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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name Hnrnpc
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr14) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C
Also known as D14Wsu171e|Hnrpc|Hnrpc1|Hnrpc2|hnRNPC1|hnRNPC2|hnrnp-C
Coordinate chr14:52310834-52341491
Strand -
Gene summary Enables mRNA binding activity. Predicted to be involved in negative regulation of mRNA modification. Predicted to act upstream of or within RNA splicing and mRNA processing. Located in pronucleus. Is expressed in several structures, including alimentary system; cardiovascular system; central nervous system; genitourinary system; and sensory organ. Orthologous to several human genes including HNRNPC (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Hnrnpc

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
HnrnpcP6 chr19:40604825-40604997 + Intragenic
 ENSMUSG00000090041 UCSC
HnrnpcP5 chr15:36119609-36121225 - Intragenic
 ENSMUSG00000092230 UCSC
HnrnpcP2 chr4:46273532-46274959 - Intergenic
 ENSMUSG00000081483 UCSC
HnrnpcP4 chr6:75359673-75361053 - Intergenic
 ENSMUSG00000107918 UCSC
HnrnpcP3 chr4:97409037-97411944 - Intergenic
 ENSMUSG00000084159 UCSC
HnrnpcP1 chr1:23023895-23024216 - Intergenic
 ENSMUSG00000101468 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001170981.2
AGAGGAGCTCGGGGGCCATTTTGTGAGGAGACGGAGAGCGAACGGTCGTGTGGTTCTTCGCTGTTGTAGCTCCGGCGTCTCGGCGTAGACTCGCAGTAGGAGAGgcggtctcttctctctctccttccttttgtgAGATTTTTTTGATCTTCAGCTACATTTTCAGCTTTGTGAGAAACCTCATCATCAAAGGAGATGGCTAGCAATGTTACCAACAAGACAGATCCTCGGTCCATGAATTCCCGTGTATTCATTGGGAATCTCAACACTCTGGTGGTCAAGAAGTCTGATGTGGAGGCCATCTTTTCAAAGTATGGCAAAATTGTGGGCTGCTCTGTGCATAAAGGCTTTGCCTTTGTCCAGTATGTTAATGAAAGAAATGCCCGAGCTGCTGTAGCTGGCGAGGATGGCAGAATGATTGCTGGCCAGGTTTTagATATTAACCTGGCTGCAGAGCCAAAAGTGAACCGAGGAAAAGCAGGTGTGAAACGATCTGCAGCGGAGATGTACGGTTCCTCATTTGACTTGGACTATGACTTTCAACGGGATTATTATGACAGGATGTACAGTTACCCAGCGcgggttcctcctcctcctcctattgctCGAGCTGTGGTGCCTTCCAAACGTCAGCGTGTTTCAGGGAACACCTCACGAAGGGGCAAAAGTGGATTCAATTCGAAGAGTGGACAAAGGGGATCTTCTTCCAAGTCTGGAAAAtTGAAAGGTGATGACCTTCAGGCCATTAAAAAGGAGCTGACTCAGATAAAACAAAAAGTGGATTCTCTTCTGGAAAGcctggaaaaaattgaaaaagaacaaagcaagcaagcagACTTGTCCTTCTCATCCCCAGTAGAGATGAAGAATGAAAAGTCTGAAGAAGAGCAGAGCAGCGCCTCTGTGAAGAAAGATGAGACTAATGTGAAGATGGAGTCTGAGGCAGGTGCAGATGACTCTGCTGAGGAGGGTGACCTGCTGGATGATGACGATAATGAAGATCGGGGGGATGACCAGCTGGAGTTGAAGGATGATGAAAAAGAGCCTGAGGAAGGAGAAGACGACAGAGACAGCGCCAATGGGGAGGATGACTCTTAAGCACATAGTGGAGCTTAGAAATCTTATCCCATTATTCATTTACCTAGGCGTTTGTGGGAGATGAAAGTAACACCAGGTCATCTCCCCTGGGGTCTTCTGCACATTCTCACTGTTGTCCCGCCTTACCCTCCCTGTGTTCATTAATTCATGATTGCCCTGCGCCTAGTTACAGTTCCACTTCCTTTGATGCTCCGTAGTACTTTCGTTAAGTCTCACCCTGTAAGTTTTGCTTTAATTTTGATACCTCTTTGACTTAACAATAAAAAGTTGTATGGTTTTTATCAACTGTCTCCAAAATAATCTCTTGTTATGCAGGGAGTACAGTTCTTCCCATTCATGACTTCAGTAGTTGCTTCCCTAACTGCAGAGGCATCTCATTTACTTGTAACCCCAAGAGCAGCTTTGCATTAGAGGTGTGTGTTTTCCCTCACGTGAGTGGGACTGTTACAACACGAATGTAACCATGTATTTTTGTGAATGGGAGTTGGCATGTCAAATGCATCTTACAGGAAAATAGTGTAATAGTCttaatatttgttttctaaagttATACCATGGGTTATTTTTGTGAACAGCCTGATGTTTGGGAtctttttctcaaaaataaacagtTCCTTATTAAACCAGGAATTTGAAggaaagacaatttttttttttccgagacaggatttttctatataggcctggctgtcctggaacccactttgtagaccaggctggcctggaactcagagatctgcctgcctctgcctcctgagtgctgggattaaagccgtgcgccaccacaccctgctggaAAGAAAGtttttcaattacattttttttttaatagcagccTCCACAAATCGTTAGGTTGTATTAAATATAATCTTCATGCATAccaatatatatgaataaaagtcattttgagaGCATTgttaactttaaatatttttgacaCGGAGTGCTTGAATGTTCAGTTACTGATTAAAACCCAGGTTTCTTTATTGCATTCTCAACCTGTGCCTCAAAAGTTTCAAAATAGGAAAGCATTTGTCTTTCCCGTTTTATATAGCATTTGCCTTCCTAAGAACTGAGTCTATAACGAGAGTTATAATTACCCATGTGAAGTACTCTTACCCCTTTtcttgatttgtttgagtcagcTTGGAACATTTTGCTGTGTAAGACCTAACATAAGGTAAAGGTATAAACAGATTTGggggcttgtttgtttatttttgtatagCAGGCTATTCAAATCTTTTATGCACACAGACTTTCTACTTCTCAAAAAGACCCTGTTGTGTATATCTAGCATACAGCTGCAAGTCTATGCTTTCATGCTATGCATTGTAGGCAAAAGTAACCCATGATAAAACTGAGGAGAGGCTGATCTAGGGGCTTCCCTTGGCTCCAGTGTGCAAATATAAAAATGGCTTTTATTGTGACCCCCCTCTGCCCCTTCCCCTAATCTTGATATTGTCTTGGGTTTTTGAGGAATTGGCTAGATATCAGAGGTTAAAGATGCTAATAAATAAAACCTGTTTAAATATGCTGTTAGAAGCTGGTGTGTACAAAATGCTGGGGTGGGTTCAATTAGTTCAGTATTGGGTACTTTCTGATATTGGGTATTGTATTTATTCAGGTgactcccccgccccctccccccaaaaaaagcagTTGGGAAATTTGAGAATAAAGACTGTGGTTCTGTCCCTTTT
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