Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name HMGCS1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1
Also known as HMGCS
Coordinate chr5:43287470-43313477
Strand -
Gene summary Enables protein homodimerization activity. Predicted to be involved in acetyl-CoA metabolic process and farnesyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway. Predicted to be located in cytoplasm. Predicted to be active in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from HMGCS1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
HMGCS1P1 chr1:239972790-239974610 + Intergenic
ENSG00000215805 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001324220.2
GCGGACTGTCCTTTCGTGGCTCACTCCCTTTCCTCTGCTGCCGCTCGGTCACGCTTGTTCTTGTTTGAAATTCCtagtgcccgaaggaggaaacagtgacagacctggagactgcagttctctatccttcacacagCTCTTTCACCATGCCTGGATCACTTCCTTTGAATGCAGAAGCTTGCTGGCCAAAAGATGTGGGAATTGTTGCCCTTGAGATCTATTTTCCTTCTCAATATGTTGATCAAGCAGAGTTGGAAAAATATGATGGTGTAGATGCTGGAAAGTATACCATTGGCTTGGGCCAGGCCAAGATGGGCTTCTGCACAGATAGAGAAGATATTAACTCTCTTTGCATGACTGTGGTTCAGAATCTTATGGAGAGAAATAACCTTTCCTATGATTGCATTGGGCGGCTGGAAGTTGGAACAGAGACAATCATCGACAAATCAAAGTCTGTGAAGACTAATTTGATGCAGCTGTTTGAAGAGTCTGGGAATACAGATATAGAAGGAATCGACACAACTAATGCATGCTATGGAGGCACAGCTGCTGTCTTCAATGCTGTTAACTGGATTGAGTCCAGCTCTTGGGATGGACGGTATGCCCTGGTAGTTGCAGGAGATATTGCTGTATATGCCACAGGAAATGCTAGACCTACAGGTGGAGTTGGAGCAGTAGCTCTGCTAATTGGGCCAAATGCTCCTTTAATTTTTGAACGAGGGCTTCGTGGGACACATATGCAACATGCCTATGATTTTTACAAGCCTGATATGCTATCTGAATATCCTATAGTAGATGGAAAACTCTCCATACAGTGCTACCTCAGTGCATTAGACCGCTGCTATTCTGTCTACTGCAAAAAGATCCATGCCCAGTGGCAGAAAGAGGGAAATGATAAAGATTTTACCTTGAATGATTTTGGCTTCATGATCTTTCACTCACCATATTGTAAACTGGTTCAGAAATCTCTAGCTCGGATGTTGCTGAATGACTTCCTTAATGACCAGAATAGAGATAAAAATAGTATCTATAGTGGCCTGGAAGCCTTTGGGGATGTTAAATTAGAAGACACCTACTTTGATAGAGATGTGGAGAAGGCATTTATGAAGGCTAGCTCTGAACTCTTCAGTCAGAAAACAAAGGCATCTTTACTTGTATCAAATCAAAATGGAAATATGTACACATCTTCAGTATATGGTTCCCTTGCATCTGTTCTAGCACAGTACTCACCTCAGCAATTAGCAGGGAAGAGAATTGGAGTGTTTTCTTATGGTTCTGGTTTGGCTGCCACTCTGTACTCTCTTAAAGTCACACAAGATGCTACACCGGGGTCTGCTCTTGATAAAATAACAGCAAGTTTATGTGATCTTAAATCAAGGCTTGATTCAAGAACTGGTGTGGCACCAGATGTCTTCGCTGAAAACATGAAGCTCAGAGAGGACACCCATCATTTGGTCAACTATATTCCCCAGGGTTCAATAGATTCACTCTTTGAAGGAACGTGGTACTTAGTTAGGGTGGATGAAAAGCACAGAAGAACTTACGCTCGGCGTCCCACTCCAAATGATGACACTTTGGATGAAGGAGTAGGACTTGTGCATTCAAACATAGCAACTGAGCATATTCCAAGCCCTGCCAAGAAAGTACCAAGACTCCCTGCCACAGCAGCAGAACCTGAAGCAGCTGTCATTAGTAATGGGGAACATTAAGATACTCTGTGAGGTGCAAGACTTCAGGGTGGGGTGGGCATGGGGTGGGGGTATGGGAACAGTTGGAGGAATGGGATATCTGGGGATAATTTTAAAGGATTACATGTTATGTAAATTTTTATGTGACTGACATGGAGCCTGGATGACTATCGTGTACTTGGGAAAGTCTCTTTGCTCTATTTGCTGACATGCTTCCTGTTGTGGTCTGGCCAATGCCAAATGTACTCGAATGATGTTAAGGGCTCTGTAAAACTTCATACCTCTTTGGCCATTTGTATGCATGATGTTTGGTTTTTAAACATGGTATAATGAATTGTGTACTTCTGTCAGAAGAAAGCAGAGGTACTAATCTCCAATTAAAAAATTTTTTAACATGTAAGAATTTTGTACTTTGAACAACAAGATTACAGAAAGTACCTGTGGTTTTTGGAAAACATTTCTAGCTTGGGGAATGTGACAACATTCCCCAGtgtggtaaaattggggtaaaatgtggtaaaatgtgATACGCACAAACCCTTTGAAAATAGCAAAACAAACATGCCCTTTTTCTAAAATTGATAAATCCTAAAGAGGAAGAAAAGAGCTGGGACAATAAAACACTGGCTCTGGAATCTGGAATGTTAAGTCCAGGCCAGCAGTGACAAAAGTTATTGTAATGACCTCTGAACAGAGAAACACTGCCATTGAAGAGGCTTCTGGTATAGAAAACATGGTACATTCAGGAGCTGTGAATATAGCTCTAGGTGTGCTCCTGAATCAGTTCATGGTAGATTATGCTGAACAACAGTGAGATGTTATTGGAGGTGTGGATGAGGGAGTTTGTTGTTGCAGTCCTTCTTTGCACCTTATTTTAAAGAATAAATGAAACATTTTTCTGGTTACTTTTTTAAAAATTTAAAATGGAAGGGAAGAATAGGGGCAGGGCATTATTAGGCTATTTCTGATGCTTCAGTGTTATAAATTCAACATAGAGGCTGACAACCTAAATTCATGGTGTAACACAGCTCttttccttttccttttttttttttttttGGTATCTGTTCAATGAAAATAAGGTATGACCCAAGTTTTTACCTAGTCTGACTAGAAGTATTCCACTTCAAGGTCTGAAGTAGGACTTTTACCTTAAAAAACAACAACAAACAAAACTATCACACAGGATAGATAAGAAGATTGGTTAAACAGTTTTGTGTAGATCTTTTTGGTGCTGAACTATGACATGAGCCTTATAGATTGTAAAATAGGGATAGTTGGAACTAATGTACAGAACTAAATTTTTTAAACTTTATTTGCTGTTAAATTCTGTGAAGTTTCAGTTATCTAAAATAAATATACACAAATATGAAATATAATGTTTCAGATTGCAAGGTAATATGTAATAGTAGTGTTTGTAAGATACTCTTGTCTAATATTAACTAGTAGTATTTTGATTTGTACAGTCATAATTTGTTAAAATGACTTCATTTAACATTCACTGATGTAGATTAATAATGTAAGTTCTGATTTAAAGAATGGTGGCAAAATGGTGCATGTAATACTTTTGCAAGTGTTGGGGAGATCGGTATGTTTTGAAAAGAGTAATTTAACTTTTGGGTGCCAGGAAATGGGTTTTCTCAAAGTCCATTGCCGGCAATGGGCAGGCCTGCAAATACTGGCACAGAGCATTAATCATACACCTTATTAACGGTGAGGTGAATAACTTTGAAATAAAGTTTTAGAGAAATGTTTCAGATACTTGAGTATTCTTTTTCACTCTTGAACTAACAACTTCGGCAAGAAATCAGCTAATATTCTATTTTTAAATATGGGCATTAATTTCATTTCAGTTCGTTCACTCATTCCattcatttatcatttcacaaacatttgaaatcctaatataagcaaggtgctctgtttaaggcagaaatttgaaaatgtacaagatatatggtcttgtctttaaggagctgttcatctagaatggaggaATTTACACTGATAATTATTCCTACACTTGAAACAAAGAAATTAACTCTCAAATTGCGTGGCAAGCATATATAGACTTTGCTATAAATATTTATGAAATGAGTTACTGTTTTCCTTAAAAAAGCTAAGACTAAGGGCTGGCAATCAAATAAGAGCAAATTTAGTGGTGAACGTAGAACTGCCCACTACCAGCTAGAGTCTCCAACCTAAAAGTCCCATGTTGCTAGTGATCCCcaggggttttatagaaggaatccctgcattggcagtaattttggattagatgatccctaagagcaccatcaagtcttaggattctatgaATTAGGAAATAAACCAAATTATATATTTTCTAATACTGATCAGCTCATATTTTATCATCATGTCATGTCTGGCTTTCATACTTAGTCATAATTTACTTTCTGGGTCATTTAGAGGCTAGCGTTCTCTAAGGTCACTTCTGCTTGCACATTGTAGGATATTATTTAGTATGGCTTTAAGAATTCAATCTTTCCCCCTCTCCTTTATGGAATGTGTGTTTCCTCTATTTGTACACTTAACCTTTTGTCCTAAGTTTTTATTTTTATGGATACTAATGAGTAACTTTGAGGTTGACACTAGACCCAAACAGATGCAAACAGCCACTTTCTGTCCTCTTGTGACACAGTTGAAACACTTTATCTCTTGTCTGCTGTTTGGAGTGTCCTGAAAGAAACACTGAAGTGGCAGTCAACAGAGCAAGGGTAACAGGATCTTTAAATAATTTAAAGTTGTCTGATCTTGACATAAAAGTGAACCCTTTCTTTAAAATTTCTAGCAACTGCTCTTAAGTCATAGGTTCCTCATTTTTTCTTTGCTGGTAGTGGGAGAAAATAGTTGATCTGTGATTTTTGTTTTCATCTCCCCAAACTATGTTATAAAGGCAGTAATTTGATGCTGAAGATTATGATTAGAAATCCTCAGATGGGTTATATATTGGGGCTTTATCTTTTAATATTAAAAAGAATGTCTTTCCTGGACTACTTTATTCAGTAGTAAGCACTATTCATTCTATGTATATtccttattcagccttgcagactcctgtgggatctgatctcttcctgcttcaactcagtaccatactcaccaaggcttagtatgtcttcacccactctcccttctcttgcattcctcaaacatgctgagtttattccagccttaagcctttgATCTACGCATCAGAAATGttgggccccacttcagatcttctctgccctgccttctactccagtcactgctgtggtaactaattccatgaagtctttgaccaggttc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