Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Hnrnpk
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr17) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K
Also known as Csbp|Hnrpk
Coordinate chr17:6664730-6676753
Strand +
Gene summary Enables several functions, including ATPase binding activity; lamin binding activity; and nucleic acid binding activity. Involved in several processes, including animal organ development; cellular response to organonitrogen compound; and regulation of synapse organization. Located in several cellular components, including axon terminus; dendritic spine; and postsynaptic density. Part of protein-DNA complex. Is active in glutamatergic synapse and postsynapse. Orthologous to human HNRNPK (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Hnrnpk

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
HnrnpkP1 chr1:89754678-89755227 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP6 chr5:59911448-59913300 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP8 chr14:115086879-115088400 + Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP9 chrX:123650450-123650592 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP4 chr3:4586617-4587925 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP5 chr5:53109595-53112430 + Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP7 chr14:100513489-100515448 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP3 chr3:1117544-1119507 - Intergenic
N/A UCSC
HnrnpkP2 chr2:22167735-22170355 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_057141.1
ATTGGTGGATCCATTTAGTTCAAGAAAATGGAGACCGAACAGCCAGAAGAAACCTTCCCTAACACCGAAACCAATGGTGAATTTGGTAAACGCCCTGCAGAAGATATGGAAGAGGAACAAGCCTTTAAAAGATCTAGAAATACTGATGAGATGGTTGAATTGCGCATTTTGCTTCAGAGCAAGAATGCTGGGGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCAAGAATATTAAGGCTCTCCGTACAGACtacaatgccagtgTTTCAGTCCCAGACAGCAGTGGCCCCGAGCGCATACTGAGTATCAGTGCTGATATTGAGACGATTGGAGAAATTCTGAAGAAAATCATCCCTACTTTGGAAGAGGGCCTGCAGTTGCCATCACCCACTGCAACCAGCCAGCTCCCGCTCGAATCTGATGCTGTGGAATGCTTAAATTACCAGCATTATAAAGGGAGTGACTTCGACTGCGAGCTGAGACTGTTGATTCATCAAAGTCTGGCCGGAGGAATTATTGGTGTTAAAGGTGCTAAAATCAAAGAACTTCGAGAAAACACTCAGACAACAATCAAGCTTTTCCAGGAATGCTGCCCTCATTCTACTGACAGAGTTGTTCTTATTGGAGGAAAGCCCGATAGGGTTGTAGAATGCATCAAGATCATCCTTGACCTTATATCTGAGTCTCCCATCAAAGGACGTGCACAACCTTATGATCCCAACTTCTATGATGAAACCTATGATTATGGTGGTTTTACAATGATGTTTGATGACCGCCGAGGACGACCTGTGGGATTCCCCATGCGGGGAAGAGGTGGTTTTGACAGAATGCCTCCTGGTCGGGGTGGGCGTCCCATGCCTCCTTCTAGAAGAGATTATGATGATATGAGCCCTCGTCGAGGaccaccaccaccaccaccTGGTCGAGGTGGACGGGGTGGCAGCAGAGCTCGGAATCTTCCTCTTCCTCCACCACCACCACCCAGAGGGGGAGATCTCATGGCTTACGACAGAAGAGGACGGCCTGGAGACCGCTATGATGGCATGGTTGGGTTCAGTGCTGATGAAACTTGGGACTCTGCAATTGACACATGGAGCCCATCAGAATGGCAAATGGCTTATGAACCACAGGGTGGTTCTGGATATGATTATTCTTATGCAGGGGGCCGTGGCTCGTATGGTGATCTTGGCGGACCTATTATCACTACACAAGTAACTATTCCCAAAGATTTGGCTGGATCTATTATTGGCAAAGGTGGTCAGCGGATTAAACAAATTCGTCATGAGTCTGGAGCATCTATCAAAATTGATGAACCTTTAGAAGGATCTGAAGATCGGATCATTACCATTACGGGAACACAGGACCAGATACAGAACGCACAGTATTTGCTGCAGAACAGTGTGAAGCAGTATTCTGGAAAGTTTTTCTAAGACTAGTGAAGAACTGAAGGAGTCCTGCATCTTTTTTTTTTTATCTGCTTCTGTTTAAAAAGCCAACATTCCTCTGCTTCCTAGGTGTTCTGCATTTGAGGTGTAGTGAAATCTTTGCTGTTCACCAGATGTAATGTTTTAGTTCCTTACAAACAGGGTTGGGGGGAGGGCATGCAAAAAAACTAACATTGAAATTTTGAAACAGCAGCAGAGTGAGTGACTTTTATTTTTTGTTCATTGTTGGTGGTTTTAAAAATTCCCCCCGTGTAATTATTGTGAACACCTTGCTTTGTGGTCACTGTAACATTGGGGGGTGGGACAGGGAGGAAAGTAATAGTCCACATGTCCCTGGCATTTGTTCAGAGCAGTGTGCAGAATGTAATGCTCTTTTGTAAGAAACGTTTTATGATTTTTAAAATAAATTTAGTGAATCTATTTTTGGTGGTCTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACAATTTCAAATGGTGGTTGAATTTTCCAGCCCACCCCTAAACTAAACACTAAGTTTGATTTTCAGCAGCTCCTCTGTTGGATATAAGTGCACCTCTTGGATATAGACAAACACATTGGCAAATTTCAGTTTGGGTGATTTCTTAATGGTTGGAAAGACTTGGCTTGATAAATTTCCATCACATATTCATGCTTATAATAAGCTTGGGATTTTGTTTGTTTTTGCAAATGTTTGCCACTACTTTTCAACAGTTTTCTGTTAGTCGTGGGGAACTGCGGTGGGGAGCAATACTACAAGAGTAAGCATCTGAGTATGTGCCAGAAGCCTGGTGGGCAATGAGCTTTATTAACCAGAGTAACACTTGGTTATGGAAGTGGCTGATGCTGAATAAATCCTGGTTATTTTTGTTAGATAATTTCTCACCTATAGACTTAAGCTGTCAACTGCTAGCGTCTTGTTAGTTGAACTTTGTAAAAATATATATATACTTGTTTTTCCATTGTATGCACAATGAAAGAAAAAAGATGTACCATTTCTCTGTTGTGTGTTGAATTATGTAGGAAATGTTTGTGAACGATTCAAAAAAAATGGAAAAGTTCCTGTGGATGTTTTGTGTAGTAACTTGGCATCTGTATTGATAGTTCCAAATCCACATCTAAATAAAACTTCATGATGTTA
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>XM_006253554.3
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