Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SUMO1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_4:180001889-180030158
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from SUMO1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SUMO1P7 scaffold_m19_p_15:2510133-2511282 + Intergenic
N/A UCSC
SUMO1P1 scaffold_m19_p_1:178991495-178992687 + Intergenic
N/A UCSC
SUMO1P3 scaffold_m19_p_3:140634316-140635233 + Intergenic
N/A UCSC
SUMO1P4 scaffold_m19_p_4:69918771-69919262 - Intergenic
N/A UCSC
SUMO1P5 scaffold_m19_p_8:82971017-82972089 + Intragenic
N/A UCSC
SUMO1P6 scaffold_m19_p_10:57466117-57467143 + Intragenic
N/A UCSC
SUMO1P2 scaffold_m19_p_3:104609921-104610146 - Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>SUMO1_x2
GCAGACGCGGTGTTGTGCTGTGGGGAAGGGAGACGGATTTGTAAACCCCGGAGCGAGGTTCTACCTACCCGAGGCCGCTGCTGTGCGGAGACCCGGGGTGAAGCCACCATCACCATGTCTGACCAGGAGGCAAAACCTTCAACTGAGGACTTGGGCGATAAGAAGGAAGGAGAATACATTAAACTCAAAGTTATTGGACAGGATAGCAGTGAGATTCACTTCAAAGTGAAAATGACAACACATCTCAAGAAACTCAAAGAATCATACTGTCAAAGACAGGTCAGAGAATTGCTGATAATCACACTCCAAAAGAACTGGGAATGGAGGAAGAAGATGTGATTGAAGTTTATCAGGAACAAACAGGGGGTCATTCAACGGTTTAGATATTCTTTTTATTTTATTTACTTTTCCCTCAGTCCTTTTTTATTTTTAAAATTAGTTCTTTTGTAATGTGGTGTTCAGAATTGAATTGAAAACTGACCCCTACCCCCTGTGTCTTTAAAACATCTGGTAATTTGAATTCTAGTGCCCATTCATTATTGTTTTGTTTTCATTGTGCTGATTTTTGGTGATCAAACCTTAGACCCCTTCATACTGCCCTCTCCTTTTTAAACATTACATGTGTGCACAGAGAGGCCACCTTTTTCAGGACTGTGCATTTTCAGGCTTGTGATACATGAGGTCGACCAATTCAAGTGTTCGTAATGACATTTCTAATTGGCCCGGAAGTTCTAGCTTGTGATTGCTTCACTCCTGGACTATGACTTTCAGTGGGAGATGGAGGTTTTTCGGAGAACTGAACCGTGGAAAATGACCTTTCCTTAACTTGAAGCTACTTTTAAAATCTGAAGGTCTGGACCAAAAGAAGAGAAATACCAGGTTGGAGTCAAGACGACAGATAAAGCGAGAGTAAAGACTAACTCCAAAGATGGCTTCACTGAAGAAAAAGCATTTTAAGAGTAAAGAAAAATCTTGTCAGAAGATCCCAGAAAAGTTCTAATTTTCATTAGCAGTTAATAAAGTTATTCATGCAGAAGTGTGTACAACAGAACACTGCTCTTTTTTATTTTAATTTGTACTTTTTGGCCTGGGATATGGGTTTTAAATGGACATTGTCTGTACCAGCTTCATTAAAATAAACAAAATATTTGTAAAAATCACACTAATGTTCCATTTTATTTTTAATTGTACAGAAAGAAAAAAAAGGCTGAAACAAGATTTTCTTGCATAATACTGGAAATTATTGTTTGTACGTGGTACAAATACatattttttcagtactgtacagtgatggtcatcatggctttgaagcactgaaagttactgaagtgccttctgaattaaggatttaattaaggccacaataccttcttaaatactcagtgttctgttttttaaaaatacttgatatttctgtatggtgcatatatatgataCAGTTACCTAATCATGTTGAATAAATGGGCACACCAAAAATTCTTAATTGGTTTATATTGATAATTTCAGTTATTCCTTTAACAAAATGTTTCTCTGCTTACTTAAGGTTTGATATATTTTGTTTATATTTTCCCTTTATTTCTTTATATCTTATATACTTAAATTGTGTAAGATTAAAGTACCAAATAAGTTTCTATTAGAGGTCTTATCCTTTTAACTTTTTAATGAATCACACAATTTAGTATATCTATGCATACACATAATCCAGTTTGATGTTATCCCAAATAGAATGTCATCTGGGCATTTGAGAAAAGCAGGTAAAACCTGTCTCTAATGCATTTTATAAACTGTTATAAATCCAGGTCACCTCCTAAAAATAATTGGTTTGCCTTATAAATTCTTGTATCTGACCCTATCTGAAAAATTATTTGTATTATATATAGTCTAGGTAAATTACTGCATTTAGACCATCACCTGGCATTTATTACATTATATTAAACAGTGACTAGAAATTAGGCCAGTTTTAGGAAATCCTCATTGAATTGTGTATTTCTATCAGGCCTGAGTAACAAAGCTGATAGACTATTTGAGCAATCCGGAATGCGTGAATAGGTGGTTTGGTGTCTTATTTTTGTTTGCATCTCTGAAGGCTCTCAGCATTTAGGTGATAGAGCTTAGCTACTGGGGAAATAAATTTTATATTTTCAATT
>SUMO1_x4
GCAGACGCGGTGTTGTGCTGTGGGGAAGGGAGACGGATTTGTAAACCCCGGAGCGAGGTTCTACCTACCCGAGGCCGCTGCTGTGCGGAGACCCGGGGTGAAGCCACCATCACCATGTCTGACCAGGTATTGGACTGGGAGCCGTCTGATGGCGGTGGTCGAAGCCTTTCTTGGCAGGAGGCAAAACCTTCAACTGAGGACTTGGGCGATAAGAAGGAAGGAGAATACATTAAACTCAAAGTTATTGGACAGGATAGCAGTGAGATTCACTTCAAAGTGAAAATGACAACACATCTCAAGAAACTCAAAGAATCATACTGTCAAAGACAGGGAGTTCCAATGAATTCACTCAGGTTTCTCTTTGAAGGTCAGAGAATTGCTGATAATCACACTCCAAAAGAACTGGGAATGGAGGAAGAAGATGTGATTGAAGTTTATCAGGAACAAACAGGGGGTCATTCAACGGTTTAGATATTCTTTTTATTTTATTTACTTTTCCCTCAGTCCTTTTTTATTTTTAAAATTAGTTCTTTTGTAATGTGGTGTTCAGAATTGAATTGAAAACTGACCCCTACCCCCTGTGTCTTTAAAACATCTGGTAATTTGAATTCTAGTGCCCATTCATTATTGTTTTGTTTTCATTGTGCTGATTTTTGGTGATCAAACCTTAGACCCCTTCATACTGCCCTCTCCTTTTTAAACATTACATGTGTGCACAGAGAGGCCACCTTTTTCAGGACTGTGCATTTTCAGGCTTGTGATACATGAGGTCGACCAATTCAAGTGTTCGTAATGACATTTCTAATTGGCCCGGAAGTTCTAGCTTGTGATTGCTTCACTCCTGGACTATGACTTTCAGTGGGAGATGGAGGTTTTTCGGAGAACTGAACCGTGGAAAATGACCTTTCCTTAACTTGAAGCTACTTTTAAAATCTGAAGGTCTGGACCAAAAGAAGAGAAATACCAGGTTGGAGTCAAGACGACAGATAAAGCGAGAGTAAAGACTAACTCCAAAGATGGCTTCACTGAAGAAAAAGCATTTTAAGAGTAAAGAAAAATCTTGTCAGAAGATCCCAGAAAAGTTCTAATTTTCATTAGCAGTTAATAAAGTTATTCATGCAGAAGTGTGTACAACAGAACACTGCTCTTTTTTATTTTAATTTGTACTTTTTGGCCTGGGATATGGGTTTTAAATGGACATTGTCTGTACCAGCTTCATTAAAATAAACAAAATATTTGTAAAAATCACACTAATGTTCCATTTTATTTTTAATTGTACAGAAAGAAAAAAAAGGCTGAAACAAGATTTTCTTGCATAATACTGGAAATTATTGTTTGTACGTGGTACAAATACatattttttcagtactgtacagtgatggtcatcatggctttgaagcactgaaagttactgaagtgccttctgaattaaggatttaattaaggccacaataccttcttaaatactcagtgttctgttttttaaaaatacttgatatttctgtatggtgcatatatatgataCAGTTACCTAATCATGTTGAATAAATGGGCACACCAAAAATTCTTAATTGGTTTATATTGATAATTTCAGTTATTCCTTTAACAAAATGTTTCTCTGCTTACTTAAGGTTTGATATATTTTGTTTATATTTTCCCTTTATTTCTTTATATCTTATATACTTAAATTGTGTAAGATTAAAGTACCAAATAAGTTTCTATTAGAGGTCTTATCCTTTTAACTTTTTAATGAATCACACAATTTAGTATATCTATGCATACACATAATCCAGTTTGATGTTATCCCAAATAGAATGTCATCTGGGCATTTGAGAAAAGCAGGTAAAACCTGTCTCTAATGCATTTTATAAACTGTTATAAATCCAGGTCACCTCCTAAAAATAATTGGTTTGCCTTATAAATTCTTGTATCTGACCCTATCTGAAAAATTATTTGTATTATATATAGTCTAGGTAAATTACTGCATTTAGACCATCACCTGGCATTTATTACATTATATTAAACAGTGACTAGAAATTAGGCCAGTTTTAGGAAATCCTCATTGAATTGTGTATTTCTATCAGGCCTGAGTAACAAAGCTGATAGACTATTTGAGCAATCCGGAATGCGTGAATAGGTGGTTTGGTGTCTTATTTTTGTTTGCATCTCTGAAGGCTCTCAGCATTTAGGTGATAGAGCTTAGCTACTGGGGAAATAAATTTTATATTTTCAATTAATTGGGTTCTTCCAAATGCATTGAATTTTGCTGTGGTTAACTTTCAAATGTGATTATCTATCTGGTGTAGTAATGCTGGTAAAATAGGCCTTTCACAGCAACAGTTTAATAGATTATCAGAATTGGAAGGGACCTTGAATAACATTTAGTGTAGCCACTCTATATAGTGCTTGACTGCAACATCCTAAATTTGTAAAAGAAGGAAGAAAATAAAGTCAATAATGGTAATTTGCCCCAC
>SUMO1_x5
ATGTCTGACCAGGAGGCAAAACCTTCAACTGAGGACTTGGGCGATAAGAAGGAAGGAGAATACATTAAACTCAAAGTTATTGGACAGGATAGCAGTGAGATTCACTTCAAAGTGAAAATGACAACACATCTCAAGAAACTCAAAGAATCATACTGTCAAAGACAGGGAGTTCCAATGAATTCACTCAGGTTTCTCTTTGAAGGTCAGAGAATTGCTGATAATCACACTCCAAAAGAACTGGGAATGGAGGAAGAAGATGTGATTGAAGTTTATCAGGAACAAACAGGGGGTCATTCAACGGTTTAG