Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name G3BP1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name G3BP stress granule assembly factor 1
Also known as G3BP|HDH-VIII
Coordinate chr5:151771954-151812785
Strand +
Gene summary This gene encodes one of the DNA-unwinding enzymes which prefers partially unwound 3'-tailed substrates and can also unwind partial RNA/DNA and RNA/RNA duplexes in an ATP-dependent fashion. This enzyme is a member of the heterogeneous nuclear RNA-binding proteins and is also an element of the Ras signal transduction pathway. It binds specifically to the Ras-GTPase-activating protein by associating with its SH3 domain. Several alternatively spliced transcript variants of this gene have been described, but the full-length nature of some of these variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from G3BP1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
G3BP1P1 chr2:135509047-135512074 - Intragenic
ENSG00000235651 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_005754.3
GTGCGGACGCAGTTGCGTGAGGGGTTTGTACTATCCTCGGTGCTGTGGTGCAGAGCTAGTTCCTCTCCAGCTCAGCCGCGTAGGTTTGGACATATTTGACTCTTTTCCCCCCAGGTTGAATTGACCAAAGCAATGGTGATGGAGAAGCCTAGTCCCCTGCTGGTCGGGCGGGAATTTGTGAGACAGTATTACACACTGCTGAACCAGGCCCCAGACATGCTGCATAGATTTTATGGAAAGAACTCTTCTTATGTCCATGGGGGATTGGATTCAAATGGAAAGCCAGCAGATGCAGTCTACGGACAGAAAGAAATCCACAGGAAAGTGATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCACACCAAGATTCGCCATGTTGATGCTCATGCCACGCTAAATGATGGTGTGGTAGTCCAGGTGATGGGGCTTCTCTCTAACAACAACCAGGCTTTGAGGAGATTCATGCAAACGTTTGTCCTTGCTCCTGAGGGGTCTGTTGCAAATAAATTCTATGTTCACAATGATATCTTCAGATACCAAGATGAGGTCTTTGGTGGGTTTGTCACTGAGCCTCAGGAGGAGTCTGAAGAAGAAGTAGAGGAACCTGAAGAAAGACAGCAAACACCTGAGGTGGTACCTGATGATTCTGGAACTTTCTATGATCAGGCAGTTGTCAGTAATGACATGGAAGAACATTTAGAGGAGCCTGTTGctgaaccagagcctgatcctgaaccagaaccagaacaagaacctgtatctgaaATCCAAGAGGAAAAGCCTGAGCCAGTATTAGAAGAAACTGCCCCTGAGGATGCTCAGAAGAGTTCTTCTCCAGCACCTGCAGACATAGCTCAGACAGTACAGGAAGACTTGAGGACATTTTCTTGGGCATCTGTGACCAGTAAGAATCTTCCACCCAGTGGAGCTGTTCCAGTTACTGGGATACCACCTCATGTTGTTAAAGTACCAGCTTCACAGCCCCGTCCAGAGTCTAAGCCTGAATCTCAGATTCCACCACAAAGACCTCAGCGGGATCAAAGAGTGCGAGAACAACGAATAAATATTCCTCCCCAAAGGGGACCCAGACCAATCCGTGAGGCTGGTGAGCAAGGTGACATTGAACCCCGAAGAATGGTGAGACACCCTGACAGTCACCAACTCTTCATTGGCAACCTGCCTCATGAAGTGGACAAATCAGAGCTTAAAGATTTCTTTCAAAGTTATGGAAACGTGGTGGAGTTGCGCATTAACAGTGGTGGGAAATTACCCAATTTTGGTTTTGTTGTGTTTGATGATTCTGAGCCTGTTCAGAAAGTCCTTAGCAACAGGCCCATCATGTTCAGAGGTGAGGTCCGTCTGAATGTCGAAGAGAAGAAGACTCGAGCTGCCAGGGAAGGCGACCGACGAGATAATCGCCTTCGGGGACCTGGAGGCCCTCGAGGTGGGCTGGGTGGTGGAATGAGAGGCCCTCCCCGTGGAGGCATGGTGCAGAAACCAGGATTTGGAGTGGGAAGGGGGCTTGCGCCACGGCAGTGAATCTTCATGGATCTTCATGCAGCCATACAAACCCTGGTTCCAACAGAATGGTGAATTTTCGACAGCCTTTGGTATCTTGGAGTATGACCCCAGTCTGTTATAAACTGCTTAAGTTTGTATAATTTTACTTTTTTTGTGTGTTAATGGTGTGTGCTCCCTCTCCCTCTCTTCCCTTTCCTGACCTTTAGTCTTTCACTTCCAATTTTGTGGAATGATATTTTAGGAATAACGGACTTTTAAAGAAGCAAAAAAAAAGACTGAATTTCCTTGCTTACTTTGCATATACAGACTGGATTTTTTTTTTTTTTTTACAGCCATTTCCCCAAAGGAATGTCTTGCATATTACTGACATTTGGTATGTTTCATTCATTGGAATATTTCTTATTTTCTACGTGTTTGAAAAGCCTGTAAGAAATACAGGATTTGATAATATTTTGAAGGCAGGAAAAACCCAAATTGTTTCTTCTTTGAGAGTCATGACTACCTTCTGGTGTGGAGAAATTGCCATTGGAAAATTTGACAATTTTGATTCTCACTGGTATGTTTAAAAACTGAATAAAAGGAATAGAATTTTTTTTTGATAAAGGATCACAAAACAATTCTAAAACCTAACTGTTTTTACCATTGAAATTTAAATTGTGATAATAGGTTTTAAATGTCTAGAATGCAACTGATAGGCTTTTCTTGAACTGTTAGTTTTTTTGAAGTAGTTTTTTCATGTTTAATTTGTATTTGTAAAAAAACAAAAAGCAAAAAAATTCCCAAAACCCAGATAACAACCAGAGCAAAACTGTTGTGCCTTCTATTTATCTTTGATTTCAGTCTTGGCAATTGTTTAAAAAAAAAATCTAGATTTGTTTTATTAGGTTCAGAGTATGTGGGGAATTATAGAATCCCTCTTTCATCACTTTGTGTATGTCTTTTGTTAACATATTTGTTATGCCTTATTCTAAAATTGAGTCTCAAACTGGAATGCCTTTGAAGACAGATGCTTCTATAGAGGTTCTTTGACCTAAATAGTTCAGCATTTGTATTTTTATTCTGGTATCTAATCAGATTCCTAATCATAGCCCGTAAGAAGGAATGTTACTTTAATATTGGACTTTGCTCATGTGCTCGTGTCCGCATTTTTTTTTTTCTTAAAATCATAGCCATATGGTAAATTTTCTATTTTGTTATGGTTCTCTTTTATTGATGGGCATGCAGTGGGTGTTACTTGGAAATGGCCAATTTTTATTAAAATATTTCTGGAAGAAAATTTAATCTGGCAATATAGACTAATACTCGTTTCACATATGTGTTATTTGTTGAGTGCTGTGTGTGAGATGGGTGAAGGTTTTGTTTACACGTGTGAAACAAACTTTTGTGTGATTGTCATTACTAATTGAAGGGCAACCAGGTTGTAAAATTCAGCGTATTTATTTTCTTAACAGTATTCATCTTTAGGACTGTCGTTTGAGGATAGCATAGGAATATTTGGTTTGCATTACTGAGAAACTCTAGGTTTGCTGTGATGGTTAAGACCACAGTGAAGTTGGTATTACCAGTTTGGTTCCAGTTCCTCAAATATTTGAAAATTGGCAGCATCTCCTTTACATAAACTTAATGTAACTGAATCACATGGCTTTTTTGTAGGGTTAAAGTAACTTTGGTAACCACTTTTGGCCCAGATCACTGATAATAGGAAGAAATACAACTTATACTTTTGTAGCTTATATTAAGCATGTGGTGGGTGGAAAGAAAAGTTTAGTCTGAGTCACTTTGGAAAAAAAAATTACTTTGTGGTAACTTCAAGGTCATAAATTATGGATAGCCTAGAAATTATCCTTCATGAGTGAATACTAAATTATACATTTCAAAACAGAAGTTCTTCCTACTTGGAGACTTAAGGGCATTAACTAGATGCAGCAATCCTCAGCTTGGTGTTATCACATACTAGAGGACATTTGGAAATGTGTGAAATTTGGAAGGGTTGTTGGAGAGACATGCATCTGGCATTTATTGGGTGGGGTCTAAGGATACCAAATGTTGTGTAAAAATGAAGCAACCCCATTGAGAACACTGATAGTCCCTATTCCTGTGGGTGGGTGGAGCTGTGGGATTAGGAAAACTGGAATGAAGACTCATTCTTTTGAAACTCAGCCTCAGATAAATAACAAACTAGGAAATGGAAATCTGTTTCAAGAATTGCAGTAACATCTACTCTAAGGAATTAGTAATTTCACTTTTTATTATTTGTACCAAATGTATGTGTGTGTTGTGTATGTTGGTGTAAATGTGGAGAGGTGGTAGCAATACATACTGATGCTGCTTGTAATTTGTTGCAGGGAATTACTGCACAATCTCAGAAAATAGAAAGCTTCCCCAGTGCTTTCTGTCATCAGAGTTGGGATGATTGTGAGGTTTTGAATGATAGTATTGGACCTAAGAAATAGGATTAGCATCATGATCAGAACTGTTGAGAATCCTTGTACAATTATGTACATTATTGCATGTAGAGTAAACCTGAGAGCTTAGAGATGTATACGTTTCCACTGCTGGAAAATCATTATAAGTTAGGGCAACATTTTCTATAGGTGGCAGCAGTAGGAGCTCATCACATTGAACATTTTCAGATTTTAAAATGAAAATTTTCATCCGTAGGAATGGCCCAATGTATAGTTATTAGCTACTGAGCTTAGAACTCTTGACCCATGAGATTTTTTTTTTAAAtttttatttttatagaggcaaggtcttgctatgttgtcaggctggtctcaagctcctggcctcatcagttctcctgccttccaagtagccggaactacaggtgtgcaccattgcacctggcCTCATGAGTATTTTAGTTAGATAAGATTTGTTTGGTTCAGTGGGTCTTAGTTTTTTAAGACCTGTTAATTTGTAATTAGACATCTTGGGCCTTAAACTGTATTTTTGTTTTAGTGGTGAGGTTGGGTTTTACTTTGTGTATTCCAGCGTTCTCAACTTTGTCAGATATTGCTAGGGACCAGTGAGATAGATAATCCAAAAATAATAATTTGACTTTGGTTGAGTATGTCATTACCACAGTGTTAGTTGAATTGCACTTTAGGTTAGAAAAGttaattttcacatctgtgctgcgggttaggtgatattgtcctcagcacaatagatgaggaagaaactgaatcagaacagttaaatgacaggcttccaagtcatccatgtagcaaggagcacatttgcctcccaaactgatgctttttctctagaaccataatgcccccctAATTACATTTCAGTAGCATAGACCGCAATGAACTTCCTACTGTAGGGAGACTTGAGTCTGGAATACATTCAGAACAAGGTTAACATTACAGTTCTTAATTTCCTTTAGGGCAAACAAGATAATTAAACTTGGGTTTTGTGAGTCTTTTTTTGATTTGCAGATTATATATGGTAACACAATAATGGTGGTTTGT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