Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Cdk7
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr13) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name cyclin-dependent kinase 7
Also known as C230069N13|CAK|Cdkn7|Crk4|P39 Mo15
Coordinate chr13:100833532-100867450
Strand -
Gene summary Enables protein kinase activity. Predicted to be involved in protein stabilization; regulation of transcription by RNA polymerase II; and transcription initiation from RNA polymerase II promoter. Predicted to act upstream of or within DNA repair; cell division; and phosphorylation. Located in nucleus. Is expressed in embryo and future hindbrain. Orthologous to human CDK7 (cyclin dependent kinase 7). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Cdk7

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Cdk7P1 chr1:161649413-161650796 + Intragenic
ENSMUSG00000102254 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_009874.3
GCGTCCAGCGACCGGAAGTAGCTGTTGGGCAGCTTTCGGACGCTTTAAATTCCTGCGGGGTGGAGGGCTTAGCTTGGGTGCCCGGGTCTGGTTTCTCACTCGCATGGCTGTGGACGTGAAGTCTCGAGCGAAGCGCTATGAGAAACTGGACTTCCTCGGAGAGGGACAGTTTGCGACGGTCTATAAGGCCAGGGACAAGAACACCAACCAAATCGTCGCCATTAAGAAAatCAAACTTGGACACAGGTCAGAAGCTAAGGATGGAATAAATAGAACAGCCTTAAGGGAGATAAAGCTCTTACAGGAACTAAGTCATCCAAATATAATTGGTCTCCTTGATGCATTTGGACATAAGTCTAACATTAGCCTTGTCTTTGATTTTATGGAAACTGACCTCGAGGTTATTATAAAGGATAACAGCCTTGTGCTGACACCATCCCACATTAAAGCCTACATGTTGATGACTCTTCAGGGCTTAGAATATTTACATCAGCATTGGATTCTACACAGGGATCTGAAACCAAACAACTTGTTGTTAGATGAGAATGGAGTTCTGAAACTGGCAGATTTTGGCCTGGCCAAATCATTTGGGAGCCCCAATAGGGCTTACACACATCAAGTTGTGACCAGATGGTACCGGGCTCCTGAGTTATTGTTTGGAGCTAGGATGTATGGTGTGGGAGTAGACATGTGGGCTGTTGGTTGTATATTAGCAGAATTGCTTCTAAGGGTTCCATTTTTGCCTGGAGATTCAGATCTTGATCAGCTAACAAGGATATTTGAAACTCTGGGTACACCAACTGAAGAGCAGTGGCCTGACATGTGTAGTCTTCCCGATTATGTGACATTTAAGAGTTTCCCTGGGGTCCCACTGCAGCACATCTTCATCGCGGCTGGGGACGACCTGCTGGAGCTCATCCAAGGCCTGTTCTTATTTAACCCGTGTACGCGGACCACAGCCTCACAGGCATTGAAGACCAAGTACTTCAGTAACCGCCCCGGGCCAACACCTGGATGCCAGCTCCCGCGACCAAACTGTCCGGTGGAGGCATTAAAGGAACCGGCGAATCCAACCGTGGCAACAAAGCGGAAAAGAGCAGAGGCCTTAGAACAAGGAATATTGCCCAAGAAGCTCATTTTTTAGTTGCAGCGAACAATGGACAGTTTCACTGCTGAAATAAATGATCCAAAGGCAAATAATGGAAAAAATAGTGAATATTAAATGCTATAAGAGAGAACTTGTAAATATTCTACAgatgtaaaatatgtaaaactacgggttatttttattaaatgtattttacaaTAAATATTTGTGATTTATGATTAGAGTACAAGGATAACTGCAGTCTCTAAAATGTAATTGACAGTGCATTGGGAGAGGCTTGGCATGCGATTCCTGGTTATTCTGCAGCTCTGGGTGATCTGCCACTTTAAGATCATTAGGTATAgtattgaaaacagaaaacaatactGTTAGCAGTTTTGCAAGAGCTTTAGCCTACTTACTACCCAGAGTAAGCCCTGAAAAGATGGCCCTGACGCCTCCCTGATGTCCTGTCATCTCGAACTCACTACGCTCCTCCTGCACGCACAGCCAGGACCTTGGCACTGCTCATCCCATTCCTTTGACCCTCCCCCAAGGAAGAGGCCTCGGGGAGATTTGTGTTTGTCTTCCATGGTTTTGTACTGCTATCTTCAAAGAGTTCCATCTCACCTTATGGCAGCctatgcctttgatcctagcatgTATGGaagtggatctctaagtttgaggacagcctggtctacatagtgagctccaggccagccagagctacgcaGTAAGGTCCTCTCTCAAAAagcataaataaacaaaataatcctaCTATAGCTCATActattgctttctgttttttacttAGAAACTTTCTTTCCATATTAATAGATCTAAATTGAGTTGATTTAATTACCATATGATAATATAGTACATAAATAGTGTAATTTACCTGTGCTTTGTTTATGgactattatttttttattgctgtaTAAATTTTATCATGAACATGGCACGAATCGCCAGGCATAGTGGTGGTTTGTCCCTGTCCaaactcgggaggtagaggcagttggatctctctgAATTCAGCCTGGATTCAGAGTGAGCTCCAGAGCTACGTAGTGAGGACCAGTTTGTGTGTAAAGGTGGTAGAGTATGTCCTACCATCTATGAACACCTGGCACTGTAACACATTAAAGTAACTAAGTAGCATGGCTCAACTCCTTTACAAGTGTCAAGCAAGCCTGAAACAAGGGGACAAGGTGTTGGCCATATGAGCATTCCTGGTgaccaaggaggccagaaaatggcattggatcccctgaaactggaattttgGATGGCTATAATCCACCAcgaggtgctggaaattgaacccaggtcctctgaaagagcagccagtgcctaaTTACTGAGTCCTCTCCCACTGCACATGAACTTTCTGTATGGAACCTTTGGGTGAGCAAAACCTCACTCCTATTCTGCATTCTCCTTGAGTCTTATGGGGATTCAAAAATTATGATTGATACAAAACTCATAGAAGAAAAACTTTACAAAATTATGTAATACCCGTTTGCATGGGGCCAGGTTTGGCTGCTCGTGCCTATAATCTCATCCTTGTCAGGCTGAGTAATGACTGCCTCAGATTTAAGGCCAGCCCAGTTACAAACAGCTCTATGCCAGTCTGTCCTCAAAGCAAgccccacccatctcaaaaagcaaaacaagaatagTTTTTGGCATGGGAGCCTCACAAAGGCATAGAGAACCTGTTAAGAATCAACTACTGAGCTGGGTGAGCTAGGCAGGGGCAGAGAggtatctatgagtttgaggataTCCTGGTCTAAAAAGTAAATTCTCAGGCAGCCAGGGATATACCATAAAACCCCGTCTCATGAATAAAGACAACTACTTGTTATATTAGGAATGACTAGTAAGTAAAGAAAAAGTGCTAAGGCAGAATGGCTTGGTCCAGAAAGTTAGCTCTAAAGGGAAACAGCTGGGGAAATAAGGATCAACAGGGTTGGTTATGCAGACTTCAGCATCGTGCTCGTCCTTGGGGCTGAATAGGCATCTTTTTccccacagggaaaaaaattattttggtttttgtttgtttgtttgttttttgagacagggtttctctgtgtagccctgactgtcccggaactcactctgtagaccaggctggcctcgaactcggaaatctgcctgcctctgcctcccaagtgctgggattaaaggcgtgcgccaccacgcctggcccccaCAGGAAaattttaatctctctctttattaactttttatgtggatgagtgctttgcctgcttgTCACATGTGTGCTGGTACTTCGAGTTCAGAAGGTGGCAGTCTCCTACAGTTATGTGATTGTGTTCTAGGTAAACCTGGGTCATCTGCGAGAGCTACAATGACCCATCTTTTAGCCATCATCTCATGCTTTAAGAACTGCACAGtgattattttatcttttgtgtgtttgataagcatgcatgtgtgcactcacTCCACAGCACATGTATGTCAGTGGACAACCTTGTGTCAATTTTTTCTGCCAGTGTTTTTGGGGGAAATATGTCAAGCCACTCTGCTTGCCCATGAGTTTCCAGAGACCCTTTGACCTTACTGTAGAGCCCCGGGAGTGCAGATACATGCTCCTCTTTATACTCACTGGTTTTGGGGTGTCTTTGGCAGAGtagtgtatctttttttttcttttgggggaggaaagggtttattcggcttacacttccatactgctgttcatcaccaaggaagtcaggactggaactcaagcaggtcaggaagcaggagctaatgcagaggccatggaaggatgttccttactggcttgcttcccctggagtAGTGTATCTTTAACTTCTGAGCGGCTCAGTTGTTGCTCTGTTGCTATGATACAGTTCTCTGACAAAAGCGCCTTAAAGGAGAAAGGCCTCATTTTGCCTTAGGATTTCCCTTGAAATTCAGTCCACCATGGTGGAGGAGGCTGGTTGGTCGCACGGTCCTTGTACTCAGATACAGAGAATGAACAGGAGTAGGGTGGAGCTAGACAGCCTTAAAGCCTACCCCAGTGACCCAGACAGAGTGACACTTAAGCCTGCGGGGAAcagttcacattcaaaccacaacagaggTTTTAGGCAGAATCTGCTACCAAGCTCACACAGTGTTTGTAGTTTTGGACagggctgtactggaactcactatggtcttgaactcagagctcaccTCCCTCACCTCTCAAGTgatgagactaaaggtgtgcaccaccaaatgGCCTTCTTATAGTTCTTAGAAATTGTTTGGTGCTGGGATCAAGCCTAGGGCTGTGCACATAACTGATGCACACTGAGCCACAGCCTGAGTCCCAGCTCTTAGTCCTAATAGAGTGCCCTGTTGCCCAGGCTTTTGGTGCTGTTACCTCTAGgcttaacttttttctttctttcctacatgCCTAAGCAGGttatctcaggctagccttgaacttatccTCCTAAGGACCCCATTTAGGATGATGGGCATGCTCCATCACGCTAATGCTTGTTCttcgttgttgtttgttttagtctttttaagacagggtttctctgtgtagctttggctatcctagaacttactctgtagatgaggctagcctcaaactcagagatctgagtgctgggattaaaggcgaatgCCACCACCGGCTGGCTTAACTCTTGGGTTTTTAACATAGCTCACATTTCTTTTACTGTGTGCTCACTTTCCACAAATTAGCAATAAGTATGATTTTCAAGTCTGATTTTTCTCATGGGCCACTGTTTTAAAATGCctttggttgggggtggggtagaaaCAATGTCTACCCACCTGTTCAAAGGACAAACAAGAGTGGGATTCCAGAGTTCATACTGGGAAGCCCAGTGAGCCTATTAAT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