Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name DSE
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr6) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name dermatan sulfate epimerase
Also known as DS-epi1|DSEP|DSEPI|EDSMC2|SART-2|SART2
Coordinate chr6:116254171-116444861
Strand +
Gene summary The protein encoded by this gene is a tumor-rejection antigen. It is localized to the endoplasmic reticulum and functions to convert D-glucuronic acid to L-iduronic acid during the biosynthesis of dermatan sulfate. This antigen possesses tumor epitopes capable of inducing HLA-A24-restricted and tumor-specific cytotoxic T lymphocytes in cancer patients and may be useful for specific immunotherapy. Mutations in this gene cause inmusculocontractural Ehlers-Danlos syndrome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 9, and a paralogous gene exists on chromosome 18. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Retrocopy(s) from DSE

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
DSEP1 chr9:68608955-68613098 + Intergenic
ENSG00000224025 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001322941.2
AGTAGCGTCGCCCGAGGCTGCAGCAGCGCATCCCGGGGCATGGCGCGGCGGGGGCGCGGAGGGCTCGGTTCGGAGGGGGCCGGGAGCCCGGGCGCCCTGGAGTGAGGAGGACCGGGAGCTGGCTCTGGAGGCTGCGGAGGCGACGCCGGAGAGAACGAAGCCTCGGCTGGGAGCGGATCTTTCGAAGATGGTTTGGCTGCCTTGGAGATTTGGAGATCTGATGCCACGATGAGGACTCACACACGGGGGGCTCCCAGTGTGTTTTTCATATATTTGCTTTGCTTTGTGTCAGCCTACATCACCGACGAGAACCCAGAAGTTATGATTCCCTTCACCAATGCCAACTACGACAGCCATCCCATGCTGTACTTCTCCAGGGCAGAAGTGGCGGAGCTGCAGCTCAGGGCTGCCAGCTCGCACGAGCACATTGCAGCCCGCCTCACGGAGGCTGTGCACACGATGCTGTCCAGCCCCTTGGAATACCTCCCTCCCTGGGATCCCAAGGACTACAGTGCCCGCTGGAATGAAATTTTTGGAAACAACTTGGGTGCCTTGGCAATGTTCTGTGTGCTGTATCCTGAGAACATTGAAGCCCGAGACATGGCCAAAGACTACATGGAGAGGATGGCAGCGCAGCCTAGTTGGTGAAAGATGCTCCTTGGGATGAGGTCCCGCTTGCTCACTCCCTGGTTGGTTTTGCCACTGCTTATGACTTCTTGTACAACTACCTGAGCAAGACACAACAGGAGAAGTTTCTTGAAGTGATTGCCAATGCCTCAGGGTATATGTATGAAACTTCATACAGGAGAGGATGGGGATTTCAATACCTGCACAATCATCAGCCCACCAACTGTATGGCTTTGCTCACGGGAAGCCTAGTCCTGATGAATCAAGGATATCTTCAAGAAGCCTACTTATGGACCAAACAAGTTCTGACCATCATGGAGAAATCTCTGGTCTTGCTCAGGGAGGTGACGGATGGCTCCCTCTATGAAGGAGTTGCGTATGGCAGCTACACCACTAGATCACTCTTCCAATACATGTTTCTCGTCCAGAGGCACTTCAACATCAACCACTTTGGCCATCCGTGGCTTAAACAACACTTTGCATTTATGTATAGAACCATCCTGCCAGGGTTTCAAAGGACTGTGGCTATTGCGGACTCAAATTACAACTGGTTTTATGGTCCAGAAAGCCAATTAGTGTTCCTTGATAAATTTGTCATGCGTAATGGCAGTGGTAACTGGCTAGCTGACCAAATCAGAAGGAACCGTGTGGTGGAAGGTCCAGGAACACCATCCAAAGGGCAGCGCTGGTGCACTCTGCACACAGAATTTCTCTGGTATGATGGCAGCTTGAAATCGGTTCCTCCTCCAGACTTTGGCACCCCTACACTGCATTATTTTGAAGACTGGGGTGTCGTGACTTATGGAAGTGCACTACCTGCAGAAATCAATAGATCTTTCCTTTCCTTCAAGTCTGGAAAACTGGGGGGACGTGCAATATATGACATTGTCCACAGAAACAAATACAAAGATTGGATCAAAGGATGGAGAAATTTTAATGCAGGGCATGAACATCCTGATCAAAACTCATTTACTTTTGCTCCCAATGGTGTGCCTTTCATTACTGAGGCTCTGTACGGGCCAAAGTACACCTTCTTCAACAATGTTTTGATGTTTTCCCCAGCTGTGTCAAAGAGCTGCTTTTCTCCCTGGGTGGGTCAGGTCACAGAAGACTGCTCATCAAAATGGTCTAAATACAAGCATGACCTGGCAGCTAGTTGTCAGGGGAGGGTGGTTGCAGCAGAGGAGAAAAATGGGGTGGTTTTCATCCGAGGAGAAGGTGTGGGAGCTTATAACCCCCAGCTCAACCTGAAGAATGTTCAGAGGAATCTCATCCTCCTACATCCACAGCTGCTTCTCCTTGTAGACCAAATACACCTGGGAGAGGAGAGTCCCTTGGAGACAGCAGCGAGCTTCTTCCATAATGTGGATGTTCCTTTTGAGGAGACTGTGGTAGATGGTGTCCATGGGGCTTTCATCAGGCAGAGAGATGGTCTCTATAAAATGTACTGGATGGACGATACTGGCTACAGCGAGAAAGCAACCTTTGCCTCAGTGACATATCCTCGGGGCTATCCCTACAATGGGACAAACTATGTGAATGTCACCATGCACCTCCGAAGTCCCATCACCAGGGCAGCTTACCTCTTCATAGGGCCATCTATAGATGTTCAGAGCTTCACTGTCCACGGAGACTCTCAGCAACTGGATGTGTTCATAGCCACCAGCAAACATGCCTACGCCACATACCTGTGGACAGGTGAGGCCACAGGACAGTCTGCCTTTGCACAGGTCATTGCTGATCGTCACAAAATTCTGTTTGACCGGAATTCAGCCATCAAGAGCAGCATTGTCCCTGAGGTGAAGGACTATGCTGCTATTGTGGAACAGAACTTGCAGCATTTTAAACCAGTGTTTCAGCTGCTGGAGAAGCAGATACTGTCCCGAGTCCGGAACACAGCTAGCTTTAGGAAGACTGCTGAACGCCTGCTGAGATTTTCAGATAAGAGACAGACTGAGGAGGCCATTGACAGGATTTTTGCCATATcacagcaacagcagcagcaaagcaagtcaaagaaaaACCGAAGGGCAGGCAAACGCTATAAATTTGTGGATGCTGTCCCTGATATTTTTGCACAGATTGAAGTCAATGAGAAAAAGATTAGACAGAAAGCTCAGATTTTGGCACAGAAAGAACTACCCATAGATGAAGATGAAGAAATGAAAGACCTTTTAGATTTTGCAGATGTAACATACGAGAAACATAAAAATGGGGGCTTGATTAAAGGCCGGTTTGGACAGGCACGGATGGTGACAACTACACACAGCAGGGCCCCATCACTGTCTGCTTCCTATACCAGGTTGTTCCTGATTCTGAACATTGCTATTTTCTTTGTCATGTTGGCAATGCAACTGACTTATTTCCAGAGGGCCCAGAGCCTACATGGCCAAAGATGTCTTTATGCAGTTCTTCTCATAGATAGCTGTATTTTATTATGGTTGTACTCTTCTTGTTCCCAATCACAGTGTTAGCACTGAAGCTATAAATTACCTGGTCATTTTGTGATCACAAGAGTCTATGCAAAAAAAAAAATTTCTTTACCCCAGATTATCAGATTTTTTTCCCTCAGATTCATTTTAACAAATTAAGGGAAGATATTTTGACACAAGAAAGCAGGAACGTGGAGAAATTGGAGCAGGAAAAGAAATTATCAAAGCAATAGAAATAGCTTGGTGGTCCTATGGTGTTTTTGGAAGTATTTGGCATTGCTAATTGAGCAGTCCATATAGTACTACTTTTAGAAGAAACAAAAAGTCTATTTTTTAAAGTAATGTTTTTTCTTATGAGAAAAAGGTTTAGATAGAATTGGGTTTTATTAATATTAATTTAATGCTATTAGCAATTTCCATATACTATATTGTGGAAAAGACTGAAGAATACAATTCTGAGAAATATAAAAAAATTTTAATGGTATACTCATGTTGAAAGATAAATGTTGCTAAGTCCTGGTATGATGGTGTGAGCTTCCTTGGGGAAGTACTTCTTGAGTTATGTAACTAACAGGATGTTTTACTACAGATCTGGATGGCTATTCAGATAACATGGCAAAAAATGATAGCAGAAGATCATTAAAAACTTAAAATATATTTTATTAGAAAACATTTATCTATGAATGAATATTTCCTTGATGCTGGTCTCTGCACACATATGCTTGGTTACTTGCATGCATTCATTGGTTGTTCAATAAGTGAGATGATTACAGATAATACTGTATTTTCCTTATATGGAAAACCGTTATAGACCCAATAACAACTAAACCTTTCAAAAGAAAATATTTTCTATTATGAATGTTGATTTTCATACCAAAGAAGATGGAGAGTCTAAAATTTGGATATGATTCTTATGTTTTTTTAATAGAAAACCTTCTTCAAGTTTATTTTCCTAAATAAACATCATAATTGTGAATTTTCTCTAGTATTCTTCTTCTTTGTTCCATTATATTCAAAATGCATTAACATTTTCCAAAATTTTTGAAGAGAGATCTTTATTTGGACGTGTATTCATTAAATATATAAAGTAGTGTTTGAATCAAAAGAAGTATTTTCTCTGCTTATTAACCTTAATTGTTGTTTAAGCATATTTTAAATATTTAAAACAATAGCCAATTCTGATATTTAAGTAGCACCCAACTTTTAAAAGCATAAAATTTTCAATCAACTCCTCAGAAGGTAACAGCAGCATAGAATACTAGAAAAATAATCCATAGTTTCTACTTGAGCATAAGAAAATGATATACTTAAAAGGAACTTAATAAATTATCATACATTCAGCATATTTGAGTCATATATTTCTCCTTTGAAACAAAATATGTTCAGCTCAAATTTTACAGTAAGGACACACTCACTGATTTATAGGTGTAAAGTAACAACAGTAACCTTTCCTCTTACTTGCTCTTTTAGTTCACAGCAATACCAGTATGTAACCAAAAGACAAGCTAGAGAAACTTTTAAGTACCTTTCTGCAGTTCTAATTTGAACCTTCTTGCATAAAGAAAACACAAGTTTGACTTTTAACTGTGCTTCACTTATTATGCTTGGAATCTAGAAAACGACTTCTGAGGAAGTAATTTTTTTCCCCTCTCATGGAAAGTCTCTAGGGAGGATGTCATTACACACTGTTTAAAAGAATAATGTTTTCAAAAGAATAATGCTTCCGTTTGTCCTGCATGGATGCTCTTACTAGGATTTAAACTTGCTTTATGTGACAGATTCTCCATTTACTTAACCTCACTCAACATTcctctcttttactctttctcactcaaaaggatgaactgtctgaaatgatcaaaaggaaattttgaaagaaaaaaaaaaggaaaattattctttgaggTTACCAAGCAAACCTGATCTCAGATCCAAACTGAG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