Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Sypl
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name synaptophysin-like protein
Also known as D12Ertd446e|PanI|Pphn|Sypl1
Coordinate chr12:33003874-33029503
Strand +
Gene summary Located in membrane and secretory granule. Orthologous to human SYPL1 (synaptophysin like 1). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Sypl

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SyplP1 chrX:58911696-58913132 - Intergenic
ENSMUSG00000083366 UCSC
SyplP2 chrX:73610531-73612977 + Intergenic
ENSMUSG00000085066 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_198710.3
gccccgcCGGCTCCGCCTCCCGCTCTCGCCGCGGAGTCGCTCCGGTCTCGCCGCTCCCCTCCTCCGCCCCGCGTCCTgactctcttccctcctttccctcagagGATGTCCGCCTTCCAGATCAACCTCAACCCGCTCAAGGAGCCGCTCGGCTTCATCAAGATCCTCGAGTGGTTTGCCTCCATCTTTGCTTTTGCCACCTGTGGTGGGTTTAAGGGCAAAACAGAAATTCAAGTGAACTGTCCTAAAGTTGGTGTCAATAAGAACCAGACTGTGACAGCTACTTTTGGTTATCCATTCAGgttGAATCAGGCATCATTTCATACACCTCCAAATGTCAGTGTGTGTGACGTGAACTGGGAAAAGCATGTTCTCATAGGTGATTACTCCTCTTCTGCACAGTTCTACGTTACGTTTGCAGTCTTTGTGTTCCTGTACTGCATTGCTGCCCTTCTGCTCTATGTTGGTTACACGAACCTCTACCGGGATAGTCGCAAACTGCCCATGATCGACTTTATTGTTACTCTTGTTGCTACTTTTTTGTGGTTGGTGAGTTCCTCAGCCTGGGCTAAAGCTCTTACAGATATTAAAGTAGCTACTGGACACAGAATTGTGGAGGAACTTGAAATTTGTAATCCAGAATCAGGAGTGTCATgttactttgtctctgtgactagTATGGGCTCCCTGAATGTATCCGTGATCTTTGGCTTTCTGAATATGATACTTTGGGGAGGAAATGCTTGGTTTGTGTACAAGGAGACCAGCTTACACAGTCCGTCAAATACGTCAGCTTCCCACAGCCAAGGCGGTGGCCCACCCACTTCTGGAATGTAACTAAGGGGAGAAATACACTGTATGAAATGTGTGCTCTAGCATGCCTTGTTGCCAACACCTTGAAAAGCATTATTGTTTCTAATAAAAAGTAATGGCTTTTTCAGTAAATTGGTGGGTTTAAAAATTTGCTGCTTTTCTACATAAAATGTGCCTTTTCTAGAAATTTAAGATGTAAATGTATTTTTACATGAAAGTTTGAAAATTCGGGAGCCTGTTATGAGATGATGTTACTTTTAACTGAACAATAATTTAACTAAGTTGCTTCTAAAGTGTTTACACCTTAAACTTTAACATAAACCTTCATTCAGAAAACAGTTATGTCGTATCATAATATAGGAAGAATGTGTTTGGAAAATACACTACTGTTAGTTTGTATACATTAGATCTTTCAGGCTTGGCTTGTTTAAAGAAAACCTTGATTGCATAAatcatatttagaaaaaaattagtgcaattttatatttgaatattgTTCATGTTAAAATTTTTTTGAATTGCAAAGACTGGgtatatattttgtttctgttttttctaaATGATCTGCTGTACTTATTAGGTGTACTAAAATTGTCTTAGAAGCGAGGGTTTGAAAATTGTACAAATGTGTAGAGGTAACTTTGCACTTGTGCTGCATGGGTATATCCATTATTTCTGGTGGTTTCTTAGGCTTGCAAAGAGCACGGTTCCCAAGACGGGTTTATACACGTAGGCGTTCTCCATCAGGCTTGTTTACTATCTTTTGTTCAtaccaagagaaaaaaatctactttttttttccagaccctGTTTAGAGGGTTACTAAAAATTAAGGTTGCCTTTTACGTTTGAAATGTTTAACATTTAGTCAATGATGTTTCTTCTCCTGAGTTTAACATTGATATTGTGAAAATAAATGCAGTTCAGATTTATTTCTTAAGATTCATTCTTCACAAAAGGGTGATTAAGGAATTATGCTCATAAAGGAACCTAAGCAAGctgtattgtgtgtgtgctgtgtgtacacacatttgtgtgtgctcAGAATACATGCTTTCTGCTCCTGACTTTTTGTTGTACAGGATTCAGATTCCTAGTCCTACAAGATGATGTTTGTGTGTAAGGCACACCTTTTTTGTTGCTTTATTCATGACAAAGTGTCAGTTTGAGAATGTATGTTTAATAAGCAAACAATAAAGAAGTGAAAATAAAGAATGCCCCGTTGTTATATTACAATGAACTCTTCATCCTAAAGGTATAAGCATTGCAAAATGGAACCTCTTTTCAAAGCAGGAGATAGAATTACAATAGTAATTTTAAGTGCCAATAGAACAGACTAAAATGGTTCAGACATTTCATTcttgtttgaaaaatatttataactatTAGATTGTCTTCCtggtaaatattttataattggtCACTCAAATAGGGAAGATTACTGACTGAGGGCATACAACTTCCAGGCCTGTTTCCATAGTTCAGTTGGAAGACTGCTTGTCTAGCTAGCCCCGTCCATCCTTCTGCACTACTGCATACATAAGCCAACGATGGCAGCCCAAGCCTCAAATCTCAGCACTCCATAGTTTAAGATCATCCTTGCCTGCTtggggagttcaaggctagcctgggctatatcaaTCAGTGAGGAGTACTcttttcctgctctctctctctctctctctctctctctctctctttacatataccatcttttcctccctcctccttcctcctcttcctttttcctcttcaccTCCCCATCCTGAAGCGAAACTGCTGGGATTAGAACCTGTCCTTGGCCAGCTCCCAAGCTGGCTAACAAGGTGAAGCCTGTATTTGTATCTGAAAACATGGAAATAAAGAATATTGaccttggactggagagatggctcaggggttaggagcactgactgctcctccagaggacccacatGACATTTAATAACCAGCTATAACTCCTAGGAGGAtctaatgttctcttctggcttctacaggtaTTACATACATTCACAGACAGtatgcatgcaggtaaaacattcacaTAAACTTAAACTGACttcaaaaaaaatatgaaaagcaaATGGGTCTAGAGGTTTTGAAATGTCTTCAGCACAGGTTCTCCATAAATGTTAGTTGTGTCTAAGACAGCCTGGAGTCCAAGGGGCTAGGGGACACAGGCTGAGAAGCGGAAAAAGCTTTAAGCATCTAAGTTTTTCCTTTGGTAGTGTTTACAATTTGGTTTCCCTTAATCAATCCTAAGTGTTTGggtgtatttgtttttctgttggtgCAGATATTGGCAAGgctaatgaaattaaaaaaaaaaaaagtagtccaTTGAAATGAGAGTAAACTCAGAAAGGGCTCCTGCTAGCCTCCCCTCCCCGCTGTTTTTTAGGGAACATTGTAGAGGCAATTTCTAGGACAGAAGTGATAAGCTTTAACTTCCCAGAAGACAAGCTGCAGAGAGACAGCTAACAGACTCGTtactaattgtttttaaaaaacattcacCTAGATAAAGATCTTTAAATGTGTAAAAGGTAGGGGTAGAATTACATGGTATTTTGTGTTTGggcataattataatttttatgtaatatttcCAGAAACAGGTGCCTGTAAAATCATACCGAAGAACTTTATATGtaccagatttttaaaagaaataaaatattgctAGAAGAACTTGTTCCTCATGGAGATAGAATTGGTACAGATAGCTCAGAATGAATATTCTCCTCAGTACTTGATGCTGCCGGGCCACTCGTCACTGCTCTGAGTTTGAAGCGTCATGTTTGTTTTAAAGCCTGTTTGTGGTTGCTGTTGAGGCTGACCTCCCTTTAGTTTAGTTACAGCTCCTCTGCttctcctgccttcccttctcAAACCCTTAGCTGAGTTTTCTTCTGTGAGACTTTCTCTGTGGATGTACACAGTTCCCTACATCACCTTGGTAGTAACCCCTTGGCGTTTCCATGGCTGCAGTGTTCGCCCCATCTGTGGCTTGTATTTTCACTGGATTTTGTCATATAAATTTGTAATTTCTTCATTTCAATGGTATGTAACTACCTTCCTGGTGGGTTTAGTTTCTGCAATGGTTTTGGCTGTGGTGAAGTCACATATTCCTGTATACATTTTAGAATCCTCTTATCAAGCTCCTAAAGACCCTTTGTGAGGTTTCAGTTGTgaagaattgcattgaatttgtacaTCAGTTAATTTGTGAAGAATTGTCAAATTTATAATGCCACagttttgtatttataaacatggtatatttctgcatttttattttatgctttccaataaagttttataattttctaCATAAAGATTTAAGATTATACTTAGCCTCAAGAATTTTCATGCTGTTTACACAATTACATTAGATTATATTTTGAATTGAGTTGTAATTGTTTATTGCTGTTATATATAAACAACATGTATAGGTTTTTACCTACTGATAATTATAGAAGTTGGCAGTTTTTCAAACCTTgaatttttaatatgtaaattatCCTGGTATTTAATGTTTATCATCTACAGATGTTGATAGTTTTATCATGTTTGGAAATTACACATTCTAAATATTCTCTAATTATAAAGTGATCTTCAAGAAAACCtgttttaaaagtagaaaaagtACATTTACCTGACATACTGACTGATAACTGCTTCAGTACATCACTTGTAATGACAGATTTGCACTGTTGTATATTGGTAGTTGTAGTAACGTAAACTGGTCAGATCGATTGGTTCTTTATAGAGTTGAATTAAACCGATCACAGTGAGAATG