Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Bnip2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name BCL2 interacting protein 2
Also known as -
Coordinate chr8:76400333-76426307
Strand +
Gene summary Involved in response to oxygen-glucose deprivation. Predicted to be located in cytoplasm; microtubule organizing center; and nuclear envelope. Orthologous to human BNIP2 (BCL2 interacting protein 2). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Bnip2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Bnip2P1 chr5:49146363-49147735 - Intergenic
N/A UCSC
Bnip2P2 chrX:52097054-52098703 - Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_006243371.3
GGCGCCGGTCCGGAGGTGGTCACTTCCGCCGCGGCGTGCTCACTGAATCCGGGTCAGCTGCTGCCTCCGGGACTGCAGCTGAGACCGTCCGGGAAAAGCTGGGCCCCGTCTCCACAGCCGACCAAGGGCAGCGGGCTCTGCCCGGCGCCACTTTCTGCGACCTGGCCGTCAGCCCCACGTCGCCGGCCTGGAGGGGCAAAGAGGACGAGGGGGCCGCGGCTTCCTCCGGGGACCTCGGCTGCCTGGATTGCCAGGAGCTGGAAGTTGACATTGAGTCTAGGCTGAGGATGGAAGGTGTGGAACTGAAAGAAGAATGGCAGGATGAAGACTTCCCAATACCTTTACCAGAAGATGACAGCATTGAAGCAGATATACTAGATGTAACTGATCCAGACAGACAGCCTGGCTCGTTAGAAGTTAATGGAAACAAAGTACGGAAGAAACTGGTGGCCCCAGACATCAGCCTGACCTTGGATCCTGGTGAAGACTCTCTGTGGTCAGATGATTTGGATGAAGGTGGAGAAGTTGACCTGGATGGCTTAGACACCCCCTCAGAGAACAGTGATGAGTTTGAGTGGGAAGATGATCTTCCCAAACCCAAAACTACTGAAGTCATTAGGAAAGGCTCAATTACTGAATATGCAGCTACAGAAGAAAAGGAAGATGGACGCCGCTGGCGCATGTTCAGGATTGGAGAGCAGGACCATAGAGTGGACATGAAGGCAATCGAACCCTACAAAAAAGTTATTAGCCATGGAGGCTATTATGGGGATGGCTTAAATGCCATTGTTGTATTTGCTGTCTGTTTCATGCCTGAGAGTGGTCAGCCTAACTATAGATATTTGATGGACAATCTCTTTAAATATGTTATTGGCACTTTAGAGCTGTTGGTAGCAGAGAACTACATGATCATTTACTTAAATGGTGCGACAACGCGAAGGAAAATGCCCAGTCTGGGATGGCTCAGGAGATGCTACCAGCAAATCGACAGACGATTAAGGAAAAACCTAAAGTCTCTAATCATTGTGCACCCCTCTTGGTTTATCCGAACACTTCTGGCTGTTACAAGACCATTTATCAGTTCAAAATTCAGTCAGAAGATTAGATACGTCTTTAATTTGGCTGAACTGGCGGAGCTTGTTCCCATGGAGTACGTCGGCATACCAGAGTGCATCAAACAAGTTGATCAAGAGCTTAATGGGAAACAGGAACCACCAAAGAGTGAGCAGTAAGTTCCGCATCCATCCCGGAGGAGGCAGAGCACCGGGGGCAGGGCTGTAGTGCATCCTAGTGCACTGCTGGCTCAAGGGTTTATGTCATCTGTTACAAAATTTACTTGACTTCTTTCCAAATGAACTCTTGTACAAGGGACTGTTCACTGCTGTCATGGTTTGCAACTGTTGAATTTAGCTCTTTAATAACTAATTATATTGTAATCGTTTTATATTGCTAAATAGCAAAAACTACACTTTATATAAAACAATTTTTACATTTGTTTATTTGAAATGATGCATCTTCAGTAAAGTATTTATATACATAAATGACAAAGGAAAGAAATAATATATATTTTTATGTTTGGGGGCAATATTTTTTAGTGTGTACCTATCTCGTGGATGAATATGTACAAGTAAATAAGACCACGATTTTAAGTGTAAAGTGCATGTAAGACTTTGTTTTTGTAAATGGTTGGATACATTTCCTGGGTAACTTAGGCTGGGTTGTCCTAAAGCAGGGGCAGGTAAATTGACGCCAAGAAGTACCTAAGGTCATGCATGTGGTCTGGGCAGTAGCAGCAGCCTGAGCTTCTCCTCACCTGAAAGCACGTTGTATCTTAATGTGGTGGAAAGGCAGGTGGGTGAATGACTTGTTTTCCTCTCTGAAGACATGTTGGAACTAGAACTAGAGATTTTGAAAAGCTAGTAGTTAGGGTTTATTATATATTTGTATATAAGGGACACTGTACTTTACCCAAAGTCAGAACTGTTCTAAGAAGAAAGCAAGCTCTTAAGATGTGTTCAGTCACGTGAGCTGAGTGGTGTCGTGTGTGTGAAGCTGTGAGGTGTGCAGAGGCTTCGATGAGCATTCATGGTCAGCTGCATCTGTAGAGCAGATGGCGCTATGGCATGCTCTCACAGTGGGGCACTTTACCAGAGTACGTCCTCGCCGGCTGTCCGACCACAGTGGTATTTGGCCTCAGCAGATGGGCGTTCTCGCTGCTGTCGGATGGTGTGACAGTGCTGTCCATGGGTCAGTTCTGTAAGTGCTGAGGTGCTACTGCTGTGCACCCGGGATGCCATTTGCTGTATGTAAGCCTTTAGCTCATGTGGTTAAGTACCTTGACTGAACGTTGAAATAAATATTATTTGTGCCTCCAACCAGGGTCTAAAAGTCATTCTAAAACAACAGATTTGTCTAGTCTTGTGTCATGGACTTGCCTGGTGTATGTATGTTTAGTGCACTATCAGCTTCACGACCCCCAGCCCGTCATGTAAATTGTTTACAGAAGTGATCCAGCAAAATAACATTGAACAGGCGTAAACTAAGCTTAGGTTATTTCCTCCCACACTGAGCACATGACCTTCACCATTGCAGTTTTTAGGGTTAAGCTTCTATTGCAATAGGGAATTTTTCTTTATTTCTTTGTCCTTCTTGGACATAAATTTGACCTACTAGATTAAAACCAGTTATGGTCAAGCTGGAGGACTTTGTGGATAAAACATTTCTCCACAACCTCAGCCTAGATCCAGGACTCGTGTTGTTGCAGTGCATTGAGCCAAAACCATTTTGCTTGTGTTGATGAAGGAAACTTTGAGAATAACTATATAACACCAGGCATGGTGGCATGAATTTAAGGGCAGCCTGGCCTACATAGCTGCATAGACAACCTTCTGAACTTACCCAAGAGTCGCGAGTAGCTTGTAGATACAGTGGCTTACAGAGCCTCTCACCTACCTTGTCTCAGAATGGACTGAGCTTTGTCTTTGGTTTTCTTCCACATTAAATACTAAGATCATCAGTTTCAAAATACAGACGATAGCCTCAGCTTTTTACTGTGTTTTACTTTTTGCAGAAATGGTTGGTTTGGGGTTTTTTGTTTGTTTTGGGTCTTTTTAAAAATTAAAAGTAGCCTATATTCAGTTAGAACAtggagagctggctcaacagttgtaagaacacttccaagtttagttcccagcaccaatggccagcagcagctcacggctgcctttaattccagctccaggggatttgcttcagtctctggcctctgggcatctgcatacacatgcacacatacacaGAATCTTTTTTTAAAAATGAATAAAATTCACAAGGAACAGCTTAATATAATATATACCTTCTTGCctagggagtctgaaacagaattctaagttggggcctatctgggctacatagcaagcccttgactgaagaagaAGGAGAACAGTGCTTTAACTGCACTTGAATGAATGTGGTATAGAGATGTGCCCACAGTAAATGTAAACATACCTGTACAGCTGGTGATAAATAGTAGGTTAGAGGAAAAGCCATATTAAGTTGATATTTAATTGGTACAATATAACTTTTTCCCATGTCATATTTTAATTTTCATGATTAACTGAGATGAAAATGCATAGAGTAATTCTTTGACTTTTTTTAATTCTTTTGACTTTTTTTGCAGGAGTCTTAGCTAAATTTGAcaggtttaattcaggtttaattcaggtttTTGTTACCATCTCTGTTACTTTGGCTCTGACTGCCCTCTTTTTATCAAGTTTTTCTTAGAAAATAATGTAACTCTGTTCTGCTTGTGTTCCTGAAAAAGCACCAAGGGAAGCTGTGAGGTTTCCACCTCACATTGAAGCCTTTAACCAGGGGCAAGAGGGGCCAGGAAGTGTGGTGCTAAGCAGAGTTAGAAGATAAGTGAGAAAATGGGCCATTAAAAAGGCTTGGTTATCACCTACATGCTCTCTTAAGGAACGTACTCTGTATAGCTGCCGGTGGTTTCATTTCCCATTTCCATACAGAAACAGATGTAAGGCATGGATTGACGAGGGAACTGCTGGTAGCCCTGGGATGATACTCTCCTGTCCTTTGCATCTTCAGGCAGAAACAGGTCTGAACAATGGCGTAGCAGCTACAGTCTCCATGTCAAGACCAATCCCACCCTTCACAGTTGGTAACGTTAATGTTGGCTTCTGTGCTACCTGTCATGACTTAAGTGTCACCAGCTCCTTGACAGTATTCTTCCAGAGAACTTGTGTCATGTTCCTGCAGCCATGTATGTGAGTGCTCAGGGAACTTGAAGAGATAATCTCATGAAGTGTGCTGGGAATTAGCACTGTGACACATGTAGCAGAGCAGGCCAGTTTCTTGATGGAATTGGTAGGTCTCTATGAAAGGTGACAGTAGCTTTGGCATTCTTTGTCCCGTGTTTTAAGTAGAGAATTGTTgctggaagatagtggtgcacactctttatcccagcactttggaggcagaggcaggctgatctctgaattctacagactgagttccaagacagccagagaaaccctgtctcaaaaTGTAGAAAAATTGTTAACACTGTTAGAGACACAGATAGTTGACAATAGAGGTAGTCACCCCATTCTGCTTTGGTTTTGTTCTGCTGCCTCCCCTCCCTCCCCTCACCCCTGTTTTCCTTTGGTATTTTAGACATTGATCAGTCATATCTCAGAGGGCTGGAATAAGAAAAATCTATACACAGGTGAACACTTGTACTAGTGAGAGTTTACTTTGTACTAGAAAATGGGAATTGGGTAGTGGGCCTTGCTAAGACCATCAAGAAACTAGGTTTAAGCTGTGTTCTAAGCTGGTACAAATGACCTGTCAGAGGACCCCTTTACCTTCAGCTCCCCTTCTGAGATCCTAaattctgaattcagaatcaggatggcagaagacagtaatGGAGCTTTTAAGTTCTTAATGGTAATTGAAACAAAACAGGATGT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