Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name XPOT
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name exportin for tRNA
Also known as XPO3
Coordinate chr12:64404392-64451125
Strand +
Gene summary This gene encodes a protein belonging to the RAN-GTPase exportin family that mediates export of tRNA from the nucleus to the cytoplasm. Translocation of tRNA to the cytoplasm occurs once exportin has bound both tRNA and GTP-bound RAN. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from XPOT

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
XPOTP2 chr18:76884954-76885216 - Intragenic
ENSG00000265261 UCSC
XPOTP1 chr7:56287843-56291984 + Intergenic
ENSG00000223559 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_007235.6
ACTCTCCAAGAGACTGCTGGCGCCGGCGCCCGCCCGCGCGGCACCGACGCGGGGAGCGCGCTTCGCGCTGACTCAgcggcggcggcggctgcggcggcggcggcggcgTTAGCCGGCCCTCGCGCTCTTTCCCTTCCTGGGGCGCCGACcccgcccgcttgcttgcttgcttgcttgcctgcctgcctgcctgccCGGCGCCACGCAAGAGAAGGTGCCAGGGGACGCAGAGCGACTAGAGGCGCGCGGTCCCGGCCAGCACCGTCTCTGGCGTTGTAGCTGCGGCCGTGGCGGAGGACTACGGCGACAAGGACGAGGGccgctctcccagctctctgcgtgccgcgccgctccgctccgctGGCTGACCATCTGGAGTGCAGGCTGGGAGGCGGGATGGAGTGATAGGGAAGATGTTTATAAATTCTTCTGTGGGATCAGAGGGCACGCCTATTACAACCAGAAAACTACAAGTATAACAGCGAGGATGGATGAACAGGCTCTATTAGGGCTAAATCCAAATGCTGATTCAGACTTTAGACAAAGGGCCCTGGCCTATTTTGAGCAGTTAAAAATTTCCCCAGATGCCTGGCAGGTGTGTGCAGAAGCTCTAGCCCAGAGGACATACAGTGATGATCATGTGAAGTTTTTCTGCTTTCAAGTACTGGAACATCAAGTTAAATACAAATACTCAGAACTAACCACTGTTCAACAACAGCTAATTAGGGAGACGCTCATATCATGGCTGCAAGCTCAGATGCTGAATCCCCAACCAGAGAAGACCTTTATACGAAATAAAGCCGCCCAAGTCTTCGCCTTGCTTTTTGTTACAGAGTATCTCACTAAGTGGCCCAAGTTTTTTTTTGACATTCTCTCAGTAGTGGACCTAAATCCAAGGGGAGTAGATCTCTACCTGCGAATCCTCATGGCTATTGATTCAGAGTTGGTGGATCGTGATGTGGTGCATACATCAGAGGAGGCTCGTAGGAATACTCTCATAAAAGATACCATGAGGGAACAGTGCATTCCAAATCTGGTGGAATCATGGTACCAAATATTACAAAATTATCAGTTTACTAATTCTGAAGTGACGTGTCAGTGCCTTGAAGTAGTTGGGGCTTATGTCTCTTGGATAGACTTATCCCTTATAGCCAATGATAGGTTTATAAATATGCTGCTAGGTCATATGTCAATAGAAGTTCTACGGGAAGAAGCATGTGACTGTTTATTTGAAGTTGTAAATAAAGGAATGGACCCTGTTGATAAAATGAAACTAGTGGAATCTTTGTGTCAAGTATTACAGTCTGCTGGGTTTTTCAGCATTGACCAGGAAGAAGATGTTGACTTCCTGGCCAGATTTTCTAAGTTGGTAAATGGAATGGGACAGTCATTGATAGTTAGTTGGAGTAAATTAATTAAGAATGGGGATATTAAGAATGCTCAAGAGGCACTACAAGCTATTGAAACAAAAGTGGCACTGATGTTGCAGCTACTAATTCATGAGGATGATGATATTTCTTCTAATATTATTGGATTTTGTTACGATTATCTTCATATTTTGAAACAGCTTACAGTGCTCTCGGATCAGCAAAAAGCTAATGTAGAGGCAATCATGTTGGCCGTTATGAAAAAATTGACTTACGATGAAGAATATAACTTTGAAAATGAGGGTGAAGATGAAGCCATGTTTGTAGAATATAGAAAACAACTGAAGTTACTGTTGGACAGGCTTGCTCAAGTTTCACCAGAGTTACTACTGGCCTCTGTTCGCAGAGTTTTTAGTTCTACACTGCAGAATTGGCAGACTACACGGTTTATGGAAGTTGAAGTAGCAATAAGATTGCTGTATATGTTGGCAGAAGCTCTTCCAGTATCTCATGGTGCTCACTTCTCAGGTGATGTTTCAAAAGCTAGTGCTTTGCAGGATATGATGCGAACTCTGGTAACATCAGGAGTCAGTTCCTATCAGCATACATCTGTGACATTGGAGTTCTTCGAAACTGTTGTTAGATATGAAAAGTTTTTCACAGTTGAACCTCAGCACATTCCATGTGTACTAATGGCTTTCTTAGATCACAGAGGTCTGCGGCATTCCAGTGCAAAAGTTCGGAGCAGGACGGCTTACCTGTTTTCTAGATTTGTCAAATCTCTCAATAAGCAAATGAATCCTTTCATTGAGGATATTTTGAATAGAATACAAGATTTATTAGAGCTTTCTCCACCTGAGAATGGCCACCAGTCCTTACTGAGCAGCGATGATCAACTTTTTATTTATGAGACAGCTGGAGTGCTGATTGTTAATAGTGAATATCCGGCAGAAAGGAAACAAGCCTTAATGAGGAATCTGTTGACTCCACTAATGGAGAAGTTTAAAATTCTGTTAGAAAAGTTGATGCTGGCACAAGATGAAGAAAGGCAAGCCTCTCTAGCAGACTGTCTTAACCATGCTGTTGGATTTGCAAGTCGAACCAGTAAAGCTTTCAGCAACAAACAGACTGTGAAACAATGTGGCTGTTCCGAAGTTTATCTGGACTGTTTACAGACATTCTTGCCAGCCCTCAGTTGTCCCTTACAAAAGGATATTCTCAGAAGTGGAGTCCGTACTTTCCTTCATCGAATGATTATTTGCCTGGAGGAAGAAGTTCTTCCGTTCATTCCATCTGCTTCAGAACATATGCTCAAAGATTGTGAAGCAAAAGATCTCCAGGAGTTCATTCCTCTTATCAACCAGATTACGGCCAAATTCAAGATACAGGTATCCCCGTTTTTACAACAGATGTTCATGCCCCTGCTTCATGCAATTTTTGAAGTGCTGCTCCGGCCAGCAGAAGAAAATGACCAGTCTGCTGCTTTAGAGAAGCAGATGTTGCGGAGGAGTTACTTTGCTTTCCTGCAAACAGTCACAGGCAGTGGGATGAGCGAAGTTATAGCAAATCAAGGTGCAGAGAATGTAGAAAGAGTGTTGGTTACTGTTATCCAAGGAGCAGTTGAATATCCAGATCCAATTGCACAGAAAACATGTTTTATCATCCTCTCAAAGTTGGTAGAACTCTGGGGAGGTAAAGATGGACCAGTGGGATTTGCTGATTTTGTTTATAAGCACATTGTCCCCGCATGTTTCCTAGCACCTTTAAAACAAACCTTTGACCTGGCAGATGCACAAACAGTATTGGCTTTATCTGAGTGTGCAGTGACACTGAAAACAATTCATCTCAAACGGGGCCCAGAATGTGTTCAGTATCTTCAACAAGAATACCTGCCCTCCTTGCAAGTAGCTCCAGAAATAATTCAGGAGTTTTGTCAAGCGCTTCAGCAGCCTGATGCTAAAGTTTTTAAAAATTACTTAAAGGTGTTCTTCCAGAGAGCAAAGCCCTGAGGACTGGATTTCCCTGTGCCTACTTCATGATCATGAATTCCAGTTAATTTATAAAGAGGCGATTTTTGTGTGCCATTCACACTGGTCTTTTTCACATTGTTTTGAGCTTATTGCAGTATATGTTTTGGGATTTTTCTGTAAAATGGGTGTAATTTTCCTAATACAGGTATGTAACAACAAAAGAAGTTGCCTGCATGCCGGTCCAAATTGTTCTGTATAAAGATGCTCTTAAAAGACACAAGAGTTATCCTAGAACCTTAATTCTTTTTTATTTGAAATTTTAAGTCAAGTCCTTTATAAAGACCATAGCAGTGGAAAACAGTGTACTTTTTAAAAAATTGCTGAATATAAAATCTTTGAAAATTTTCTTTATGTGTGAAGACACAAAGTATGGGGGAAGACAGCAATCAAAACTAACTTTTTGTAGATAGCCATTTCATTTCTTTAAACTGTTTCAACGCCAATATGTATTCTACAAAAGAGAATGGTTTTAGGCTCCAGTGTTATACTTTTTTTTATATATATATATAAAAATAAACTTTACGTAGTGAAATCTTCCAAGTCTTTTCTGGAATTATTATAAATACTTTAGTTTTATTTTCTCATCTTAATCTCTCCATAATTTCCCATTTAAAGGTTTACAAATATGAGTGTGTGGATGCTTTAATTCATTTAACCTCACTCCTCAAAGGTAACATGCAACTTAGTTCTGTTATATGAGAGTCTTTTTCTTTAATGTACTGGAAAAAGCCTATGTGAATCTGTTGATAGAATTTAAAATTCCAggccgggcgtggtggctcacgactgtaatcccagaactttgggaggccaaggcaggtggatcacttgaggtcaggagttcgagactagcctggccaacatggtgaaaccccatctctactaaaaatacaacagccaggtgtgatggtgcacgctcgtaatcccggctactcaggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccggaaggcagaggttgcagtgagctgagattgtgccactgcacgccagcctgggcaagagagtaagactctctctcaaaaaaaaaaaaaaagaaTTTAAAATCCCAATTTATTTTCTAACTCTTTTATTGGATGTATTTAGAACACAGTATACCTATAGTATACCTATGTGTTTATTATGTTTGTAAATGGTAACTGACATTTAATTATTAGAAGTACTTACCCCTGCCTTCCTCCATTTTTATTCATGGCTACTTGAGAAAGCAAAAGGAAAAAATAATAGTTATCAGTAGTGTCACTGGAAAGAAGAGAGGAGGGACAAAACTGAGCAGCAGAATTCGTATAGACATTTACGTTTAAATTCTAAAAGCCCAATTGAGATGTTCAGGGAGGGTTTGTTTTGCCCTTTGGCCTCATGAAtgggtttcatgaatgggcttcagtggcttataaactctgtaaaattctattctaaattttgtacatTTATTTTGTTCCGGTTAATTCCAGAAGACATTTCAAACATTTTTCTTACACCATATAATAAAAATACTTAACTAAATTGACAGTTATAAAAATAAATCAGTGAAATGTACCTTATACTTTAATAAAAAATGTTTTCAGAAATAGATAAGTGA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