Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name VAPA
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m19_p_10) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Phyllostomus discolor
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m19_p_10:56341309-56391417
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from VAPA

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
VAPAP1 scaffold_m19_p_2:132546210-132547185 + Intergenic
 N/A UCSC
VAPAP2 scaffold_m19_p_2:163980313-163981396 - Intergenic
 N/A UCSC
VAPAP4 scaffold_m19_p_7:57374570-57375822 + Intragenic
 N/A UCSC
VAPAP5 scaffold_m19_p_9:67864101-67865347 + Intergenic
 N/A UCSC
VAPAP3 scaffold_m19_p_3:209484116-209485285 - Intragenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>VAPA_x4
GGATCGCAGTGCGCGTGGCCGCGGTGGTTGGTGTGGGGTTGAGTCAGTTGAGACCCGGAGCTGCTGACCTAGCAGGCGTCTCACCAGCCCCGCGCCTTAACTGCAGGCATTTGTGTGCTGGAGCCTTGAAGTGTCCGGGTCACAGAGTTTGCGGGGGCCGTCGCTGCTGTCTTCCCTCGTCCCCAGCCAGCAAACCGCCGCAGCGGGCGCGCCCCCGCTCTGCGCTGTCTCTCCGATGGCGTCCACCTCTGGGGCCATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGACCCTCCCACAGACCTCAAATTCAAAGAGGAAGAGGAATATAGACCAAAACCATTGTTTTGAGGGTGGCCCATAACAATAACAAATCAGTAAAGAAAAGTAATCTGTGTGAGGAACCAGGGGACCTGTGATGTGTCAGCCAGATCATCTTTGAATAGCTGCGTATCACTGAGAGAAAGGACAAGTGAAGATGCAGAGTACTTCTACTCTTGGATACCTGGCACGTTTTTAGGTGTTTCAGGCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTAAGTTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTATGTTTCAAAGTGAAGACTACAGCACCTCGTCGGTACTGTGTGAGACCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGGGTCAACTGTGACTGTTTCAGTAATGCTACAGCCCTTTGACTATGATCCCAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTTGCCCCACCAAACATTTCAGATATGGAAGCTGTGTGGAAAGAGGCAAAACCCGATGAATTAATGGATTCTAAATTGAGATGTGTTTTTGAAATGCCCAATGAAAATGATAAATTGAATGATATGGAACCTAGCAAAGCTGTTCCGCTGAATGCATCTAAACAAGATGGACCCATGCCAAAACCACATAGTGTTTCACTTAATGACACTGAAACAAGGAAACTCATGGAAGAGTGTAAAAGACTTCAGGGAGAAATAATGAAGCTGTCAGAAGAAAATCGACACCTGAGAGATGAAGGCTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACACTCGGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCGTCCTTCAGAGATAATGTCACCAGTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTCTTTCTAGGGAAATTCATCTTGTAGAGTGAAGCATGCAGAGTGCTATTTCTTTTATTTTCTCTTGACCAGAAAAAGATGTGTTTACCTACCATTTCATTGGTAGTATGGCCTACGGTGACCATTTTTGTGTGTGTGTACAGCGTCATATAGGCTTTGCCTTTAATGATCTCTTACGGTTAGAAAACAGAATAAAAACAAACTGTTTGGCTACTGGACAAATTGTATATTACCAGATCATCACTAGCAGATGTCAGTTGCACATTCAGTCCTTTATGAAATTCATAAATAAAGAGTTGTTCTTTCTTTGTTGTTTTAATAAGAGTTCAAGAATTGTTCAGAGTCTTGTAAATGTTATTTTAATAATCCCTTTAAATTTTATCTGTTGCTGTTACCTCTTGAAATGATTTATTTAGATTGCTAATCCCACTCATTCAGGAAATGCCAAGAGGTATTCTGTGGGGAAATGGTGCCTCTTACAGTGTAAATTTTCTCCTTTACCTTTGCTAATATGGCAGAACTTTTCTTATCCCTTGTGAGGCAGTTGTTGACTGAGTTTTTCATCCTTACAATTCTGTCCCATGGTATTTAACATTAAAACAAATAAAACTATTAACAGATTCTTGCTCAACAGCTTGTGTCTGTCGTGTCATTAGACGGGGATAACAGAAAGTCCACTCCATGATAATTTGAAACTTAAAATGCATAATTTTATTTCACATTGAAAAACCCTTTCAGATTTACAGTATTTGTAAGTAAAAGTTCTCATTCTATTAATGAAaggaactgatcagtttcactgtacttttcatattttgaaAGATAATCAGTTTGTCTTCAAGATAATATAAATTAAGCAAATTTGATGAGAATAAAAGTGCTGTAATTTTTGTCAGTTTATGTGTATGCCTTGTGGCTGTATTGCGTTTACCCCATTCTAAACAGGTCCTTTTAGTATTGTTCCAAGAAAGATTCATTCTTCTTGGTTGTTCTAGTCAAGTGCTTTTTAATGAGCTTATTAATAATTCCTTTTTATAATATTTCATAATAATAGTTAAAAGTAGGTGTTTTTCCTGCCCAATTTGACACTCAAAGTAAATTCCCATTCTGGAAATTTATCACTGAGCAAGCCTTGGGAATCTTTGTGAGAAATGACTTTATTCCTTGCAGTTCTGTTAACCATGTGAAACACATTTTCATTGTAAATGTGCATTATAGGGTTTGAATTTATTTCACGTGTATCAGCATAGAAAATTTTGGAACCATAGAAAATACGttcttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttAACTGAGTACAAGTGAATTTTGATCCTGAAAATAGGTGTTGGTTTTGTAAAAGATACATTTCTATCTGAAAGGGAGATTGGACTTTGGGACTTGATGTGATCAGTGAAGTATGTTAGGCCCATGTCTGTGTATACATTTTATAAATGAGTGAAATGCTCTAAGTATTTTGTTTGACCTTTCATTTTAAGTATATTTTGATTTGTCTAATCACATTTATTGTGTGATTGGCTCTATATGGTATTTTCTACAAAACTTCTTGCTGTTGTGCAAAAGTTACTAAAAACAAGCACAAGTAACACCCATCTCATTACTAGCATGCTACTGCAGGTAATGTTTCCATTGCTGCTGTATGAATTACAGTCATTGTAAAATTTCCTTCCCTTTCTGATAACTGGAAAAGCATGCTAGAAAGAGTCTTGCATTTTTACCCCATAAATGCAGAATCAGTAATTCCTTGGCTTAAAGCTCTGTATAATCTACATTATTGGTGATAAGTATCAAGCTTGATATTTCATGGCTGTCATTTTTTTAAACATTTAAGTTCTCAAAAATTTACCAAAATCCCATTTCATGGGAATGTTCCTTAGATATCATTTTGTTCAACCCCTTTGTTCATAGTTAAGGAAACTAAGGCCTTTATGAGAGAGAGTTAAAGAGAACTTTCCTTGCATCTCATAGATAGGTGAGGCAGGGCTAGACCTAGTAATCTGCTCTCCTGACTTTGGTTTGGTGTATTTTCTGGTCACTTTGTAGGGAAAAAAATGTATTGATTTAGTTCATGACTTGAAATAATGAACCTAAGATGCCATTTAATAAGAGTATGTGGTTTTCTATCGTAGACTTGTATTATACGCCACTACTGTTGAATAGTCTCATGTATATGTTTTCTTTTAGTGTTTAGGCTAGAAATGCTCCCATCCCCTAACATTGGTAATAAACACTATGAAATACAGTGTATTTTTAGATAGGCATTTTGCAAAATGCATTATGCAATGGTTGGATTTTAGATATAGTCTGGGCAGCACCTGCAAAGAAAAGGGTGTGTGGGCTTAACTGCTTTACATATCAGGAAATGCTCTAATTGTATAGGAGATTTTTAATTTGTTCTTTTTAATGAGTGTATGAAGTGTGATCAGATTATTTTATTACCAGTGGTTACTTTAAGAGTTCAGCTGTATTGACTGATAACATAGATTAAATTGTCTTCATTTCTTACATGTTTAGAAAATTTTGTCTGCCTGCTTACTTTTGTATGTAAGCATGAGGGAAATACACTGTTGCTAATACTGAAATCACAATCCAGTAACTAAGGCCTTAAGTTCGTATGTGATGTTAAATGCACTACCTTCCTTCATTCTTTCTATAATTAATGTACCTTAACTCTGCCCATTCTTTTATTTACAAGAAACAAATTTAAGAATTGTACTCTTGAGTGTGTTACCTTTTAAAAAATGGCACTTGGAAAAATGTACTTAATTCAGAAATTCTGGTCAAAGAAAAAATAATATTTCTCCTTCAAGTATCTTGCTCAGAACTTTTGCTAAAATTGATATTATCTGCTGTGGGAATTACTTTTGAATTGTAATCATTCAAAACATGCCACTTCAAAACGAAGTTTTATCAATATGGTAAAAAAGAAGAGTTCTTGTACAGTATGACCCCGAATTGTGATCTTTTGCCACTTTAAAAGCAATCAAGTAATAGTTTTCCTAGAGCTTTGCACATTCCTATTCAGTGATTTGGTGTGTGCATAGATTTTTAAAAATTGACCTTTCTGGGAGTTAGGGAAAGATCAGTGTTTACCGTATGGAAAAACAATAAAAATAAGGTAAATGATCTTTATTTTCTAGCTTTCAGAGGAAATTAAACTGTTACGTGAATAAATAAACTGATTAAAAATC
>VAPA_x5
ATGGCGTCCACCTCTGGGGCCATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGACCCTCCCACAGACCTCAAATTCAAAGGCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTAAGTTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTATGTTTCAAAGTGAAGACTACAGCACCTCGTCGGTACTGTGTGAGACCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGGGTCAACTGTGACTGTTTCAGTAATGCTACAGCCCTTTGACTATGATCCCAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTTGCCCCACCAAACATTTCAGATATGGAAGCTGTGTGGAAAGAGGCAAAACCCGATGAATTAATGGATTCTAAATTGAGATGTGTTTTTGAAATGCCCAATGAAAATGATAAATTGAATGATATGGAACCTAGCAAAGCTGTTCCGCTGAATGCATCTAAACAAGATGGACCCATGCCAAAACCACATAGTGTTTCACTTAATGACACTGAAACAAGGAAACTCATGGAAGAGTGTAAAAGACTTCAGGGAGAAATAATGAAGCTGTCAGAAGAAAATCGACACCTGAGAGATGAAGGCTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACACTCGGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCGTCCTTCAGAGATAATGTCACCAGTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTCTTTCTAGGGAAATTCATCTTGTAG