Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Sestd1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name SEC14 and spectrin domains 1
Also known as 1500031J16Rik|A930010O20|Solo/Trio8
Coordinate chr2:77010684-77111160
Strand -
Gene summary Predicted to enable phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding activity and phospholipid binding activity. Predicted to be involved in negative regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel. Predicted to be located in intermediate filament cytoskeleton. Predicted to be part of calcium channel complex. Is expressed in cranial ganglion and dorsal root ganglion. Orthologous to human SESTD1 (SEC14 and spectrin domain containing 1). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Sestd1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Sestd1P1 chr7:120112295-120113589 + Intragenic
ENSMUSG00000109326 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_175465.6
CGTCCCCAACGCCCGCCAGCCCGGCCCGCGCCAGCCAGAGGCAAGGACGTGAAATGGAGGCCTCGGTGATATTGCCCATTCTGAAGAAGAAGCTGGCCTTCCTTTCAGGAGGAAAGGACAGACGCAGTGGACTCATCTTGACAATTCCGCTGTGCCTTGAGCAGACAAGTATGGATGAGCTGAGTGTCACTTTGGATTATCTACTCAGCATTCCAAGTGAGAAATGTAAGGCCAGAGGATTCACTGTGATCGTGGATGGCAGGAAGTCTCAGTGGAATGTGGTGAAGACAGTTGTCTTAATGCTGCAGAATGTTGTTCCAGCCGAGGTATCCCTTGTTTGTGTAGTGAAGCCAGATGAATTCTGGGATAAGAAAGTAACACACTTTTGTTTTTGGAAAGAAAAGGACAGACTTGGCTTTGAGGTTATTTTAGTGTCCGCCAATAAGTTGACGCGTTACATAGAGCCATGCCAGTTGACAGAAGACTTTGGTGGGAGTCTCACCTATGACCACATGGACTGGCTGAATAAGAGGCTGGTCTTTGAGAAGTTTACAAAGGAGTCTACATCATTGCTAGATGAACTTGCTCTGATTAACAATGGAAGTGATAAGGGGAATGAGCAGGAGAAAGAAAGGTCTGTGGATTTAAACTTTCTTCCATCCGTTGATCCTGAGACGGTTCTTCAGACAGGGCATGAGTTGTTATCTGAATTACAGCAGCGTCGATTTAATGGCTCCGACGGAGGGGTCTCGTGGTCTCCTATGGATGACGAGCTGCTGGCACAGCCGCAGGTTATGAAGTTGCTGGACTCACTCCGGGAGCAGTACACGCGCTACCAGGAAGTCTGCAGGCAGCGCAGTAAGCGCACACAGCTGGAGGAGATCCAGCAGAAGGTGATGCAGGTTGTGAACTGGCTTGAAGGGCCTGGATCTGAGCAACTGAGAGCACAGTGGGGCATTGGTGACTCGATCAGGGCCTCCCAGGCCCTGCAACAGAAGCATGAGGAGATCGAGAGCCAACACAGCGAGTGGTTCGCAGTATACGTGGAGCTTAACCAGCAGATTGCAGCACTCTTAAACGCTGGAGACGAGGAAGATCTTGTGGAGTTGAAGTCTCTACAGCAACAGCTTAGCGACGTTTGCTATCGACAGGCCAGTCAGCTAGAATTTAGGCAAAACCTCCTGCAGGCAGCTTTGGAATTTCATGGTGTGGCCCAAGATTTGTCTCAGCAGTTGGACGGCTTATTAGGGATGTTGTGCGTAGATGTAGCACCAGCTGATGGAGCATCGATTCAGCAAACTTTAAAACTGCTTGAAGAGAAGCTGAAAAGTGTTGatgTAGGATTGCAAGGCTTGCGAGAAAAAGGTCAAGGTCTCCTGGATCAGATCTCCAACCAGGCTTCCTGGGCCTATGGCAAGGATGTAActattgaaaataaagaaaacgtGGACCACATACAAGGAGTGATGGAAGACATGCAACTTAGGAAACAAAGATGTGAGGACATGGTAGATGTGCGGAGGCTGAAGATGCTTCAGATGGTGCAGTTGTTTAAGTGTGAAGAGGATGCTTCACAGGCAGTAGAATGGCTGAGTGAACTTCTGGATGCCCTGCTGAAGACCCATATCAGGCTGGGTGACGATGCTCAGGAAACAAAGGTTTTACTGGAAAAACACAGAAAATTTGTCGATGTTGCCCAGAGTACTTACGACTATGGCAGACAGCTGCTGCAGGCCACAGTTGTACTGTGCCAGTCTCTGCGCTGCACTTCCCGGTCCTCAGGGGACACACTTCCTCGACTGAACAGAGTGTGGAAGCAGTTTACAGTCGCATCTGAAGAGAGAGTGCACAGGTTGGAGATGGCTATTGCCTTTCACTCCAATGCCGAAAAGATTTTGCAAGACTGCCCAGAAGAGCCTGAAGCAATGAATGATGAGGAACAGTTTGAGGAAATTGAAGCAATTGGAAAATCACTTCTGGATAGACTCACTATCCCCGTGGTTTACCCCGACGGAACTGAACAATATTTTGGAAGTCCAAGTGACATGGCTTCTACTGCAGAGCACATCAGGGACAGAATGAAACTGGTCAGTCTCAAAAGGCAGCAGCTGAGACATCCCGAATTGGTGACCACGGAGAGCTAATGTCCCCAGCTCCCGCAGATCTGCAGGTCATACGCCCACATTCTTTGCTGCTGGCATTCTCTGGGGTTAGCCACAGCTCGTTAAGATGCATTTCACAGCGGGATAAGCCTCCTTTCTTCCCACGACACGTGTCTCTCTCTAAATGCTAACATTTCTCCACCACCAAGGCATAGTCACAACATGCTTTGAGACTGTAGACTCCTGGTATCCTAAGAGAAGGAATTGTAACCACCGCACTGAGTCCTCGCTTTCACGCCGTACCTGACTTGTCAGTTTGTAGCCAAACAACCAATACTAAGCTTTGAATGGTGCTAATCAGAGTTTAGGAATTCTCTATAAAACATGGCTGCCCTTCCTCCCCAGGTGATGTAGGATATTTAGACCATAGTTAGACTGTTAGTGAATAGTGGTGTCCTCAAAATTTTACTTTGTAATTCTTcaaaattgattatttttaatgtCTATATGAAGAAAACCCTTCAGATCTTTGATATATCATATTCATTGAAAGACATTTTCCTATTGTATTCATAATGTATTAAAAGTTGTTTGTGCTTAATAAAAATCTTCTTTAAACATCTTATTTAATTTGGTAGTTACGTCCTGCTTCTAAACACGAGTGCCTTACTAACGGGGCATTCTTAGAATTGTAAGGAGGGTTAATCATTGTTTGTGATGGTGGATGCATGTATTTTAGGCAAGAAtttcatatgtatgcatgtgtatataataaaaaacaagcaTGTTTATTGTGAAGAATAATTTAGACCATTAAGAACATAATAATAGAATACTATTTTAAACTTTTCTCTTGAAAAATGGTGTCCAGAATATTAGCTCCCCTGAAGACACTTTGTCTGTGGGGAAGGAGGGCTAAAGATGAAGGTATACATACTCAATGTAATCTTTTATATCACAGCAATCACTCTGGAACTAAAGCAGAAATtgttaataatatttaatatctCATGGTATTAGAGgcaaaaaaatcatcctgaagtATAGTCACAAAAACTGTATAGatctttagaaataaaatttgtCATAAAATGGTAATGCTTTTATGTTTGTATTAagttataaaatgtatatacttTAACATtgtgttaattttaattttagaatatattttaaggTGAAAATAACTGGGCTTATCAGTACAAAATTATGCAAAGAATCGTATGCAGGTTTATTTTTCTGGTCTGTAAAGACGATCACGTACCTTCCTATGTTCAAGCCAGTTTCTCCAGCCTTCTTTTTTGCCAGCCTTGATGAATTTCATCATCCTCACCCTCACCCTGTGTCACCTTTCAGTCAGCTTTGCGCCTCACTTTACAGGAAACGGCCATAGTCTTCTGGGTCCCGCATTGAATGTTTTTGCTCTCTGACACGTCACCTTCCTTTCGCTCCGTTTCTAGTCTCTCCCTAACAGTGCTCCATCCCTCAGTGGTGCTCTCTCCTGCCATGTGAGGGCATGGTTTAGGTCTGTTGCACATGCACACTGTGCTGCTGTCCTCAGCTCTTGCTCATTGGGCATCCCATCCCTAGTCCTGCATTTCACGTCCGATCCCAATTGCATAGCTTTCAGCTGACTCGGTCCTCTCCCCTAAATGAAAGCATATCCTACTTGCCTTTTCTTCCTGAGTAGTTTTGATTAATGGTGCCAACAATGTCCAGGGCAAACCTCAGCTGTTCCCCATGTCTTACTCTGCCTCTGAGACCATCCAGAAGTCTTTTCTATACTTGATAACCCTTCTTCAGGGCTCGCCTCCTGTGCATAGGAGCTCCTGTGATTCTTTCTTCAGTCTTCATGATGGTGCTAACTTTTCCTGTTACATCATAAAGTCCTCTTGGGGGTGACTCTTGTCCCACATGTCTTGTGCCTAGACCTTTGCTCATGTGTGACATGCTCAGTCCTACAGCTGTGTTCCTTTGTCAGCGTTAGTAATAATCTCTCCACTACTGCAGTCTGAGGTCTATTTAAACAGTGTTTGGCTTTTCCTAGCGTTAGAACTGACTTGTAAATCTGTGTCCATGGAATGTGTCTGATGTTTTAGATCCTTAGATGTGGAACTTTTAGATATTGTTTATATTCAGTATCAGTCTCTTTTTACTGAGTTTCAGCATCATCAGTATCTTTATTTGACTTGGTAATTATGCCATCAGCTCATGGATGcataatttcaatttaattttcatatatcTTAAGCCCTCTTCCCTGCAAAAAGTGGAATAAGACAAACCATGGAAATGCCATGTCGGACTTGAAAGTTAAATGGAACGAGATACACAGAATGGACATAGTCGCTCTTCTTTGGCAAATGTGGACCCCTTTTCCATGGGTTTATCTTTATAGATACACAAGAGTTATGAATAAAAACCGAGCAATGCCCAAACTGACTTTCCTCATGTGGTCACAGTTCACTTAGAGGACATATGAAGGAGGTGACTTCGGTTTGTGTGAAATCTCAGGCctttgttatattaatactgacatTGACCTAAAAAtgtcattaaaaagaaatacttCCTTCTTACTGGTTCAATGCCGCAGCCCCCTGCATTATTTTAACCCTTCTGGAGGTTGACTGACACATTAGCTAGCTAacttttgtgtctggctttttttttttttttcttttttgcccgtGCCTATCTTTGTTCCTGTGTAAACTCAGCAGACAATGGCAATTTGATGTCTTCTCTTAGTACGTATCTGACTCGGCAGAGCTGTGATGCAAAGACGATAACTTCCTTTGAGACCAGTTTGGCTGCATTCCCAGTTCTCATCGTTCTGACCTTATTTTACAGGGGAGTCATTAGTGATCTTGGTGAGAGCTCATCCTGTTAGCTTCC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