Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name COX4I1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_14) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_14:69984547-69992343
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from COX4I1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
COX4I1P1 scaffold_m19_p_3:209363558-209363908 - Intragenic
N/A UCSC
COX4I1P3 scaffold_m19_p_8:62383532-62384090 + Intergenic
N/A UCSC
COX4I1P4 scaffold_m19_p_14:36435467-36435610 - Intergenic
N/A UCSC
COX4I1P2 scaffold_m19_p_5:119262427-119262801 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>COX4I1_x1
CCGGTCGCGAGCTGACAGGGTGTAGAGGGCGGTCGCGGCAGGCACAGCGGGCTGCGGCTGGGCGGCGGCGGCAGGATGTTGACTACCCGAGTGTTTAGCCTAATTGGCAAGCGAGCAATTTCCACCTCGGTGTGTGTACGAGCACATGGTAAGTTGCCTTTTTTAACTTTTAGGTAGGCTGAGCTAATTTCATTTTGCTTGTGCTATGTGTAAGGCCCTGTGCTGGAGTGTCAAACACAGATGGCTAAGATTCTGATCCAGCTGCTGAGGGATTTTAGGGGAGGGATAAATATTTTAACGGGACACTTAATTCTAGATTAAAGACTACGAACCACTGAATTCTAGTCCTGGATCTCTGCTTATATTAATATTTTCTCTTTTTTCCTTTCTCTCCCATTTTTTTTTAAAGTTCAGGTTCCACCCCTTTCAAGAACTCTTCTCCACTATACCTGATTTTAATGATGTTCTTCTCCTCCAGGAAAACTCCCAACCATTTACCTTTAGTACTGTTTACATTACTGGGACAGTGGAAGGGAAAGAGCCTGAGCTTCCTAACCTGAGCTGGGTTTAACCTCATTTTAGTTTTGGACTAGGTACTTAAGTTTAGGAATCTGTTTTCTTACCTGAAGTACATATAAAGAGCTTAGTTCAGTGCTTGGCAAGCAATTGTAGTTTTTCACTTATCTAGCATCTTCTTTGTACCAGACACTGTTAAATGTTGAGAATAAAAACAATGTGAAATATGGAGTCTTTCCACGAGAAGGTTTGTAATCAGGAGAGGGACAGGTACATGAAGAAAATGGCTCAGCAACAGATGGCCCCTAAGGAGAAGCACTTAGCCTGGCTTGGGGTGCAGGGGAAGCTTCTGGGGGAGAGGCTTTGTTTTGCTTGAATGTGAACACGTTAAATCTCACATTCAAGAGGGAAATGGCATTCCAGGCAGAGGGAAAGTAAGCAAAAGGACAAAACACAAATCAGCATGGCAGGGTATGTTACTGAGGGGTCAAGTACAAGGCTTAAGTGGTGGATGATGAACTTGGAGAGCAAGGTTTATGTATCTAGGGGCTCCGTAATCAGTAATTTCTGTTAACTGCTTTATATGTGAATTTGTCTTTGAAATTGTGTTTTTAAATTAGTGATACTATTATCTTAAATCCTCTATATTATTGCCCATGATAACGCTATGGATACAGACTGTAAAACAGATCATTGTAGTCAGAGTGTTGTTGAAATGTCTGTTATTTAAACAAGTAAGTAATAAAGAAAAATTTATTGTTTCATATATACTGAAAGAAACACCTTCATTAAAAGTTTAGAAGGTCACTTATAACAGAGATCACATTTTGTTTCCATTTTGGTTTTCTGATAGTGTttagtttgtttgaggcgtaatttatggaaaataaaattacctttcctaggtgtaatgttctatggatttggacaaactcacagtatgtaacgacggctccggtcagaacacactacatggccatcagcccccaggttccttgatgtccctttgatcattctgctcTTTTATAAGAAGCCAGCTTCTACCTTCTTATAGTGGTGGTGGCTGTGACTCACTCTTAGGTATCATTTTTGGTGAAGAAGTAACATCAAGTCAGCCCCTTCTTGAAACCCTCCAGGGCCTAGTCATGCCTAGAGCAAGATCTGAGGCTGGCCTTTCTGATCTCATCACATCTTACTCAAGCACACAGCTCAGCCAGCCCTGCCCATTGCTCGAGGCCCAGCCTCCATTGGTGCGGTGTTTTGTCCCTTGTGAATGCACATTGGGCTGGTCCCTCCAGCCTCAGCTCCCAAGTTATGGATGATTGCTTCTCTCTCAGCATCTCCTGCAGTAGAAATGTTATTTTAGAATTGCCTTCCTGACCCCCTGTCCTAAAGATGCTCCATTCTGCATCACCTTGCGTTGTTTCTCCTCAGAACGCTGATGCTCTGTGGGTTTGTGTGCAtgtttgagtgttgtctgtctctgcctctggagcgcgagctttgtgaggccagggaccttgcctgtgttactcattgctgcatctctagcacacagtaGGCAGATGGAAAAGACAACAGTCCATTAGATAAGTTGTCTTTAATTTTTAACTTCTGAGTGTATGCTTGATACATGAACTGTTTGTTGTTCACATGAAATAGTAGCACAGTACGGAGTGCCATTGGTAGCTGCTGGTGTGGATTTGGGCATTTTCTCAGTGACAGATCTGATTGCGAGGGGAGCTCAGAATCAGCAGATTTTCTCAGCAGAGGCTCAGCCAGAGTTCCATCCAGACTGAAGACAGAAATGACAAAGCATTCACTAGAATGCAAAATCTTGGCTGTTTTCTCTTTTTTAAAAGGAATGTATGGTATGTTGAGCTTTGCTCCTCACTGCACTCCATTTGTTGGGGGACCAGGCCCAAAATGCTGAAGAACCTCTAGCAGCCCTGAGATCACAAATTGGTTGATCTTATTCTAGAAAATGCAGTTTTATGCTTAGAGTGCTTCACGGTTATGAGCATTTACAGTAATGCCCTCCTTAACTACTGGGACACATTCTGGCAAATGTGTCTGactttacaaacctaggtgggatagcctaccatgcacctaggctgtatggtatagcctgtggctcctaggctacaggcctatgtagcacatctctggacaaagcaacgtgagattaaatccagcacaagacaaagtgatgtaatcaagagagtggtgagcagggggtgtatgaggctgctgccagtggagcacagcgtgctgtttctgtctctttatcctacatggagggcatttttttcattgctttttttgagcgggagggagggaggggaaggagagagaaagagatatatcaattggttgccttctcatacgtgtcctcagtggggaccgaacctgcagcctgggtgtgtgccctgactgggaattgaacccatgatctgctctatgggatgacacccaaccaactgagccctactggttagggctTCACTAGGCATATTTTTAATAATTCATGTGTAAGCTGAGTGCTAATGTACATCATTATTTTTAGTTCACTCATTTTAATAGAATCTTAGAATTCTAAAATTGCAAAGTAATTCTAGCCATTTCTATATGAGATCCTTTTAGGTTAAGGTCAAGTATAAATATTTAATTGGTAGTTATTTGCATGGCAAAGGTAAGTATCTAGAGAAATTATATTTTGCAGTAGGCTGAATGTTTTACTTCACTGTTAACATGATTTGGGAGATTTTAACCATTGGGACTAAGCTAATGGAAGGAAAGAATTTTTGAAGGACTTCATTAAAATACTCCTTTCTTTTCTGCTGTCTGAATTTTTTCCTTCTTGAGTAATACTCTTCATTTGTATAGTGAATAAATTATTCATCTGCTTGAGTAGATACAGTTCATTTGAAGGAACTAGAATTTCTGCCTATTTGAGCAGAAATTCCCATTTCATCCTCTCCTCTTCTGCTTATAACAACTTCAGTTAACTTTGCCAGGAGTTTTCTCTCTTCAGTTTATAAATGTGAGTATATATACACAATTTACACTTTCAAAAAGAAAAACAAAACAACTCTGATATATTGCTCTGTGACTTGGTGAGCACACGATTGTTTCTCCATTTTGAACACTTGGCTGTGCTTTCTACTGTGTAAGTTGTCCCTGCCATACATGTATCCCTCCGATTCCTTCCTCTACGTGCTTTTTCCCAGAGTGCTCATTTCCTAACATGCTCTGTGATTGTCACATTTGCTTCCCACTTTTAGCAGGTAGTTGCCAGTAAGTGGGAATCtttgctttgttcactgatgatctcagctgtctagaaccatgcttagcatatagcaggtggtcagtaaacatttgttgaacagctgaatgaatGGTTCCATGATACATGTTTCTAAGGAGCTAGCTAACTCCATCCTTTGTTGGACACGgttttttttgttgttgttgtttttTGGCTATAATAAAAAGTAATGCAGTGACCATCTTTTCATATATCTTTGTTTCTCAACTTTGAACACTTCTTTATGAGTTTTATATTTTTGTTCTTCCTCATTAGTTTGAGTCACTTGCAGAAGGGCCTTCATTTAGTTAGGTCTCCGTCCAGGGCAGGGAACCCTGAGAGCCTTAGCTGACCTCTGCATGAACACTGTTGGTTGCAAGAAGTGCTGCCTCTGGGCAGTTGCTCCCGGTAGGTTTCTGTTTTGCTGTGATGAAAACTGCTACTGTTAACTCTGCCTGCCAttctcattctgctgtctgggccacacaggacaggcctacctcctgctccacatggtagtccttcagctgtttgaaacagTAGCTGCAGCCCCTGGGATGAGTGCACATGTGCTTTTTTAGGTTTTTAGAAGTACCACCGAGTTTGTGACTCTAATCCTTTGTGAATTTTGAAATATTCTCCACCGTGCCTTTTAGGGGGTGTTGTGAAGAGTGAGGACTTTGCTCTCCCGAGTTATGTCGATCGGCGTGACTACCCCTTACCTGACGTGGCCCACGTCAAGAACCTCTCTGCCAGCCAGAAGGCCTTGAAAGAGAAGGAGAAGAACCCCTGGACCAGTCTGTCGATTGAAGAAAAAGTTGAATGTGGGTATCGAAGGGAAGTCAGGCACACAGTGTGGAGGGGATTTTTATGATGAGGGCTGGGGTGCTGCCCAGAGACCAGCCTGCCCTGGGGGCTCGGTGTGGTGTGTTTCTGTGGGGCTGCCCCAGGGTGCAGTTTCGGTGCTTTGCTGGCTGGCTGGAACTCTGCCCAGGCTCCTGTGTGCTCCTGGGGCCCCAGCCCCCAGGGAGAGGCATGAACAGGGACGCAGAGCAGCTGAGCGTGTGTCATTCGAGTGTGTGGCATGTGGATGCGGTGTCTCCATGCTTCTGCTGGGTGGGGCTGGGTTTACTGTCAATTATTGATGGAAGGTCAACAAAGCATTGTCAGG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>COX4I1_x3
GGAGTCCTCCGCGATCCCGTGGTGCTGCGCGGCGCGGCCTCTCTCTCTTCCGGTCGCGAGCTGACAGGGTGTAGAGGGCGGTCGCGGCAGGCACAGCGGGCTGCGGCTGGGCGGCGGCGGCAGGATGTTGACTACCCGAGTGTTTAGCCTAATTGGCAAGCGAGCAATTTCCACCTCGGTGTGTGTACGAGCACATGTTTGAGTCACTTGCAGAAGGGCCTTCATTTAGTTAGGTCTCCGTCCAGGGCAGGGAACCCTGAGAGCCTTAGCTGACCTCTGCATGAACACTGTTGGTTGCAAGAAGTGCTGCCTCTGGGCAGTTGCTCCCGGGGGTGTTGTGAAGAGTGAGGACTTTGCTCTCCCGAGTTATGTCGATCGGCGTGACTACCCCTTACCTGACGTGGCCCACGTCAAGAACCTCTCTGCCAGCCAGAAGGCCTTGAAAGAGAAGGAGAAGAACCCCTGGACCAGTCTGTCGATTGAAGAAAAAGTTGAATTGTATCGCATTAAGTTCAACGAGAGCTTTGCAGAAATGAACAGGAGCACGAATGAGTGGAAGACAGTTGTGGGTGCTGCCATGTTTTTCATCGGCTTCACTGCTCTCATTCTGATCTGGGAAAAGCGCTATGTGTATGGCCCCATCCCGCACACCTTTGAAGACGACTGGGTGGCCAAGCAGACCAAGAGGATGCTCGACATGAAGGTCAGCCCGATCCAGGGCTTCTCTGCCAAGTGGGACTACGACAAGAATGAGTGGAAGAAATAAGAACCTGCCATTCACGTGTCTGAACCTCACTTTGTTCTGTCATTTCATTGCAGTTCAGCATATTTACTGGAAACTCTTACGTTGCAGTCCCAATGCTAATAAACAAGCAGTTTACTTG
>COX4I1_x4
ATGTTGACTACCCGAGTGTTTAGCCTAATTGGCAAGCGAGCAATTTCCACCTCGGTGTGTGTACGAGCACATGGGGGTGTTGTGAAGAGTGAGGACTTTGCTCTCCCGAGTTATGTCGATCGGCGTGACTACCCCTTACCTGACGTGGCCCACGTCAAGAACCTCTCTGCCAGCCAGAAGGCCTTGAAAGAGAAGGAGAAGAACCCCTGGACCAGTCTGTCGATTGAAGAAAAAGTTGAATTGTATCGCATTAAGTTCAACGAGAGCTTTGCAGAAATGAACAGGAGCACGAATGAGTGGAAGACAGTTGTGGGTGCTGCCATGTTTTTCATCGGCTTCACTGCTCTCATTCTGATCTGGGAAAAGCGCTATGTGTATGGCCCCATCCCGCACACCTTTGAAGACGACTGGGTGGCCAAGCAGACCAAGAGGATGCTCGACATGAAGGTCAGCCCGATCCAGGGCTTCTCTGCCAAGTGGGACTACGACAAGAATGAGTGGAAGAAATAA