Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CTBP2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr10) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name C-terminal binding protein 2
Also known as -
Coordinate chr10:124984317-125161039
Strand -
Gene summary This gene produces alternative transcripts encoding two distinct proteins. One protein is a transcriptional repressor, while the other isoform is a major component of specialized synapses known as synaptic ribbons. Both proteins contain a NAD+ binding domain similar to NAD+-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenases. A portion of the 3' untranslated region was used to map this gene to chromosome 21q21.3; however, it was noted that similar loci elsewhere in the genome are likely. Blast analysis shows that this gene is present on chromosome 10. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Retrocopy(s) from CTBP2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CTBP2P10 chr21:7128888-7131558 + Intergenic
ENSG00000280330 UCSC
CTBP2P7 chr19:36494977-36498259 - Intergenic
ENSG00000267091 UCSC
CTBP2P5 chr2:48914143-48916716 - Intergenic
ENSG00000214602 UCSC
CTBP2P2 chr10:94644522-94648182 - Intergenic
ENSG00000235746 UCSC
CTBP2P6 chr11:43521872-43524378 + Intergenic
ENSG00000213697 UCSC
CTBP2P3 chr18:60662832-60665502 + Intergenic
ENSG00000267153 UCSC
CTBP2P8 chr1:68160094-68163492 - Intragenic
ENSG00000234383 UCSC
CTBP2P11 chr21:5696735-5699405 + Intergenic
N/A UCSC
CTBP2P4 chr5:98576338-98578446 + Intergenic
ENSG00000251102 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001083914.3
ACCTCGCCTCCCGCCTAGCTCCTGCGCAGCCAGCGGGTACCGGGAGCTGCGGCCAGCGCCGCTTCTTTCCTTTCCTTTTCTCTCCGTTTTCCTTCTCCTTCCCCGGAGGAGAAAACAAATAAAGAAGAGCAAATAGCCGGGAGGCGCTCGGCATCCAGGACGTTCCCTCCCCCGATCCAAGTTGGAATTAGCATCCTCTCGGGGGGTTTCATCACCTTAAATGGTTTTGAACCAATGAAGGTGTATTCCCTTAAAAAGACGGACAGCCCATCGTGTGAACTATAGAGTTTGTGGACAGATTTATATTGGGTTCATAGTGGCGTCATGCACGCAGACTCCTGCAAGTTCCCCTAAGTTCTTAGAGGACTGCTTTGCCTTTTGATCTGAGAGTTGCAAAGTTCCATAAAGAATGGCCCTTGTGGATAAGCACAAAGTCAAGAGACAGCGATTGGACAGAATTTGTGAAGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCCCTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCTGGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCGCCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGGATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTCTGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGTACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGCATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTTTGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCTACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCACCTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGTGGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAGAGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTACAGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCCAGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAGCAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTTCCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTCCCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAATAGCAGAGAATGCCAGAAGGTAATCACTCAGATACACTTGGGACCAAGAGACAGTGAAAAATAGATGAACTAAGAGAAAAAGAATCGGATGGTCTTTGTAACTGATTCTGGACATATGCATCATTGATGTTGCAGTGTTGAAACTACAAGAGCTAGAAAACTGAAGATGTCGTCTGCTTACGGAAGCGCTGAAAGACTAGGATGTGATTTATTAACGACCAACTTCTGTTATTGTGTGTTAAGTTTTTCATCTGTGCATCAAATCACAAAAAGAATAAATAGAGCTTTTTCCTTTATCAGTCCCTTGGGCACAGCAGGTCCTGAACACCCTGCTCTACAATGTTGCATCAAGAGTTCAAACAACAAAATAAAAAATATTAAGAGGAAATCCCCATCCTGTGACTTGAGTCCCTTAAGTCTACAGGGGCTGGTGACCTCTTTTTGCTAATAGGAAAATCACATTACTACAAAATGGGGAGAAAACTGTTTGCCTGTGGTAGACACCTGCACGCATAGGATTGAAGACAGTACAGGCTGCTGTACAGAGAAGCGCCTCTCACATCTGAACTGCATACTGAGCGGGCAAGTCGGTTGTAAGTTCAGTAAAACCCTCTGATGATGCAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTAAGTTTCACAAGCTGTTTGTACTCAAATATATTTTCTCAGTTTCAGATCCTCTGCTATTTTATTGAGTGGAAAGTCTTGAGCTAAAAGGGTTCAAGAAGAATAATGTTGCATTTCCTTATGTCTCAGGAAACACTTTTTATGGTAACTTGTCAGATTGTCTATGAACAAACCCACTTTTTTAGACATTGATAAAGTCTTCTTTTCTTCACGTGATATTTTATACAAGAACACTTCAGATGTATTAGATGTGACTGATTTTAACAAATCCTATTAGATTTGTATCAACTAGTTACATGTTCTATTCATAGTCTTTTGTGAATCATTGCCTTTTTGTTTAAAAAGATGGCCTATTTTGAGCCTTTGTATAGGTACATTCCTGTTTTTGTGACAAAAGAAAAACTTTAAAATTGTCCCAAACAGAAAAATAATGGCTATCAGAAGTATGTTTTGTTTTAGTGTGAGTTACCGTTACTGTATTTGTTTATTGTAAAGGTGGACATTTAGCGTTCAGTGCAGTTTTCAATAAAAAGTAATTAAAATTTGTTAAGTTCTGAAATTCAAGTACATCTCACTAATGTAAATGTTCTCTACTTGAGATGTTTAAGGCAATTGCATTGTCAATTAGCCAATTTCCAGCTCTTGTTACTACAGGGTTCCATAACCAGACTCAAGACCGCTGACAATTAATTACCTGTGATAACAAAAAGTTTAATTGAAAAATCAAAACCTCACACAAGTCCATCATTATCACGTCATGCCATCCTTAAGATGCAATGGTGGGTTAGTGCTAAATCAATTCAAAAAAAAACAAAGTTGCTCAACTTTTAGAGTTCTGACTTTAATCTACCCCAAAGCAAAATGACCTGGACCTGGTTCAAGGGAGGGAAGTGAACCTTGAAACTGTTTTGCCAATAACCTAACAAACAAAATGATATTTACAAAGAAGTGTTGCAAATAGTCCCATGAGTTAAGAGCTTGATTTAATGGATCTTCTTTTTAAATAGAATTAAACCTTTATACTAAAAGTATTTGCAAGTGTCAATTAAGTCCAACAATTCCAGGTATGAAACTCCCTCTGAGCTCTTCCTTATACTTCCCTTCCCAATTAAAACAAAACAAGAAAATCATGGTGTCTTAAAGCCTTTGGCTTGCCTGGCCTTGTCTGCTCACTCATTTTAAGGTGGTGGCCCCATCCCAACTCTACCATAAAAGTGTCTATTAACACAAGCTCACATGGAGAGAGACGGCGCTCATAGTTACTGACCTATTACCCCAGGGAACAAAAAGGTAGTTTAACGTCTTCGTAACCACTCATCAAAGAGGCAATGAAATATGCGTGAAAAGGAGGCCAAGCGCACACAGAATATCTTACCTTCACGAATATGTGAAGAAGTCTGGGACACGATGAACCTAAGAGTCAAAAACATAAAAAGGCAGGTCTGAATCCATGGTCCACCTGGGTTTTAATTATTAGATCTTGGTCGCCCAAACAAAAatttatatatatatatataaatTTGACCCCAAGGAAGAACAAGTCAAAACAAAATGCCACGCTCTGTTTGCTCTAGAAAAAGAACCATCAAGTCCACAGAGTGCAGGTATGACTTACTCTCCAGAGTCAGTCATTAATGTCTGTCACCTAGCCACGTATAATCATCTTTGAAAAAGGACTATATTCTATCTTGGGACAATAATTATGGCTGTTTTAATAGTTCAAGAGCATAATATAGCATTGATTTACCAAAATTTTTGGCCTTTAACAGCCAGTCTATGAAAACCATTTAGAGCCCCATTCCTGTCTGTAGCCTAGGAAATGGAACCATCTTTAATTCTTTCCCACAGGGAAGAATGCTGCACCTATCACACTATGTGGTCAGGGTCACTGATTGATAATAAATAAATAAATAATAGAGCGCTCAGGGGAAACAACACTCACCAGACCACAACACACAGTAGAAGCTAAGTGCTGAGCGTGTACTCTGGACAACGCTGGCTGCAATGCAGACTGCAATGGCTACATGCTTTTCCCTCTAACAATTCTCTTTGGCTTTTTCAATTGGGAGGGCAGATTTTGCTTAACAGGCAACTAGAACAGGATCTCTGCCCACTAAAAAATTATCCCTATACATAGAGAAATTACTACAGATGCTAAGTAGTCAGAATGCTAACATTTTCTACAAACTTGATTACTTATTGGCCAAAATGAAAGCAAACAGCCAATTTTTAACAACACATTCACCACTTGAAACAAACAGCAGCATTTACATTATATCAAAGATTCATTTCTACAGAATCGTACTAAAAAATCATTTTTCCTGCAAGATTTAGCATGCAGCAAAAAATGATCTTTTCATCCTGGGAACACCTTTTTACTGAGTTTTCGGGGGGAAAGAACTAAAGACATGACAGTTTTGTGGGTATTTTTCTATTTTTAGTATTCTGGCAGCAAATTTGAGGTTGTACACATTTCATTATCAACTAAACAAAACAAGAAGCAAGCAAATACTTTAAGGTTTTCACAGCCTTTTTCATCACAGGGAAGGAAAAAACtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgCGCGCGCGCGCGTGCGTGTGTCGTCTT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>NM_001290214.3
AAGTTTTtgtgtgtgtgtccctgtgtgcgtgtgtCATTTTAAGGTGGCTCGGGAGCGGCCCGGAGGAGCCGGCGGCGGCCCGAGGAGCGAGGGACCGAACCGGGAGCCATGCCGCGCTGAGGGGGGgccgcacagccgccgccaccgccaccgccgccgggtggggtgggaggggcgggagacgccgccgccgccgcctccAGGGTGGGCGCCTTTCGCCGTGGACGCCGACCGTCCGGGACGAGATGGAGAAAACAAAGGATTCAGATTGAAGGACTGCTCAGACACCCTCCGAAGAGGTGGCCCTGCCTGCGCTCCTCCTGGCTGCAGAGTACCCCACCAGCGCGGTTCATAGTGGCGTCATGCACGCAGACTCCTGCAAGTTCCCCTAAGTTCTTAGAGGACTGCTTTGCCTTTTGATCTGAGAGTTGCAAAGTTCCATAAAGAATGGCCCTTGTGGATAAGCACAAAGTCAAGAGACAGCGATTGGACAGAATTTGTGAAGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCCCTGCACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAGATGCCCATCCTGAAGGACCTGGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTCGACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTTCTAAACGAAGCCGTGGGCGCCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAGTTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGGATAGGCAGTGGCTATGACAACGTGGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGAATTGCCGTGTGCAACATCCCGTCTGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCACATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGTACCAGGCACTGCGGGAAGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAGCGGCCCGCATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTTTGGATTCAGCGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGGGCGTGCAGAGGGTCTACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGCGTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCACCTCATCAATGACTTTACCATAAAGCAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGAACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGTGGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTCAAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAGAGCCCTTCAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATCTCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTACAGTGAGCAGGCGTCACTGGAGATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTCGCATCCCAGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTGTCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAGCAATTCATCCTGAGCTCAATGGTGCCACATACAGATATCCGCCAGGCATCGTGGGTGTGGCTCCAGGAGGACTTCCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAGGCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTCCCAAGCGCCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAACGAGCAATAGCAGAGAATGCCAGAAGGTAATCACTCAGATACACTTGGGACCAAGAGACAGTGAAAAATAGATGAACTAAGAGAAAAAGAATCGGATGGTCTTTGTAACTGATTCTGGACATATGCATCATTGATGTTGCAGTGTTGAAACTACAAGAGCTAGAAAACTGAAGATGTCGTCTGCTTACGGAAGCGCTGAAAGACTAGGATGTGATTTATTAACGACCAACTTCTGTTATTGTGTGTTAAGTTTTTCATCTGTGCATCAAATCACAAAAAGAATAAATAGAGCTTTTTCCTTTATCAGTCCCTTGGGCACAGCAGGTCCTGAACACCCTGCTCTACAATGTTGCATCAAGAGTTCAAACAACAAAATAAAAAATATTAAGAGGAAATCCCCATCCTGTGACTTGAGTCCCTTAAGTCTACAGGGGCTGGTGACCTCTTTTTGCTAATAGGAAAATCACATTACTACAAAATGGGGAGAAAACTGTTTGCCTGTGGTAGACACCTGCACGCATAGGATTGAAGACAGTACAGGCTGCTGTACAGAGAAGCGCCTCTCACATCTGAACTGCATACTGAGCGGGCAAGTCGGTTGTAAGTTCAGTAAAACCCTCTGATGATGCAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTAAGTTTCACAAGCTGTTTGTACTCAAATATATTTTCTCAGTTTCAGATCCTCTGCTATTTTATTGAGTGGAAAGTCTTGAGCTAAAAGGGTTCAAGAAGAATAATGTTGCATTTCCTTATGTCTCAGGAAACACTTTTTATGGTAACTTGTCAGATTGTCTATGAACAAACCCACTTTTTTAGACATTGATAAAGTCTTCTTTTCTTCACGTGATATTTTATACAAGAACACTTCAGATGTATTAGATGTGACTGATTTTAACAAATCCTATTAGATTTGTATCAACTAGTTACATGTTCTATTCATAGTCTTTTGTGAATCATTGCCTTTTTGTTTAAAAAGATGGCCTATTTTGAGCCTTTGTATAGGTACATTCCTGTTTTTGTGACAAAAGAAAAACTTTAAAATTGTCCCAAACAGAAAAATAATGGCTATCAGAAGTATGTTTTGTTTTAGTGTGAGTTACCGTTACTGTATTTGTTTATTGTAAAGGTGGACATTTAGCGTTCAGTGCAGTTTTCAATAAAAAGTAATTAAAATTTGTTAAGTTCTGAAATTCAAGTACATCTCACTAATGTAAATGTTCTCTACTTGAGATGTTTAAGGCAATTGCATTGTCAATTAGCCAATTTCCAGCTCTTGTTACTACAGGGTTCCATAACCAGACTCAAGACCGCTGACAATTAATTACCTGTGATAACAAAAAGTTTAATTGAAAAATCAAAACCTCACACAAGTCCATCATTATCACGTCATGCCATCCTTAAGATGCAATGGTGGGTTAGTGCTAAATCAATTCAAAAAAAAACAAAGTTGCTCAACTTTTAGAGTTCTGACTTTAATCTACCCCAAAGCAAAATGACCTGGACCTGGTTCAAGGGAGGGAAGTGAACCTTGAAACTGTTTTGCCAATAACCTAACAAACAAAATGATATTTACAAAGAAGTGTTGCAAATAGTCCCATGAGTTAAGAGCTTGATTTAATGGATCTTCTTTTTAAATAGAATTAAACCTTTATACTAAAAGTATTTGCAAGTGTCAATTAAGTCCAACAATTCCAGGTATGAAACTCCCTCTGAGCTCTTCCTTATACTTCCCTTCCCAATTAAAACAAAACAAGAAAATCATGGTGTCTTAAAGCCTTTGGCTTGCCTGGCCTTGTCTGCTCACTCATTTTAAGGTGGTGGCCCCATCCCAACTCTACCATAAAAGTGTCTATTAACACAAGCTCACATGGAGAGAGACGGCGCTCATAGTTACTGACCTATTACCCCAGGGAACAAAAAGGTAGTTTAACGTCTTCGTAACCACTCATCAAAGAGGCAATGAAATATGCGTGAAAAGGAGGCCAAGCGCACACAGAATATCTTACCTTCACGAATATGTGAAGAAGTCTGGGACACGATGAACCTAAGAGTCAAAAACATAAAAAGGCAGGTCTGAATCCATGGTCCACCTGGGTTTTAATTATTAGATCTTGGTCGCCCAAACAAAAatttatatatatatatataaatTTGACCCCAAGGAAGAACAAGTCAAAACAAAATGCCACGCTCTGTTTGCTCTAGAAAAAGAACCATCAAGTCCACAGAGTGCAGGTATGACTTACTCTCCAGAGTCAGTCATTAATGTCTGTCACCTAGCCACGTATAATCATCTTTGAAAAAGGACTATATTCTATCTTGGGACAATAATTATGGCTGTTTTAATAGTTCAAGAGCATAATATAGCATTGATTTACCAAAATTTTTGGCCTTTAACAGCCAGTCTATGAAAACCATTTAGAGCCCCATTCCTGTCTGTAGCCTAGGAAATGGAACCATCTTTAATTCTTTCCCACAGGGAAGAATGCTGCACCTATCACACTATGTGGTCAGGGTCACTGATTGATAATAAATAAATAAATAATAGAGCGCTCAGGGGAAACAACACTCACCAGACCACAACACACAGTAGAAGCTAAGTGCTGAGCGTGTACTCTGGACAACGCTGGCTGCAATGCAGACTGCAATGGCTACATGCTTTTCCCTCTAACAATTCTCTTTGGCTTTTTCAATTGGGAGGGCAGATTTTGCTTAACAGGCAACTAGAACAGGATCTCTGCCCACTAAAAAATTATCCCTATACATAGAGAAATTACTACAGATGCTAAGTAGTCAGAATGCTAACATTTTCTACAAACTTGATTACTTATTGGCCAAAATGAAAGCAAACAGCCAATTTTTAACAACACATTCACCACTTGAAACAAACAGCAGCATTTACATTATATCAAAGATTCATTTCTACAGAATCGTACTAAAAAATCATTTTTCCTGCAAGATTTAGCATGCAGCAAAAAATGATCTTTTCATCCTGGGAACACCTTTTTACTGAGTTTTCGGGGGGAAAGAACTAAAGACATGACAGTTTTGTGGGTATTTTTCTATTTTTAGTATTCTGGCAGCAAATTTGAGGTTGTACACATTTCATTATCAACTAAACAAAACAAGAAGCAAGCAAATACTTTAAGGTTTTCACAGCCTTTTTCATCACAGGGAAGGAAAAAACtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt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