Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Hnrnpa3
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3
Also known as 2410013L13Rik|2610209F03Rik|2610510D13Rik|Hnrpa3
Coordinate chr2:75489603-75499751
Strand +
Gene summary Predicted to enable RNA transmembrane transporter activity and mRNA binding activity. Predicted to be involved in mRNA transport. Predicted to act upstream of or within RNA splicing and mRNA processing. Predicted to be located in several cellular components, including neuron projection; nucleoplasm; and ribonucleoprotein granule. Predicted to be part of catalytic step 2 spliceosome and messenger ribonucleoprotein complex. Is expressed in central nervous system and sensory organ. Orthologous to human HNRNPA3 (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Hnrnpa3

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Hnrnpa3P2 chr1:9644760-9645890 + Intragenic
ENSMUSG00000081441 UCSC
Hnrnpa3P9 chr10:59642335-59643465 + Intragenic
ENSMUSG00000091941 UCSC
Hnrnpa3P10 chr11:8834171-8835313 + Intragenic
ENSMUSG00000082095 UCSC
Hnrnpa3P11 chr14:122355298-122356437 + Intragenic
ENSMUSG00000066538 UCSC
Hnrnpa3P12 chr15:41785436-41786566 + Intergenic
ENSMUSG00000116083 UCSC
Hnrnpa3P14 chr16:94043116-94044252 - Intragenic
ENSMUSG00000114993 UCSC
Hnrnpa3P15 chr16:97291195-97292336 + Intragenic
ENSMUSG00000096156 UCSC
Hnrnpa3P3 chr2:180858481-180859612 + Intragenic
ENSMUSG00000083993 UCSC
Hnrnpa3P5 chr4:111664541-111665663 - Intragenic
ENSMUSG00000100514 UCSC
Hnrnpa3P7 chr5:17698175-17699293 + Intergenic
ENSMUSG00000106358 UCSC
Hnrnpa3P8 chr7:65434559-65435693 + Intergenic
ENSMUSG00000068480 UCSC
Hnrnpa3P4 chr3:54388835-54389976 + Intragenic
ENSMUSG00000069014 UCSC
Hnrnpa3P1 chr1:143558916-143560427 + Intragenic
ENSMUSG00000089640 UCSC
Hnrnpa3P6 chr5:13130609-13132835 + Intergenic
ENSMUSG00000104577 UCSC
Hnrnpa3P17 chrX:79500293-79502157 + Intragenic
ENSMUSG00000081205 UCSC
Hnrnpa3P13 chr15:77327471-77328633 - Intragenic
ENSMUSG00000082233 UCSC
Hnrnpa3P16 chrX:73178724-73179900 - Intragenic
ENSMUSG00000081118 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001359971.1
GCCTCTTCCTCTCGGTCCCATATTGAACTCGAGTTGGAAGAGGCGAGTCCGGTCTCAAAATGGAGGGCCATGATCCAAAGGAACCAGAGCAGCTGAGGAAGCTATTTATTGGtggtctgagctttgaaaccacaGATGATAGCTTAAGAGAACATTTTGAGAAATGGGGCACACTTACAGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCCCAAACAAAACGTTCCAGAGGCTTTGGTTTTGTGACCTACTCTTGTGTTGAAGAGGTGGATGCTGCAATGTGTGCTCGGCCACACAAGGTTGATGGGCGTGTGGTGGAACCGAAGAGAGCTGTTTCTAGAGAGgaTTCTGTAAAGCCTGGTGCCCATTTAACGGTGAAGAAaatttttgttggtggtattaAAGAGGATACGGAAGAATATAACCTGAGAGACTACTTTGAAAAGTATGGCAAGATTGAAACCATAGAGGTTATGGAAGACAGGCAGAGTGGGAAAAAGAGaggatttgcttttgtaacttttgATGATCATGACACAGTTGATAAAATTGTTGTTCAGAAATACCACACTATTAATGGGCATAATTGTGAAGTGAAAAAGGCCCTTTCTAAACAAGAGATGCAGTCTGCTGGATCACAGAGAGGTCGTGGAGGTGGATCTGGCAACTTTATGGGTCGTGGAGGAAActttggaggtggtggaggaaacTTTGGTCGTGGAGGAAACTTTGGTGGAAGAGGTGGctatggtggtggaggtggtggcagcagaggtagttatggaggtggtgatggtggataTAATggatttggaggtgatgGTGGCAACTATGGTGGTGGTCCTGGTTACAGCAGTAGAGGAGGTTATGGAGGTGGTGGACCAGGATATGGAAACCAGGGTGGTGGatatggtggtggaggaggaggctaTGATGGTTACAATGAAGGAGGAAATTTTGGTGGAGGTAACTATGGTGGTGGTGGAAACTATAATGACTTTGGAAATTATAGTGGACAGCAACAATCAAATTATGGACCCATGAAGGGGGGCAGTTTTGGTGGAAGAAGCTCAGGCAGTCCCTATGGTGGTGGCTATGGATCTGGAGGTGGAAGTGGTGGATATGGTAGcagaaggttttaaaataaaacagaaacgGTGAATGAGAACCCTACCTGCCTAACGAGGAATGTCTTTCCCACACCTTAAATACGAAGGTTTCTGGCTGGGTAAGGTTTGTAGCTCACAGTAAAAACCGATGACACTGTTGGTTTCCCACAAGTCAATGTCACAGTTGAGACACCCCTCAAGCTCAGTTTTGTTTTGGTGCCCATTGAACAAATTCTAAGACATAGGCAGTTACATTCTGCAAAGCCATGGGTGTTTGTCATAAGCTAGATGTGCCTCTTCATGTGTACAACTCAATGTTCTAAGGTAAAGTCATCCTTCAATAAGGGGAAGTCATGTTGGCTTTTCAAAAGTAAGTTTTTCATGTATGACTTTAATAAGCTGTTCCCACCCTAAGAACTAGGAACTTTCACAGTTGTCAGAATAATTGTCTTCCTTAAAGCTCTATAGCGTGTAAGTTTACTCTTGTGTGGACCAGTAGGGATAGTCAAGTGTTTAGTCTTCTCCCCTAACCCATCacaaacagggtctcactgttgtCCTAGCCTGGAACTCAATCCACCAGCCTTctgtgtctcccaagtgctggagttaaaaggGTGGTGCCTGTATGATAACTcaagttcctttttaaaaaaacatccaAAGAACAGTTGGGTTACTATTCACATAATGTTGCTGGTTGTTCATAAGGGCTATTTCTGCTGCCCTGAAAGGGCTTATTTGAAAATTGCTTAATTCAGGTTACTTCTTAATAGAACATTTTCAGGGGACAAATCTGCAAAATGTTTCCCACACAGGGAACATCCCTGCATCAACAAGTTTGCTTGGCATTTAAGTCAGgacaaagttcacagaaatcatagttacCAATGAGGTAGCAATCGTTCAATGGTGGTTAACAGATTGGAGAAAATACATTTGCTTAGGAGGCATTTACAGTCCATTTCCTTTctgaaataaagttattttactAATATGGTTCCACTGTCATTTCTGCAAAAACACTTTACAATGGTAGAAGGGTAAGCATAAAACAAAAGAGGCTGCCTCTGGTTTTGTTGGACCTGTGGGATGCTGCTCCCAGTTTACATGTCTGAAAGGTGTGTTCACATTCGTGTATAAATTAGGGGACACATGGTAAGAAAAAGTCCATCTAGTAGGGGACTACAGAGAAATGGGCTCGGTTTTTAAGGGTTCTGTTAATGTCACAATTTGAAACGCTCCTGACAATAGTTCAGTAATTGGCATGGTAGCAAGCATGCAGATGTGCAAGGTGCTGTGAGGATTGGTAGCCTGAGTATTCAGTTTTAAACTTAACATGTCTTCTAATCTTTATGACAGCAGAGGTGGTCTGTAATTCAATTGTTTTCATTTGTAGCATAATGAAATGTTACAGAAAGATGaccttttcattaaaatatttttagaaatgtg
>NM_053263.1
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>NM_198090.2
GCCTCTTCCTCTCGGTCCCATATTGAACTCGAGTTGGAAGAGGCGAGTCCGGTCTCAAAATGGAGGTAAAACCGCCGCCCGGTCGCCCCCAGCCTGACTCCGgccgtcgccgccgccgccggggGGAGGAGGGCCATGATCCAAAGGAACCAGAGCAGCTGAGGAAGCTATTTATTGGtggtctgagctttgaaaccacaGATGATAGCTTAAGAGAACATTTTGAGAAATGGGGCACACTTACAGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCCCAAACAAAACGTTCCAGAGGCTTTGGTTTTGTGACCTACTCTTGTGTTGAAGAGGTGGATGCTGCAATGTGTGCTCGGCCACACAAGGTTGATGGGCGTGTGGTGGAACCGAAGAGAGCTGTTTCTAGAGAGgaTTCTGTAAAGCCTGGTGCCCATTTAACGGTGAAGAAaatttttgttggtggtattaAAGAGGATACGGAAGAATATAACCTGAGAGACTACTTTGAAAAGTATGGCAAGATTGAAACCATAGAGGTTATGGAAGACAGGCAGAGTGGGAAAAAGAGaggatttgcttttgtaacttttgATGATCATGACACAGTTGATAAAATTGTTGTTCAGAAATACCACACTATTAATGGGCATAATTGTGAAGTGAAAAAGGCCCTTTCTAAACAAGAGATGCAGTCTGCTGGATCACAGAGAGGTCGTGGAGGTGGATCTGGCAACTTTATGGGTCGTGGAGGAAActttggaggtggtggaggaaacTTTGGTCGTGGAGGAAACTTTGGTGGAAGAGGTGGctatggtggtggaggtggtggcagcagaggtagttatggaggtggtgatggtggataTAATggatttggaggtgatgGTGGCAACTATGGTGGTGGTCCTGGTTACAGCAGTAGAGGAGGTTATGGAGGTGGTGGACCAGGATATGGAAACCAGGGTGGTGGatatggtggtggaggaggaggctaTGATGGTTACAATGAAGGAGGAAATTTTGGTGGAGGTAACTATGGTGGTGGTGGAAACTATAATGACTTTGGAAATTATAGTGGACAGCAACAATCAAATTATGGACCCATGAAGGGGGGCAGTTTTGGTGGAAGAAGCTCAGGCAGTCCCTATGGTGGTGGCTATGGATCTGGAGGTGGAAGTGGTGGATATGGTAGcagaaggttttaaaataaaacagaaacgGTGAATGAGAACCCTACCTGCCTAACGAGGAATGTCTTTCCCACACCTTAAATACGAAGGTTTCTGGCTGGGTAAGGTTTGTAGCTCACAGTAAAAACCGATGACACTGTTGGTTTCCCACAAGTCAATGTCACAGTTGAGACACCCCTCAAGCTCAGTTTTGTTTTGGTGCCCATTGAACAAATTCTAAGACATAGGCAGTTACATTCTGCAAAGCCATGGGTGTTTGTCATAAGCTAGATGTGCCTCTTCATGTGTACAACTCAATGTTCTAAGGTAAAGTCATCCTTCAATAAGGGGAAGTCATGTTGGCTTTTCAAAAGTAAGTTTTTCATGTATGACTTTAATAAGCTGTTCCCACCCTAAGAACTAGGAACTTTCACAGTTGTCAGAATAATTGTCTTCCTTAAAGCTCTATAGCGTGTAAGTTTACTCTTGTGTGGACCAGTAGGGATAGTCAAGTGTTTAGTCTTCTCCCCTAACCCATCacaaacagggtctcactgttgtCCTAGCCTGGAACTCAATCCACCAGCCTTctgtgtctcccaagtgctggagttaaaaggGTGGTGCCTGTATGATAACTcaagttcctttttaaaaaaacatccaAAGAACAGTTGGGTTACTATTCACATAATGTTGCTGGTTGTTCATAAGGGCTATTTCTGCTGCCCTGAAAGGGCTTATTTGAAAATTGCTTAATTCAGGTTACTTCTTAATAGAACATTTTCAGGGGACAAATCTGCAAAATGTTTCCCACACAGGGAACATCCCTGCATCAACAAGTTTGCTTGGCATTTAAGTCAGgacaaagttcacagaaatcatagttacCAATGAGGTAGCAATCGTTCAATGGTGGTTAACAGATTGGAGAAAATACATTTGCTTAGGAGGCATTTACAGTCCATTTCCTTTctgaaataaagttattttactAATATGGTTCCACTGTCATTTCTGCAAAAACACTTTACAATGGTAGAAGGGTAAGCATAAAACAAAAGAGGCTGCCTCTGGTTTTGTTGGACCTGTGGGATGCTGCTCCCAGTTTACATGTCTGAAAGGTGTGTTCACATTCGTGTATAAATTAGGGGACACATGGTAAGAAAAAGTCCATCTAGTAGGGGACTACAGAGAAATGGGCTCGGTTTTTAAGGGTTCTGTTAATGTCACAATTTGAAACGCTCCTGACAATAGTTCAGTAATTGGCATGGTAGCAAGCATGCAGATGTGCAAGGTGCTGTGAGGATTGGTAGCCTGAGTATTCAGTTTTAAACTTAACATGTCTTCTAATCTTTATGACAGCAGAGGTGGTCTGTAATTCAATTGTTTTCATTTGTAGCATAATGAAATGTTACAGAAAGATGaccttttcattaaaatatttttagaaatgtg