Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Trmt10a
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name tRNA methyltransferase 10A
Also known as Rg9mtd2
Coordinate chr2:243422811-243437533
Strand +
Gene summary Predicted to enable tRNA (guanine(9)-N(1))-methyltransferase activity and tRNA binding activity. Predicted to be involved in tRNA N1-guanine methylation. Predicted to act upstream of or within magnesium ion homeostasis. Predicted to be located in actin cytoskeleton and nucleolus. Predicted to be active in cytosol and nucleoplasm. Orthologous to human TRMT10A (tRNA methyltransferase 10A). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Trmt10a

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Trmt10aP1 chr15:57302294-57303958 + Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_006233368.3
TGACATCTTCCCGCATCGTGATTGGTCAGCTGCGGTTCGTTAgcgggcgcagggcccgttcggggcgtgcgcgcccggcctgcgtctgcgcgtgctcgtgACCCGCTGTCGTGCTGGCTGCTCGGGGTTTCTGTTGTTCGTGGGAATCCTGCCGGAAGTGTGGCAGAAAGGGCAATGTGGAGGCTGAGGGTGGCTTGTCGCAATGCTGCGTTATGCTTAGAGGACAGGCGAGGCGTTTTCCCTGCCTTTCCTCTTTCCTCTCCCCTGGCGGTCGGATGTAGGGAGCCGAGGGGCGGTTGCTGCAGATGCGGCCCAGCCTCGTGGTGAGCTGAGGATGAGTTTAAGATGGAGGTGTTACCGGTTGTCACTGAAATACTTTGTGTTTAAAATGTGGCTATGTGTCCAGAGGTGTAACATTATTCACATTGAAAGAAAGGCTGTCCTGTGATTCCTTCCCAAGCCAGAATTCCGGCCAAAGGGACTTAACAACTGAACAAAGGGCTATTGCTACTGCGATACTGACCAACACGCTAAATAATAAAATGATACAGAAATACACTGGTGCCGGCATGTGTTGATTCTAGTAACTACGGAAAAGAAAGCTTTAAAACTACGAGGGCTGTTTTAGCCAGTTTGATAGCAGCCCtggtttgtttggtttgttttgttttgtttttttttgtctttgGCATTAGGTGACGTATGCTCGCCCCACACCAGATAGTCTTTGTCGGCATTATTCAATTTTGAGTTGTGTAATTCCATCTGATAACCTATATCCAAGAATTAACCATCCACGGTTTAAGATGTGCTAAAGTAAAAGTCTCACACTTACGTTCTATCTTTCTGTAAAATGTTCTTTAATACTTGTTAAACTTGGATTAGTGAATGAAAATGTGCTGCGAGCATCCCTGCTGGTCAGGGAGGAGCCCCAGACTCGCTACCATAGAGATTTATGTCGTGACCCAAACTAAAACCAAGTGCGTTCACAAGTGCCATGTTTTACATAGTTGTATCAAATTCGTACACTGTATTTATTATGTAGTAGACAGTCGGAGCGGAAGCAATCTTGGTAAAGTCTAGCCAAAATAAGACACCCAGCTACTATTTTATCTGCATTCATATATTTTATAAAACGAAACATATTTCATGTGTTGTTCAGTAGTATAGCTTATTTAATTAAAGCTTAGGAAACTCACCCAGCACAGTGCTTCGAGAATTGATAAAATACATTAATGTTTAGACTGGCTTATGATAGGCTGCTCAGAAATGTTTCTGTTCTCTGATAGGTCAGGTTAAATTTAACTTGAGACATTTTAGATGTGAAAGGCAAAGGCTCCCCCTGGTGTAAGAGAGCTATAAAGCATGGCTTTTGTAATTCTCACAGTATAGCTAGCTCAGCACTTCAGAATTTTAAACATAGAGAACTATTGAAAACTATTGCCACAGATAAACAGAAATGTGCTCTCTTGAATATTTGTCTCAGAAAATGCTTTCCTGTTAATTTCAGTTTTGCTTTTAAGTTTGCATGTTTGATGGGAATTGTTTTATCCACCGTCCGTGGCTTTGGATATATACATTTTAAAGTTTTATTTAATGCCTTTAGAGTCATCTGTCAGCAGTGTACAGTCTGCACTATCCCTTCAGAATCCCCCACTCTCAAGGTGTTAGGTTACTGGGAAGTGTTGCTCTTGGAGCTGGGTTTGAGTCATATTGCCATAATTTCATTCATCTCTTTATTCTACCAACTATTTTGAGTATATTCTCCCTGTAGATTTGTTTGAGATACCTTGTTTCTTAGGAATTACTGGAGACGGGAGGAGTTAGTAGCTTTGCTATAATTATCCTCATTTAAAAAAAAAACCCTTTGAAATACCATATCTACTCACTTATCCGGTCAGTTTGAAGTAAGAGTCAACTTCGTCTCAAGTAACGTGACACTGCACTTTCAGAGAAAGTGAGATGCACATAGTAAAACTACTGCTTAAGTTCTGTAAATGTGTTGTCCTTATTATTACGTCCTGAAGAGTAATTGTTTCATTGTTTGTTTTTGTGTGGCTTAGATTAACTAGCTACCTCTGTAAGAAGAATCTCAGAACATTTCTTAAGGCCCTACGATGCTTAGTACATCATGCTTAGTCTGAGGCAGGGACAAAAAGGCAAACGCTTGTAAGCTTTGTTATTAGTAACATATTAAAGAGAAAAGACATTTCAGTGTAGTTAGCCTTCCCCCAGTCAGCAAGTTGAATTCTAGTTGTTATGGATAAAAATGTGTGTGGTTGGATTTAAATGGAGATTTATTTCAGTCAACGCCTTAGCGTTGCAGACTGATTACAGAATCATATTTTGTTTTTAGCCATAACTAAAGTGTTTACAGATATACTGTGACATTTGTTAGAGAAAGAAAACTTGTCTATTTCATTAAAGCGCGTACACATCTTCAACGTCTGTTCATGGAGACAACAAATATGTCATCTGAAGTGTTGCCAGCATCCATTGAGCCTCCTAATGTAGAAGGAAAGCCGGGCGCTAGTGACAGTGAGGAGGAGAGACAGAAGCAGAGAGTGGATGCAGAGGCCCAGCCAATATCTAAACGGCAACTGAAGAAGCTGATGAAACAGAGACTATGGGAAGAGCAGCGGGAACAGCGCAAGGAAAAACGAAAAGAAAAACGCAAGAGAAAGAAATTAGAACGACGGTGTCAGCTGGAGTCCAACTCAGATGGAAACGACAGGAAACGGATCCGAAGACACGTTGCTCCTAGCAACCTCCGCCTTATCATAGACTGCAGCTTTGATGACTTGATGGTGTTAAAGGATATTAAGAAACTTCACAAACAGATTCAACGATGTTATGCAGAGAACCGCCGCGCATCACATCCCGTTCAGTTTTACTTGACAAGCCATGGAGGCCAACTGAAGAAGAACATGGATGAGAATGACCAAGGATGGGTCAACTGGAAGGATATTCACATCAAGTCCGAGCACTATAGTGAACTCATAAAAAAAGAAGACCTGGTTTATCTGACGTCGGACTCACCTAATGTATTAAAGGACTTAGATGAGTCAAAGGCCTATGTGATTGGAGGGTTAGTGGACCACAACCACCACAAGGGACTCACGTTTAAGCAAGCATCCAGTTATGGAATCAAGCATGCACAGCTCCCTCTTGCAGAGTTCGTGAAGATGAACAGTCGAAAAGTCCTGGCGGTTAACCACGTGTTTGAGATTATCCTGGAGTTCCTGGAGACAGGAGACTGGCAAGAGGCGTTTTTTACAATCTTACCCCCACGGAAAGGAGCTGTCCCCGCACACAAGGCCTGCGAAAGCTCTCCTCAGGACCACCAGGCCCTGCCAGGAGGATGGGACAGTGCCATCGAGGGAGAGCATGGCAGAGATGATCCTGGCTCTCCGCACAAAGAGCAGCAGGGCCAGCAAAGCAGCTCGGTTTCTGCAGTGAGCCCTGACCCACAGTAACCTTCCCCTGTTCTCTTGCTTCAGAGAAACCAGACAGTGTGGTCGGTGCTTCCCAGAATGCTCAGACTGCGAGAAAACTTTCTCTCGTCTCTGTTGTGGAATTTTAAATCTTTTTAAAGAGTTAAATGATAACGAAAAACCCTTTAAGCACTAAGAAAGGATTGCTTGGTTTTGTGTAAGAAGAAGACTCAAAGGTGTGATTTCAGACGAGCTTAAGCCTCACTCACATCGGTCGTGGAGGCTGTTGCGTGGTGTGGGGTCTGCCTCCACCCGTCCTTCACCGGGGCACGTCCTGCAGGGCCAGCCTGCTGACCCAGTGGTTCTTCCATGCTCATCCTCCCTGTGTCTCTTTGGTCTGGTGGCTGTTTGTTGGAACAGATATTCATAACTGTCCCTTGAGTCTTCTAAAATGTTGGACTTGGGAAGCTACCCTTTCTTTCTGTAGCTTCTGTGTTCAGTTCTAAGAAATAACATTAATTCTGGGAGGACACCGATTGTTTGCTGGGCTCAACAATCCATTCCTTTTGGACAGCGGAGTTGACTCCTGTGCCTCCCTTGTGATACCTTCTTATGCTTCTGAAATAGTCACAAGAATAATCTTAAGTCCCGTAGTGACAGTAACTTACTCAATTACACAAGTTTTGCTGGATAGATTACTTTATAAGGTTACTTCTGAAGAATCAATTTGCCTTTACCTCAGTTAAACAAAACAAAGGAGCTGTCCTTTCCATTTATTTTCTACATATTTAACATATTTCCATAATGTTAGGATTTAACATAATGTGAATATTGTACATCTTCCGTCCTGCTGTAATATCCCAACCAGTGTAAATGTGTTTCTGTAAATACCATGTGCATGTAATGTTGACATCTGTCACATCACATTTAGCTTTCATGCCTTAATCCACGATGGCAGGCTGATACGTATTGTTTGTGGAAAGGTTGTATTGAATTCACTAATTTGAATTCATTAGCCAGAAATTAAACAGCGGTTTGGAAGCTGATGAAGACAGAGCAGAGGGGTGCCGTTAGGCTTTTGCACAGTGTCTGCAGAGAAGTGTGTTTGGATCACGTGCCCCTTACACAGGTGCAGTGGAACCTCAGGAGCGGTCACTGAATTGGGAGGAAATCAGCTTCTGGTCTTTTCTCTTTATTATGTAATGTATGTGCTGTGTTAACACCAATTTAGAGGGAAGCTCACTAGATCTGGTGTGGATGTTCACTGCCTGTTTTTGTTGCTTTATTCCTAGTTACCTATGGTAGCTAGGTCCTTCACTGTCCACAGAGGTGTGTTAATAGTCAGAGTGCAGTTCTTAGTGAGTAAAGTCAGTTCATGTTGTTACTGTACTTTTCTAAGATTCAgatttggtgagatgtcccccatgtgcccgtgtgtttggacacttggtctccactgatggttctgttttggaggttgtgggacctttctaaggggaagcatgtcacttagggtgggcttttcctgtctacagccagtcctgtttcttgtgtgatcacacttcc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