| Gene Name | Syncrip |
|
| Specie | Rattus norvegicus | |
| Full Name | synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein | |
| Also known as | Ab2-339|hnRNP Q | |
| Coordinate | chr8:96100692-96266342 | |
| Strand | - | |
| Gene summary | Enables mRNA 3'-UTR binding activity and mRNA 5'-UTR binding activity. Involved in circadian rhythm; negative regulation of mRNA modification; and positive regulation of translation. Located in several cellular components, including neuronal cell body; nucleus; and proximal dendrite. Orthologous to human SYNCRIP (synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022] |
| Retroname | Coord | Strand | Genomic Region | ENSG | |
|---|---|---|---|---|---|
| SyncripP2 | chr12:30624987-30626761 | - |
Intergenic |
N/A | UCSC |
| SyncripP1 | chr11:60838537-60841821 | + |
Intergenic |
N/A | UCSC |
| >XM_006243513.3 |
| CACGTCAGCGCGGGAGAGAGAAAGAGCGACTCGGCAGGGACTGGGGACGGGCCGAGAGAGCTAGCGAGGGAGGGCGTGAGCCAGAGAGCCAGCGAGGAGAAGGGCGGCCACTCGTGCTTGAGCGGCCGCGGACGGGAGTGGGAAAGCTGGGGGAGGAGGTGCAGGGAAGGAAGGACGAAGACCGAGAGGACAGGGCGGCCCACGGCCGGCAGAGGTGGCAAGGGGAGAAGGAGGAGCTGTAGGAGGGCAGGGGCTGAGGGAGTGAGTGAGAGAAGCGGACGCGCCAGGGAGGGGAGGGAAGGGGGGTCAcgcgggggcgcgcgcgcgcactgggagcgcgctcgGAGGCGAGTGGAACTGGATCGGGTTTGCTGCCAGCGGCGTGAGCTTCGGCCGCCATTTTACAACAGCTCCACTCGCGCCGGACACAGGGAGCAGCGAGCACGCGTTCCCCGCCACCCGACCCGGTCGGACAGGATTCCTCGGCCCCAGCCCCGCGGGGAGATCTCTGGAAACATGGCTACAGAACATGTTAATGGAAATGGTACTGAAGAGCCCATGGATACTACTTCAGCAGTTATCCATTCAGAAAATTTTCAGACATTGCTTGATGCTGGTTTACCACAGAAAGTTGCTGAAAAACTAGATGAAATTTACGTTGCAGGGCTAGTTGCACATAGTGATTTAGATGAGAGAGCTATCGAAGCTTTAAAAGAGTTCAATGAAGACGGCGCATTGGCAGTGCTTCAACAGTTCAAAGACAGTGATCTCTCTCATGTTCAGAACAAAAGTGCCTTTTTATGTGGAGTCATGAAGACTTACAGGCAGAGAGAGAAACAAGGGACCAAAGTAGCAGACTCTAGTAAAGGACCAGATGAGGCGAAGATTAAGGCACTTTTGGAAAGAACAGGCTACACTCTTGATGTGACTACAGGTCAGAGGAAGTATGGGGGGCCACCTCCAGATTCTGTTTATTCAGGTCAGCAGCCTTCTGTTGGCACTGAGATATTTGTGGGGAAGATCCCCAGAGATCTGTTTGAAGATGAGCTTGTTCCATTGTTTGAGAAAGCTGGACCTATATGGGATCTTCGTTTAATGATGGATCCACTTACTGGTCTCAACAGAGGTTATGCCTTTGTCACTTTTTGTACAAAAGAAGCAGCACAAGAGGCTGTTAAACTGTATAATAATCATGAAATTCGTTCCGGGAAACATATTGGTGTCTGCATCTCAGTTGCCAACAATAGGCTTTTTGTGGGCTCTATTCCTAAGAGTAAAACCAAGGAACAGATTCTTGAAGAATTTAGTAAAGTGACAGAGGGTCTCACAGATGTCATTTTATACCACCAACCTGATGACAAGAAAAAAAACAGAGGCTTTTGCTTTCTTGAATATGAAGATCATAAAACAGCTGCCCAGGCAAGGCGTAGGCTAATGAGTGGTAAAGTTAAAGTCTGGGGAAATGTTGGAACTGTTGAATGGGCTGATCCTATTGAAGATCCTGATCCTGAAGTTATGGCAAAGGTAAAAGTGCTGTTTGTACGCAACCTTGCCAACACTGTAACAGAAGAAATTTTAGAAAAGTCGTTTAGTCAGTTTGGGAAACTGGAACGAGTGAAGAAGCTAAAAGATTATGCTTTCATTCATTTTGATGAGAGAGATGGTGCTGTCAAGGCTATGGAAGAAATGAATGGTAAAGACTTGGAGGGAGAAAACATTGAAATTGTTTTTGCTAAGCCACCAGATCAGAAGAGGAAAGAAAGAAAAGCTCAGAGGCAAGCAGCAAAGAATCAAATGTATGATGATTACTACTATTATGGTCCACCTCATATGCCCCCTCCAACAAGAGGTCGAGGGCGTGGAGGTAGAGGTGGCTATGGATATCCTCCAGattattatggatacgaagattattatgattattatggttatgattaccataactatcgtggtggatatgaagatccatattatggttatgaAGATTTTCAAGTTGGAGCTAGAGGAAGGGGTGGTAGAGGAGCAAGGGGTGCTGCTCCATCCAGAGGTCGCGGGGCTGCTCCTCCCCGTGGTAGAGCCGGTTATTCACAGAGAGGAGGCCCTGGATCAGCAAGAGGCGTTCGTGGTGCGAGAGGAGGTGCCCAACAACAAAGAGGCCGCGGGGTACGTGGTGCAAGGGGTGGCCGCGGTGGAAATGTAGGAGGAAAGCGCAAAGCTGATGGGTACAACCAGCCAGATTCCAAGCGGCGCCAGACCAATAATCAGAACTGGGGCTCCCAACCCATTGCTCAGCAACCGCTCCAAGGTGGTGATCATTCTGGTAACTATGGTTACAAATCTGAAAACGAGGAGTTTTATCAGGATACTTTTGGGCAACAGTGGAAGTAGAACAGGAGGGCATCTGTAAAATTAGAGACTGATAGGTTGATCAGAAATTGGGCCTAAATCTGAACGGGTGCCGCTATAATTTGAGACATCTGGCAAGATTTTCCCTTTATGTATATATTTTAACAACCCGCTTGGACATGAACAAAGTCACACTTCTGCTTCTGGCGAATTGATTTTATTTTTACTTTTAATTTTTTTCCAATAAACGTATTATTAGAAGATATGAAAGAAATAGTTAATGAGTTTGCATTCCTTCTTAAGAATTTGGCTCggggttggggatttagctcagtggtagagcgcttgcctaggaagcgcaaggccctgggttcggtccccagctccgaaaaaaagaaccaaaaaaaaaATGGCTCATTTGGCTGTTTGtgtgtgtgtatacatatatgcatatgtgtacatatatatatatatatgtatatgtatgtatatacacacaaacacacgtgtctgggtagtatTTAGACTTGGTGTCTTGAAAAGGTAGTTGATTAAAAACTTGAGTATGTCTTTAATATCTTGTATCAGAACAACTATTTGTATGTTACCAACTTAAATTGCTAGAATAAGGTAAATTGGTACACAACTGCTATTTTTAATTTAGAACTTTGACCTAATTGGGTTTTCAAAACCATTTGGCTACTTGTATTATTTATGCTGTTGTTAATTTCAATAAAAAAAATTCACACCTAAATGTATACTTACTAAAACTGTGTTTACAATTCGTTTTTTTACAAAATTTCTGAAAATTGGTTTAAATTATATAGCATGCCAAGGCCAACTAAAGGGTTTTTTGTGCCTTGTTAATTCTTGTGTGGAATATGTCTGCACATTACACAACACTGATTTGTTGCAGTTTTCTGCTTCTGGTTTATAGTGCTATTATACAACATATTTCATGTTCTCAACCAAAATTTATAATTAGTGTGTGTAGTAAGTTTAAGTTGGTAAGTATCTTTATAGTTCTTAACTTTATGATAAATTGTATAACTAAGACTATTATTACAGGTAGTTTCAAAGTGTTGTAGGCTGCACCTGACAGTTGTTTGAAGTTTTTTCTAACTTAATATAAAACTCAAATTGAGTATATTGCCCTCTTGATTATTTTGTGCAGCATGGGACAGCTACGAACTCTTAATATGAATATTGGGAATAATGTGAGTTCTT |
| >XM_006243515.1 |
| GAGAGAGCTAGCGAGGGAGGGCGTGAGCCAGAGAGCCAGCGAGGAGAAGGGCGGCCACTCGTGCTTGAGCGGCCGCGGACGGGAGTGGGAAAGCTGGGGGAGGAGGTGCAGGGAAGGAAGGACGAAGACCGAGAGGACAGGGCGGCCCACGGCCGGCAGAGGTGGCAAGGGGAGAAGGAGGAGCTGTAGGAGGGCAGGGGCTGAGGGAGTGAGTGAGAGAAGCGGACGCGCCAGGGAGGGGAGGGAAGGGGGGTCAcgcgggggcgcgcgcgcgcactgggagcgcgctcgGAGGCGAGTGGAACTGGATCGGGTTTGCTGCCAGCGGCGTGAGCTTCGGCCGCCATTTTACAACAGCTCCACTCGCGCCGGACACAGGGAGCAGCGAGCACGCGTTCCCCGCCACCCGACCCGGTCGGACAGGATTCCTCGGCCCCAGCCCCGCGGGGAGATCTCTGGAAACATGGCTACAGAACATGTTAATGGAAATGGTACTGAAGAGCCCATGGATACTACTTCAGCAGTTATCCATTCAGAAAATTTTCAGACATTGCTTGATGCTGGTTTACCACAGAAAGTTGCTGAAAAACTAGATGAAATTTACGTTGCAGGGCTAGTTGCACATAGTGATTTAGATGAGAGAGCTATCGAAGCTTTAAAAGAGTTCAATGAAGACGGCGCATTGGCAGTGCTTCAACAGTTCAAAGACAGTGATCTCTCTCATGTTCAGAACAAAAGTGCCTTTTTATGTGGAGTCATGAAGACTTACAGGCAGAGAGAGAAACAAGGGACCAAAGTAGCAGACTCTAGTAAAGGACCAGATGAGGCGAAGATTAAGGCACTTTTGGAAAGAACAGGCTACACTCTTGATGTGACTACAGGTCAGAGGAAGTATGGGGGGCCACCTCCAGATTCTGTTTATTCAGGTCAGCAGCCTTCTGTTGGCACTGAGATATTTGTGGGGAAGATCCCCAGAGATCTGTTTGAAGATGAGCTTGTTCCATTGTTTGAGAAAGCTGGACCTATATGGGATCTTCGTTTAATGATGGATCCACTTACTGGTCTCAACAGAGGTTATGCCTTTGTCACTTTTTGTACAAAAGAAGCAGCACAAGAGGCTGTTAAACTGTATAATAATCATGAAATTCGTTCCGGGAAACATATTGGTGTCTGCATCTCAGTTGCCAACAATAGGCTTTTTGTGGGCTCTATTCCTAAGAGTAAAACCAAGGAACAGATTCTTGAAGAATTTAGTAAAGTGACAGAGGGTCTCACAGATGTCATTTTATACCACCAACCTGATGACAAGAAAAAAAACAGAGGCTTTTGCTTTCTTGAATATGAAGATCATAAAACAGCTGCCCAGGCAAGGCGTAGGCTAATGAGTGGTAAAGTTAAAGTCTGGGGAAATGTTGGAACTGTTGAATGGGCTGATCCTATTGAAGATCCTGATCCTGAAGTTATGGCAAAGGTAAAAGTGCTGTTTGTACGCAACCTTGCCAACACTGTAACAGAAGAAATTTTAGAAAAGTCGTTTAGTCAGTTTGGGAAACTGGAACGAGTGAAGAAGCTAAAAGATTATGCTTTCATTCATTTTGATGAGAGAGATGGTGCTGTCAAGGCTATGGAAGAAATGAATGGTAAAGACTTGGAGGGAGAAAACATTGAAATTGTTTTTGCTAAGCCACCAGATCAGAAGAGGAAAGAAAGAAAAGCTCAGAGGCAAGCAGCAAAGAATCAAATGTATGATGATTACTACTATTATGGTCCACCTCATATGCCCCCTCCAACAAGAGGTCGAGGGCGTGGAGGTAGAGGTGGCTATGGATATCCTCCAGattattatggatacgaagattattatgattattatggttatgattaccataactatcgtggtggatatgaagatccatattatggttatgaAGATTTTCAAGTTGGAGCTAGAGGAAGGGGTGGTAGAGGAGCAAGGGGTGCTGCTCCATCCAGAGGTCGCGGGGCTGCTCCTCCCCGTGGTAGAGCCGGTTATTCACAGAGAGGAGGCCCTGGATCAGCAAGAGGCGTTCGTGGTGCGAGAGGAGGTGCCCAACAACAAAGAGGCCGCGGGCAGGGAAAAGGGGTCGAGGCCGGTCCTGACCTGTTACAATGAAGACTGACTTGCTATGTGGGATTACACCAGAAGCTTGCAGTGGAGTAATGGTAAGGAAAATCAAGCAACCTTAAATATCTCGGCTGTATAGGAGCATATTCTATTGCAGAAGACCTCCCTGTGAAGATCATGGAATCAAATACGGGACATTGAACTAATACTTGGACTTTGATATGAATTTCTTTAACAATTTTCTCTGCAGTGCAAGTTATTAAACTAAAGCTACTCTATTTTCCAAATGTGTTCCAACAAAAATTCTTCATAACTTCTAGCATGGTATCTTAATAAAGAATAAAGTTCTTCTCTTTAAAAAATCTGCTCTAAGTAGATTTTTCCCCTTTTTTTTTAAATTAAGGATCTCAGCAGTGGTATTCTGGAAATATTCTCTTGAATTTGTGCATTTAAATTTTATTGCAGTGATACAGATACCACTGTTGGTACCCTTAAATTTTTATTTCTGCTCACCAAGGTTAATCATGATTGTCTATATCTTTTTTATAGTAATCACTTTTGAATTGTGTTCAGATGCAGTTTCAGGTGTAATCATCAGAGCTGGTTAGTCAGGCATTCCAGATAGTGGTTCTTTTCAGAACCTTTTTTAAAGGGTTGGTTAACTACCTCAGTAGCAGAGGATTGAACTATACCCTGTCTGTACTGTACATAGAAAATCTTTGTAGATAAAAGCAAGGCTTGTTAAATATGATATGAGGGTAAGATTTTAATATACCAAATGTAACATTCTTAGTTGCCTTTAGTTTCAGAGGCTTGTAAGACTTCCTCATGACCATCATAACAGGCCTTGCTTTTGTCGTATTTTGTGGCTGAAAAAGCAGCCTTGCTTCTTCAGATATTGTAGTTATTTGGATGTATAATAGTTTAGCAAGATGTTACTTTTGTAAGACATCAGATGTTCAAAAAAAGTGCATCCGAACTTGTACTAAATACTGCAGTGTCCCTTTATAAAAAGTCAGACTAAAACTGACAATTGTACAGCAAAGCCTGACATTTGGATATTTTGAAGTTTTTTCATAAATCATAGAAATTAGTATATGGCTGTAGTTTAGCTTTTTAGGTAAAAGGTATGTTTCATTAGTGCATTTGTTACTGCTGATCACTATAAAAACGTGAGTCAGCTTTCCATTTCTTATGCAGGTCATGATAACTTGTAGAATAGAGTACAATCATTTGTGCTATGTTTTTAATTTTCTAAAGCACCTTGATGACAGTGAGTGTTCAGTGGTGAAGCATCCTCTATTGAATCACCCTCAAAAAATTTTTTTGCCAAGTCCTAAGTTGATAGCTTAAAGTCAAAAGTAAAATTACAGTTTAAGTAGGACTTGGTGTAAAGAAATACCTTCTCCCCTTCCCCAAAGGGATACTGCAGTTATATCACATACCCAATAGGCACCACGATGAAGATCAGAGCTTATACCTAATTAAGGTTTTATACACACCAGTTCCCCAGTAAATGCAAATTTAACAAGAAAATTAGACATGTCATATGTTCAAAATGCTCATGGCAAACAATCATTTTGCATTCCTGCAAATAAAATTGTTTTATACTGTAAGCTGGAGGCGAGTGTAACTTATTTTTGTAATAAAGTTTTTATTTTTTTTATGTGTCATTAATATAAATGTGTGTTAGTATAGAAAATCTTCTGGTTTAAAAACTTAGAATTGCACACATTTCAGTATGTTCATTTGTACTTACATAATTCTAGAATAGTGGTTGCCAATAGCCTGTATGTTTCCCATTAATTGGTTTTTTTTTTTTTTTGTTACTTAATAAACCATTTTAGTATGTTGTATGTCAGTTACTGGGATAGCTGGGGCATAGAGTGTAATTTAAAATTTGTCAATAAGTATTCATTGGAATATATGTAAATGTGCCTTGCCGGTTACTGAAACTTACCTACAAAATGAGTATGGGGTGACAAAAATTTGTTCCTGGTGCTTAATGAAACTTTCTTCCACTGATTTTATATATTACCCTGTGCTTTTTAAAAGTACATCTCTCAAATGTATTAGTGTAAGTTTGAGGGCTACAACACAAAACATGTACATTTCATTCTAACATAGTGAGTATACTAGGTCGTGAAAAGTGGGTCAGTTAATTGTAGCCTTCAGCAAAATCAAATCTCAGTGTAATCCTTGGTGCTGGCACTTCCCATGTCCAAGGAGTAAAATGATCCTATATAAGAGGTCATTGCCATGCCTATTGGCACTTAACTGTCATACCATTTTTAACGGACACTGTCAAGGTCTTTTATTTAATTCATGGATTTATTTGTTGGGATGTTAGAACAGGTTTGTTTAACTTAACTGCATTGTTAAAGTTGAAAGATGAACACTTTTGTGAGTTCACAAATGTGTTCTTTAAGAATACATTAAAATATGGAGCTCTGTGGGTTTCTAAGACTTGACTTTTTTTAGTTTGGGGATATGGGACGAAACCTTATGATTCAAAGGAAATTGTGAAGAATTGATGGTTATATTTATGGGGAATGTAAACAGTGGTAATGAAACGTAGACTCAAGTGAATATACTTGACAGTGTTCATTTTAATGACTTTGAATTCAAGCCATTATAATTACTTTTAAAATTAAATATAATTTGCACTGTTCTGATAATGGGTGCAGTTTTTGAGCAATATAATCAGAGCTAAATATGCATGTAGTGATTAGTGATGTGAACAATTAAGTTCTGAGAAGAAATACTAACCGTGGTATTTTCAAACTTAAATTTCTGTAGAAAAATCAGTATCAAACACTTACCAGAAGTCAAGAAAAACAGGCAATGCATATAAACATAATTTTGAATGTTGTGTGGCCTATAAAGCAATAATGCA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