgatctatgtttctcatatagatgtttctttatttgtttttctccttcccttcccctctctttaaaaataaacaaTCTTTTTAAAAAAGGTAGCTCTATAGTCCCAAGGTTGGATTGTTTTTATGAGTGGACTTGCATGCTTTCTAACATATCAGTTTATTCTGGTTAAAGACTTTAATGATGTTTAACACAAACACATTTGGCTCTTTAGTAACAAAATAAAAAGCATGAATAAACCACAATATTTGAGGTGTCAAATATTAGTTGCCAGCCTAAAATTTATAATATATTGTATGCTATTTATAGGAAAAGTGATTTCAATTATACTTTCAGTCTTGACTACTTGCATGAATATGGCTTTATTGCTTCTAACCAGATTGAGATCTGTAACTTTTTTTATATACTGATTGACTCTGTTTTAAAGGAGTATTTTGGTAAGTATGTGATATTCTCAAGGTAACAAATAAGTAAACAGACTTCTTTAGTTGGAAATTGTACATGAATTAACTAGCATGGATTGCCCTTTGACCAGCTTGTTTGTGTTTGTCTTTTTCTTCTAATATAATAACCAGGGATTAATGAAAATCGAGTTTCGTCCTCAGACAAGAGGTAAAGTGGTAATATTTCACACACTCTCCCCATACTCCTTTCAGAAAATTTACCCGCCGTTAGAGCTGAAGATAATTTAGCAGCGGTGACACTGATGAGAGGTTTAGATTGCTAGGCCTGTTTACAGTAGCAGCCAACTTATGGGAGCACATGGGTGGGTAATGCTGGGGAGCTAGTTTGAGATATTAAATATAGATTGGGGGAAAGTGATGGATCTCAAGCTtaaacaacagcaagattctcatctttttatgtgttcatgccattaggatatcacattctgaaaactctgtcagatactctcaagaataagactgaagtagacaaataacattattatggaagtggtcttgccctcatggatttcatgaacgggtccccagaccaaaatttgagaaccactAGTGTAGAGTAACATGTAAACTCAGTTCTTTAACCCCCACTTTTAAATATGAGTCATCTCTTTCAAAGTTTTTATAGGCTGCTATTATAACATTTATTAAAATAATGCCATGGGTTAATAGAAACAACAAAGAACCAAAGAATTAAAATACAAGCTATGTTAAATCCCAACTAAAACCCCAAAGTATCTAATGTGTTCATTCATAAGCTAATTAAAAAGCCCAAGAAAGACAAGACACCCAATATAATACTCAAAAACAATTGGCAATTTTCAGTTATCAAAAGAGTGGATTTTGCATTTTATATTCTTTTCTCAAGAAAAAATTTTTTGAGTGTTGTATAACATATATATATAAAGATACAAAAATACATTATAAACTTCTAACAATGGCTGTAGGTACATTACCTTGCATGTTTCTCATAGGCCATTGGTTGGTTATGGTACGTGACAAAAACATATGTCAGCTGTATGGTAACATACAAGCAACACTCCCTGTATTATCTCTTGATGTCATTATTTTTTCCAAAAATACTGCTTAATTTTTATTCCATACTTTGTTTTTCAGGTAAAGAAGAAAAATTCAGCCAGCTGATTTGTTTTTAGCTTAACTGCTGTCCTGGTCAGAAGAAATTGTTGGTCCATTGTTTAAATTACCAAAGACAGCAAGATATTTGTAAATTATCTTACAATAAACAGCTTACAATAAAAAAAAAATCACTGTGTT