Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Ptbp3
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name polypyrimidine tract binding protein 3
Also known as 5830471K22Rik|Rod1
Coordinate chr4:59471868-59549376
Strand -
Gene summary Predicted to enable mRNA binding activity. Acts upstream of or within negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in several structures, including central nervous system; liver; metanephros; sensory organ; and thymus primordium. Orthologous to human PTBP3 (polypyrimidine tract binding protein 3). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Ptbp3

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Ptbp3P1 chr8:106092654-106093548 + Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_144904.2
GGGAACGCGCTCGCGGGCCGGGAGGGCGGGGGCGCGGCGCTGGCGAGAGCGTGCCCGGTCCCCGCCCCTGTTTCCCactcttccttccacctctgACCGGCCGGAGCTGCGGAGCGGCTCCGCTCGCTGGTTTCCCGGAGCCGCCGCCCGCTTTCTCCGCCCGCGGTGAGCCCGTCAATCCCCGCACAACGCGCTCCTCCATCTGGGCCATGGATGGTGTTGTTACAGATCTTATAGCAGTCGGTTTAAAGCGGGGATCTGATGAGCTTCTGTCTTCTGGTGTCATTAACGGACCTTCTACCATGAACAGCTCGACTTCTGCAGCTAATGGGAATGACAACAAGAAATTTAAAGGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATTCCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGGTCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTTGAAAGGAAAAAGCCAGGCCTTTTTAGAAATGGCTTCTGAAGAAGCTGCTGTTACTATGATAAATTATTACACTCCTGTTACTCCTCATCTTCGAAGTCAGCCTGTTTATATCCAGTATTCCAATCACCGAGAACTTAAGACTGACAATCTGCCTAATCAGGCTAGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCAGTCCAGTCAGGAAACTTGTCCCTTCCTGGAGCTACTGCAAATGAAGGCACATTGCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTCCGGATAATTATTGAAAACCTATTTTACCCTGTCACTCTGGAAGTTCTCCATCAGatattTTCTAAATTTGGCACGGTGTTGAAGATTATCACCTTTACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCCGACCCAGTGAATGCGCAGTATGCCAAAATGGCTCTGGATGGCCAGAATATCTACAATGCGTGCTGCACTCTCCGTATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGAAATACAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGACGGCCAGCCATCTCTTGAACCTCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATGTCCTCTCCATATGCAGGGGCTGCTGGCTTTGCCCCAGCCATCGCATTTCCTCAAGCAGCAGGTCTGTCTGTCCCAGCTGTTCCCGGAGCCCTTGGTCCTCTCACACTTACCTCCTCTGCTGTCAGTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCAAGTGGTATGCCTGGGAATTCTGTTCTGCTGGTCACCAACCTCAATCCTGACTTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTGTATGGTGATGTACATCGAGTGAAGATTATGTTTAACAAGAAAGAAAACGCCTTGGTGCAGATGGCGGATGCGAGTCAAGCCCAGCTAGCAATGAACCACCTAAGTGGTCAGAGGCTCTATGGAAAAGTACTTCGGGCTACACTGTCCAAACATCAAGCCGTCCAGCTCCCTAGAGAGGGACAGGAAGACCAAGGTCTGACCAAGGACTTCAGCAATAGTCCCCTGCATCGCTTTAAAAAGCCCGGCTCAAAGAATTTCCAAAATATCTTCCCTCCATCAGCCACACTTCATCTTTCCAACATTCCTCCTTCTGTCACAATGGATGACCTGAAGAACCTGTTCACAGAAGCTGGATGCTCAGTGAAGGCTTTTAAGTTCTTCCAGAAAGACCGTAAGATGGCTCTCATTCAGTTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATCCAGGCTCTTATTGAGCTTCACAATCATGACCTTGGAGAGAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCCACCATCTGACCTTCCCGTGAAATTGTCTCCTTATACTGGACCACAGTTTCTGTAAGATCTTCAGGCACAGACTGAAGCAGCTCAAGACCATTTCTGCCTCTTCACAAAATAACTCTTCGGGAATTTGATATTCGAGAACAGTCAAAACAAGAGAGAGTCCTTTTCTTCCTCTCGTTTTCCCCAACAGTGTATGATCAAAAGTTTGCTTTGCCTTTGTATTGTGGTTTCTATGAAAATAACTTTCGGGgggaaaaaatcaggaaaatctttttaaaataatttaattcccTGAATGAGATTTAAAAAGGACAGAGTTTCTTTCTGTTTGGGTCCAGAGCAGCCTTACATGACATTTCTAAACTCCTTTGTACTTTGAGAAATTTAAACATACAGACTTTTACAATTTCTTGATGTAATTTAAATCACCTACAACCAAgtttttttaactttatgatTCAGAAGTTTCCCTGTAGAAAATGACATTCATTCACTTATAAAAATTATACCAGATATTTGCATCTATTGATAGTtattatacataactacatggAGATATATTGGAAACAGGTTTATAAACGTGCATGCTTtctttcagatttcttttttccccccactgtaGCACACTCCTTTAAATAATGTCCATCTTCTCTTTTTAAGACCATTTGGAAAAGCAAAGTGTTGCAGTTGTCCCCAGGGAAACAGAAGTGAAATTCAGCCTGGATCTTTTACAATATCAGCATAATTagtcattttaggaaaaaaaatcatgttttaaatttcaaaatgacACTGTCTAGTAATGTAATGTGATCttggaaaattttaaaagaaaaataatcctacttttttataattgttttcagaaaaaaagttTACAGTCTTAAGGAAAAATATTCAGGTCTATCATATGGTTTgacagattttttaaaagttatttttggtAAGGtcttcttttagaaaaaaaaatctcaagggtTTTTTGTACCACTATAATCTCTAATACTCAGAATTACTGTGTATTTActtaatttcttattatgtgcCTTATTATGTGCTTAAGATACAATAGATTAGAATTTTATCTAAATATCTAGAAAGATAAATTGTGGGCTTGGTGAGCATTCTGTTATTTTTTCCTGTCTTGGATTTTaagggttttggttgtttttgttttgtttttttctttttttctcgtTGCAATTTTAAGTGGTTTTCAATAAGTAATAGTTTCTACTCAGATTTTTGGTGCTTTGGGATAGTGGTGGGATAGAGAAGGGTGAGTGGATTGGGAATAAATAACTCAGTGTGCACCTGTAGGCCTCTCTAGGTTGGCTGCCGCCAGCCGTCAGGGAAGTCTGAGCTGTAGACCTGCAGACTcggatctctgtctgtctgccttcacTGCCCGTTAGATTTTGTCTCAGGATTACTTGATTCCTTCTCAGCACTCAAGTGAGaacctgattttctctgttaATGCGACTTCATTACAGATAGCCCACATATTTGGAGTATGAGAAAGTGggttatttttttatattctgaCCCTCTTACTTTTTTGGTTGAATGTAAAAAGTACATATTAATGTTGCTTCAATGATTGTGTCatgtaaaattactttttaatatgAAACTGCTTTTGTTAATTATTTCTTCAATGCGTGATTggcttttaaaatacagaatttgTCAGAGGAATCAATTTTGTCCACCCCTTCTCACTTTTAATAATCTCAGAGTGGATCAtctcatctttttaaaatatctcagTCTTTACTTTCAGCCATTAATttgaacattcttttaaaaaaaaaaaagaatgaaggaaagaaaaaaattgtataaGCTGAAAGATAATTATAGGTTGAAGTCAAATCAGAATTCCCTCAATACAGAGCAACTATTGGTAGGCTAGGCAGGGAAATGCTAGATTGGGACGTTTCAGATGGGTTACCTTCATGTTGGTTGAATAGTTAGGTATGATGATTTTCCAGTGGGTGTTTTCCCACTTACATCTGAGGTGTATTTTCACCTGAATACTGAATAAGGGAGGGAAAAAATTAGGACTGTCTCCCcaaatttgcttttttttcccctcacacaGACATTATCTTAATTTTCAGTGGCATTTTAAATTggattgcttcctttattttgagTTGGGAACTACTATGTAATTTATTAATTCATGGCACTCATATCATCCAGCATAAGTGTAGCAAAAGTTTTTGAGAATAGAAGGGAAATCATACTGGTGTTGAATGTAATTCTGAAGTAGGGATGGCCTTTAAATATGAGAGAGAACATTGAAATCCTTTTCAGGGATTTGTGTagatatgtgtgcgtgtgtatgtgtgtgtataaataagtgtatatacatacatatactcttttaatgttatatatacatgtgcacattacatacattttaatttattgacAAAATTAACAGTGATTTGGGAACGTAAGATATGCTTGTTTTAAAAGAGCATGTTTGAAGCCATCAGATTGTGTCTAAAATTAGCTGTAGCATATGGATGCTGTCCATATTTGAGCTCTTTACTGTTTATTATAGAGGTCTACAATATTTGTGTTGGCATAGTTTTAAATATCAGGGTGGTGGGAAAATTCGatctgtgtatttttattttagcatGCAGTATTCAGTATCTTTTAAGCAGTGGTTAATTTGTGCTGTTGATGCCTTGCTGAGTTAATCtactttatttttcacttttcaaGGTATCCTGACTTTTACAAAGCATATATATTCAGGACTTAGAAAATAGCAGTACACATTTAATAATAGAGTTATATATCAAGATGTTTTACTTTGGGATTTAGATGTGTTTTGTGACAGATGAGAATATACAAGTCATGCATTCTCTTAATTGACAATTTGTTAGAATTTCAGGATTACCTGGTATCCCCATAGAATGTTATGCGATCTTTGGGACTAAATACTACAAGCAGCTCTTTGTAGCAGTGTTTGCACTGAATGTTTTAGAGTCATGGTTGCTGTCTTTTTagttccttctttgtcttttcctaCTGTGGTGATTAAGGGTCCTGTTGTGGTTTTGGAATTAGCCCTTATGATCCAGGCATAGTAGCACACAGCTGCAATTGAAGCACTGGAGGAAACTGATGGTTGTGACTTTAAACCCAGCCTGGACTGCAGACCATGCTCCATGCTAGTCTTGCTAAGATCCTGTgtccttccctttccccagttAATCTACTATCAACTTTAAAGTCTTCATGTCATCAAGCAGAGCATTTACTTGAGTATATTATCGTGCAGTTCCTCATCTAGTCCCATAATGATCTTTTGTGCCTCAGTGAATCTACTTGTAAACTCCAAGCTTATCTCTTAGAAAACCCAGTGTGTACTGCTATTTTTAGAACCAAAAAGCATGACTATGATTGGAGCATTTTTCTCAGCCTTTCCTTTGTCTTGATCTATTGTCAATTCGAATAAAACTGCCAGACTTAAAATACTCACTATCGTGCTAAAACAAACAGTTTAGATTGTACATAACTTTGCAGTGTAACTCAGCTGTCTCCTTAAGGATTGTGTTAGATATAAGACTGTTTGCAGTCCTTTTTTCAGAGCAAATCCTAACAGGTACTTgtgaattgttttaaaaatagaaaattacagAAATCTTAATTTGGGGTGGGAGCttaaagggagaaaaacaaaacaggaccaaAGTTTATGTGCCTTCTTCAGTAGTCTTAATTGACCTTTTCCTATTTGAGACTAAGGTAGCACTGGTATTTTGGTTTTCAGGAAATATCTACTATATAGATTAAGAGACTATTGTCCCTCAAACTGGTCATACAAGTGACTAGTTATGACTGAGTTAAAAAGTCAGCTACACTTATGCCTTCAGCATTATGTGTTACCAGTTGAAGAGCAGAACTGCTCTCGGTCTTTATGGTAGTCACCGTAGCTTTCGCAGCTTGTCAGGGGCCTTGGTGTTGATAGCAGTCATAACCGAAAGCTGCTCATAGCAAATTTCACTTCACACTGTCAGCAGAGGTTTGTTGGTATGTCCTTTGTAAGAACAGGTATTTTAGGTaggaggtttttggttttgtttttgttttggcgtCTTTAAGACTATCATCCTCTAgtcttttttgtttcttggttgtcttttgttatttgtttttttccttgccACTCATTGTTACCCAGATCTTTAAAAACACATCCCATATCCAGGAAGTACTAATCACCAAGATTGCTGACCACACCAAGTTTTACACTGAAGTTTCACCTCATTGCTCTGACCAAAGACTGCTTGTTCTGGTTTTAACTCAAAGGTGAAGCATTTTCCCTGAGCTCTTTCCTAAAAGATCCCATGCAGAGCGGCCTTGACTTTTCCTTTCCTATTGGTGAATAGACTACTTAGAGAAAATGGGAGTTGACCATGAACAGAgcgagacagaaggatggacggTTGTTTTCAGAACTGTATTTGAGGAAGGAATAGCACAGCTAGACGCCTCGAACATTGTCTAATGTTTTACATGGTCTGTTCATaaaattcccttttctgtttgtaAGGATGTTCATCTAACAGAAGAAAATGCTGTAAATATTTGTAACAACATTTTTTAAACcaggccaaaaagaaaaaaaaaaaaggttttcggGAACAAGTTAACATATAAAGTGGTTTTATATAAAACAGCGATTGTCTTGTATATTTTGATAAGCAGCAGTACCAGATTTCATTTGTAATACAGTTTGTGGTATTGGAAGAAAAGGATTCTGTGATTGTCTAAGTGAATTATGTTATAAATGCAAAgaggagaaaatattaaaaaacgtATTTTCTAACTGTGTAGTGCATGGTTAATTCAAGCTTCTGTACACTACAATATTGATTCCGCTTCCCTTAGGTTTGTATATTTGATAACTGTTCCTTGGAATCTCAGCCTCTTTTCCTAACACATATAGCATTGTAGCATGCCTTTTAATAAATGTCATGGCATCTGTACTCTCTTaa