Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name PDK1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Sarcophilus harrisii
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr3:400725102-400753472
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PDK1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PDK1P2 chr5:68534082-68536221 + Intragenic
N/A UCSC
PDK1P1 chr2:440393189-440393390 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_031960460.1
CCCGCGGCCCGGCCTCTTCCGTGCCCCGCCCCCTCCGCCCCCACGTACGCGCTACGGATGTCGGGAGCTGCGCGCGGGATGGCGCCTCCTGATTTcggccccctttttttttctccccttctggAAAGCATCTCGCTATGAGATTAATAAGGTATCTGAGGCGGGCGGCTTCGGCCGGCCCGGGCTCGGGCCCCGGTCCCAGCCCAAAGCAAGGTGCTGGTGCTGGTTCCGAGCGCAGCGTCCCGGGCCAGGTGGATTTCTACTCGCGCTTCTCCCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAATTTCTGGACTTCGGATCTGTGAATGCATGTGAAAAGACCTCATTTATGTTTTTGAGGCAGGAGTTGCCAGTGAGATTGGCAaacataatgaaagaaataagtcTCCTTCCAGATAACCTTCTAAGAACACCTTCAGTTCAACTGGTACAGAGCTGGTACATTCAGAGTCTACAGGAGCTTCTggattttaaagataaaagtgCTGAAGATGCTAAAGCTGTTTATGAttttacaGACACTGTGATAAGAATCCGGAATCGACATAATGATGTCATTCCTACCATGGCTCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAAAGCTTTGGTGTAGATCCAGTGACCAGCCAGAATGTACAGTATTTTTTGGATCGCTTTTACATGAGTCGCATTTCAATAAGAATGCTACTCAATCAGCACTCCTTACTGTTtggtggaaaaggaaaaggaagttcaGCTCACCGAAAACACATTGGAAGCATTAATCCAAATTGTAATGTTGTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCAAAGCGTCTTTGTGATTTGTACTATATTAATTCTCCAGAATTAGAACTTGAAGAATTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCCATGCAAGTAGTATATGTACCATCACATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGCGAGCAACTATGGAATACCATGCTGACAAAGGTGTTTACCCTCCTATTCAGGTTCATGTAACACTGGGTAATGAGGACTTGACTGTGAAGATGAGTGATCGTGGAGGTGGTGTTCCTTTGAGGAAAATTGATAGACTCTTCAACTATATGTATTCAACTGCACCCCGACCTCGTGTTGAAACATCTCGAGCTGTACCCTTGGCGGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCTCGGCTTTATGCACAATACTTTCAAGGAGACCTAAAATTGTATTCCTTAGAAGGTTATGGGACGGATGCTGTTATCTACATTAAGgCCCTATCAACGGAGTCAGTGGAGAGGCTCCCTGTATATAATAAAGCTGCTTGGAAACATTATAATACCAATCATGAGGCAGATGACTGGTGTGTGCCAAGCAGTGAACCAAAGGACATGACCACGTTCCGCAGTGCATAGCTGTGTCTAGGctatctgaaaaaacaaaactgatttcTAGTATTATGTTTGAAAGCAACTTTGGAAAACTGTTACACCAAACATTTCTTGATCTTCACTCTCATTAACTAGGTAGAATAAATGGAAAGTGAATTCCATAGTTATCTTTCAGACCTCCTAAAGAATCGAACCATTTAGctgtaagaagaaagaaaattctagatACTGTGTACATTTACTTTTAACTACTGCAAATGTTACATATGTTGCTTCCTTTCCAGTGTACTTCAGGGACTAGGTTTCAGGTATAGAAATTTCCAGGTTCCTCATTGGACCTGTGCAGTTTATTCTTAGTTCTTTCATCTATATCTAGTAAAAGTATTTCCCTAATTGTACTGATTAATTGATTAACTACCTTTttataatctggaaaatcttGTTATGCTTTATTTACATCTACTCAGGAATGAGAGCAAATCGAAATTGTTTTCATGTTATAATCAATAACTGCCTACTGGTTGCATATATAAAGGTAGAAAATTGTTACTCTGTGGCTTTCAATACCACCtgctttttataatttccttttgtgGTTGATTTAGGGGCACTTATTTTTAGaggtaaattttctttttctgaacaaTCAATATCTAGTTTTCTCTGTTCAGTCAAGATCCTGTGAAATTTACAGTCAATAttcttttgattaattaattgaggAGAAAATTTTTTATTGCTAAATGACCAGCAACCCTTAACAAAATCCTTAGAAATTTTGAGGGGATAGTTATTTATTGTGTGATTATAAATTGTGTGTAATGATCTTAATTATGACATGAAGAAGTAGTGTGGCATAATCGATAGAAAACTGGCATTGGAGGCAAGAAAACCTAGGTCCAATCTTGCATTGATACATGCCATCTATGTTTAATTTACCAAAGGTCAGGCACTTTACTTCTTGCCTTAATTCTTTAAGTTTGTAAATTGACTTGTTTTTGGAGGGAATTTGCAAAATAAGAGTTCATcataataatgaaatcacagatctagaatcTTCCCAAAAAAGCAACCCTAATAATGATAGAATTATCCTTACATACCAGATGGGCATAATAATACAGGTCTAGATTAGGTTTCCACAGATATCTAaatatagcataataaaaatCTCAATTAGTCTCCCAGTTTCCTCAGTTGCTGGGAATCTAATTGTATATAGGAGGGGCAGTTATGTAGCTAATTGTACATAAAAGAACACAGcagaatagaaataataagaattGAACAACAATTGATAACAGATTAGTCTTAGAGCTCTAAAAATCATTCTGCACATGTAGTAATTGATTTTTGTGATAAattaccaacaacaacaaaaaaaatcaattctccTTCAGTATTGGAGATATGAATGATTATACAGTAATAATACTATTTTGTGAGCCCATACCATTTTGTTTTAATCAGTGGGAGAAGTGtctcatacatttaaaaaaatcttttattggaaaatattaaaagagattCACATAAGAAGAATTCCATGTTTTCTAATGATGCTGGTTAAATGAGGTATTACTGTccatactatataaatattgcaGGGTGACCTAACAAAAAACCCGATGTATTATTAGTTTACTATGAATTAGTAAATGAAGGGCAAATAATTCTGACTTCTTATCATTGCTGAATATAACTGTCTTCAGATTTCCAGCAATAATGATGTATAAACTTTTGGAACTCTTCAAATCAGAACAGgttttgaataaattttaaaatggtcagtcttaaataaaataatttttttttttacaatcaaagCATGTAAGTTtgacatttgtattttttaatgctGTCATAAAgagatcctttttcctttataaCAAGACATTCATATTTTTAGATGATTGATATGGAGTTCTTTCTGATAATTGTGATTATACACAGAAACTTACAAGAAATTTTTTGTTTCCTCCTGGTTTCTAGTAGGTTAGTATATTGCTTGACTGATTAATTGTTCATGATGGTTCTTAGCTGTTTGTATGTTTTAAAAAAGCTGTTAAGTTTTGTTTAAAATAGTTTCTCCAAGTATGTTGGAGATAAATTACTTTTAACTGTAATATATAGATatcatctattttctaagtcaatacaaGCTGAGAAAATTGGGAATTGTTTTAGGAATTCATAGTAAAGTAGATTTCTGTGTTATGCTTTGATTATATTCATACCTACCTGTGGTTTCCTTTTCttgaattataaaatttaagTGATATATTTAAATGGAAGTGTAAAGTATAATCTTTGAAAGATTTTGTCTATGAAACTAAATTGATACCAtgatttaaacttaaaaaaagaaatcctttcaAAACCAAATTTTACTCTAGGCTGCTATGTCTTATGCAATTAAATCAGCTATTCCTCCCTATCAATGcttaatattcaaataaattttcatcagaaaaggatgaaaatagGAAATTGCAGTTTTGTGAtatatattaatcttttttttttttctttaggggtCAGACATAAATGGTATTGTGGAGACTGAAAAATAAAGTggttgaggaaacaaaggttcaaGCTTCGGAGCATACTGATTTTTTTAAGCAATGCAATGCCAATTGCATAACAAATTGGGAACCAGTGGCCTTTCTCAACTTTGCCATTGGACCTTATATATGGAAGAGAGATTTTCatgcattaaaaacaaataaggcCAGTTAATTTATTGAAAGGACATAATTTGAAAAGTAATTATGTTAAGGataaaatgactcaataaaagTTGTTGCAGAAACATAAATGACCTGATCTGCATCACAAGTATCAAATAAAAACCAATCTAAGCAGAGAGAGGTATTAAACATGTCCTGGGATAACAATACAGTAACGTGAAATTTACTCCACACCAAATCTTTGTTATTTAGTTATAGGCTGTCTAGGAAGAAACTCCTTTTTCTTACTACCACTCCCTgcaccttcatttgtatttttattaactCTATTCCTCCATTGTTGCTATTCTACTCTGTTCTGCCCTTCCATTGAAGCTTGTGAAATGCCAATTTTATTAACTGTTTTCCATATTAAGTCTCTTCCTCtcatattcctttaattttcttgcaGTCATAGAAACGTCTTCTACAGAAGATACTCTGTTCATGGCAATCCCTCCCAGTAGTAAATAGGCAATCTCTCATGTGCCCCCAGTGCAATTGGCTGGGAAGAAGAGTTGACTCCTTTTTTCTCACTGTTTTCGATCATCACCTACAATTATTTTTCCTGGTGAACTTCTTGTAAGTGTCTTCCATACTGCAATATGTGAATCGCATGTTCTATGAAGttatatttcttgatgtctttgggtatacaataaaacaattttaacaactTGT
>XM_031960461.1
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