Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name AMD1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Sarcophilus harrisii
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr4:190576104-190601995
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from AMD1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
AMD1P1 chr4:178139536-178140656 + Intergenic
N/A UCSC
AMD1P2 chr4:200362582-200362953 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_031964404.1
GTCCTCGCTTACACAGTATGGCCGGCGACATTAGCTAGCGCTCGCTCTATGCTCTTCTCTGTAACGGGAACCAGCGGAGTAAAAGAGACTGAACAGCATCTGCCTCTATTTCCAACACAGACTCACGTTCAACTTTCGcacgagaggaaaaaaaaaaaaaaaaaaagccgggaaaaattttattaatttttttaaaaaagttaatataaaattataacaaGCAAAAAAAGAACCACACgcacgcaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaacaaaaaacaaacaaaaaaaaacctcctgAACTTTAAAGAAGCAGCAGGAACAACCCGCAGcggcggaggcggcggcggcgggagaAGAGATTTAATTTAGTTGATTTTCTGTGGTTGTTGGTTGTTCGCTTGTCTCACAGTGATGGAAGCTGCACACTTCTTCGAAGGGACCGAGAAGCTGCTGGAGGTTTGGTTCTACCGGCAGCAGCCAGACGACGGCAAAGGATCTGGGGATCTCCGCACCATCCCAAGgtTTGAGTGGGACAAACTTTTGGAGAATGTGCATTGTTTAATCATAAGTGTGACAAAAACTGACAAGCAGGAAGCTTATGTACTCAGTGAGAGTAGCATGTTTGTCTCCAAGAGACGTTTCATTTTGAAGACATGTGGTACCACCCTCTTACTGCAAGCACTGGTCCCCCTGTTGGAGCTTGCTAGGGAGTACAGTGGGTTTGACTCAATTCAAAGCTTCTTTTATTCTCGTAAGAATTTCATGAAGCCTTCTCACCAGGAGTACCCACACAGGAATTTCCAGGAAGAAGTAGAATTCCTTAATGAAATTTTCCCAAATGGAGCAGCATATTGTATGGGGCGTATGAATTCTGATTGCTGgtACTTGTACACTCTGGATTTTCCAGAGAGTCGAGTCATTAATCAGCCAGATCAGACACTGGAAATTCTGATGAGTGAGCTTGACCCAGCAGTTATGGACCAGTTCTACATGAAAGATGGTGTTACTGCAAATGATGTCACTCGTGTGAGTGGAATTCGTGACCTGATACCAGGTTCTGTCATTGATGCTACAATGTTCAATCCTTGTGGGTATTcaatgaatggaatgaaatcGGATgGAACTTATTGGACTATTCACATCACTCCAGAACCAGAATTTTCTTATGTTAGCTTTGAAACTAACATAGGTCAGACCTCTTACGATGACCTGATCAGGAAAGTAGTGGAAATTTTCAAGCCTGGAAAATTTGTGACCACCCTCTTTGTAAATCAGagTTCTAAATGTCGCACAGTGTTTTCTTCGGCCCAAAAGATTGAAGGGTTTAAACGTCTTGATCGCCAGATTGCTCAGTTCAATGATTACAATTTCGTTTTTACCAGTTTTGCTAAGAATCGTCAGCAACAGCAGAGTtgattaagaaaaatgaagaaaaaacgcAAAAAGAGAACACAAATAGAAGGTGGTGGCAGCTTTCTAGTTAATGATACAGGGGGCCATGCTTTCCATACCCACCACCTTGTAGTTTCGGAAAGCCCTAGATGTAATCATAGTATAATCATTTTGAATTGTATGCATTATTATATCAAGGAGTTAGATATCTTGCATGACTGCTCTCTTCTGTGTTTAGGTATTCTATGCCACTCTTGCTGTGAACTTGAAGTGCATGTAGAGAAAAACTTTTACTGTATGAGACTTTACAACACTtgtaaaaacaattcaattagGATTATGCACGGTGTAATTTTTCTCCAGGTATCACCAAAAATCCCCCACAGACAAGGCTTTCGTCCTCATTAGGTGTTGGCCTCAGCCTAAATCATCTGGGACTGTTCTGTTAAATTACTGCCAGATATTTTTTGTGGGCAGTTTCTTCCAATTTCTAGACCacatttttctctattaattCTAATGAAATTAATGACTAATTTAAAACACAAATGCACTTGAGAAATTAGTAACTTTACCTTCTTAATGAAAATTAATGATTACTTGGAActgatcattttattatattaaaattttgagtATTGGAACATTATTTTTGCTCCCTGTATCTTTAGTTCTTTAAGCTCAGTGATTTCCACTTCCCCTTCATAAAATGAGCAATATACTGTTGCACTGAGTTTAACATTAGCCTTTCACCTTTTGGGGGAAGAAGCTTCCTCCAGATCTAAATTTATGTCAAGGTGGGTTTGGTGGTCTCTTTTGATGTATGATTGGCAAGGAGGGGGGAGTGGGGCACCAAGACTTTCTCCATTATGTGTGGGTTATAATTAGAATGCATTGACAGAAGGTTCTAACTATGCTATTTCCATACTCCACAGCTAATAGAGCACCAAATGTATAGCCACAAaccttcaaatacttaataatttttttaaatcaacaaatttAATAGGGAGATTTAGTGTAAAAGAGATGGAATTTACCAGACTAGATATTCCGGTCAGCTTGGATCATTCACCATAACTTTTTCCTTAGCAGCCATTTCAACCTAATTGTGAGTAAAGAATATACTGTTAACCTAATTTTGTTGTTCCAAGCAGAATTGATATGCCTTTTTATCTTGTGACTGAAAGTCCTGTGATATTGTGGTGCATGAGACTATTATGCTGTATTTGATAGTGTTGTGACTTCATCTGTTCCTCTTAATTAATGTGGTGATTCCTTTAACCATGATTTGATGGCATCAAGTGAATGACTGCACAAAGTGAGAATTGTCTAGGTTATTTGGACAGACAGtgaagtaaaatactattgatttaAAATAAGGCATGTTCAGAAATGGTCATTTAATGGATGACTAGTAGATGCAGGCTTTCAAGAGTTGGCATTTTCAACAAATAACTGTGGGATTTTAGCAGTTGTGAGACCaacaaaattaacttttaaattttcctcttgTCCTCTAATTTTGTTTTGACTTTCTGGATTGATGCAGTGGTGTTTTGTTCCTTCCGTATTTATAaatgaaacacttttttttagtgtttctaaactttaaaaaatctgcTTGGTTAGTAATCAAGTGGTTGGAACACtgttttgacttttattttaagCATGTTGTTGACTAAAGGCTTCATTGAAGGAAGCATTCTACCAACCTAGTAAATTTGATTCTGTGATCTGTAATGAGGCACCTGATATTTTTTGGTGCTTGATATTTTTGAGGACCAATAATTCAAGTGGATTTTGTTCTTGAACAGTGTCCCAAAAGATTTGAAGATGACATTTGTTGGCTTgaggtctgattttttttttttttttttttaatatactgaaCATCCCTTTCTATCTAGTTGAAAAATGCACAAATTTATATAAGTATCAAAACAAGCCTCTGATAGAAAAGTGAAAGCTGTTGAATGGATATTAATCTAAATTAATCTAGTATGATCAGAAGAGGTGAAGTTTTGGTGTCATAATTTCTCTCTTCATGGTGTTGGACTTTAATcagttaaaatgtatttttaaaatctgtaccACAAAACTTAATGCTTCAATAAAAGTTTGCTTAATTAATTGTTTAGAGacattcagagattttttttaaacgtTAAATCATGTCAAACCTCAAAAACAATCAGGGTTCTGTTCACCAAATTCTTTGGCATCTTAATTTTCAGAGTTGGTACAGAAATGGAGCTATTCTGCCCCTTAAACATCTTGGACATCTGTTCTCTCCTTTTCATTCTACTACCTTAACTTTGCTGCAACCTTTAATCTGATAAACTTACTCCTAGATCCCATTGCCCCAGAAATACATTCCTAGTATTCAAACTAACCCCGTTTTACTTCATGTACCACTTCACATAACTCTTTTTCATCCAGACAGAATTCAGCCATGGTCTTTGCCCACCTCTTCCCATATCGGTACTGTGCCTTTATAACTTTTACTGAAAGggatttcccttttttgatcccAACTCTCCTCTTAACTTTTCTAATCCTTCCCCTCAAGAGGAAGGCCAGCTCacttagaaaattttctttttctttcatacatTCCCTtgttatttctatatattcttaCTCTGCCCAGTTTGAGTTTAAGCTCAAGAATAGgacctttgtctttgtatccctagcacctagtaTAGTACTTTGTGTGTAGTATTTAACATTTGCTTAAAATACTAGTCTGCTAACAACCCTTCTGAGACATCTAATAGTGTCTTGTTTGACCTATGCCCATTGTTCATCAACTTCTTGGGTACATTTTCAGATAACTACTGAACAAACAAGGTTTCTTTAGTCTAAATATTTACTAGATTGGGTGTATTAAATTTGtcattggcttttaaaaaaatcattacctGGTTGGCTAACCTGTACAAATTGAGCCTTTCCAGCTTCCATTAAGATGGGAGATCTTGTGTTCTGTGCTCTTAAATCTTGGAAATTAAACTGACTGATTTACCCaatatcacaaaaataataagggtccaaagttaggatttgaacctagatccaTTAATTCCAGAGCTAGGGCTTTTTCCTCTTATCCTAAGGAACTTCTGCCATAGCCTGTAAAGTTACAAAATAATATTCCCCTGTTGAAAATATCCCTGTTAACCTAGAAGTAGATTAGATTTATCTTGTAAGCCAGCTTATAAATAAGCCTCTTTCCCTACTTGCTCTATTCAGTGCTGAGTGGGGAtggaaaattaatggagaaaGGATCTTGACTCTAAAGTTAAAACTTACACATTTCCTAGATAAGGTAAAATACTCCAAAACACATTCTGATACCTTGTACTCCAGATCTATGAGAAACTCAGATGGTCACTTCTATGGTTCTTGATCCTTCTACTTGAAGAATTTATCAACTGTTTTACTTTTAGCACAGAGGCTATCATAAGTATATCAGAATTgccaggttttatttttttaaaaaattcctcttcCATCTAGAGGGCTGAAATATTGTAATTATCACTTCTCTATGAAAtgttttgcttatattttctcAGTTAACAGCTACTTTGGGGTAGGAA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