Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CHTOP
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m16_p_20) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Molossus molossus
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m16_p_20:22852009-22861715
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from CHTOP

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CHTOPP1 scaffold_m16_p_1:94997452-94997948 - Intergenic
N/A UCSC
CHTOPP3 scaffold_m16_p_12:49866046-49867256 + Intergenic
N/A UCSC
CHTOPP2 scaffold_m16_p_9:68830072-68830622 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>CHTOP_x1
GGCGGCCATTTTGTTTGGACACCGAGCGGGAGTTGGCGGCAGCGGCTGTGGTGGCACAGACGAAAGGCAGGGGAGGCAGGCCGAGTGAGCAGGTGGACCGGCCAACCAGACAGCCAGCTAACAACAACGAACTAACCTAGCAGTCTACTACTTACGCATCTAGCCAACCAAACAAGTTAACCCCAACCTCTCCACCATCAACTCAGGTTCGGCCGGCCCCCGGCCCGCCTTCCGCAGCCGTCGTGGCAGCCCCGGGAGGAGCACTGGCGTCCTTTTCCTTCGATCCTCGGGATTTGAAGATGGCTGCACAGTCAGCACCGAAAGTTGTGCTAAAAAGCACCACCAAGATGTCTCTAAATGAGCGGTGAGGCAGCGAACAGCAACTTCAGCTCATTCATAAGAAAACGTTACTTAAATTGGCCCTGGGGTCCAATGCACAAAAACCGGTTTTAAACTAAATACCAACAGAAGGCTACAGACCTCTGTTCATAGTTGCATCTTACTTATGTGGTACACAGAGCAAATTGGGCGGTTGTTTCAAAACCCCTTATCAGTAGATTTTTATGTTAAGCTGTCTGAAATATTTATTTGGTGGGATGTATTTTAAAAAAGACTCCTCACACCCTCCCTTTTCTTCACATGTTTTTAACATTGATAACAGGGATGGTGCAGCTCGGTAGCACAGTATCCTGGCTGCAGTAGGCTTGCTGCCCAGTCCAAGGCCAGCAGTGTTGTGTCTGGCCTGTAAGAGGCAGGTAGCAAGCTTTGAATATGTCCAGAGGCCCTTGAATGCCATTCTTGGGCCTTGTAAGAGGCACTTGCTTTTGCTCCATTTCACTTTCTTTCCATTCTGCTTTTAGTTTGTTTTGTTTTGGATTCTTTACAGTTACGTGTTCTTCTCTTCCATTCCATTAAACTTACCTTTACAGGAATAATAGAAGAGTGTCTTCACAAACTCTTAAACAGTTGAACTAACCTAACTTCAGAAGTAGTCAGTTGAAGTAGAAAAACTTAATCATTTGAGACTAAGAAAAGCGAAGATATTAAAAGGAAGTTTCTATCCATGAGAGCTCTATTCATTGAGTGCCTTTGACCAGTAATTTCAGTAAGTTGATAAATCAGACCACTGTATATTTTTGCCTTTTCTGAAGCATATGTGCTCCTCTCCTCTTAGGGTATGATATATTAATTCATATTCATGTAACTAAGTGACCAAATATATAAGAAAATGTGATGCATTCCTATGACTTACATGGGTGCATTATTTCCCTGGGCTTTGAAGGTGCTCCAGTCCTTCTTATATTTGCCCTTAAATGCACCCTCAGTTCTCCCAAGGTTTTGACTTCCTTTGTTTGTCTTTGAAACTACATCTTTTGTCTTGTGTTGTCATCATATCTGCTTATTGCGTGTTTTTCATACCTTCCACCTCTCTAAAAGCCGTTACTTGAGCCCTTGTTATCACTTTTGATTGAGTGTGCTGCACTTAGCTGCATTTCTAAGTTTCTGATTCTTGCAAGTTTATGGAAGCAGAGGAGTCTTTAACCCACATCAGCCTTGATCTAAGTGTACCGCTTTACTTAAAAGTTCGTGGGATCTGGAGTTCCTGGTCTAGCAAGCCATGAAAATGCCAATAAATGTTTTATAATAAAGCTTTTATTTAAACATCCATTTTGTTCGACCTTGAAGCTTTACTAATATGCTGAAGAACAAACAGCCGATGCCAGTGAATATTCGGGCTTCGATGCAGCAACAACAGCAGCTAGCCAGTGCCAGAAACAGAAGACTGGCCCAGCAGATGGAGAATAGACCCTCTGTCCAGGCAGCATTAAAACTTAAGCAGAGCTTAAAGCAGCGTCTGGGTAAGAGTAACATCCAGGCACGGTTAGGCCGGCCCATAGGGGCCCTGGCCAGGGGAGCGATTGGAGGACGAGGCCTGCCCATAATCCAGAGAGGCTTGCCCAGAGGAGGACTACGTGGGGGACGTGCCACGAGAACCCTACTTAGGGGCGGGATGTCGCTCCGAGGTCAGTGCTATGTACCTGATAATTGTCAAGCCCCACCCCCTTTCCTTTTCTCTTGGGCTGCTTATGGACACATTTTTTAACATCTTTAAGCCTGAATTTGTATTAATATAATCAGTAACTTGAAGTCACATTTTTAATAGTGCTGCATGTTCTTTTATCGATGCCATTCCTTTTCTGATAATGTACAATGGTGAGAGGCTATGGCCTGCGTAACAACAGGTAATCCATGTCATCTCCATTCCATTTTAAAACACCCTGCTGCTGCTTGAATCAAAGCACATTTAAGTTCTAGAAGTAAGTCAAGTCTAAGAAATGTATGGGTCTGTTGACCTATAACTTAACCAATCATCTCTTTTCCTGTTGCTAGTGAAATACTGTTGTATCTGTAAAAAAGAGAAGACAAGTTGACCCGTAGCACTTAGCTATATATTACATTTGAGGCACTGTTATACTGTTCCCTATACAGTTCTTGTCCCCTACAACAATGTTTTGAGAGCAGGAACCGTATCATTTATTTGTAAATTTATTGGAATGTTAGGCACCTATCTGATTATTCAATAAATACTTAATTAAATGTACATACTTACTAACTAACTTAACTCCTCCCAGTTTCTTCCAAAAGTGGATTTTTGGTCAGACTTGTTGAATTGATTGAATAAAGAACATCTTAATCTGTTCACACTCAGTATGCAGCTTGCCCCACCCAACCTAAAAATTACCTGAATTAACTCATTTAACCCTCACGCCTTCCTTTGGTTAGAATCTACTTTGTTTCTCTTGGATTTACCTGCATATACATTGTATGCCTCCTCTCCAAGGTCAAAACCTGCTCCGAGGTGGACGAGCCGTAGCTCCCCGAATGGGCTTAAGAAGAGGTGGTGTTCGAGGTCGTGGAGGTCCTGGGAGAGGGGGCCTAGGGCGTGGAGCTATGGGTCGTGGCGGAATCGGTGGTAGAGGTTAGTCAGCTACCAACTTCAGAGAATAGCTCCCTCTTATTTCTCTCCCTTCAAAACTCAGAGCCGCCTTTCTGCACAGCTTCAAGTCATAGGCAGGCTTATTTGTTTGTCTTGTTTTGTTTTTTGAAACTGGCTTATTTTTCTAAATGCACATGGTGATAGTGCAAAAGTCTTTCATGGGTTTTCCTAGAACTAGTAAGTTGCATGTTACAGAGTCAGATTATATGCAGTCTTCTAGACTCTTGTGAATTTAAATTGTATTACTAAAATGACATAGTGGTTGGTTTGGGCTTTTACCTTTCTCTATCCCTGCCCCACCACCACACACAACCCACCCCATAATTCAAAACCCCACTTTTGAGTCTAAGAATCTAGAAGAGGAAGATGTACAAAAATGAAGCAGATTTAAAGAGCTGGATATTGACTCTGAAACCAAGTAAAGTCAAGGTAAAGTTTGTGTCTGTGGGAAACCAGCAATGACTCGGACTTTTTTTTTttcttgcatttgtcttcagatagagcaggagggaggaaaagagagagacacatcaagtggttgccacccacaggaccccaccagggccggggacaaactgcaaccgaggtacgtgcccttagtggaaaccaaacccaggactctatggtccacgggccgacactaaccgctgagccaaaccagccagggcAGCGATGACTCTttttgagagtacatttataaaagctagggacagtgaaacaaggaagggcctagaatagaagaagcaacaaaaggggaccttggagacaggttcagggggttagcctagaaccaggtgcacattgcccattgttcccctggttgcaagtctcttgaggaatcccttaaagtttaggaaatgcacgcctgtggggaagtagaggggagaagggagggcacgggattgctcccatgagggagagggtgcccagagattacttattttgaTGAAGGTAGAAAGCAAGCATGGTATTTTGTCAGTTAACTGACTCGTGTTGATAATAATCTTACCTTTGAGACTTAGTGATATTTGTCTTGTGACCTCTTGACCCAGATTGGGAGAGCTTAATGGTGTTGCTGTTAAAATGCCAAATCTCATGGGAATTTTCTGGCTTAGAATTTAGTGGAAAACTCCCAACAACACCTGTCTAAGAAAAAGAAAATTTTTATTATCTTAGCCCTGTGTATATTGACTTTGGTCCTTTTAAAGTGTGTGATGGGTCTTCCATAATTTATGACCTTGAAGTTGCCAAGGGATAATAACTGTTGGGAAAGGAAATTTGATAACTGAGGGCGTGTTTTCTTCTCTTCTATTAAATGTTGCTTGGCTAAAGTGAAGTGCAAGCTAGTTTGGGTTTCAGGGTGAAATAGCATGTTTCCAAATTATCTTGACTTGGTTTCTGAACAACACAGGGGTGGGGGAGTCTAAAGTCTTAGCTGGGTATATTTTAAGTGAATCGAAACCACCTCTCAGATAACCATGATTGTTAAAGGTATCTAGAATAGGAGATAGAAATGGCTGAGACTACTCAAGATGTTTTTTCCCATCTCTCCACATTATTCTTATGTAAAAATAACTCCTCAGTCAGCTCATAAGATCTTTAGGTTTGATAAGTTTGAGAAGAGATGGGCTAATTTTCCAGAAGGATCTCCAGTAAAACTTACTTTGAAAATGATATCTAGCTTCTCACCCCTGTTGCTCTGTGCCCTGATTACTTTCTCCCTATCTTAATTAATGAGTTTATGTGTAATGTATTTTAATTATGAATTTATAGTAGGTCTCGAGCTTTAGATAATTTGTTTTAGGAAAGATTAAGATTTTTCGAATTACCAGTTTCTCTTTGTTTATAGAATAAAAATTGTAAATAGCCTTTAGAGATGAACATATAATAAGGGATTCATTATGTGTGCTTTCCATGTGTTGCTTGCTACCCAGTGTGTTTCCTATTTTTCCAGATTTCTCCTCTTTACCCTGCCCTTCAGCCTCTCAGCTAGGCCCCACTA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>CHTOP_x2
GCACTGGGCGTGGCGGCCATTTTGTTTGGACACCGAGCGGGAGTTGGCGGCAGCGGCTGTGGTGGCACAGACGAAAGGCAGGGGAGGCAGGCCGAGTGAGCAGGTGGACCGGCCAACCAGACAGCCAGCTAACAACAACGAACTAACCTAGCAGTCTACTACTTACGCATCTAGCCAACCAAACAAGTTAACCCCAACCTCTCCACCATCAACTCAGGTTCGGCCGGCCCCCGGCCCGCCTTCCGCAGCCGTCGTGGCAGCCCCGGGAGGAGCACTGGCGTCCTTTTCCTTCGATCCTCGGGATTTGAAGATGGCTGCACAGTCAGCACCGAAAGTTGTGCTAAAAAGCACCACCAAGATGTCTCTAAATGAGCGCTTTACTAATATGCTGAAGAACAAACAGCCGATGCCAGTGAATATTCGGGCTTCGATGCAGCAACAACAGCAGCTAGCCAGTGCCAGAAACAGAAGACTGGCCCAGCAGATGGAGAATAGACCCTCTGTCCAGGCAGCATTAAAACTTAAGCAGAAGAGCTTAAAGCAGCGTCTGGGTAAGAGTAACATCCAGGCACGGTTAGGCCGGCCCATAGGGGCCCTGGCCAGGGGAGCGATTGGAGGACGAGGCCTGCCCATAATCCAGAGAGGCTTGCCCAGAGGAGGACTACGTGGGGGACGTGCCACGAGAACCCTACTTAGGGGCGGGATGTCGCTCCGAGGTCGGGGTATGATAGGTCGGGGAAGAGGGGGCTTTGgaggcagaggccgaggccgtggacgagggagaggTGCCCTTACTCGCCCTGTACTGACCAAGGAGCAGCTGGACAACCAATTGGATGCATACATGTCGAAAACAAAAGGACACCTGGATGCCGAGTTGGATGCCTACATGGCACAGACAGATCCTGAAACCAATGATTGAAGCCTGCCTACCCTCCTTTGAGAGACTCTTGTTAAAGTTATCACGTCTGTAAATAATTTTGAAATAACAGATGAGAAGAAACCTACCTGATTGATGCTGGAAGGACCTATCACAATAGACTATGGACTTACTTGCCACCAGTTTGTGCATTTAGTGTGTTCCTTTTACTTTTTTGATACTGTATTGTATGAAACCTGTTTTTCCTCTGACTTGGGTTTGGTTTCATTTTGTTGTTTTGGTTTTTTGTGGGATTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTCCTTCTCCCAGACGTTTCATGAATGTGTTGGCCGTCTTCCCACCTCTGCCTCCCGTTACCTGCCATATATGCTCTAACATTTCCTCTGTACCCCCTGAAAAAGTCCTAGAAAAAATCCATTCGGTGTTCCTCCTTAATGCCTAGGTTTCTGGGATACAGTTCTGTTCTATATCACTTTAATAGCCTCTTAGAAGTGATTAGAAAATCTGGAATTCAAAAATGCATTCTGCCACTTTGATATTTTAGTATAATACAGGAACATTGGCCTAACTCTAGTGTCACATAACAGGTTATATATGTGTTAGCAGCTCAGATTTGGTTAAAGTTGCTACCATGTGTATTGACACCACATGATGTGAGGTGGTTTGGGAGTATGCATACTTTCTACCCTGGAATAATATTTATAAACTTTCCTCTCAGCTTTGCATCGTGTCCAAAGGGGTACTGTTGGGTTAGTTTACATCTGCAATAGTGAGAGAAACCCCGTTGGTTAAGCAAATGCTTCAGAAGGGGTGGGAGAACTATGGCAGATAACTGCATGGGAAGATACCCATGTTGAATGTAATTATTATGTTTATCCCAAACCAATCTTGGGCTTTTCCATACATTGGCTCTGTTTGACCCACTTATTTTCCTTGAAGGTTTGTAAGTTCAGCCATATTCTGTCAACTGTTCCAGTTTCAGTGGAATCTTGTATTTCTGGTTTATTATAACAAGAAATTGTTCTCTCAAATCC
>CHTOP_x4
ATGGCTGCACAGTCAGCACCGAAAGTTGTGCTAAAAAGCACCACCAAGATGTCTCTAAATGAGCGCTTTACTAATATGCTGAAGAACAAACAGCCGATGCCAGTGAATATTCGGGCTTCGATGCAGCAACAACAGCAGCTAGCCAGTGCCAGAAACAGAAGACTGGCCCAGCAGATGGAGAATAGACCCTCTGTCCAGGCAGCATTAAAACTTAAGCAGAAGAGCTTAAAGCAGCGTCTGGGTAAGAGTAACATCCAGGCACGGTTAGGCCGGCCCATAGGGGCCCTGGCCAGGGGAGCGATTGGAGGACGAGGCCTGCCCATAATCCAGAGAGGCTTGCCCAGAGGAGGACTACGTGGGGGACGTGCCACGAGAACCCTACTTAGGGGCGGGATGTCGCTCCGAGGTCAAAACCTGCTCCGAGGTGGACGAGCCGTAGCTCCCCGAATGGGCTTAAGAAGAGGTGGTGTTCGAGGTCGTGGAGGTCCTGGGAGAGGGGGCCTAGGGCGTGGAGCTATGGGTCGTGGCGGAATCGGTGGTAGAGGTCGGGGTATGATAGGTCGGGGAAGAGGGGGCTTTGgaggcagaggccgaggccgtggacgagggagaggTGCCCTTACTCGCCCTGTACTGACCAAGGAGCAGCTGGACAACCAATTGGATGCATACATGTCGAAAACAAAAGGACACCTGGATGCCGAGTTGGATGCCTACATGGCACAGACAGATCCTGAAACCAATGATTGA