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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name GXYLT1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name glucoside xylosyltransferase 1
Also known as GLT8D3
Coordinate chr12:42081845-42144874
Strand -
Gene summary GXYLT1 is a xylosyltransferase (EC 2.4.2.-) that adds the first xylose to O-glucose-modified residues in the epidermal growth factor (EGF; MIM 131530) repeats of proteins such as NOTCH1 (MIM 190198) (Sethi et al., 2010 [PubMed 19940119]).[supplied by OMIM, Mar 2010]

Retrocopy(s) from GXYLT1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
GXYLT1P1 chr13:18723405-18725683 - Intergenic
 ENSG00000230931 UCSC
GXYLT1P7 chr2:94733540-94735900 - Intergenic
 ENSG00000227265 UCSC
GXYLT1P2 chr21:13823346-13825679 - Intergenic
 ENSG00000224860 UCSC
GXYLT1P3 chr9:40348540-40350897 + Intergenic
 ENSG00000232433 UCSC
GXYLT1P8 chr9:42974795-42977147 + Intergenic
 ENSG00000276128 UCSC
GXYLT1P6 chr9:64488541-64490896 + Intergenic
 ENSG00000235310 UCSC
GXYLT1P4 chr9:66025421-66027777 - Intergenic
 ENSG00000275026 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001099650.2
AGAGGCGGTGTCCAGGCTTCCGGGCGGGTAGTCCTTCGGCTCCGGAGCCGCGACTGCGCTCGCCTAGGTGGTGGGCGGGGAGGGAAGGAAGGGAGCGGGCGCAAggcggcggcggcggctgcggGTGAGGAACTTGTTGCGCCCGCGGCTGCGCGGTGCCCCTCCCTCCGCTCCAGTTcgtcggggcgggcgcggcggcggcggcgaaggaggagcgcggccggggcgatgcggcgCTACCTGCGCGTCGTGGTGCTGTGTGTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTCCTTTACGCTTTCAGCCAGCTCGCCGTGTCCCTGGAAGAAGGAACGGGCGGCGGTGGCGGGAAGCCGCAGGCCGCGGTGGCTTCCTGGCTCGCGGGCGGCGGACGCGGCGCCGTGAGAGGCGCCGGCGTCGCGGGCCCCGCAGCGCATCCCGGCGTGTCGGACAGGTACAGTCTGAAAATACAGCCTGTTGAGAAAATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGTGGTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCATATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTAATTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCTTCGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTGACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTTTTTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAGAACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAACTCTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACTACAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTATTGAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCATTGTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTACCATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACATCCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAAATATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAGTGATTCTTGGTGACTGCTTAATCAAATGGATGAAAACAAAGAATCAGAAGATAAGTGTGAAGGAATCGTCTTGGATGAAGTATTCAGGAAGGAATTACTCATCTCCAGAATAATTTTTTTTTTCCTAAAGAAGTTAAGTAAGCAGTATTTTCAGGTAATGAAGAATAAGTTAAAATCTTGGGCCTCAACATTGAACATTTTTTATCTCTGATGTTTTGTAATGTTACTTGCTATCATTCCAGTATTGATGAAAATACTATTGAATGGGTTTAACCTGCAGACTTCTGTTGACTCATACTCTCAAGAGTGGTAGGGGTGTGTAGATGGAGAAAATGTACCTCAAACAGTGCCAACACTCAAGACTGTGAGTAGAGCAATAATTTTATGTCAGCACTAACCTCACTTTAAAAGTGTGAGAAAAAAGTTTGTTTACAGGAGCAGAAACAGGTCTGTTGTTTCTGAAGAAATGTGATGTAACTGATGTAACCATTGACAATCTATGTGTGCCTTTATACATTTCATCTCTGTTTTAAAATATTTTTATGACAATCATGTTTAAAATTATTTTTAGATTACAAGTAAGCTGCATGTTAAAAATTGAGCTGTGTAAGGTAGAGGAAAAATAGTGAAAACTTTGGGATTTTAATCtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtgAGAGAGAGTGAGAAATGTAGTGTTTCATTTTGTATGCATTAAACTGTCTTGCCAAAACTCAGATCTAAGATTGTTAAATAGATATTTGGGGAATTTTTTTTTAATCACTTTAAATGAAAAACGTCAGCTTTACTGGGCATTCTGGAAGCAAAATATATTATGCTGATGGTAAAGTGAGAACCTTAAGAGTATACTCATGATGGTGGAAAGTGTGATGGACCAAAATGCATAAGCTATATACTTCCTGTGAGTAGTAATTTTAGTTACAATGGAGTAGAAAAATATGGTCCATTTAAACTTGTCTTCTACCTCATAACGGCCTTGCAAGATACTTTTGAAGAAGCAAATGTCTAGAGCCTTACTTTAAGTAAGTTAAACAACTTAAGTGGATGATTTGGAATAAGATTGTTACATCCAGCTGTAGAAAATGTGGTTTTAATTGGGTTGATGTGCATTTTTGAATATCACCTAAGACAGTTAATTTTTTTAAATCTTGAGAAATTACTTCTTTGGCATTCTTGACCTGTTAGCTAATATAACTATAGATTCTGAATACTTAGCATATACTATGCTGGGGCACATATCTTATTTTACCAACAATATGATTATCTATATGGTTATCTTCTTTTTCTCCCTGATATTTTAATGCTCAAGTAGAAAATGGAAAATCATGAAGGAAAAATACAACCTGTGAAAATTGTGGCAGTTAGCTTTGTGAAGACACAGTGACCTCTGTGGAGACATGGAATATGCAGAAAGAGATGGTTAGTACAGTTGTTCTGTCGTCTGCAGTTCAGTCAGGGACAAATTGAGAGAGGAAAGTTTAAGCAGGGTGCATTAGAAGTTGATAACCAGTCCAGCATTCTTAGAACAGATGGGTTTAGAGAACACGAGTTGTAGTTCCTTGGCAGAATGCCATGGTGAATATAAGAAACTGTGAAATTGAGCTTACTGAGTAGAAAATGAGAATACTAAAAATGTGAAGTTTGGAGGGTATGTATTAGATCATTTCTAATGGTCCTCAAATAATGATCATTGCCTGCCTGACTATGTAAGATTCTTGTTGGGAGCTTAAGAATAGATTCCTGAGCTAGGCCTTTGGAGACTCTGGCATGCTGTGTCTAGGAGGGAGTCTGTAAAACAATTTTTAATGAAGAAATTTAAAAATTACACAAAACTAGAATAGTGCATTGgtactcaacatccagatctgacacttatcactatcttaccatgtttgcttcatttgtcatttttttgtttgcttaagtatcttaaaatcccatacattgtgttatttcactgctgtgaacactttgggtagataccacgatatcacacctaacagaggcagcagcagtccttcggcttcatctcatagccagtccttaagcaaatttccctgattatctcaaaaatcatcttctagttggtttgttagaatcaACAGAATATAAGTCACATGATGATTTCGTttttaacaatcacctcagatgactttgatgttagctactttgagaaccactgGAAATTATTTTGCCAACTTGAAAGTTCAAGTTAGGATACCACAATTCTTGGCACGTTTGGTGGATTATAAATGTGATTTTGAAATATTAGAGGAAGCATTTGGGGTTAATGACAGGATATGAATTTATATTAGTAAGTTTGATAAGATAAAATTTCCTCAGTGAACGGAGAATCTCAGCCCCATGGGCTCTAATTGATTGGGACTTGTGTAGAGCGTGGTCACAGTTTAATCCAACTGGACTGTATGCTGTGGTCTCACTCATGTTGTGGCTTATTTACACTGTCACACACACTACATTGTGGATCAGTTGGAAGGTTCTTCATCTGGTTTATTTAGACCTGACCTAATTGATCATTTTACCATAAATTGAATTATAGTGAAAACTGTCTTTTGGGTACTGTTTCTACCTAAAATTAAAGGTATCACAAAATATGTATAATAATTTTTAAATGAATTTTCTGAATTTATCTTTAGACAAGGTAATTCTTTTGAATTCTAAAGAAATGCAGTTCTTGGAGTTGATGAGAGGTTAAATTATAGATGGACAACTTAGAGAACGTATTCCATCTTCATATAAATGGTCTTTCATAAAACATAGTGTATCTATGCAGTTTATATAAACTACATGATTTATTATTTGAGTCTATGTATTCTGACCTCAGAACTATCTCTGGGCTACAGTATTACCAAAGTGGGATGCCTTTAAAATGCAGTCAAACTTCATTTGTATGAAGTAGAAAAGAACTTGGGAAACCTTTAAAAATATATATTGTGATTTATGCTTTAAGAAAATGCATACTTTTTTCTAATGAAGAGTAGTTCATAATATATAAGGGTTTTAAGGCCCTGAAATAACATTAGTGCTTACTCATTGCTCTCTCATCTTGCCTCCAGTCAGATGTTATTGGTATAGTGAAaagaagaccagattttgaactagatctggattctctttttagtaactcaggcatgttatttacccttctctgtgccttaggtttttaagtacaatcagtgtacccttcaaacctcacaagatgaaactcagaagagataatggatttggaagcattttgCGTGGCTTATATTATGCCACGCCAGtgttactgttgaagttctgttttgttcgttgttttctgtACAGAGCGTTCAGTTTACTCAGGCTGAATGTTTTCTGACATATATCTCCAGTATGAATTTGTTTATGTAAGGAAGAGTTTTTCAGGAAGAGAAAGTAGAGAAGAAAAGAATGATGTAACTAAATCAAAAAAGAAGGAAAAGAGAGGAAGTGAGAAAAGGGGTGAGGAAAGAGAAAGGAGTAAGAATGGGGATGGCAAAGGGCAGAGT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>NM_173601.2
AGAGGCGGTGTCCAGGCTTCCGGGCGGGTAGTCCTTCGGCTCCGGAGCCGCGACTGCGCTCGCCTAGGTGGTGGGCGGGGAGGGAAGGAAGGGAGCGGGCGCAAggcggcggcggcggctgcggGTGAGGAACTTGTTGCGCCCGCGGCTGCGCGGTGCCCCTCCCTCCGCTCCAGTTcgtcggggcgggcgcggcggcggcggcgaaggaggagcgcggccggggcgatgcggcgCTACCTGCGCGTCGTGGTGCTGTGTGTGGCCTGCGGCTTCTGCTCGCTCCTTTACGCTTTCAGCCAGCTCGCCGTGTCCCTGGAAGAAGGAACGGGCGGCGGTGGCGGGAAGCCGCAGGCCGCGGTGGCTTCCTGGCTCGCGGGCGGCGGACGCGGCGCCGTGAGAGGCGCCGGCGTCGCGGGCCCCGCAGCGCATCCCGGCGTGTCGGACAGGTGTAAAGATTTCTCTCTGTGTTACTGGAATCCCTATTGGATGCTGCCCTCTGATGTTTGTGGAATGAACTGCTTTTGGGAAGCGGCTTTTAGGTACAGTCTGAAAATACAGCCTGTTGAGAAAATGCATCTAGCTGTAGTTGCCTGTGGTGAAAGACTGGAAGAAACTATGACCATGTTGAAGTCAGCTATCATTTTCAGCATCAAACCTCTTCAATTCCATATTTTTGCTGAAGATCAGCTACATCATAGCTTTAAAGGCAGACTTGACAACTGGTCATTTCTACAAACATTTAATTATACGTTATACCCCATAACCTTTCCAAGTGAGAATGCAGCAGAGTGGAAAAAACTCTTTAAACCATGTGCTTCGCAGAGATTGTTCTTGCCGTTAATCCTGAAAGAAGTTGACTCACTATTGTATGTCGACACTGATATCCTTTTTTTACGACCAGTTGATGATATTTGGTCTTTACTAAAGAAATTTAATTCCACACAAATTGCTGCAATGGCACCAGAACATGAGGAACCTCGAATAGGATGGTATAATCGCTTTGCTAGGCATCCATATTATGGAAAAACTGGAGTAAACTCTGGAGTTATGTTGATGAACATGACTCGAATGAGAAGGAAGTATTTCAAGAATGATATGACAACTGTACGACTACAATGGGGAGATATACTTATGCCATTGCTTAAAAAATACAAACTAAACATCACATGGGGTGATCAAGATCTATTGAATATCGTGTTTTTTCATAATCCAGAAAGCCTTTTTGTTTTTCCGTGTCAATGGAATTATCGACCAGATCATTGTATATATGGAAGCAATTGCCAAGAAGCAGAAGAAGGAGGAATCTTTATTCTTCATGGGAACAGAGGTGTTTACCATGACGATAAGCAACCAGCATTTAGAGCTGTTTATGAAGCACTGAGAAATTGTTCTTTTGAAGATGACAACATCCGTTCCTTATTAAAACCTTTAGAACTGGAACTACAAAAAACAGTGCATACATACTGTGGAAAAATTTACAAAATATTTATCAAACAACTAGCAAAAAGTGTAAGAGATCGTTATGCCAGATCACCAAAGGAAAAGTGATTCTTGGTGACTGCTTAATCAAATGGATGAAAACAAAGAATCAGAAGATAAGTGTGAAGGAATCGTCTTGGATGAAGTATTCAGGAAGGAATTACTCATCTCCAGAATAATTTTTTTTTTCCTAAAGAAGTTAAGTAAGCAGTATTTTCAGGTAATGAAGAATAAGTTAAAATCTTGGGCCTCAACATTGAACATTTTTTATCTCTGATGTTTTGTAATGTTACTTGCTATCATTCCAGTATTGATGAAAATACTATTGAATGGGTTTAACCTGCAGACTTCTGTTGACTCATACTCTCAAGAGTGGTAGGGGTGTGTAGATGGAGAAAATGTACCTCAAACAGTGCCAACACTCAAGACTGTGAGTAGAGCAATAATTTTATGTCAGCACTAACCTCACTTTAAAAGTGTGAGAAAAAAGTTTGTTTACAGGAGCAGAAACAGGTCTGTTGTTTCTGAAGAAATGTGATGTAACTGATGTAACCATTGACAATCTATGTGTGCCTTTATACATTTCATCTCTGTTTTAAAATATTTTTATGACAATCATGTTTAAAATTATTTTTAGATTACAAGTAAGCTGCATGTTAAAAATTGAGCTGTGTAAGGTAGAGGAAAAATAGTGAAAACTTTGGGATTTTAATCtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtgAGAGAGAGTGAGAAATGTAGTGTTTCATTTTGTATGCATTAAACTGTCTTGCCAAAACTCAGATCTAAGATTGTTAAATAGATATTTGGGGAATTTTTTTTTAATCACTTTAAATGAAAAACGTCAGCTTTACTGGGCATTCTGGAAGCAAAATATATTATGCTGATGGTAAAGTGAGAACCTTAAGAGTATACTCATGATGGTGGAAAGTGTGATGGACCAAAATGCATAAGCTATATACTTCCTGTGAGTAGTAATTTTAGTTACAATGGAGTAGAAAAATATGGTCCATTTAAACTTGTCTTCTACCTCATAACGGCCTTGCAAGATACTTTTGAAGAAGCAAATGTCTAGAGCCTTACTTTAAGTAAGTTAAACAACTTAAGTGGATGATTTGGAATAAGATTGTTACATCCAGCTGTAGAAAATGTGGTTTTAATTGGGTTGATGTGCATTTTTGAATATCACCTAAGACAGTTAATTTTTTTAAATCTTGAGAAATTACTTCTTTGGCATTCTTGACCTGTTAGCTAATATAACTATAGATTCTGAATACTTAGCATATACTATGCTGGGGCACATATCTTATTTTACCAACAATATGATTATCTATATGGTTATCTTCTTTTTCTCCCTGATATTTTAATGCTCAAGTAGAAAATGGAAAATCATGAAGGAAAAATACAACCTGTGAAAATTGTGGCAGTTAGCTTTGTGAAGACACAGTGACCTCTGTGGAGACATGGAATATGCAGAAAGAGATGGTTAGTACAGTTGTTCTGTCGTCTGCAGTTCAGTCAGGGACAAATTGAGAGAGGAAAGTTTAAGCAGGGTGCATTAGAAGTTGATAACCAGTCCAGCATTCTTAGAACAGATGGGTTTAGAGAACACGAGTTGTAGTTCCTTGGCAGAATGCCATGGTGAATATAAGAAACTGTGAAATTGAGCTTACTGAGTAGAAAATGAGAATACTAAAAATGTGAAGTTTGGAGGGTATGTATTAGATCATTTCTAATGGTCCTCAAATAATGATCATTGCCTGCCTGACTATGTAAGATTCTTGTTGGGAGCTTAAGAATAGATTCCTGAGCTAGGCCTTTGGAGACTCTGGCATGCTGTGTCTAGGAGGGAGTCTGTAAAACAATTTTTAATGAAGAAATTTAAAAATTACACAAAACTAGAATAGTGCATTGgtactcaacatccagatctgacacttatcactatcttaccatgtttgcttcatttgtcatttttttgtttgcttaagtatcttaaaatcccatacattgtgttatttcactgctgtgaacactttgggtagataccacgatatcacacctaacagaggcagcagcagtccttcggcttcatctcatagccagtccttaagcaaatttccctgattatctcaaaaatcatcttctagttggtttgttagaatcaACAGAATATAAGTCACATGATGATTTCGTttttaacaatcacctcagatgactttgatgttagctactttgagaaccactgGAAATTATTTTGCCAACTTGAAAGTTCAAGTTAGGATACCACAATTCTTGGCACGTTTGGTGGATTATAAATGTGATTTTGAAATATTAGAGGAAGCATTTGGGGTTAATGACAGGATATGAATTTATATTAGTAAGTTTGATAAGATAAAATTTCCTCAGTGAACGGAGAATCTCAGCCCCATGGGCTCTAATTGATTGGGACTTGTGTAGAGCGTGGTCACAGTTTAATCCAACTGGACTGTATGCTGTGGTCTCACTCATGTTGTGGCTTATTTACACTGTCACACACACTACATTGTGGATCAGTTGGAAGGTTCTTCATCTGGTTTATTTAGACCTGACCTAATTGATCATTTTACCATAAATTGAATTATAGTGAAAACTGTCTTTTGGGTACTGTTTCTACCTAAAATTAAAGGTATCACAAAATATGTATAATAATTTTTAAATGAATTTTCTGAATTTATCTTTAGACAAGGTAATTCTTTTGAATTCTAAAGAAATGCAGTTCTTGGAGTTGATGAGAGGTTAAATTATAGATGGACAACTTAGAGAACGTATTCCATCTTCATATAAATGGTCTTTCATAAAACATAGTGTATCTATGCAGTTTATATAAACTACATGATTTATTATTTGAGTCTATGTATTCTGACCTCAGAACTATCTCTGGGCTACAGTATTACCAAAGTGGGATGCCTTTAAAATGCAGTCAAACTTCATTTGTATGAAGTAGAAAAGAACTTGGGAAACCTTTAAAAATATATATTGTGATTTATGCTTTAAGAAAATGCATACTTTTTTCTAATGAAGAGTAGTTCATAATATATAAGGGTTTTAAGGCCCTGAAATAACATTAGTGCTTACTCATTGCTCTCTCATCTTGCCTCCAGTCAGATGTTATTGGTATAGTGAAaagaagaccagattttgaactagatctggattctctttttagtaactcaggcatgttatttacccttctctgtgccttaggtttttaagtacaatcagtgtacccttcaaacctcacaagatgaaactcagaagagataatggatttggaagcattttgCGTGGCTTATATTATGCCACGCCAGtgttactgttgaagttctgttttgttcgttgttttctgtACAGAGCGTTCAGTTTACTCAGGCTGAATGTTTTCTGACATATATCTCCAGTATGAATTTGTTTATGTAAGGAAGAGTTTTTCAGGAAGAGAAAGTAGAGAAGAAAAGAATGAT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