| Gene Name | CBX5 |
|
| Specie | Homo sapiens | |
| Full Name | chromobox 5 | |
| Also known as | HEL25|HP1|HP1A | |
| Coordinate | chr12:54230942-54280122 | |
| Strand | - | |
| Gene summary | This gene encodes a highly conserved nonhistone protein, which is a member of the heterochromatin protein family. The protein is enriched in the heterochromatin and associated with centromeres. The protein has a single N-terminal chromodomain which can bind to histone proteins via methylated lysine residues, and a C-terminal chromo shadow-domain (CSD) which is responsible for the homodimerization and interaction with a number of chromatin-associated nonhistone proteins. The encoded product is involved in the formation of functional kinetochore through interaction with essential kinetochore proteins. The gene has a pseudogene located on chromosome 3. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
| Retroname | Coord | Strand | Genomic Region | ENSG | |
|---|---|---|---|---|---|
| CBX5P1 | chr3:88095242-88096083 | - |
Intragenic Intragenic |
ENSG00000241535 | UCSC |
| >NM_001127321.1 |
| CAGCCCGCCAAGACCCAGACCTGGGAGGGGAGGCCCCTCCTGTTAGCCCAGAGGGAAAGAAAGAACTGGGGCGATCCGGGACCTGGTGGCCTTAGTCTTTCAGGTGGAACGGTGTGCGACATGGGAAAGAAAACCAAGCGGACAGCTGACAGTTCTTCTTCAGAGGATGAGGAGGAGTATGTTGTGGAGAAGGTGCTAGACAGGCGCGTGGTTAAGGGACAAGTGGAATATCTACTGAAGTGGAAAGGCTTTTCTGAGGAGCACAATACTTGGGAACCTGAGAAAAACTTGGATTGCCCTGAGCTAATTTCTGAATTTATGAAAAAGTATAAGAAGATGAAGGAGGGTGAAAATAATAAACCCAGGGAGAAGTCAGAAAGTAACAAGAGGAAATCCAATTTCTCAAACAGTGCCGATGACATCAAATCTAAAAAAAAGAGAGAGCAGAGCAATGATATCGCTCGGGGCTTTGAGAGAGGACTGGAACCAGAAAAGATCATTGGGGCAACAGATTCCTGTGGTGATTTAATGTTCCTAATGAAATGGAAAGACACAGATGAAGCTGACCTGGTTCTTGCAAAAGAAGCTAATGTGAAATGTCCACAAATTGTGATAGCATTTTATGAAGAGAGACTGACATGGCATGCATATCCTGAGGATGCGGAAAACAAAGAGAAAGAAACAGCAAAGAGCTAAAGGAGGGGATGGTCTCTGTCATTTCTCTTTGTACATAATACATTCACCTCCCTGCCTCCTCTCCTTTCTACCCACCCCTTTCTATCCTAAACACATCCATAAAAAATGTGCTTATCACTGTGCTCCACAGGAGAAATGTTGGTATTGGTTCTCTTGTAACATAACTGATGGTCTGATTAATGATAAGTGTCTCTCTGTGAAGACCAGGCATTTACATACTGAGTGTAATACCCACAATTTTTTTTTCCTTTGCCCTGATCTCTTCCTTCTGCTTCCCTGTGACCTCAAGATGAGTTTCAACTTTTTAATCACCTTAGAGTCTTGATCTTTTCAGGGTTGGTCGCTTTTTAGGTTGGGGGATTTTGTTACAATGATGTTGAATTTTGGTTTCTTGCTTTGGTTCTTAGAACATGTTGCTGACTAGCTGGCCTTTGTTCTGACATGTTGAGATGGAAAGGATGTTGCCCATCTGTTAAAAAGCCAATAGCAACTGCCTACCTGTTGGGGCTTTCCCAACCTTGTTCAGCTCTACCCAGGAGAATACAGGGTTTCTGGTGTGGTCTTCTGGGCCACCCTCTGTTGTTCATCCTCACTCATCCTCCCAGAATTACTCCATCCTTTGGAAGATTTGAAATTTTACACTGAAATCTGTCAAGACACTCTTTTTAGCCCCAGGACTTTCGGTATTGCTTTTAGCACTCCCCACTTCTGCTTCTGTAAAGTGATATCAATTTGTGATAAAATGACAAGATTATTAACTGTGCAGATTTGTAGCTATAGTACATGAGGATGATGGGGTAGGGTACAATTGTCTTTATTATCATATATGGTATGTATGTATGATTTCTTTCCATTCCTCATATTTAGACTGTATATTTATGTAGGTGTGAGTGATTGCCTGGTGCTTGCTTGTGCCAAGGTGCTAGGCACCCTCCAACCCTGCCAACTTTTGTGGCCTCCCAAAGCATTCCTGTTACCAAAGAGGCTTCAAACCTGACCCTCACTTCTCAGTGGACCCGAGTTTCCCTTCCATGCCATTATTTTCAGTGGGGAAGTTTTAGAGGTGAGCTGTTGGCCACAATATCAATTTTAAGTGTTCATAGCAGTTATGTCTCCTGCATTCTTGGCTCCTGGATTTACCACCAAGAGTCCCCAAAATATTAATGCTCTTCCCTTTTTCTACCCTCAAACTTATAGTTGTATCTTATTTTTTAAAATGAATTTTCATggccaggcacagtggctaccgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcaggagaattgcttgaagccagaagtttgagaccagcctgggcaatgtagtgagaccccctgtctctaaaaaatataaaTAAAAATAAAGGCATGTTCCTGAAAGACTGTCACCTTGGAAAGTGACAGGCCCTGGCATTAGCATGTTGACACACCCTTTTCTTCTTACTCAGCAAAATACTTCGTTTTGGTTTCTTCTTGTGTTGCTATTGAGAAATTTGTCTGATCATATCCTTCTGCCTTTGTCCCCCAAGAAATGCCCTACTTTATCCTTTTCTTTTTGTAGTTGAGGAGGGCTAGAGAATCACAATTAAAAGTAAGGAAATAGCAGGGTTTTGAGGATCCTTGTCCCAGCCCCAAAGCTGAGGAAATAAGAATAAATGCTTAATATAGCCTTAATTCTAGAGCGCACCAGCCATGAGGCTGCTTTTCTTGTTGTTTTTGATTTTTAAAACATACAGCTGTCTGGCCAGGAGCATCTACCATTTCTAGATTATTCAGAGTAATGAGGGGAATGGATGGATTGCTCCAGTCCACAGATGAGCCACATAATATGCAAATCATATACCCATTCATAGCATTTGTTAACATTGCTTCCCTGCTCAGCTGCTGATTGAATTCTGTGTGCTTATATAAATTATGTCAAAAATTATACTGCATAATTGAGGTGACAGCTGTTGCTGCAGTGACATGACAGACTGGAACAATGAAGCTTTTGGTTTAAGTCAGCCAGGAAAATCCTTCTGAATGGTAATGTGATTGGGCAAGAGCTCATAAACCATACCTCAAGTGGGTGGGAGTTTTATCTCTATATTCCTTCTCTCTCTGAAGGAATTAAAGGCCTAGATCAAGTGCTGGATAATTGACAATTGCTTGTACTTAATCTGATCGGTATCTAAAAGAAGGAAAGGATGGTCAGGAAACATTTATCATAAATGTAGCCAAGGATATCAATTAGGGTAGACAAGAATAGGACAAAAATAGGCCAGAGCTCCTGAGGAGGTGATATGGGTCTCTTGATTTGCAGAAAATGACAGCCTATCCAAGTGGCCCAGTGTATGCCTCCCAGTAGCAGTGGGCATGTAAACTGCAGCGACCTTATTTTTAAAACCAAAAACCTAGTATGTGGACAAAGAACATGACAATATTTGGTACTGAGATTGGTTCTGAGAAACCTGGGGCATGTGGCTGCTGTGGTTATAGGTAATATTTAAGACATTCATAAAAATCTGATATTCTTTTACCGAAATAACCCCAGTATCATCTACTACTTACCATCTGTTAATAGACTTTACTCTGTCTTTTTTGTCTTCGGTTTATTGTACTGAGTGCCGCCAAAACAACTTTTGTTCTCTTCCTGCCTACCTGCAGCTGGTTCTATAGGAATGTAGGGAGCCAGAGGCCAGTATTGATTTCAGCCCTTAGCACAAAGGAAATCAGATGCCTGCTTCCAGCATTTGTTAGTGTTGAGTAGATGTTCTTGCCCTAGAAGAATTACAGCCTCAAACAGAAACCTGTTTCATGGAGCTTTCTCCCCTCAGAAGAGTTAATAGTTAAGAGCTAAGCACTCTTAAACACCTAAGTCTCAAATGCTAAAAATTTATTTTTCTTGTGTTTAGTCCTCTTTCAAGACATCTTTCTAAGCCTTTCAGTAATCAACATTAAAAGATCTCCCTTTCTTCAGAGTTATAGCACAGCTTTGCCCAGTAGAGGCTACCAAGGACAGCTTAGCAGCCCTTTGATTGCTGGGCTGGGCAGATGGCCTTCAAGTTAAGATCAAATGCCGGGAAAATCAGCCTACATGGGAGCACCCATTTTAAACCTGGAGAGAACCATGATGTTTTCTTCTTCAAATAACAATCTAGTTTTTTTTCCCCCAGTACTAAAATTGTATTGTCTTTCAGACAATATAATTTTTATTTAAAATTGGAACATACTATCTTCATGCTTTCTAAGCTAAATCTTCATTTAGATTTCACTCCTCAGTAGATCCCAGAGAAGAAGCTATATAGGATCCAGATTCAAATTTAACAGTGTCTTCTACTTTTTTAGTTATGTTTTCTATCAACTCCTGCTGCCTTTTCAAATACGGATATTTTTCAGGAGACTCTTCTACTTGTCCACTGACTGTATTTTTTCCTTTTTGATCCGTAGCCCTGGTTAAATGGCTGACATCCTTCCGTGGATGATTCTTGGAGGTAGTCTCAGAATTCCAAAGTGATTGTCTGTCTTCTTCTTGTCTTGATCCTAATGCAGACATTCACCTCTATTAtttatttattttttttagacagagtctcgctctgtcaccaggctggagtgcagtggcacaatcttggcttactgtaccctccacctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctctcgagtagctgggactacaggtgtgtgccaccatgcccagctaatttttgtatttttggtagagatggggttttaccatgtttgccaggatggtctcgatttcctgaccttgtgatctgcccaccttggcctcccaaagtgctggaattacaggcatgagccaccgtgcctggccACCTCTATTAAATTTTTGTGGACAAAAATAAAATTGTCATTATTTGTTTGCTCTCATGGAGCACTTTCAGTAATACAATTTTTTTTAAATTCCAGTTGCCCTCTTTGTTGCTCTGTCCTCTGTAATACCTGACTTTGCTAAAGACTTGAGGGGTGGTTTCAGAGGAGGGTCAGGTGATGGGAAGGCAGGATGAGAAAAGCCCTGGACTTGCATGTTTGAGAAGGCTTCCAACCACATCTTCACTCAGACTCTTGGAATTCCTGTCCCCAAAACAAGCTTCTGTTTTTTGCTCACAATGCTATATTTCTAAATTTTTCCTGAATTACTGAGAAGCAGTCATTAGCTTTGTTAAGTTTGGTTTGGGGACATTGTTGGTATCAAAAATCGAAGTCTTATTCATTTGATGTAGGCCATGAATCATCAATAACTGGTTGCTGGAAAGCTTGACTACCATCCACT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