Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name Srsf10
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name serine and arginine-rich splicing factor 10
Also known as FUSIP2|Fusip1|NSSR1|NSSR2|Nssr|SRrp40|Sfrs13a|Srsf13a|TASR|TASR1|TASR2
Coordinate chr4:135582454-135597219
Strand +
Gene summary Predicted to enable RNA binding activity. Involved in RNA splicing, via transesterification reactions; cytosolic transport; and negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome. Located in nucleoplasm. Is expressed in several structures, including brain; branchial arch; foregut-midgut junction; heart ventricle; and sensory organ. Orthologous to human SRSF10 (serine and arginine rich splicing factor 10). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Srsf10

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Srsf10P4 chr13:20177239-20180096 - Intergenic
 ENSMUSG00000050243 UCSC
Srsf10P5 chr14:112565285-112566599 - Intergenic
 ENSMUSG00000115581 UCSC
Srsf10P6 chr19:16390884-16393434 + Intergenic
 ENSMUSG00000118142 UCSC
Srsf10P8 chrX:79406217-79407381 + Intergenic
 ENSMUSG00000083444 UCSC
Srsf10P3 chr12:74640601-74640832 - Intergenic
 ENSMUSG00000113962 UCSC
Srsf10P1 chr3:61236092-61236605 - Intergenic
 ENSMUSG00000102667 UCSC
Srsf10P7 chrX:115806646-115810069 + Intergenic
 ENSMUSG00000080954 UCSC
Srsf10P2 chr12:113343033-113345285 - Intergenic
 ENSMUSG00000104218 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001080387.2
GAGGCGGGAGCCAAGTCTCGCGAGAAGAGGCAGTTGCCGTAGCGGAGCCCTCTGGGTCTGTGCGAGTGTGGTGTGAGTGGATGTGAGCCGCCGCCGGAGCTGCGGACGGTTTGCCCGAGCCCGTTAGCGCCGCCGGCCCAGAGTCCCGCCGCCACCATGTCCCGATACCTGCGCCCCCCTAACACGTCTCTGTTCGTCAGGAACGTGGCGGACGACACCAGGTCTGAAGATTTACGTCGGGAATTTGGTCGTTATGGTCCAATAGTAGATGTTTATGTCCCACTTGATTTCTACACTCGGCGTCCAAGAGGATTTGCATATGTTCAATTTGAGGATGTTCGTGATGCTGAAGACGCTTTACATAATTTGGACAGAAAATGGATTTGTGGGCGTCAGATTGAAATCCAGTTCGCACAGGGGGATCGGAAGACACCAAATCAAATGAAAGCCAAGGAAGGGAGGAATGTATACAGCTCTTCACGATATGACGATTATGACCGATATAGACGCTCTCGAAGCCGGAGTTATGAAAGGAGAAGATCGAGGAGTCGCTCCTTTGATTATAACTATAGGAGATCTTACAGTCCTAGAAACAGTAGACCGACTGGAAGACCACGGCGTAGCCGAAGCCATTCCGACAATGATAGATTCAAACACCGAAATCGATCTTTTTCAAGATCTAAATCCAATTCAAGATCACGGTCCAAGTCCCAGcccaagaaagaaatgaaggctaAATCACGTTCTAGGTCTGCATCTCACACCAAAACTAGAGGCACCTCTAAAACAGATTCCAAAACACATTATAAGTCTGGCTCAAGATATGAAAAGGAATCAAGGAAAAAAGAACCACCTAGATCCAAATCTCAGTCAAGATCACAGTCTAGGTCTAGGTCAAAATCTAGGTCAAGGTCTTGGACTAGTCCCAAGTCCAGTGGCCACTGATAGTATAAATTATGATACTTCTAGGCATGTATCATTCATTTACTCATAGTTTGGTATACTTAAATTATCAGGAATACAATGTTGCAATGATgcgtttaaaaacaaacaaacttaactTGTTAGTTTTCCCTGTACTGGGCAATGGTTATAATTAAAAAGATGCGCTGTTGAGAAGCCACTCTTAAGAGTCCAGTTTGTTTAATGTTATGGGCAGCTACCAATTTGTGGTGTCTCTGTATATTTTTGTAAAGATTCTCATTTTTTATGCTTGAAGTATTTGGTGAAAAGATGTTGGTTGACCATAATTTGCAACATTGTCTTATTAGAAATAAATTTTCATATCCATATTTGGTAGAACTGTTAACCTAGAAATGTAGCTTGCTAATAAGATAGAATGATACAGAAGTGAAGTGGTAGCCACATTACAACACTGACTGCTCAGACACATTTAGGTTCAGGGTGGACCTTTATGTCTTGTCAAGATGTCTAAGCCCATGATGATTATTTATGATGCAATGTGGAATAGTTCTTTTGTTAAATCCACCATCTGGGGATTGATGCCAACTGGGTTAAATAGCGTTTTCAGGGAGAGTGCCCTTTTCACTGAAACATGGAGCCTTCACTGCTTTCCCCACCTCAATCCCTGCTGGTTTCTAAGATATGGAACATTAAAGCATAAGGGAAAACCCTCCCCCTTAAGTTGTGAGTGAGTCAGTGATCACAGAAACCATTGTAAGGGGAAAAGACTGTTCTTAGCATAGTTGCTCTAAATTTAACTATTGTTGATCATTGTTatttaggggttttgttttgttgtttgttttttctgttagaaACAAGTGAACtgtttgaaaatacatttttgtttgtttatatgcatAGTGTAAAACAAACTGAATTTTGATGCTCACAGCACTTACCATGTGCGTTTGTATCAAAATCTGCCTGTTCTTCATAGGGGAGGCTTGCTCTTCACACCTCAGTTTATTCATGTGAGACAGGCTGAGAAGATAACACTCCTAGGTGATTTTGTGGTGCCGTGGATTTTTGGGGAAAGTTGAGTTTTAAGCAAAAGCCACATCACTTAGTTTTTGGTAATGTAGGACATGACTAAAAAATAACGAAATGATAcccttaaatatttataatttctagTATTTCAAGATTGTTTTGGAGGCAATAAAATGACTTGAAATGTCCGGTGTCATTTCAGAATACAAAGCTAGTGTCTCTAAGATCTTAGATTCGTTGCTTACAGATGTGAGTGAAGATACTGTGGGGGACGATCCTCCTGGAGGATtaccttatttttttcctttcgattttgtttttagaaatttaGTCCTTGCTTGTAGACAACAAAAGATGGTTTTAAGAACTGTTTGTGGAATGTGTTTGGAGGGTTAATTCTAGAACCTTTGTATATTTAATAGTATTtctaacttttatttctttactgtttGCAGTTAATGTTCTTGTTCTGCTATGCAATCATTTATATGCacgtttctttaatttttttagattttcctGGATGTATAGTTTAAACAAAGTCTATTTAAAACTGTAGCGGTAGTTTGCAGTTCTAGCAAAGAGGAAAGTTGTGGGGttaaactttgtattttctttcttatagaagcttCTAAAAAGGTATTTTTATATGTTCTTTTTAACAAATATTGTGTACAACCTTTAAAACATCAATGTTTGGATCAAAACAAGACCCAGCTTATTTTCTGCTTGCTGTAAATTAAGCAAAGAtgctataataaaaacaaaatgaaggaaataa
>NM_001284195.1
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>NM_010178.3
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