Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CBX3
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_11) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_11:49387575-49398025
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from CBX3

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CBX3P1 scaffold_m19_p_2:95878817-95879387 + Intragenic
N/A UCSC
CBX3P3 scaffold_m19_p_4:109069714-109070622 - Intragenic
N/A UCSC
CBX3P4 scaffold_m19_p_4:41223126-41224787 + Intragenic
N/A UCSC
CBX3P2 scaffold_m19_p_3:157711687-157712180 - Intragenic
N/A UCSC
CBX3P5 scaffold_m19_p_10:63068894-63069431 + Intergenic
N/A UCSC
CBX3P6 scaffold_m19_p_11:67080031-67080570 - Intergenic
N/A UCSC
CBX3P7 scaffold_m19_p_15:10522537-10523080 - Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>CBX3_x1
ccctggctgggaatcgaacctgggacactttggttcccagcccacgctcaatccacagagctacaccagccagggcaatagtatcttgattaaagtaaagaaacgtaatctTGATAGAATAGCACAGTATGAACATGAAGTATATTTATCATGAAGTGAAAGACAACAAATTCGTGTACTTGAAGGAATACGTTACAAGCATGGGCAGACAAAGCAGTAAAGGCCTTGTTGATTGGCATACTATCACCTAATTCACTGTGTACTGAATTCTGGAGAAATCAAGTATTTGCCGTATTGCTCAGTTTAAAGAAAAAAGTACCTTGTACAGTACACTGGCACAAAACTCATTGACTCTTTCAAATGCTTGGGCACTTTGTCATATTTCAGACTTAACTCTGAATTATAGAAAGGCCTTAAATTGAAGTCATTGCTGGTTTTTTTATATGTCCAGAATGTACCAAATTGCACATGTGTCCAGGAAGGAGAAAAGAGTAGGCCTTATGGAACTTCTGAGTGGTTAAATTTTTTTTTCTCTCTGTTTCTTAAACCCAAAGTTTGTGTTCTTAGGCTTCAGTAAACACTGGAATATTcacatgagagttgtgaaattcaaagttacggttcccacagtagttaattctaacacactgcaTTAATAGTAGTCACAAGCATGTAAAGGTGAGTGTTAATGTGTGAATAAAGGAAAGCATTTGGTTTTGGTCTGTAAGTTCTCCCCTTGGATTCCACATTAAAAAGGGCACGTTTGTAATTTATAATTTGTGTCATCATTAGATTGCACATTTAAATGAAACATCTTGGGACATAGGAAATAGAAAAGGCCTGATGAGTCTCTGTAGCATTCATCAAAGCCATTAGTGGAAAAAGCACAAAGTGTATTCTGTGCCCCTTCAGAGGTAAACTATTCTTCAAAATCCATAATCAGTAAACCAAAGTATATATAATTGAGTTGGTTTTATAGTTACCTGTGTCCAGGTATTGGATGGAAAAGGAACTAGCTGTGCCTGGTGCTTTGAGGATGGATATAGCGAAAGCAAATAGTTACGTCTATTAAAATTGAATTGCTTCTGCACACAATTTTTTTAATTTCATGTGTGTTACGAGCTAATGGTGCTATAATTTAAATTGGGAAAGTGGGTGGATTTTTTTTTTAAGATAAGCACTTCAAACTAGCTCATGAGTGCTATTGCAATTACATACATTGTTTTTTATGCCAGTTTTTCTTAAGCTTAGGGtttgtccttttcattttctgttgtttgtttgttttttgGTCATCTTTATTCTGTTAATCTTCTACCTTCACACACCTAGCTGTGTTGCTTGTCATTTAGGATCGGTATCTAATAAGCTTTTGTCCACACCAGCTGCTCTTTATTGTCCCCACTACCATGCCTACCTTCCTTGTACTATACAGAAGCAGAAAATTACCTGGCTGTGTACAATGCCCAAGTAATGTGTGTGTGTACTTCTAAATGACTCCATAATTTTAATGTTCTTTTGCAGATGTGTCATTGCTGTGATTTTTTTTCTGCATGCTATATTGAGGGACAATTTTAGTGATCGGGTGATAAAAGACTATTTTTTTAATAGCACGTGTTCTAAGATGAAATGAGTATAACACTTGGGATTTTCTTCTCTTAGTCTCTTCTAATTAACCATTTCGTTTCGTGGGGTTTTAAACATTTACTCATTTTCAGTCTTGTAACAAATCTGAGTTATTAGAAAGTGGTGGATTGAGCTTGGTCTCTGAAATAGTGTTATACTTGAAAAAGCACACACACGCTAGGCGGCAAAcacaggtggcaaacaaggcccttgagctgaatcagcctccaccttgtttcatctggcctggcaccttgtttctgcctgcagcagcgctgagctctttgcctctagtgaaggagcagttacatttatacaggcctaaaattactttcagccctttgaaggcaactgcgaggctgttgtggcccctggtgaaaatgagtttgacagccctgcTCTAGGCTAAAACTTGTTTAAAGTGAATTTTGTTGGCTACCAGTTTAGACTCTTGAGAGACAAAAGGATTGTTCTTGCCACAAAATTAAAATGATCCAGTATTTCTGCTTCTTGAAATGACAGCATTATTGCTTTGTTCCAAGTGGTCAGTAACGTAACATATTGTCAGCAGAAATTACGGAAAAAATGATCTTGTTCTTTTTAAACTATTCATCATCTCCTTGGTTGACCCTGCAATTGACACCAGGATACTGAACCATGTTTTCATTCTTGTAGGTAACATTTTTTTTTTTTTATATTGTTGAGGCTTTTAACGTTGTGTTTGAATTGGCAAAGGTGGTCTTCAGGTTTGGGGGGTATTATGATTTCAATCAGTTTATTGTTCACTTAGTAACACCTGTTACTTCTTTCTCTAATGTTCTGGTACCTCCTAGAgcaggggtgtcaaactcattttcacctggggccacatcagcctcactgttgcctccaaagagctgaatgtaatttcaactccttaacagttaatgagtagttaaatttatacagtcctaaaattattttgtccctttgaaggcaacgacgagtgtgatgtggcccccattgaaaatgagtttgacatcttggcacCCCTGTCCTAGATGTTTGCAGCTGTGTTGTAGCATGAAAACTAGTGAACATGGTTTTGTAGACTACATAGAAATAAGACTAGGGAGAGAGAACAGTATTTTCCACATAGTGGTTTTGATTGTATTTTTTCATAGAAAGGTGGCGGGTGATAGGTTTAAGCTAAACCAGCAGAATTAAGTGTTTCTTTTATTGGTTATCTGTTGGCTTTTATTTTTTCAGAAGGTGCCTACCCAGGGATATAGAAGTAAAAATCTAGATATCAAATTCAACAATAATAATTGCTTAATTTAGCAATTGCAGAATTTAGCCTTTCAAGTGTAGCCTTTGGGATACATATTAAAGTATATCCCAAAATAAAAACAAGATGTTTCTTAATTCTTTGTTTTAGCAAAAAATGGGAAAGAAACAGAATGGGAAGAGTAAAAAAGTTGAAGAGGCAGAGCCTGAAGAATTTGTAGTGGAAAAAGTATTGGACCGACGAGTAGTGAATGGGAAGGTGGAGTATTTCCTGAAGTGGAAGGGATTCACAGATGCTGACAATACTTGGGAACCCGAAGAAAATTTAGATTGTCCAGAGTTAATTGAAGCATTTCTTAATTCTCAAAAAGCTGGTAAAGAAAAAGATGGTACAAAAAGAAAGTCTTTATCTGACAGTGAATCTGATGATAGCAAATCAAAGAAGAAAAGAGATGCTGCTGATAAACCAAGAGGCTTTGCCAGAGGTCTTGATCCTGAACGAATAATTGGTGCCACAGACAGCAGTGGAGAATTAATGTTTCTCATGAAATGGAAAGATTCAGACGAGGCAGATTTGGTGCTGGCAAAAGAGGCAAATATGAAGTGTCCTCAAATTGTAATTGCTTTTTATGAAGAGAGACTAACCTGGCATTCTTGTCCAGAAGACGAAGCCCAATAATTGTTTTTGTTGCTTTTtatatatatttatatatataAAAACCTGGGTCTTGGATTTTTTTGATTTATTAGTGTGAAGAGATAACTACATTCTAATAAAAATCAAGTTTGGTATGTTTGTTTTAAAGTAGTACTGGGGGTGGTGGTGTTGGGGGGTGCATCTGTAGCACTGGTTACTTTGGAACAAAAGCTTTTTCTGTAGTTGCTTCCTTTATCAGAAAACATTTGATACCATGGTATATTCTTTCCTCTGCATTAGAGAACAGCTTTTCTAAATGTTGGGGTCAACTTCCATTGTTACTCAGTCAGAATTTTTGTTTAAGTCATATATACTTAAGGATCATTGTGGGGGTTTTTTGTTTATTTGGTGGGGGGTGGTTGGTGTGTATACATATGTAAATTTAAATGGTTTTCTTCCTTTTTTTTTAACTGAAAGGAAAACAGCATTTCACAACCATAGATAAGCTCATGTTTCTGGGCTGCCATCATTTTCAGCAATCTAAGAAATAAATCACTTCAAGTTAAATTGAAATTTTTCCTGAAGCTTTAACCTTTGAAATTAAATAGTTTGTAACTAATTGGGCAATTTAAATATAATATGAGCAGTTTAAATTGGACAATTTAAAAGCAGCTATATCAGAATCCGTGGCCATATCTAGAATTATAAAGGCAGATTTATTTGCAAAACACCTGAAAGGAAAATCTTATCATTACCAAAAACTTCCTCTCCCAAATGAGAAAACTAAATAAACCCTGGTATGTTTTAATTAGGCAGGCAAGACTTACTTAAAGGTTTCGCCTAGCAAGCCGTTCATTTACAAAAGTTAACATTCTTGTGTTATATTGACCAAAAGGTTATGATCATGGAATGTGTAAGACTTTATTCATGGAAGCCTAATCAGACTACTAGAGACCTTGGCAATTTAAACCTGTTGAAATAAATGGGTGAACAAACTTCTGTCATCTATAGTCTTGACCTGCATGTTTTACTCCAACTCGTTCCTTACATGTAGGCTCAGTCTCAGTGTTTGGGTTACCGGTTCAGTAGAAGCCAGGAAAAACAAAGACTTTGTAGTAACCAGAATGTTATCCAACTGTATATTGTTTACTTTATTGTAAATACTGGTAAACAGTGGTCAATAAATAGTTTTATATTGCTTT
>CBX3_x2
ATGGCCTCCAATAAAACTACATTGCAAAAAATGGGAAAGAAACAGAATGGGAAGAGTAAAAAAGTTGAAGAGGCAGAGCCTGAAGAATTTGTAGTGGAAAAAGTATTGGACCGACGAGTAGTGAATGGGAAGGTGGAGTATTTCCTGAAGTGGAAGGGATTCACAGATGCTGACAATACTTGGGAACCCGAAGAAAATTTAGATTGTCCAGAGTTAATTGAAGCATTTCTTAATTCTCAAAAAGCTGGTAAAGAAAAAGATGGTACAAAAAGAAAGTCTTTATCTGACAGTGAATCTGATGATAGCAAATCAAAGAAGAAAAGAGATGCTGCTGATAAACCAAGAGGCTTTGCCAGAGGTCTTGATCCTGAACGAATAATTGGTGCCACAGACAGCAGTGGAGAATTAATGTTTCTCATGAAATGGAAAGATTCAGACGAGGCAGATTTGGTGCTGGCAAAAGAGGCAAATATGAAGTGTCCTCAAATTGTAATTGCTTTTTATGAAGAGAGACTAACCTGGCATTCTTGTCCAGAAGACGAAGCCCAATAA