Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name TRIM13
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr13) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name tripartite motif containing 13
Also known as CAR|DLEU5|LEU5|RFP2|RNF77
Coordinate chr13:49997042-50018467
Strand +
Gene summary This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This gene is located on chromosome 13 within the minimal deletion region for B-cell chronic lymphocytic leukemia. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from TRIM13

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
TRIM13P1 chr16:71833725-71834724 + Intergenic
ENSG00000262140 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_213590.3
GAGTCCATTTTGGGGCTGTGCTTGGCGCGTACCGTGCGGTCCCTGTAGTTGGAGGACGGGCGGTCGCGCGGCCTTTCCCACTAGCCGGAGGTCGGAGATAAGTACCCGCCGCCCGGCTCCTCTCGGGAAAGCGGGGTGGTCCTCGAACCTTCAGCGAGGGTGGGGAGTTGCCCAGGTCAGCAGGGATCTGCGTGGGTTGGGGGGGCTGGCGAAGGCCGTCTGAGCTCCAGTCCGGCAGCGCGGCAGAAACCAGCGGGGCACTGTCATGGGCCTGGGGAGGAGCGGCCTGCGGAGGGCGCCGGGGCAGTGTGTCTGTGGTCCAGAAAACCTGCTCCGTCCGGAGCCTTCCTGGCCCCGCTACCAGCGTCTCCACATCCCCTAGAAAAGAAAAGACGGGTGTGGGCCTTAGGTTACAGCGCGCCGCCAGCGTTTGGTTGCATGGCGCCGGGGGAGGGCGCCCTAACCGAGAAGCTGCTTAATACAAAGAGCTCCAGGCTCCTGGCGGTTCACCAGGTCTAAACAGCCGGGCTTTATTTGTGGGGGCGATTGAAAAAATTGAGGGTCAAGATTGGGGTGCTGTGCAAATAAATGCGTTAATACTGTTCTTTTTCTTCTTTCTTTGCAGTAGCCTCTAGTTCGTTAGTCAAAACGTGAAAAAAAAGACCTGCTTTGCCCTGGGAAATAGTAACCCTGCCAAATACATCAGCTTGTAGGAGACAGAGGATGTGATGGAGCTGCTTGAAGAAGATCTCACATGCCCTATTTGTTGTAGTCTGTTTGATGATCCACGGGTTTTGCCTTGCTCCCACAACTTCTGCAAAAAATGCTTAGAAGGTATCTTAGAAGGGAGTGTGCGGAATTCCTTGTGGAGACCAGCTCCATTCAAGTGTCCTACATGCCGTAAGGAAACTTCAGCTACTGGAATTAATAGCCTGCAGGTTAATTACTCCCTGAAGGGTATTGTGGAAAAGTATAACAAGATCAAGATCTCTCCCAAAATGCCAGTATGCAAAGGACACTTGGGGCAGCCTCTCAACATTTTCTGCCTGACTGATATGCAGCTGATTTGTGGGATCTGTGCTACTCGTGGGGAGCACACCAAACATGTCTTCTGTTCTATTGAAGATGCCTATGCTCAGGAAAGGGATGCCTTTGAGTCCCTCTTCCAGAGCTTTGAGACCTGGCGTCGGGGAGATGCTCTTTCTCGCTTGGATACCTTGGAAACTAGTAAGAGGAAATCCCTACAGTTACTGACTAAAGATTCAGATAAAGTGAAGGAATTTTTTGAGAAGTTACAACACACACTGGATCAAAAGAAGAATGAAATTCTGTCTGACTTTGAGACCATGAAACTTGCTGTTATGCAAGCATATGACCCAGAGATCAACAAACTCAACACCATCTTGCAGGAGCAACGGATGGCCTTTAACATTGCTGAGGCTTTCAAAGATGTGTCAGAACCCATTGTATTTCTGCAACAGATGCAGGAGTTTAGAGAGAAAATCAAAGTAATCAAGGAAACTCCTTTACCTCCCTCTAATTTGCCTGCAAGCCCTTTAATGAAGAACTTTGATACCAGTCAGTGGGAAGACATAAAACTAGTCGATGTGGATAAACTTTCTTTGCCTCAAGACACTGGCACATTCATTAGCAAGATTCCCTGGAGCTTTTATAAGTTATTTTTGCTAATCCTTCTGCTTGGCCTTGTCATTGTCTTTGGTCCTACCATGTTCCTAGAATGGTCATTATTTGATGACCTGGCAACTTGGAAAGGCTGTCTTTCAAACTTCAGTTCCTATCTGACTAAAACAGCCGATTTCATAGAACAATCAGTTTTTTACTGGGAACAGGTGACAGATGGGTTTTTCATTTTCAATGAAAGATTCAAGAATTTTACTTTGGTGGTACTGAACAATGTGGCAGAATTTGTGTGCAAATATAAACTATTATAAAATCTGTTTCAAGTATGCAGTTTTCTTTTGTTAGAAATTGTTAGAGAATAGAGAGTGGTAATTCAGATTTGGTCAACGATTCTAGTCACATATTTTCCTCCAAAAGTATTCCTTCCAAAAATAATCTATACATGTTCAAATTAGGTAGCATAAAGATAAAAGTGAAATTTAGTAGTATAGGCCTGAACCTTTTTTTGTTTAAAAGAGTGCTTTTGAAATAAGCATCCACCCCAAATGTTGGTTGTATTTATGCTGTGATAAAAATAGGTGAGAGATCATATGATCTAATATTGTATTGATGGAAGTATAGGTAGTATAGTAGTGATTGTTCTTCAAGCATGCAGTAAAGATCACttttttttttttttttttttttgagatggagtcttgctctgtcgcccaggctggagtgcagtgatgcaatcttggctcactgcagcctctacctcccaggttcaagtgattatcctgccttagcctcctgagtagctgggattacaggcgcgtgccaccacgcccagctaattttttgtatttttagttgagacagggtttcactgtcccttaagaccatcctgttagccaagatggtcttgatctcctgacctcgtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccgtgcccagccAAAGACTGCTCTTAAAGCACCTTTTTGACAGTGAACATGGTCTAAAAAAGGGAAGATATTGTAGAAGATTTCACACACACACGCGTGTGTGGGAGACAACTAAAGGTATTGAAGGTACTAATTAATTAGATTTCCAAAATTTTCTACAGAGAGTTAATTATCACCAAAATGTGAATGGTACATACAAAACCTGGCATTTTCTTGTGATAAGTTTACATTTTTAGGAGAGTGGAGCTTTCAATCTGCCCTTTTCTCCTTTGTTTTTGTAGTTTTCACCAAAGATGATCAACTAGAAATGTTAAGTGGCTATGCAAGCAAAAGCATAGATAGGTTAAAAAAAAGGATCAGCTggctgggcagggtggctcatgtctataatctcagcattctaggacagtgatgtgggaggattatttgaggctaggagttccagttcgaaaccagcttcgtaaacatagcaagacccagtctctaccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatacacacacacacacacatatgtacacatacatatatatacatatatatgtatatataGAACACATGGCAAGAGCAGGAAATGGGAAGACTACCTTTTTTCTGGCAGCTATGTGTTGTTTTGTTCGAAAGATGGCAAGTGTACAACCAAACCAATCCACTTGCTTACAGAAAGAATGTTTAGTGTAGTTAAGACTAATTTGACAACAGATAAAACAGTCTGTCAGCTATTACAAAGTAATCAGCTGAACACTAATGCTGTTCTGTCTGCTCACAAGAGATAAAGATACCCTCTCATGGAATAAACACCTTGCTTAGAATTCATATAACAAAGAAGTAACCTTATAACTGCTCTCTAGTCTGCCTTATTTGTGTCATAGAGTAAGATATTCCTTGAAAGCCCATTAAGTGGAATAGACTTTCTGAAAATAAGAGTTCTTTACCTCAGTCCTCCTCTAATTTGGTTGAGAGGAGGTAATGAAAATGGGGACAGGATAAAAGGTGGCAACTAAATTTAAAGCACAGAAGAAATGATTTCCTTCTAGCTATGAGAATAGTCAAATTGAGCTTGCCAGGCTGTCTCATTCCTAACATGTAATTCATGATTTAGCCACTAAATTTCTAAGGAGATCATAAGAAATTAAGAAAAACGTTTAAGTCTAGCCTCTGCGTGGTAGACAGGTATGGGGAGGGAGAATGCTTTTCCCCTCCCAGTaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataGTTTTACTAGGTTTTCATGGATAAGTTTTTAAATGTAAGACAGGAAAGGGATCTATTTGATGTCTATCTTCAGATATATTGGCAGTTTTCCTTAAGCTATTTAGTTCCTCATCTGTTGCTTTTTCATTTTGTATACTGCAAGTTCCCAGGCAACTCGAATTTGCAAACACAGCCATGGATACACTATTTACCTTACAGTAGTTTCCTGGGAATCTAAGTCTGGTTTTTGTTATTCTTCCCTCCCCTCCACTGCATAATCATGTATAACTAGCAACATTTATGGTTATAGGTTGATTTCCTAAGTGTGGCTGATGGTAGCCTCTAGTTTGAAGTGAGGGAAGAATGAGTAGTCAGGAACTGGTCACTTTGAATGTGGGAGGGAAGATATTCACGACAAGGTTTTCTACGATAAAGCAGTTTCCTGCTTCTCGTTTGGCACGCATGTTAGATGGCAGAGACCAAGAATTCAAGATGGTTGGTGGCCAGATTTTTGTAGACAGAGATGGTGATTTGTTTAGTTTCATCTTAGATTTTTTGAGAACTCACCAGCTTTTATTACCCACTGAATTTTCAGACTATCTTAGGCTTCAGAGAGAGGCTCTTTTCTATGAACTTCGTTCTCTAGTTGATCTCTTAAACCCATACCTGCTACAGCCAAGACCTGCTCTTGTGGAGGTACATTTCCTAAGCCGGAACACTCAAGCTTTTTTCAGGGTGTTTGGCTCTTGCAGCAAAACAATTGAGATGCTAACAGGGAGGATTACAGTGTTTACAGAACAACCTTCAGCGCCGACCTGGAATGGTAACTTTTTCCCTCCTCAGATGACCTTACTTCCACTGCCTCCACAAAGACCTTCTTACCATGACCTGGTTTTCCAGTGTGGTTCTGACAGCACTACTGATAACCAAACTGGAGTCAGGTATTTTGTACTTTGCAGTATTTCTCTTGTATACCAGTTTGTGATGTTTTCTCTAAAAACTTGAAGTTCCTCAGGCCTGTAACTTCTGGAAAAGATGATTATTCAAAATAATGTTTTGGGGTAACCAGTGGAGTTGGGtag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