Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name RPF1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_5:111315144-111326138
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from RPF1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RPF1P2 scaffold_m19_p_4:129976473-129978043 - Intergenic
 N/A UCSC
RPF1P3 scaffold_m19_p_9:10214709-10215755 - Intragenic
 N/A UCSC
RPF1P4 scaffold_m19_p_10:58975409-58976296 + Intergenic
 N/A UCSC
RPF1P5 scaffold_m19_p_12:63731508-63732318 - Intergenic
 N/A UCSC
RPF1P1 scaffold_m19_p_3:69047958-69048822 + Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>RPF1_x4
AGACGCCCAGGAACGAACGCTATGGAGAAGACTGGCGGTAGCCGAAAGAAACCCCTGAAACGCAAAGGCGCTACCGAGGAACCTCAGGAGGCGGCATTTGTTAAGGATGGGGCGACAGAAAGCGAGGTCCAACCCCCCAAAGCGTCTGCCTTTCCTCCAGGCTTCAGCATTTCCGAGATCAAAAACAAACAGCGGAGACATTTAATGTTCACGCGGTGGAAACAGCAACAGCGGAAGGTACGGGAGGGGCGGAGGCTGTAGAGCGCTTGCGCGGCTTCTTTTGCTCGCGGGTTGTGGGGAAGTGGATGGGGTTGTTGAATTTGCGTGGTCCCCTTGCCAGGGTTCCGAGCTGTGGTGACTAATCCGAAGGATTGCCCTCGCCGGGCTTGTTTTGTCCCGGTCCCCTCGTCCTGCTTTTTGTTTGAGCGTCCGTGATTCCTTTTCTTACCAGCTTTTTGCTAGGGGGACTCTGGCTGAGAATGAAGCAATTTTCACTACTCCTCTCCCAATAGTGAAAATTATTTCTTACTGATCTAGGAAGCAAGTTTCCCTCTCCTTGGTCCCGTCCGCTTCCGGTTGGTTAATTCACGGAATCTAACGGAGGCAGTACATAAATTCAAAGTGATGTTTCTCTGATGCAACTCTTAACTGAAATTAGTGCTGTAATGTTTCTAGTAATTGTATTTACTCTTTACAGCGTTGCCCTCATACTCGTCTGGAAGGTAATCAAATAGGGAGAGATAAATAAAGCCCAAGCTGACAGTGCTCATTTGTGGTTAAATTGCAGTTAAAAGTAAAACTTGCTTATTCTTGCACATTGTAAAAGTTCATACACATAATACTCTTTATTTGTCTGCCTCCTGAGCTGTTTGAAGCCCTCAACTGAGTCTTATTCGGCCTGATTGCTGAGTAAGGAGTACATTGAAGGAGCATCTTACCCATTCTGTTGTGCGAGTATGGGGGAAGGGTGCCCTAGAAGACCTGAGACCTGGACTTCCTGCGACCTAATAGACTGAGAGTTAATAACACCGGGGGAGGAGGGGAGGGAGCATTTTCTGTTGTGTGTCAAGCGTTCTGTTCAGAAATGTCCAGAATATACACATTCACAGTACAATCTTAACTCACCTTTCAAGTTCTTAATACCTTTAAAAGCACATTTTGATTATGAAATACATGGAGAGCTAGTGATGCTTTTATTGGAAGCAACGTGAAAATGAATCTCCCATTCCCATTTATTTTTAGTACTTTCCCAGAGAAACAACCAGCATAGCCATGGCTTTCTTTAGGAATGCAGGGGAAAAAAAGCAAAAGTTTTTTTAGATATACATTGTGTGTTTTCACTTAGTTTCAGATTTTACAATAAAAAATAAAGTTAGTGAAATTTTAAATATTCAAAAATTGGCCAATTTAGATTTTTTTTTTGAAGAAGCAGGCTTTTTGTTACAGAAATTTTATTGATGGGCCAGCTCGTTTGTTTTACAATACCTTAACGGAAATCTACGTCAACATTTTAATTTTAATACATTACGAAGATTACTCAATGTAAGTATTTGTAGCATTAGTAATTTGTAGTTTCTGTGTTTATGATATAACTGATGGTTTCTCAATATTATTCTTTTTTCATACCCTTTAGGAAAAGTTGGCAGCTAAGAAAAAACTTAAAAAAGAGAGAGAGGCTCTTGGTGATAAGGCTCCACCAAAACCTATACCCAAGACCATTGACAACCAGCGAGTGTATGATGAAACCACAGTAGACCCTACTGATGAAGAGGTTGCTTATGATGAAGCTACAGATGAATTTGCTTCTTACTTCAACAGACAAACTTCTCCCAAGATTCTCATTACAACATCAGATAGACCTCATGGGGTAATAAATACATTAATTTGTATAGTTCTTGAATTCCTAATGTTCTTTTATTACTTAGACTACTTAAAGGAACCCTGTTCAGAAGAGTTAATTAGTAATTGCCTTAGATGATGCCTGTGAATAAGCTAAATAAAATGTAACACTGATGGAATGTAGGTTTACCAAGCATGATTCTTCAGGATagggtttctcgacctcagcactgttaacatttgggctgtataatttttcgttttgagggtagtcctgctcattataggaaggttagcagcatctgtggcctttacctgctagatagcaccagtatcagccatcccccatccccagccataatcaccagaaatggtgatgttttcagacattgccaacagtctcctggtagaacagagtcaccaccaatgaaagtcactgCTTTAGGATAATCAGCCTGTGGTAAAGAATGAAACACTGTTCAGATTTCATTCTTTTCCTGGCCTTGCTCTCTATTAACATTTTATAATACTTATTGTATCTTTGCTGATAAGTAAATTCTTAACGTCTTCACTTTTGAAGATTTTTGTAATTTTGTTTTACAGAGAACAGTACGACTCTGTGAACAGCTCTCCACAGTTATACCAAATTCACATGTTTATTACAGAAGAGGACTGGCTCTGAAAAAAATTATTCCACAGTGCATCTCAAGAGATTTCACAGATCTGATCGTTATTAATGAAGATCGTAAAACCCCAAATGGATTAATTCTGAGTCACTTGCCAAATGGACCAACTGCTCATTTTAAAATGAGCAGTGTTCGTCTGCGTAAAGAAATAAAGAGAAGAGGCAAGGACCCCACAGAACACATACCTGAAATAATTCTGAATAATTTTACAACACGGCTGGGTCATTCTATTGGACGGATGTTTGCATCTCTCTTCCCCCATAATCCTCAGTTTACTGGAAGGCAGGTTGCCACATTCCACAATCAAAGGGATTATATCTTCTTCAGATTTCACAGATACATATTCAAGAGTGAAAAGAAAGTGGGAATTCAGGAACTAGGACCACGTTTTACCTTAAAATTAAGATCTCTTCAGAAAGGAACCTTTGATTCTAAATATGGAGAATATGAATGGGTCCATAAGCCCCGGGAAATGGATACAAGTAGAAGAAAATTCCACTTATAAAGCAACTGAAGGAGTAATATTGGATTTTGCTGAGCAGGTCTATCTTGAGATTGTGACAGAAGACCCTTCAAAAGGGCATTTGCTGATAACACCTTTCAAATCTGCACAAATTACCTAGTGCCATGAATTACCTACCACTTACTGTTTCTGTAAGAAATATAAATAAATGTCATTTTGGTAAGAGATTAAGTTGTTGCAATTTAGGTTTCTTAAATTTTTGATAACTGAGTAATTAAGTTGGAATCAAAAATCAATATAGTATTCCCCTATGCACCTTCATGGAACATGTGAGTCAGAAAAATGGTGCCTGATAGATTACTAGGTAACCAACACACTGGTTTTATATCAGACTAATCTTTGATCTGGCACCTAGTTTTTAACTCAGTTTTCTGAATGATTAAGAGGCCAGGTGTCTGCAGTTTTTAACATTCCCTTAAGCCTGTCAGAAAGGTAAATATTTTAAAGCAAAAGTTTCCCAAGGACTCAAGCAAAGTTACAAATTATTAAAGCCAATCTTTGGTCCTTTTTTCTTACTACATTGTACCTCATTTGTTGTATTGTGGTACTCCAGGTTGTAAGTTCTTAGGTTTTTATGTATAATGGTAATACCCTTATAAGGAGTTTATTAATTTGTTATTAAAACACAGTTAACCCTATAAATAACTCATGAATAGAAAATGTAACTTCCCCTGACCCTTAAAAGAAGTATGCAACTTACCTTTACTTCTATAGCAGTCTTGGAAATGCAAGCATAGAGTTATGTGAGAGGAGTTGGTGGAACAAACAGTAACAACTTAACCCATCATGACAATGGGAAAATTGCCATTTATCTTAGGTGTTCAAAACAAATTAATATATCGTATACTACCAATAATTAAGCAAAAACCCTTTTATACTAAGTATTTATTTGAATGCTGCGCTCAGTGTATATAAAATAATCATCCTTGTGAAATAGAAATTCATGAAAATTCAGAGAGGTAGATGTTAAGGACTGACAAAGCAGAAGTTTGTATAGTGTGGCACGTGTTACAGGGATAAGCTTTTTGTACAAGCTTCAAATTTAGCTCTCTTCAAATATTCACTGGTTCATGAAAAGTGGTTTAGAACACCTGAAATGGAAAAAAAGGTGAATTAGGGTAAAGTGTCAAAGAGCAAGTTGTTTTCTTTTAACAGCAGTATATTTTATATTACTTTCACAGCATTCATCTAAATGACAGTTTATCAAGTACTTTTAAGCAGACACATCACAGAATTTCTAGGAAAAAGTGAAAAACAGGATGGGAAATGACTATAACTTAATTTCAAAGCTACTCTAAAGTATGTATCATTTATGGTTTTTAACTGGAGACTTAAAGATTAACTTGCCAAGATGATTTCCAGAATATACTCTGATTTTTAAAAAGGTTAATACACAAATCTGTTAATGCTGAGAAAAATCTGAACACCCCTACAAAATAAGCAATAGCGTTGCAGAGAATAGTCTGGTAATATCTGGTAAGATAGAACATGCAATCACACTTCTATTTACCTAGATAAATCTATACACAAAGGGAGATTTGTACACTGATAGGCACTATAGTGATGTTTAACAGCAACGAACTGGAAGTAGCCTAACTGCAACTCAACAGGGTAGTAGATAAAAAGATACACAGCCATTAAAATATCTACATGCGGGAGATAAACTAAGAAATGTGTGTTGTAAAAAGCAAAAACACAGGCACACCAAATTTAAGATGCTATCTATGTGGAAAGGTAGTAAAAGTTTATCTTTTATTAAACTCTTTAAAGATGGGTTTAATCTTGTGTGTTTACTGAACAAATCAATCCTGGATAAAGAAAAGTAGGCTTAGGGACAAAGGTTGGGGAGATGGGGAAAATTATTTAATTCAGGATGGTAGATATAAGGTCCATCTTTATACTTAAAAGGTTGAGATATTCTATAACAAAAGTGTGCAGTCAGTGCAAATtat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>RPF1_x5
ATGGAGAAGACTGGCGGTAGCCGAAAGAAACCCCTGAAACGCAAAGGCGCTACCGAGGAACCTCAGGAGGCGGCATTTGTTAAGGATGGGGCGACAGAAAGCGAGGTCCAACCCCCCAAAGCGTCTGCCTTTCCTCCAGGCTTCAGCATTTCCGAGATCAAAAACAAACAGCGGAGACATTTAATGTTCACGCGGTGGAAACAGCAACAGCGGAAGGAAAAGTTGGCAGCTAAGAAAAAACTTAAAAAAGAGAGAGAGGCTCTTGGTGATAAGGCTCCACCAAAACCTATACCCAAGACCATTGACAACCAGCGAGTGTATGATGAAACCACAGTAGACCCTACTGATGAAGAGGTTGCTTATGATGAAGCTACAGATGAATTTGCTTCTTACTTCAACAGACAAACTTCTCCCAAGATTCTCATTACAACATCAGATAGACCTCATGGGAGAACAGTACGACTCTGTGAACAGCTCTCCACAGTTATACCAAATTCACATGTTTATTACAGAAGAGGACTGGCTCTGAAAAAAATTATTCCACAGTGCATCTCAAGAGATTTCACAGATCTGATCGTTATTAATGAAGATCGTAAAACCCCAAATGGATTAATTCTGAGTCACTTGCCAAATGGACCAACTGCTCATTTTAAAATGAGCAGTGTTCGTCTGCGTAAAGAAATAAAGAGAAGAGGCAAGGACCCCACAGAACACATACCTGAAATAATTCTGAATAATTTTACAACACGGCTGGGTCATTCTATTGGACGGATGTTTGCATCTCTCTTCCCCCATAATCCTCAGTTTACTGGAAGGCAGGTTGCCACATTCCACAATCAAAGGGATTATATCTTCTTCAGATTTCACAGATACATATTCAAGAGTGAAAAGAAAGTGGGAATTCAGGAACTAGGACCACGTTTTACCTTAAAATTAAGATCTCTTCAGAAAGGAACCTTTGATTCTAAATATGGAGAATATGAATGGGTCCATAAGCCCCGGGAAATGGATACAAGTAGAAGAAAATTCCACTTATAA