Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name DDX5
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m29_p_20) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rhinolophus ferrumequinum
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m29_p_20:42581945-42589847
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from DDX5

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
DDX5P1 scaffold_m29_p_2:67980502-67980799 + Intragenic
N/A UCSC
DDX5P2 scaffold_m29_p_12:64954962-64957071 + Intragenic
N/A UCSC
DDX5P3 scaffold_m29_p_14:16906243-16908323 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>DDX5_x1
ACCTCATTCATTTCCATCGGTCTCTTGCGGAGCAGCTCCGGCTCCTGTCATCGCCGTCCTTCCGCCGCTGCCGCCCCCGCAAGGCTTTGCTTGCCGAAGCCACCTCCACAGCGACTCGTCGCACCAGATTCTCTCCACTTCGTTCCCCGCCAACCGCAATCATTGACGCCATGTCGGGCTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGTCGGGATCGAGGGTTTGGTGCACCTCGATTTGGAGGAAGTAGGGCAGGGCCCCTATCAGGAAAGAAGTTTGGAAACCCTGGGGAGAAATTAGTTAAAAAGAAGTGGAATCTTGATGAGCTGCCAAAATTTGAGAAAAATTTTTATCAAGAACACCCTGATTTGGCCAGGCGCACAGCGCAAGAGGTAGAGACATACAGAAGAAGCAAGGAAGTTACAGTTAGAGGTCACAACTGCCCAAAGCCAGTTCTGAATTTTTATGAAGCAAACTTTCCTGCAAACGTCATGGATGTGATTGCCAGACAGAACTTCACTGAACCCACTGCTATTCAAGCTCAGGGATGGCGGTGCTCCCAAGGGACCACAGATACGTGATTTGGAGAGAGGTGTGGAAATCTGTATTGCAACACCTGGAAGACTGATTGACTTTTTAGAGTGTGGGAAAACAAATCTGAGAAGAACCACCTACCTTGTCCTTGACGAAGCAGATAGAATGCTTGATATGGGCTTCGAACCCCAAATAAGGAAGATTGTGGATCAGATAAGACCTGACAGGCAAACTCTAATGTGGAGTGCGACTTGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCTGAAGATTTCCTGAAAGACTATATTCATATAAACATTGGTGCACTAGAACTGAGTGCAAACCACAATATTCTTCAGATTGTGGATGTGTGTCATGACGTTGAAAAGGACGAAAAACTTATTCGTCTAATGGAAGAGATCATGAGTGAGAAGGAGAATAAAACCATTGTTTTTGTTGAAACCAAAAGAAGATGTGATGAACTTACTAGAAAAATGAGGCGAGACGGGTGGCCTGCCATGGGTATCCATGGTGACAAGAGTCAACAGGAACGTGACTGGGTTCTAAATGAATTCAAACATGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACAGATGTGGCTTCCAGAGGGCTAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGACTACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCTCGCAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAAAGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGTGAAGCTAATCAAGCAATTAATCCCAAGTTGCTTCAGTTGGTTGAAGACAGGGGTTCAGGTCGTTCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGACCGTCGAGACAGATACTCTGCAGGcaaaaggggtggatttaatacctttagagatagggaaaattatgacagaggttattctagtctgcttaagagagattttggggcaaaaacccagaatggtgtttacagtgctgcaaattacaccaatgggagctttggaagtaattttgtgtccgctggtatacagaccagttttaggactggtaatccaacagggacttaccagaatggttatgatagcactcagcaatatggaagtaacgttccaaatatgcacaatggtatgaaccaacaggcatacgcatatcctgctactgcagctgcgcctatgattggttatccaatgccaacaggatattctcaataagactttagaagtatatgtaaatgtctgtttttcataattgctctttatattgtgtgttaccagacaagatagttatttaagaaacatgggaaatgcagaaatgactgcagtgcagcagtaattatggtgcactttttcgctatttaagttggatatttctctacattcctgaaacaatttttaggttttttttgtactagaaaatgcaggcagtgttttcacaaaagtaaatgtacagtgatttgaaatacaaTAAATGAAGGCAATGCATGGCCTTCCAATAAAAAATATTTGAAGAC
>DDX5_x2
CTCCTCTTTTTTTTTTTGCGTTATATAATTTTGTTACCTTGATCGGAAGCCGTTCCGCGGTTCCTCCCTAGTCGATTGGCTTGTATAAGTGTCCCCGAGACCACCACTCTTGCTTGTTCTGCTTTCACTGCCTGTGCTGTCCCGTTATCCATTGAAACCAAAGACCCTTTGCTTGGAAACAGCTGGTTTGGTGCACCTCGATTTGGAGGAAGTAGGGCAGGGCCCCTATCAGGAAAGAAGTTTGGAAACCCTGGGGAGAAATTAGTTAAAAAGAAGTGGAATCTTGATGAGCTGCCAAAATTTGAGAAAAATTTTTATCAAGAACACCCTGATTTGGCCAGGCGCACAGCGCAAGAGGTAGAGACATACAGAAGAAGCAAGGAAGTTACAGTTAGAGGTCACAACTGCCCAAAGCCAGTTCTGAATTTTTATGAAGCAAACTTTCCTGCAAACGTCATGGATGTGATTGCCAGACAGAACTTCACTGAACCCACTGCTATTCAAGCTCAGGGATGGCCAGTTGCTCTAAGTGGATTGGACATGGTTGGAGTGGCACAGACTGGATCTGGGAAAACATTGTCTTATTTGCTGCCTGCCATTGTCCACATCAATCATCAGCCATTCCTAGAGAGAGGTGATGGGCCTATTTGCTTGGTGCTGGCACCAACTCGGGAACTGGCCCAGCAGGTGCAGCAAGTAGCTGCTGAATACTGTAGAGCATGTCGGTTGAAGTCTACTTGCATCTATGGCGGTGCTCCCAAGGGACCACAGATACGTGATTTGGAGAGAGGTGTGGAAATCTGTATTGCAACACCTGGAAGACTGATTGACTTTTTAGAGTGTGGGAAAACAAATCTGAGAAGAACCACCTACCTTGTCCTTGACGAAGCAGATAGAATGCTTGATATGGGCTTCGAACCCCAAATAAGGAAGATTGTGGATCAGATAAGACCTGACAGGCAAACTCTAATGTGGAGTGCGACTTGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCTGAAGATTTCCTGAAAGACTATATTCATATAAACATTGGTGCACTAGAACTGAGTGCAAACCACAATATTCTTCAGATTGTGGATGTGTGTCATGACGTTGAAAAGGACGAAAAACTTATTCGTCTAATGGAAGAGATCATGAGTGAGAAGGAGAATAAAACCATTGTTTTTGTTGAAACCAAAAGAAGATGTGATGAACTTACTAGAAAAATGAGGCGAGACGGGTGGCCTGCCATGGGTATCCATGGTGACAAGAGTCAACAGGAACGTGACTGGGTTCTAAATGAATTCAAACATGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACAGATGTGGCTTCCAGAGGGCTAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGACTACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCTCGCAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAAAGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGTGAAGCTAATCAAGCAATTAATCCCAAGTTGCTTCAGTTGGTTGAAGACAGGGGTTCAGGTCGTTCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGACCGTCGAGACAGATACTCTGCAGGcaaaaggggtggatttaatacctttagagatagggaaaattatgacagaggttattctagtctgcttaagagagattttggggcaaaaacccagaatggtgtttacagtgctgcaaattacaccaatgggagctttggaagtaattttgtgtccgctggtatacagaccagttttaggactggtaatccaacagggacttaccagaatggttatgatagcactcagcaatatggaagtaacgttccaaatatgcacaatggtatgaaccaacaggcatacgcatatcctgctactgcagctgcgcctatgattggttatccaatgccaacaggatattctcaataagactttagaagtatatgtaaatgtctgtttttcataattgctctttatattgtgtgttaccagacaagatagttatttaagaaacatgggaaatgcagaaatgactgcagtgcagcagtaattatggtgcactttttcgctatttaagttggatatttctctacattcctgaaacaatttttaggttttttttgtactagaaaatgcaggcagtgttttcacaaaagtaaatgtacagtgatttgaaatacaaTAAATGAAGGCAATGCATGGCCTTCCAATAAAAAATATTTGAAGACTGAATTAAGTGGAAATTGTACTTTATTTTACATATACAATGTCATGTAAAAGTTTGCTTAGATTTTTTTTTTTTTAGTCAAAAACTAAATTGCTCCTTTCCATAATTTAGTTTTGGTAAGTGGGGAGATCAGAAGGCCGTACTTTCTTAAAGTGCTCTCTATTCATATTGCAAGAATTAAATGAGATTGATTTAGGTAAACTTACAATTCTAGGCTAAATTGCGTAAAGGCTTTCTGACAGTACCTCACAACATCAGGTGAGTTATTTAATAGTCAATTAGCAGAGTGGTAAAAGGAGATACTAAACTAGATGTGAAGCAATCAACTACAGCCTACCTTCTATTGGTTAGTGTGAGAACAACATGGGTGACTGTTCCTTGTGCAAAATTTAGCATTTGAAAAGCTCCAAATAACTTTTTTCAAAAGATGATATTCATGCTCTTCACTGTATTGTGAATTACTGGAATGCTGAACAAAGCTAAGACTTTACATCTTTTAAGATAAGGTTGGCAAGAGCTAAGTTTCAATTTTTCAGTGTCCAGATTATTAACAAATTACAGTCTAAACAGGCTTCCAGGGGCTCTTAATTATAGTCACACTGGGAGTCATTAAATATCTTTCTAATAACCCAGGGAACTTGAGAGGACTCCAAACTGTAAGGTCTATTCATATTTAAATGAACACAAAAAAAATCCTTGTCAAAATTAATGGTTAACCAAGAGGAAGCAACATAACCAAAAACACTGACCATAGTACAAGTCTTGTTAGGGTCAACATGGGTTTATTTCTAGAAAGATTCAGGGAGTAACCAGATTTAATTCCAGCTCACCAACCTAATACTGTATTTACTAATGGCTAGAAATAGGTCTGAAATGTCTTCCCGGAGCATCTGGTATATATGTTCTTGCCAGGAGACGAGAGTTCTTCATGAGACTTCATTGAAATTCTGATTATTAAACTTGAGGCTTTAGTTGGTATTAATGCCTTACCTCTAAAATACAAAACTAGAATTTGTGAGGGGATGGGGAGTGGTAATTTTAGGACTAATACATTGAAAACCGATTCAACCTTAACAGTTTTCAGTAGCATGGTAGGTCAAATTCATTAATGACTTAAGCTTTCAGGATAGGTTGGAGTATTATTTTACTGTTGAATGTCTAACGTGGGCCTTTTAATTTGTAAACACTGAAATGTGGAAAACATTTACCTTTGAAGTTTTAAAAGACAGTCCACTTTTTAGCATGTGTGTTGTGTCCAGCCTGTGGTTGTCTTAACTAATAAATGTGATTTTACTCCCC