Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name Srsf10
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name serine and arginine rich splicing factor 10
Also known as Fusip1
Coordinate chr5:154205358-154219550
Strand +
Gene summary Predicted to enable RNA binding activity. Predicted to be involved in cytosolic transport; mRNA splice site selection; and negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome. Located in axon terminus; dendrite; and neuronal cell body. Orthologous to human SRSF10 (serine and arginine rich splicing factor 10). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Srsf10

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Srsf10P2 chr6:97561624-97561843 - Intergenic
 N/A UCSC
Srsf10P3 chrX:47883631-47884413 + Intergenic
 N/A UCSC
Srsf10P1 chr2:151632597-151633096 - Intergenic
 N/A UCSC
Srsf10P4 chrX:83176199-83177544 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001025738.1
GCGAGTGAGTGAGTGGATGTGAGCCGCCGCCGCCGGAGCTGCGGACGGTTTGCCGAGCCCGTTAGCGCCGCTGGCCCAGAGCCCCGCCGCCGTCATGTCCCGATACCTGCGCCCCCCCAACACGTCTCTGTTCGTCAGAAACGTGGCGGACGACACCAGGTCTGAAGATTTACGTCGGGAATTTGGTCGTTATGGTCCAATAGTAGATGTTTATGTTCCACTTGATTTCTACACTCGACGTCCAAGAGGATTTGCATATGTTCAATTTGAGGATGTTCGTGATGCTGAAGATGCTTTACATAATTTGGACAGAAAATGGATTTGTGGGCGTCAAATTGAAATACAGTTCGCACAGGGGGATCGGAAGACACCAAATCAAATGAAAGCCAAGGAAGGGAGGAATGTATACAGCTCTTCACGATACGACGATTATGACCGATATAGACGTTCTCGAAGCCGAAGTTATGAAAGGAGGAGATCAAGGAGTCGGTCCTTTGATTATAACTATAGGAGATCTTACAGTCCTAGAAACAGTAGACCGACTGGAAGACCACGGCGTAGCCGAAGCCATTCCGACAATGATAGGTAAATAATTTTGCTTTGAAAACAACTCCTGTTTTTTCAATTTCAGAGTGAACTTTTGCTCTAAAAGTAACAGATTTGATTAATATAGAATCTAATTTTTACTCTAATTGTATCTCTCCTCTGTTTTGAAAGATTCAAACACCGAAATCGATCTTTTTCAAGATCTAAATCCAATTCAAGATCACGGTCCAAGTCCCAGCCCAAGAAAGAAATGAAGGCTAAATCACGTTCTAGGTCTGCATCTCACACCAAAACTAGAGGCACCTCTAAAACAGATTCCAAAACACATTATAAGTCTGGCTCAAGATATGAAAAGGAATCAAGGAAAAAAGAACCACCTagatccaaatctcagtcaagatcacagtctaggtctaggtcaaaatctagatcaaggtcTTGGACTAGTCCCAAGTCCAGTGGCCACTGATAGTATAAATCATGATACTTCTAGGCATGTATCATTCATTTACTCATAGTTTGGTATACTTAAATTATCAGGAATACAATGTTGCAATGATGCGTTTAAAAACAAACAAACTTAACTTGTTAGTTTTCCCTGTACTGGGCAATGGTTATAATTAAAATGATATGCTGTTGAGAAGCCA
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