Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name Agps
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name alkylglycerone phosphate synthase
Also known as 5832437L22|9930035G10Rik|Adaps|Adas|Adhaps|Adps|Aldhpsy|bs2
Coordinate chr2:75662521-75761694
Strand +
Gene summary Predicted to enable alkylglycerone-phosphate synthase activity. Predicted to act upstream of or within lipid biosynthetic process. Located in mitochondrion. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; respiratory system; sensory organ; and urinary system. Used to study rhizomelic chondrodysplasia punctata type 3. Human ortholog(s) of this gene implicated in rhizomelic chondrodysplasia punctata and rhizomelic chondrodysplasia punctata type 3. Orthologous to human AGPS (alkylglycerone phosphate synthase). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Agps

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
AgpsP1 chr3:68240534-68241174 + Intragenic
Intragenic
 ENSMUSG00000102846 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_172666.3
AGTCGCCGCGGTGACTGCCGGGATGCGCCGCAGCGAATGGTCGCGCGGGGCGCCGCTCTGAGTGACCTTTCACCCGAGCCCAGCGGCCTCGGGCGGCGGCACAAGGCGGAAGCCATGGCGGAGGCGGCGGCGGGCGAGGCGGGCGCGAGCGAGCGGGACCCAGACGCGGGCCGCGCGCGCCGGCGGCTGCGGGTTCTGTCGGGCCATCTGCTGGGCCGGCCCCAGGAGGCTCCGAGTACCAATGAGTGCAAAGCGCGGAGAGCCGCGTCGGCGGCCGGGGCGTCGCCCGCCGCTACTCCTGCCGCACCAGAGTCGGGCACCATCCCCAAGAAGCGGCAAGAAGTTATGAAATGGAATGGATGGGGCTACAATGATTCCAAGTTCTTATTGAATAAGAAGGGCCAGGTTGAGCTGACTGGGAAAAGGTACCCACTTAGTGGCTTGGTTTTACCAACTTTGAGAGACTGGATCCAAAACACCCTTGGAGTAAGTCTGGAGCATAAAACTACCTCTAAAacaTCCATAAATCCTAGTGAAGCACCTCCTTCTATTGTGAATGAAGATTTCCTTCAGGAACTTAAAGAAGCTCGGATTTCCTACTCACAGGAAGCAGATGATCGTGTGTTTAGAGCTCACGGTCATTGTCTTCACGAGATATTTTTGCTCAGAGAAGGGATGTTTGAGCGGATTCCTGATATAGTTGTATGGCCAACATGTCATGATGATGTAGTTAAGATTGTGAATCTAGCTTGCAAATATAACCTTTGTATCATACCAATTGGTGGAGGAACAAGTGTGTCCTATGGCTTGATGTGTCCTGCAGACGAGACAAGAACAATAATTTCTTTGGACACTTCACAAATGAACCGGATTCTCTGGGTTGATGAGAACAATCTGACAGCTCACGTAGAGGCTGGGATAACAGGACAAGATTTGGAAAGACAGcttAAAGAAAGTGGTTATTGTACAGGTCATGAACCGGACTCCCTGGAATTCAGCACCGTGGGAGGATGGATATCTACTCGAGCGTCAggcatgaagaaaaatatctatggCAATATTGAGGACCTGGTGGTTCATATGAAAATGGTAACACCTAGAGGTGTAATAGAGAAAAGCTCCCAAGGACCTCGTATGTCAACGGGCCCTGATATCCATCACTTCATTATGGGATCTGAAGGAACTCTTGGTGTAATAACAGAAGCTACAATAAAGATCAGACCAACCCCTGAGTACCAGAAGTACGGTTCGGTGGCTTTCCCTAACTTTGAACAAGGTGTAGCCTGTTTAAGAGAAATTGCAAAGCAGAGATGTGCTCCTGCATCTATCCGCCTCATGGACAACCAGCAGTTCCAGTTTGGTCATGCTCTTAAACCTCAGGTCTCTTCTATTTTTACATCATTTTTGGATGGATTAAAAAAGTTTTATATTACAAAGttTAAAGGATTTGATCCAAATCAAATAAGTGTAGCCACATTACTGTTCGAGGGAGACCGTGAGAAGGTTCTTCAGCACGAAAAACAAGTGTATGACATCGCAGCAAAATTTGGTGGTCTGGCTGCTGGAGAAGATAACGGTCAGAGGGGTTATTTGCTGACTTATGTCATTGCATATATTCGTGATTTGGGTTTGGAATACTATGTAATAGGAGAATCTTTTGAGACTTCTGCTCCTTGGGACAGGGTTATAGATCTGTGTAGAAATGTAAAGGAGAGGATAAGAAGGGAATGCAAAGAAAGGGGAGTTCAGTTCGCACCTCTTTCTACGTGCAGGGTGACACAGACTTATGATGCAGGTGCATGTATCTACTTCTATTTTGCCTTTAACTACAGGGGAATTAGTGACCCACTGACCGTGTTTGAACACACTGAGGCAGCTGCTAGAGAGGAAATCCTTGCCAATGGAGGGAGCCtgtcacatcaccatggagTGGGCAAGATACGAAAGCAGTGGCTAAAGGAGAGCATCTCTGATGTCGGCTTTGGAATGCTAAAGTCGGTCAAGGAGTATGTGGACCCAAGTAACATCTTTGGAAACAGAAACCTTTTATAACTCCATTAATATCATTATGAAAAATGTTACCTTTTAAAAGTCATCAGCTATGGTTATACCAGTAATTGAATATATCATGGGACTGTATTTCAGCTacatttgtttgttggtttaaaATGAGTTGGTTTTTGTTCTGTGCTTTGTTTCTACATCTATAGATTGACAGATGGCGCTCCTGGGCCTCATTGTAGGTGTACCAGTTTATAGCCAACTAACTGGTTGTCGTTTCAGATTTTAGTCAGGCAGCACAAGGCTGCCCATTATCTGAGGAATATGCTGCCAGCTGTTTTACATGCTCCTCCTCTCGGTGAGCTGAGGCAGAGGGTGTCATCCGTTGCTCGGCTAGCCTCTCTTCTGTCCTGTCCTTTCTTAAACATTTCTCTAAAGCAGATAATCTAGCAAAGATTCTGCTGGTGAGAGATATTTGTGTATGTTGTTAAAGCATACTTTCCTGTGAGTAGGTCATTGGGGAGGACACTCAAGACAGAGCTGGTAGTCTGTTACTAGCATGCCTTCATCTGTATAAGGTGCTCAGCCTAAGCTTTGCTTGAAGTGCATACATGTTACAAACTTAAATTGCCAACATATAAATTACTCTGTCAGCAGACACACTTTTGTCCTCCGTGTCTGTTCCTAGGAGGGTGTGAGCTGTATTTGTATCACTGAGGTGTCAACTATAGCTGTGTCCTGGATCGTTCATAGCGTGCTTTGTAAGAACAGCTGACTTAATTCACGTGAAGGGCAGGTTGTACCATGAAGTGAAGGCCATTGTCCATCCTCCAGCCTCAGGTTTCTTCTGCCCCATGCCTGGTAAGCTGCACACGCAGTGCAGCATGAGCAAAGGAAAGTCTTCTGAGCCTGCTGTCTCCGCTGTAGAGAATTATTTGGCTAAAGAAATAGTCATTAGTTGACTCAAAGTCTCAATAATTTCAATGACAacgatctttttttttaattagccacAAATAGCCTGATAAATTTTCATGGAAAAACATTTTCAGTTTAATTCTTAATAATGGTTTAATGCTTTTTTGAATTACTGGTTTAacctaaattaaaagaaaatgtattactGCATATGCCATAATCACAAGTTTGAAATATcctatttcttaaataaaaaggagaacGTTAATTACATTTAGCAGACATTTTTACATTCAAAACTGGATATTGAAATACGTGGAACAATTGCTTTAAATCACTGTCTGTTGAGGTTCCTGATTCATGTTTTGAAATGGGTTCTTTTCTTAATGCAATACCTAacttttgataattttttaaaattaatatttaatcagATAATGTAAGTCAAAATGCAGACGATCCTTTAAAAGGACACACTGTCTGTCTATGTAGCAACAGCTCCAGATACGTTGGGGCAGTTTGATACCTTTTATATCTTAAGTAGCCTTAAACAGAACAGCGAAAATTTAAAattgacaaaatatttttaagacttcaaaatagtaaataatttttaactattataattggcctcaaactaacaaaTTTAAATCTGTAGGAAAATCAATATTAAATATTAGGTTAACAACAAAAACtcaatatttattttttggaaGCTGCCTTTTTattgatgatttatttttaattataaaatttacaTCAGATCTTTGATTAAAGACTTTGATGGTTTGAAATAGCCGGACACTCAAGGAAATTGCTTCTAGAATTATAAGATTCTTTATAAAATGCATCTTCATGAAGGTGATTCTCTAATTGGTAATTGAAATGTAGCATTTAGTAAGATTCCAACATCTCACTGCAAGTGTCTACATGTTTCCAAGtagttattttaataatttcattagTAGGTCCAGTTCCTTGCATGTGATTGTTAAAACGTTTTTCTCAAGGAGTTCAGCTTTTCACAGCCTCAGCGATCTGTACTGTAATTGTAACACCTGAGTTGCTGGGTTGGTTCTTATGAGCTTTATGGCAGTTGGCAGTTTATGTCTTTGCTTCCCTTTTCTGTGTATGGAGGCCTCAGCAACCTCGATTCTATAATGGTTactacattttgtattttaagtAATTTCTACAGGGATCATTTTGGAACACATGAATGTTCATTAGTAGTAGTTCTTACTGCAAATCAGGAAGCCTTCCCAGCCACTTCTGGGAGGTGCTGCGTTGTAGACTGTGTCTGCGGAGGAACATGAGTTCATGAATATGCACAAAGCACTTAAACCTTGTCTCTTCTTTCAGAAGTGTCTGCACATGGCTTCATGAAGCTAAGCCCAGGAAAATACTGTTCTCTGAAGCATCTTAACTCAAAGAGTAGTGTTTTTCCTGTTGGGTATCAGAGGCCTAGAACACTGACTTGTCCTTCCCAAGTTAGTCATATGTGTAATAGTTTGCTTAAATCACATGCAGGTTGGGCTTTCAGTGGGAATGGGAACTTGCTGCTAGTGAGAAATGGAGTCAGATACTAAAGACTCACCAAACAGGCTGTATTGACCTTGGAGAAACTGCTGCATccatgtgtggtggtgcataAGTGAATTGAGTCTTAATGCTATGGTCCTTGAGCATCTCCGTTAGCTGAATTGTGGAGACCACATGTTTCTTGTGTCCAACATTTTATTACAGAATAAAGGATTAACCTATGGTCTTTTTAGAAATGGTAGGTTGTTACTCAAAATGCTTACGTATAATAGGATTATTGACCTGAGGTTATTTATGAATCTGGAAGCTTTCTGGTATGCATATTTGTGTTGTTGGTGTATTTTGGGAAACAAAAGCTCAATAAAATATAAGCTTCCATTGGTGTGTATATTATATCAGATATAAACACATGTAGGaaccctcctttccccctccagAACACTGTAACAGTCCTAGATGACGTATTTGAAAAAGCCTTTCTGCATGTTAATCCCAGAGATATTTTTTGTCATACTCTTTCATACCAACAGCTTCTAAGT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