Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CALM2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_6) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_6:29150890-29165590
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from CALM2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CALM2P5 scaffold_m19_p_8:5953411-5954018 - Intragenic
N/A UCSC
CALM2P1 scaffold_m19_p_1:61406751-61407692 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P2 scaffold_m19_p_3:82287112-82288149 + Intergenic
N/A UCSC
CALM2P3 scaffold_m19_p_5:64967902-64968943 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P4 scaffold_m19_p_7:37969849-37970882 + Intergenic
N/A UCSC
CALM2P6 scaffold_m19_p_10:64973857-64975079 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P7 scaffold_m19_p_12:25144099-25144789 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P9 scaffold_m19_p_14:18948877-18950456 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P10 scaffold_m19_p_15:48048804-48049843 - Intergenic
N/A UCSC
CALM2P8 scaffold_m19_p_12:49087862-49088056 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>CALM2_x1
GTAAAATTTAGACTTTCAAGCATATTCTGAAATATTTTATCTTAAACTTGGGGTCAAGACAGCTTAGTTTTGATGGTAAATTAGATGTATGTATTTTCTCTCCAACCTATATGCTTGTTACTGGTACTAAGGAATGTTGAACTAAATGAAGTTTATGGTATGCTGAATCTTgagagttttgtttatttatgtattaaaattttatttatttttagaggatgggtaagggatggggagacacttccattggttgcttctctcacacacacccccaagtgacctgaccccacagcccaggcatgtgccctgaccaggaatcaaaccagaggcctttcctttggtttttcaggacccgtccaacccactgagccacaccagtcagggctGAACCTGGAAAGTTTTAAGACTTGTTTTTGTAGCTGTTAATCTACTACATAGTTTCCAGTCACTTACCTGCTTATCTCTTTGATCTCTTTGTAGGCTGACCAGCTGACTGAAGAGCAGATTGCAGGTGAGGAATACATTGCCTGATAGTACCCATTGGCTTTTATTGTAAATTGAATAGCCAATCTCAAAATAAGATACTTGTATGAAAGAATTGACTTTGTTGTGTGTAGGAGATTGTAGCAAGGTGTAATACACTATAGTATTTGAACTTGCTTTGGCAAGTGAGATGGTAAACTTGCCTGAAAAAGGTGTAGGGCTAACTGTAACTGAAGACATGTATTTAGGCCGTGTGGATATATTTTGGAGCCTAGTGGTGGTCTTTGGCTTTTTTCTTTGTCATTGTTGAAGGTTATCTTACTCTAAAACATGAATTCTGGGCAGTTTTTAACACTGGAACTGCAGATCAGTCTCTACAAAAAATGAGGACCAAGTAGTGTTATAGTAAGTGACTTGATATGTAGAATCAGAAGATGAATGTTGAATTTATCCCAGTTTAAAGTAGCTAGTATTTTAACCTTAGAATTACATATATAGTCAGGAAATAACCATTTCTCCAATGAAAAACCTAGATCCAAAAAGACAGCATTCTGTTTTACATATTTAATTGTGTCTCACAAAGCAGTGACAGCTATTTGAGATGAGCTTCTTGAATCTGGTCTCTTTTGGTTTGCTATGGAAATATGTGAACTTGTTACATAAAAGCTGAAGTCATGTGTCTATGCCATACCAGTAAACATGTACTTTTGATTTTATTATTATACTTTGAGCTGTCTGGTTAACATCAAAATGTTGGAGAAACTTGCTAAAGGTTTTTTTTAATGCAATATTGAAATGTCTTTTGAACTATTCCTTTCCTTAGAGTAGGGGCTTGTTAACACAAGCATAAAGCAAGCAGTTTTAACTGTCACAATTTTCTTAGTAGTCAGGGAGTTAAAAGTACCCAAAATATAAAATCTTTtttttttttttttttttagattttcttatatatatatgacattttctttctaggttttatgtatttttagagagggagggaggaagagaagaaaagaaatatcaatgtgcaagagaaacatcagttggttgcttcttgcacactcccgtttggggacctggcctgcaacacaggcacatgcgtggaccagggatccagtggacaactttttggtctgcgggacagtgcccagctcacagagccataccagtcagggctaacactttcttctaatgttagagaaaaCTGTGAGTTACCCAGATAGGACTCAGTGATATAGCCCATTTAAAGTAAGTCCTTCCCCATCCCCCATAAACAAAAATTTGGAAGAGCCAGAAATCACTAATTTCCTCAAATATTTATTGCAAATATCATTTGAAAGGACTATATAAAGTAGAAAGCTATTAGCATTAAGGACCAAAAGTAGCAGATTTTATTTTTACCATATGAATTTTATTTAAACCTGGGATTTGCTTTGTAGGTTTGGTAAATTGCATGCTTGAGTGTGTTAATGTAACCAAGCAGAGCTTCAGAAATAATTTCTTTGTTGGTTTATACcagagttgtcaaactcattttcacagggggccacatcagcctcagcctcatggttgccttcaaagggccatatgtaattttaggactgtataaatgtaactacataacagttaatctgagagctcagcactgtcaccctgtataaacaaggtggagggccggatttggcctgcgggccttgtgtttgccacctgtgGTTTATACTATTGTTAAGTGTATCAATTAAATGGAAAATTAATTTCAAAATAGTTTTTTATATATCCTTCAGTAACTGACCTGGGCTATCTAATATTCTtagtctttaaaaaatttatttttagaggggaagggagggagaaagagatggaaagacactgatgtgttgcctctagtaaacaccccaactggggactgggctggcagcctttcatctgcggtgtgacacccaaccaattgagccacactggtcagggcTCTAGTCTTAAACTCTTACCTTGTCTTAATACATCAGGCCTTCCTCTCAGCCTTTCATTTCTTGGTGTTCCCAGTCAGTTAGTTATGTCTACTGGTACATAGCACAAAATGTTTACTTTAAGGGAGAAAATGTATCACTCAAGGTGCTCGTCACATAGGTGATGCTTATTACTGCCTTCCCAAATACACACGCTTCTTTAAAAAAAAGTTTGTGTCTGAAATATGAGGATCAGACTTCGGTGACTGATACAGCATTATTATCAAGAATAGTTGTAGTTCATTTGAACATTGCCTTTAAGGTAAATTCTGTCATTTAACTTCCATCATACAATTAAATTTCAACTGGTAGTGGAAGGAAAAAATCTGTTGTAGATTCTCTCCCTAACTCTGCCTTTTCCTAGGCTTTTAAAGATGTTCCTTGAACCCCAGGTTGTCTTTAGTGAACTTTTAGGTTGCAGGAACCTAAGCTTTTAATGctacttaaataaaaaccctgtgagataggggctttttttgtttcttgtgttcccagtgcctcccacatagtaaggattgaataagtttttcttgaatgaataaatTTTATTTTCAAAGAGGAGGAGAACACAAATAAATGTTCTAGAACACTACCTACCCTATCCTAAGAATTAATTGTGCCTGGTCCCAAAGTCCTTTCCTGAATTTGATATGTTTCAATGTCCACCTTTGAGGTAAACACAAATTTTGTCTTTATCTGGTGAATTGTAATCACTGGTGACCAGTAGCATATTAGTGTCTAAGACTTGTTAAAACACAAGCTTCATACATGTAATGCAACATTGAATATATACTAAGGTACACTTTAAGCTATTTTTATCTTTGTATCATCATTATTACAGATTTGTTTAGAAATTCTAATAGCAAATAATTTGGTCTAGAAGAAAAGCATGCTGTTGTTTAGGTAGAGTTACTAGAATTGTTTACATTACTTTCTCTTAAAGAACAATCCAGAACAGTCTAGTATGATACCATTAACACGTTAATTTTGACTCTGCCACAATTTCAGTAATTGTTGACATGTAGAGGACAAATTTTAAAAATGTACAAGAATGTTTCTAAAGGAAATTAACTGTACTCAGTTTATAGCAACAATTCATAGTGCCAAAAAATGTATGTTACATGACCTGTAAAGGGATTCAGTTTGGCTTTCTAAATACATAGAGGTTAATTTAGGCACAACTACAGTGAATTTGGAGGAGGTCCTATCAGTTGTTGAAGACAGCTGTTCTGTGTGATAGTCGGGACCTGTTGTTTTCTTACCTTGTGTTTAGGTTTTGACTCCTGTTTTTATATTTGAAGTCATTCTTGGGAATTACTGGTTAGAATGACATGCTCCTACATATGAAGATTATACTAGTTCGAAAGTATAGGTGGTAAGCTGTAAAGGCAGGTGAATTTAAATTGTATTTTTGAGTTTATCCTTTCAAGGAATTTTTACAGGTGTTTCTGGCTCTGTAGTGTAAAAATAAAATAGAAATTTGGAATAAACCTTGACATTTAAAATATTTTTATTCCTTTCTCATATCAATCAACTGCATTGTTACAGCATAGGTAAAATTTTATTTTCTGCTTTTCACTTTTTTTCAGCAAACATTTTAATAGTTTTTAGATGTTAAAATGTTGAAATTTAGAACACATGTAAGTTAACATCATGCATCTTGTAGAATTTGTCTTTAAGGTAAATCATATAGTAAAAGGATAATAACTGGTTACACATTCAGAATTTTGAACATAATGGTGGTGGTAAATGATCCTTGTGGCTTAGCATTACAGCAGAGAATGTAATGTAAACAAATATAACTCTCTAAGTACTTTTAATTTTCTTGTAGACTAAGTTAGTAGGTAGTAGATGCTATGTGTTAAAACCCTAATGGTTTGTATATTTTTAGACAATATTTCTACATCACGTTTTTAAAAAAAATTTAAGATGGAAATCTGTTGAATTCTGCTATTTGTGGGATTTGTTTATTTTTGTCATTGGATTGGTCTAGAGTAGATTCGATGCGTAGCTTCTGGTATCAGATGAGTTCCTCTGAAAACAAGTATGTTTAAACAGAATGAAACTGTGTGTTACTATTGAATGTAGCAAACTACAACTATTCAGTGATACCTGATCTAAAAACTAAACAATACAAAAATTTTAAGCAGAAGAAAGGAACACAGTAATCCAAAAAAGGTAAATAGGACCCAAGTAGTTGTGAGGGTAATTTTAAATAAAGAACCCAGTTTGCAGGGTTATCATAATTGTCTGGGCAAAAGGTGATGGGGCCATAAACCAAATTATTGGTTGTAGTGATGAAGAAGAATCCAGTAGTATTTAAATAATACCAGAGTTCTACAGGACTTGTTGATGGATTTTTAGGAGGAAAGAGGTTAAATGGCTTTTGCTTATGTTCCTAGGGGAACGTAGAATTCATTTTCCTAAGTTTTGCTGGAGGTCATCCAGGGGAGATGTCTGCCTGTAGGAAGTCAGAAATAAAGGGTAATATGTTATAGAGAAAGATGA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>CALM2_x2
ACTAGCAGCATGGTGAGTTCGTCGCTAAGCTGCCGGCGCTTGGCCTGTCGGGGAAAGAGGCTGAAGCAGATCGACCAAAGAAAGGGAACTTGCCTTCCTCAAACCCTCCAGAAATGGTCTTTGCCAGCGGGATGGCGCGAAAGAGGCTGGGGGGCCCGCGGCTGTTGTGTCGCAGGTGTCCCCACCACCCCCATTCTCCTCAGGCTGACCAGCTGACTGAAGAGCAGATTGCAGAATTCAAAGAAGCTTTTTCACTATTTGACAAGGATGGTGATGGGACTATTACAACAAAGGAATTGGGAACTGTAATGAGGTCTCTTGGGCAGAATCCTACAGAAGCGGAGTTACAGGACATGATTAATGAAGTAGATGCTGATGGTAATGGCACAATTGACTTCCCGGAATTTCTGACAATGATGGCAAGAAAAATGAAAGACACAGACAGTGAAGAAGAAATTAGAGAAGCATTCCGTGTGTTTGATAAGGATGGCAATGGCTACATTAGTGCAGCAGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACCTTGGAGAGAAGTTAACAGATGAAGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAAGCAGATATTGATGGTGATGGTCAAGTAAACTATGAAGAGTTTGTACAAATGATGACAGCAAAGTGAAGACATTGTACAGAATGTGTTAAATTTCTTGTACAAAATTGTTTATTTGCCTTTTCTTTGTTTGTAACTTATCTGTAAAAGGTTTCCCCTACTGTCAAAAAATATGCATGTATAGTAATTAGGACTTCATTCCTCCATGTTTTCTTCCCCTATTGTCATTGTCCCAAAACCTTATTTTAGAAAATTGATCAAGTAACATGTTGCATGTGGCTTACTCTGGATATATCTAAGCCCTTCTGCACATCTAAACTTAGGAGGAGTTGGTCAAATGAGGGAACATCTGGGTTATGCCTTTTTTTAAGTAGTTTTCTTTAGGAACTGTCAGCATGTTGTTGTTGCAGTGTGGAGTTGTAACTCTGCGTGGACTATGGACAGTCAACAATATGTACTTAAAGTTGCACTATTGCAAAACGGGTGTATTATCCAGGTACTCGTACACTATTTTTTTGTACTGCTGGTCCTGTACCAGAAACATTTTCTTTTATTGTTACTTGCTTTTTAAACTTTGTTTAGCCACTTAAAATCTGCTTACGGCACAATTTGCCTCAGATCCATTCCAAGTTGTATATTTGTTTTCCAATAAAAAAAATTTTACCC
>CALM2_x3
ATGGCTGACCAGCTGACTGAAGAGCAGATTGCAGAATTCAAAGAAGCTTTTTCACTATTTGACAAGGATGGTGATGGGACTATTACAACAAAGGAATTGGGAACTGTAATGAGGTCTCTTGGGCAGAATCCTACAGAAGCGGAGTTACAGGACATGATTAATGAAGTAGATGCTGATGGTAATGGCACAATTGACTTCCCGGAATTTCTGACAATGATGGCAAGAAAAATGAAAGACACAGACAGTGAAGAAGAAATTAGAGAAGCATTCCGTGTGTTTGATAAGGATGGCAATGGCTACATTAGTGCAGCAGAGCTTCGCCATGTGATGACAAACCTTGGAGAGAAGTTAACAGATGAAGAGGTTGATGAAATGATCAGGGAAGCAGATATTGATGGTGATGGTCAAGTAAACTATGAAGAGTTTGTACAAATGATGACAGCAAAGTGA