Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Ctdspl2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase like 2
Also known as D2Ertd485e|SCP4
Coordinate chr2:121785879-121845807
Strand +
Gene summary Enables phosphoprotein phosphatase activity. Acts upstream of or within negative regulation of BMP signaling pathway; positive regulation of protein export from nucleus; and protein dephosphorylation. Located in nucleus. Is expressed in several structures, including adrenal gland; brain; gallbladder; genitourinary system; and gut. Orthologous to human CTDSPL2 (CTD small phosphatase like 2). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Ctdspl2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Ctdspl2P1 chr19:39040879-39043428 - Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_212450.4
GCGCTCTCCTTGTCGCCCGGCTCTAGGCGGTTCCGTTAGCGGCGGGAGGGAAAACCGCCCCCGGCGTCCCCGCCTCCGCTGCTAACGCTTTCCTCCCTACTCCCCCTGCGACCACCCCGCAGCCCGCTACGGAGGCCCCCGAAGTACAAACGTCCCCCACGCTCCGAGCCCCATCGGAGGCTGAGTCCAGTCTAACTCCTCGGGCCctaagctcatttttttttcattgttttttgttgttgttgtttcttgtttttcttttggtcagGAATTCGCTCTGGTGAGTTCCCTAAGGCGGCAGAAACTTCAGCCTCTTCACGGTAGTAAAAGTTGGTTTCCCCTCCCCCGCTGCCGCCCAGGCCTCCCGCATTCCTTCCCTCCCGCCTCTCCGGATCGGGGCGGGCGGGGGAGGAGGGAGCCAGAGCGCCTGCGCAGGGAGGCCGCTTTCCATCCGGGTCCCTGTCCGTGCGGTGCAGCAGGTCGGTAGGCGGGAAATGGCGACTGGCTGAAGGAGCTGGTTCTGTTGCTGCTGAGGGATAAGCGGGAAAGACACCACCTATTGCGCAGTCGGGACCATCGCCGGAGCCCGAAGACACTTTTCTGTCGTCACAGTGAAGGTTTACATGTGGCACCCGTAAAAGATGAAGCTGAGAACACGGAAGGCTtctcagcagtccagtccaatcCAGACACAGCGCACTGccagagcaaagaggaaatactCAGAGGTTGATGATAGCTTGCCTTCAGGAGGAGAAAAACCATCAAAGAATGAAACCGGCTTATTGTCTTCAATTAAAAAGTTCATTAAAGGAAGCACACCCAAGgaagagagagaaaatcctTCGAAGCGGAGTAGAATTGAACGTGATATAGATAATAATTTAATCACATCAACACCAAGAACCGGAGAAAAGCCTGACAAACAGTTGTCTCGAGTAAGACGGAAAAGTCCAGTCAATGgagAAGCTGGTAGTTATGAAATGACAAATCAACATATAAAGCAAAATGGAAAATTAGAAGATAACCCTTGCTCTGGTAGTCCTCCGAGGACTACATTGTTGGGGACCATATTTTCGCCTGTCTTCAACTTTTTTTCACCAGCAAATAAAAATGGAACGTCAGGCTCAGATTCCCCAGGACAGGCTGTGGAAGCTGAGGAGATAGTGAAACAACTTGACATGGAACAGGTGGATGAAATTACTACCAGCACCACGTCAGCTAATGGAGCGGCTTACTCAAATCAAGCAGTTCAAGTGAGGCCATCACTAAATAATGGtttagaagaagcagaagaaacagTTACCCGGGATATCCCACCCCTTACAGCACCAGTAACTCCAGAGAGTGGGTACTCGTCAGCCCATGCAGAGGCCACCTATGAAGAAGACTGGGAAGTATTTGACCCCTATTATTTCATCAAACATGTTCCGCCTCTGACAGAAGAACAGCTAAATAGGAAACCTGCTCTTCCTTTGAAAACAAGAAGCACACCAGAGTTCTCCCTGGTCTTAGATCTGGATGAGACACTAGTGCACTGCAGTCTGAATGAGCTAGAAGATGCAGCGCTCACTTTTCCAGTCCTTTTCCAAGATGTCATTTATCAGGTTTATGTGAGATTAAGACCATTCTTCAGGGAATTCCTGGAACGAATGTCTCAGATGTATGAGATCATTCTTTTTACTGCTTCTAAGAAGGTGTATGCAGACAAGTTACTGAACATACTAGACCCTAAAAAGCAACTGGTCAGGCACCGGCTTTTCCGTGAACATTGTGTTTGTGTACAAGGAAACTATATAAAGGACTTGAATATCCTTGGGAGAGATCTTTCCAAAACTATAATAATTGACAACTCACCACAAGCCTTTGCCTATCAGcTTTCTAATGGAATCCCTATAGAAAGCTGGTTTATGGATAAAAATGACAATGAACTCCTAAAATTGATTCCATTTCTGGAGAAGCTTGTAGAACTGAATGAAGATGTCCGGCCTCACATCAGAGACAGATTTCGATTGCATGATTTGCTGCCCCCAGATTAAGTTCAGAGACTTGTCATATCACTGAAGGGGGGGAGAGAATGCAGGACCCTTTTGGACTAAGACAAAAACATTGCCATTACTGTTGAAATTTTGCATTTTTGTACCCCGTCTTGCTTTCTTATCTTTGGTGCCCAATAATAATCAAGGGTTACAGAAAGAGACTCTCGGATTGAACACATACAGTGGGTAGGCTAAAACAGAAGCGTCTGTAGAGTAGACAGCTCCAGTGAGACTCTATGTATAGGACATCTGCAGCTCATAACGAATTCTGTTTCTGCCACCAGCAGTTTGACCTGTAGTTACACAGGATTTTATGATAATAACAGAGATGAAAGTGgactttcattctctctctgtttgGTGCTCTCAGTGGGTTTGTAGCCACTCTTCTGTTACTTCACTATTCTCATTTCAACAGGAATGGCCAGtaaaagttgttttatttttcctgttaagGTTTATAACCTTTTTACATTTCTGACCTGTATTAGATTAGAATCTCATGATGCATTCCTTTTAGTTAAGGCGCTTCATAGTTTTCTGGAAATAGtcaatttttagttttttttttaattatacattTGAATGGCCGTTTTCCTGCTTTGTCTGCCTGCATAttgtatatttgtttaaaaatattctctacTTTTAGTCCATGTTAAGTTTCATTTAAAAGATGCATTTATATTTTGTTCTGTAATATTCTACTGTAGGTGAAATCTTCAAAAATCAAGAGACTGGGTAGTTAAGAATATATGAATGACTAATATTCAAATGATTTGAATGAACCATTGTGATGACATGTATTCCAGATGGTAATATCTTGCAATGGCACACGTTTAATGGATAAAGGTATACCTCAGACTTCACTGTGCTCACTAGCCTTTGAGGAGAACGAGTTCAGGCACCTGTTGGGCTTGATTCGGTTACTGCTGCCTTTGGGTTTTCTCCAGGAAGGAAGTATTCAGCACAGTGACTCAGTATTTTTACTTTGCATGGGCTGGTAGTACCTCTGTTATGCTCCCAGTTACAATCAGTTTAAAGCTCTGTGTAACAGCTGTGGTACCTAACGGTGGCTATGCATAATCCTGTGGCACAGTACACTCCCGGGCCACCAGTGCAGTCAATGTGCTCATAGTGGTTTTCTATGCTATATGAAAATAAGTCGTCACGCCTTGGTTCTCTAATGCAGCTACCACAAGAGGTTGATATTTTTATAGTGGCGTGTAATCTCCTTTTCAGGAGGCTTTTTATGGAAGGTAGAATTTGTAAAAGTCAGTATGCTTTGCCTCTCAACTGCATTAACATGCCGCAGGCTCAGACTGTTTTTGTGTAAAGGATGTCAAAGAACGGCACTTTTTCTAAAGAGAAGTTTGATATTTTGTATGCTTGTTAAGAAAGTACAGTATTGGAAATTAAAGGTGGACAATTGATAATTGAGGAGTATGTCAgttaattttttatgtatattaCCTGTTTACTTGTACAACTTATTGTACAAATTACATGCAGCTTCATTTTCAAATGAATCCTTAAAATAAGGAAATCTttttaggaaaacatttaatttttgtatttttgatttTAAAGGCATGAGTTGTCAGTTTTCAGTGTATTAATGAAGATTTTAACTTTTCATCAGGTTGAGTGTTTTCTTACTATATTATCTGTTGTGTATGTAGTTAGCATATTGTGTCACTGAACTGTTTAAAAATCTAGCATGTAGAGCAAGCCTGTTTTGTGGAAAATccttattcattaaaaaaaataatcatggcagattttctgcaaaaaaaaaaaaagcaaaagcatttgcaattcagattttttttatttaaaaaaaaaaggtattttgcTTGCAGGAACAATACTACAGATTCATTTTAATGAGAATCTTCGAAATGTATTTATCTTTAGGGCACCTGGGCATCTTTATGCTGTTTGTCTTATGTCTTtcttgaaataaaatgtaaatatgttaCCTTTACATATGCTCTTTCTCAAAATTGTGAACCTAGTTAATATCTTCTTGCCCCCATCATTTTTATGCTTATACAGCAAACCCCAAAACCTGTACAAGATTGAATTTTTGACAAACATAATTGTTGACAATGTACTTGATCAGGAATTAAGTAAATACAGTCTCAAAGCCCTTCCCACATCTTAAAAGGGGAAACACTTATACCATAGTGCCTGTGggcactttaataataaaaaagcaggCCTGTGCCAGGGGAATGAGCTCCTACTCAGCCAGTAGGTGAGTCAACAATACACTTTTGTAGAGAAATGTAACGTGGGAAAGTTTACATGGCCTGAGAGTTGAGACCAAATtaatagattatttttttctattactttGAGTAATTCTAAAGTTGTTGATAACAAAGTTTAAAGAAGATTATAAAGAAGTTTGCtggcttcttttcattttaataggTTTATCTTTCAATCATATCTTTTCTTTGTTGGTAACTGTAGAACGCTTCCTTTTAGTTAATCAGAGGTGTGTACTTTTTTAATTGCAATGTGCCCAGCCTGTCagtgcacacagcacacatgacTATAGTAAATGCAGGGGCCATGGGTCCATGAAGCACACAGCAAGCTACCTGTGTACACATTACAACTCTTAAGGACCTATTAAAATTGTGCTATTTCCAGTTATGAATGTTTGACTTTTAAgacattcttttaaatatttgtatcaTTGTTAGAGAATATTTGCTTGGTTGTATTTTTTAGACCCATGTAATATATGTAGTCCTGACCAGATTTATTACCATTTTTCTCTGGGTCCTAAAAGAGATCGATGACAATTCGTAACCagaaattgttttatatttgctagtatgtatatttatttatccaATGGCTTTATTTGTTTCCCAAAATTGTTTTGGGACTTGTTGAAAGCATTGTGTAACTTCTATAAATGGCTATTTTCTTGTAACTGTCAGT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