| Gene Name | Gm20498 |
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| Specie | Mus musculus | |
| Full Name | predicted gene 20498 | |
| Also known as | ARIP2a|Arip2|Omp25|Synj2bp|Synj2bp-cox16 | |
| Coordinate | chr12:81405626-81579685 | |
| Strand | - | |
| Gene summary | This locus represents naturally occurring readthrough transcription between the neighboring Synj2bp (synaptojanin 2 binding protein) and Cox16 (cytochrome c oxidase assembly protein 16) genes on chromosome 12. The readthrough transcripts encode fusion proteins that share sequence similarity with each individual gene product. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2015] |
| Retroname | Coord | Strand | Genomic Region | ENSG | |
|---|---|---|---|---|---|
| Synj2bpP1 | chr16:3352158-3358495 | + |
Intergenic |
ENSMUSG00000116007 | UCSC |
| Synj2bpP2 | chr17:3106865-3109216 | + |
Intergenic |
ENSMUSG00000044697 | UCSC |
| Synj2bpP3 | chr19:3206530-3207415 | + |
Intergenic |
ENSMUSG00000117928 | UCSC |
| >NM_025292.7 |
| GGTTTCCTTTTCCGGTCTGACCGCTGAGGAAACTGTAAAAGCTATGCTGGGGAGGCAGCGCGGAGCTTGATTCACCTTCACCTGCTCTGGCCACCCGCTGACCCGGGGTTTCCGGCCGGAGAGCAGTCAGATATGAACGGACGGGTGGATTATTTAGTCACGGAGGAAGAGATCAACCTGACGAGAGGACCTTCGGGGCTGGGCTTCAACATCGTCGGTGGGACAGATCAACAGTATGTCTCCAACGACAGTGGCATCTACGTCAGCCGTATCAAAGAGGATGGGGCTGCGGCCCAGGATGGGCGGCTCCAGGAGGGTGATAAGATCCTCTCGGTAAATGGCCAAGATCTGAAGAACCTGCTGCACCAAGATGCTGTAGACCTCTTCCGTAATGCGGGATGTGCTGTGTCCCTGAGAGTACAGCACAGGTTACCAGTGCAGAATGGACCTATAGTACATCGAGGTGAAGGAGAGCCAAGTGGAGTTCCTGTAGCTATGGTGCTGCTACCAGTGTTTGCCCTCACCATGGTAGCAGTTTGGGCCTTCGTGAGATACCGAAAGCAGCTTTGAAATGCTTGCTGTCTTCCAGTGTGTCCAatgaactctctctctcactcaccatCTCTGACATCCTCCCATATTCTTTCTCCTCCACATAGCCAATACAAGATTTAAAGTGACTGCTTATCACCCAAAACCCTGCTATTCAAAATCTCCTATTCTAATGGAAGAGTACAGGGGTTATTTGAAGAAAagctgtggtggtgtgtgtgtgggggaagccTTGCTTAGAATGAATGAGAAGTTACATATTTTACTAGGACTGCCAATAAAAACTCAGCTATCATCCAAAGAGGAAAAGCTCAGCCTTCCTGTCTCCATGGACGACACCTTTCTCTTAGCTGGCATGCTGTGATGGCTAGCTGTGCTATGTGAAAGGAGgagctgattttgtttttttttttttttttaaatgctttttcttgGGAAGTATTTGTGGCCTTTAATTTGTAACTATATACCTAGATGCCTATATTGGACATAGGCGAatgaagttttttctttctttcgtttttattttttttaaattaaaaaagaaaatatatgtatacagtaatacacacacacacacacacacacagtagcatAAAATTGATGCCTTATGGAGAATTAAAGAGGTAAGAAAGCTACTGGTTCTTGGGTTTCTAATGGACAATTTTGGGGGACTAGGGGATCATATTCCCTCATATATAATCAAGACTCATATTGAAAAATGAGTTCTGGATTGTAAAGAGAACTTACTTTTTCCACTTGCCTGTAAGTCTTTGTCCACAAGTTAAAAACATACACAGTGCTAAGGAATGATCATAACTGAAACATTTCAAGAACTATTAGCAGAGCATGTATATTGAGGATGGGGAAGTTAGCTTTAAAAGAGAATGCTCAGTCAGTGACATTAGGAAAATAATGACTGAAGCAATTAGTTAAAAATTGTAGAGCAACTGGTGTTACTCAGTAGCTACAGTGCTGTGGGAAATTGTAGTAAGGCATCTCTACTCAAGTCAATTTGTTCAAAAGGCTTTGGGATATACAGATGAGTCCCACAGTCTCTGAACTGCCTTAGTTGCTATTTTACAGTACTGTTAAAGGATCCATTGGCATGGGATGGGAAGCAGCAGGGCCCAATCAACCATCAAGACATCTGAAAAAGATCATGTCTCAAGGTGGCACTTGAGCCTTCAAAACTGCTTAACAATTCTCAGTTTCTAGTGTCAGACAAAAAGCCTAAGGGAAGGAACTGCCCTCCTGGTAGGATGGacctgaatcagcctgcttctgacTGAGTTAGGATGAGAAGGCATTGGTAtgggttttctttttgaaaaaaaaaaaaaaaaaaagtattttttgaaAAAGGTATTTTCCCCCAAAGCTATAAACACTAGTTTTGGTTTTAATAAGGTTAATGGACCATTTTTCAAAAAGGAGAAGgaataagttttgtttgtttgtagagggTGCAAGGAAATTTGGTGAGCATTTCTGAGGAAAGCCTGAGTACACAGTGTAATGAAGAGATGCTGGAGATGCAGGGATATTGGTGAGGTGGGAgctgtcctgtttatgtaacatCTAAGTTGGTTTTAGAGTACTGAGGATAGTTGAACCAAGcctattttttttccactttaacAAAATAATTTCCTTCTTTTCAGTAAATTGGCCAGACTATTATTTTGACATAAGATTATGAAGAGTTTTCCCGACAGTCTAGCAGTCACTTAACAGATGTTGATTGCACATTAGTTTTGTCAGGACAcctttataaaaagagaaatgcaCATATTTCATCCAAAGGGACATTGTGGTTACAGTTAGGAAGGAAACCCTTAAAATGGAGTTAGTTATCTAAGTGTAAGTTGTTTATATTACAGACAGCAAAAGAAAATAGCTCCTGAGGTCTGGACACTGAGGATTTCATAGAAGAGGGAATCGTTAGGTGCCAATCATCTAGTAAGAGCATGCATAAATAGAGGAAAAGTTAAGAATCTTATCAGGGTGAGTAATAAACACAACCAGTAAGAAAAATATTGCCATCCAAAACAGAGCACAGTGCAGCAACATAGAAGATAAGCAGATAACCAGCAAGTATTGTAAGGAGTTCAGAAAAGGAAAGCCATCGTGTAGTGGCATCAGGGGAGAATGGAAAGGAAAGTCTAGAACAGTCCAGTGATACTTTACCTCTGGGAAAACTCTTGATACAGGGAGACATTTGCTTTAAACAATCTTCACATAACTAAGCCATTCAGTACTTTTTGAAACTGACTTAGTAACAGGAGTCATTGTAAGCTCCATAGAAGGCAAGACGCATTCCACATCTTGTCTTGACCAGCAGCACTCTGGAGGCCCAGTGTCTGCTACCCTTCTTGTATCTGATGGCATGGGTAACAGCTCTGCCATGGGCCTGCTTACTTCTAGTATTCACCTCAGGGCTTGGAAATTGGTTTTGAAAGGCTTTTAGACATAGAAAGTAAAACTAATGGCAAGGAGGATAAAACACTGTTGTGTGTTGTATTGTTgatctaaataaaaaatatcattgGTAGAAGTTTTACTTTGGTTGATAAGGATTCTGATAACATTTGGGTCTCCTTAGGAAAGAAACACTTAACTAAAACATTTAAGTTTTAGGCAAATACTGTAATATTTCACTCTTAGTTATATGAAAACTAAATGAGATGTTGAGAATCTATATAGATTATTCAAATTTTATGTTTCTTATAGACTGACTCAAATATTCCTACCaccttaaaattatatatgatgCACCTACCACATAAATTATAATGTTTAATGTTTTGAAAATGGATTATAggtatttttaagttttcataaAGTATTTCTTATATTTGTCATTGTGAATTATATGTAATTCTAATAGACACTGTTTgcttcagttgtttttgtttccttttcctacAGTTTTCTGTGTGGGTGATTTCATTTAATTAATTGGACAGTCTAGCCACAGGCAACAAATAGAAATAGTATTTGTAATTATAGTCTATGCCAGGGACTGTCTTAAACTGATTAGTAACACTATGACTTACCCTGAGATCTAagtattgctataaagagactgAAGAGGAGAGAATAAAGTATTTTCCTAGGACTACATAGTTGGTAAAAGAGAATCATGATTTAAACTCTGGACTATGGATGGCAGTATCAGTAATATTCCCTCATAGCTAGCAGTCCTCATGCAAGGTCTCTGAACAAAAGCAACGTATCACCTGCAAATGCTTGGGTTTCATCCCATTCTTATGGAGTGAGATGAGTGTGTGCCAGCCAGCAACTCTGTCCTTCTAGGTAACTGGTTCATGCTGAACCTTGAGATTCACCACTGtcaggagctctctctctctgcttagaATCATCCAGACAGCGGGCTGGTCAGCCCACATTAAATAAGAACATGTGGGACTAGAATTCAGTCAACAATGACATGTTTCATCAGGTGGTTAAAATGTACAGATTCTGTTGGAAATGTTCCATGGTATTTCAATAGCCAGAATGAAGAACTGGGCTAAGTCCAGAGCTCTGCTCTCTGAGCATCTGCCCCAGATACAGAGGCAGAGTATGAAGTGGAACATTGTTTTATTCCTAGGTGCTCAGGACAGACTGATCAACCTCCAGTAACATATGTGGTTAGTAAGTGCTTCAGCTTGTGTAGCCATTAATAACCAAGTCATAGGATTGTGAATCTAAAATACTCCTGGGTAAAATTTGTattagaatggaaaaaaaaatgagggtcAGAAAGGTGAGCTAACTTCAAGTTAGATACTCCCCTCTATTTTGGTCTCAAATTTGTTTTAGTGTGTCCACAACATGAAAACATacaaaaactatattttaaaaatcagtttactTTCATCTTTTCTCTTTAGGCTTTCAATAAAGACCAGAAGGACTGATAGACAGCTAGAGAGGATCGTGTAGGCATCCAGATTAGAATGGAAGAATCCATTGAACAATCTGAGAAAACTAATCAGGTGTTGTTTTAATCACATTAGTTTTAAGTTAGATACATGCTCTTTGTAGTATTTTGGGTTTTATTGTGCAAATaagcaattaaaatatatttagaagcCAAGTATAATGGTACATGTCTTTGCTCTCAGCATTAggatgcagaggcaagcagatctctgtgagtaggAAGCTAGTGTTAGatctccctcaccctctcctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctctccctcttccttcctcccttcctcttcttcttccctgcctccctctctccctcttcctctggtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtagtcataaGGATTTTATTTTACCCACTTTGAGTGGAATGTATCTTTGTACAGATAAtgatg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