RCPedia: Genes

Summary

Gene Name	VAPA	Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr18) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie	Pan troglodytes
Full Name	VAMP associated protein A
Also known as	-
Coordinate	chr18:4979471-5022142
Strand	-
Gene summary	N/A

Retrocopy(s) from VAPA

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
VAPAP1	chr15:67757352-67758671	-	Intragenic	N/A	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_009433641.3
AGGAGCTCCCGGCCGGGGGCGCGCACGTAGGCACGCAGAGGCCGTCACGTGGGTCGCCGAGGATCGCAGTGCGCGTGGCCGTGGCGGCTGGTGTGGGGTTGAGTCAGTTGTGGGACCCGGAGCTGCTGACCCAGCGGGTGGCCCACCGAACCGGTGACACAGCGGCAGGCGTTAGGGCTCGGGAGCCGCGAGCCTGGCCTCGTCCTAGAGCTCGGCCGAgccgtcgccgccgtcgtcccccgcccccagtcagcaaaccgccgccgcgggcgcgcccccgcTCTGCGCTGTCTCTCCGATGGCGTCCGCCTCAGGGGCCATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGATCCGCCCACAGACCTCAAATTCAAAGGCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTAAATTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTGTGTTTCAAAGTGAAGACTACAGCACCTCGCCGGTACTGTGTGAGGCCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGGGTCAACTGTGACTGTTTCAGTAATGCTACAGCCCTTTGACTATGATCCGAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTTGCTCCACCAAACACTTCAGATATGGAAGCTGTGTGGAAAGAGGCAAAACCTGATGAATTAATGGATTCCAAATTGAGATGTGTATTTGAAATGCCCAATGAAAATGATAAATTGAATGACATGGAACCTAGCAAAGCTGTTCCACTGAATGCATCTAAGCAAGATGGACCTATGCCAAAACCACACAGTGTTTCACTTAATGATACCGAAACAAGGAAACTAATGGAAGAGTGTAAAAGACTTCAGGGAGAAATGATGAAGCTATCAGAAGAAAATCGGCACCTGAGAGATGAAGGTTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACATTCGGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCATCCTTCAGAGATAATGTCACCAGTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTCTTTCTAGGGAAATTCATCTTGTAGAGTGAAGCATGCAGAGTGCTGTTTCTTTTTTTTTTTTTCTCTTGACCAGAAAAAGATTTGTTTACCTACCATTTCATTGGTAGTATGGCCCACGGTGACCATTTTTTTGTGTGTACAGCTTCATATAGGCTTTGCCTTTAATGATCTCTTACGGTTAGAAAACACAATAAAAACAAACTGTTCGGCTACTGGACAGGTTGTATATTACCAGATCATCACTAGCAGATGTCAGTTGCACATTGAGTCCTTTATGAAATTCATAAATAAAGAATTGTTCTTTCTTTGTGGTTTTAATAAGAGTTCAAGAATTGTTCAGAGTCTTGTAAATGTTATTTTAATAATCCCTTTAAATTTTATCTGTTGCTGTTACCTCTTGAAATATGATTTATTTAGATTGCTAATCCCACTCATTCAGGAAATGCCAAGAGGTATTCCTTGGGGAAATGGTGCCTCTTACAGTGTAAATTTTTCCTCCTTTACCTTTGCTAATATCATGGCAGAATTTTTCTTATCCCTTGTGAGGCAGTTGTTGACTGAGTTTTTCATCCTTACAATCCTGTCCCATGGTATTTAACATAAAAAAAAATAAAACTGTTAACAGATTCTTGCTCGATAGCTTGTTTGTGTCTGTCGTGTTATTAGAGGGAACTCCACTATATATGGTCACTTGAAATTATGATGCAAAGGTTTCTCTTGCATTGAAACCCTCTTGGATATTACAGTATTTTTAATTGAAAGTCCTAATTCTGTTAAGGAAAGGAGTTGATTAAATTTTAAGGTACTACTGGTATTTTGGGAGATTATAATCAGTTTGTTTTCAAGATAATAGAAAATAAGGTCCATGAGAATAGAAGTTATGTGATTTCAGTGAGTTGATGTGTACAGCATGGCTGTGCTCCATCTGATTTACCCCATTCTTAAGTTCTGAGAGTATGTTCTCAAGGAAGATTTAACTCTCTTTGGTTTTAAATTACTTTTTAACCAGCCTAATAAATAAGTCTTACTACTTTTCATAATATTTCATAATAGTTAAAAGTAGGTGTTTTTTCGTGCTCAATTTGGCACTCAAAATAATGTTCATTATGGAAGTTTGGTAATACTGAGCAAACCTGTGGAATTTTCTTTATGAAAAATGATTTTAGCCTTTGCAAATGTTAACCATGTGAAACACATTTTCAGTATAAGTATGCGTTACAGGGTTTGATACTTTCCTGCACTTAGGTTTGTCCTATTCTTCATTTATTCATACTAGGATAGAAAATTTTGGAATCAGAAAATAGATCCAGTGTTTAGCTACATACAATCTAGTACAAGTGAATTTTTATTCTTAAACATAGGTGTTGGCTCTTTTTTTAAAAGATGCGCTCTACCTGAAAAGGAAATTGGATTTTAGAACTGGATGTGGTGCAGTGAAGTATTTTAGGCCCAGGTCTGTGTACACATTTTATAGAAGAATGAAGTACTCTGAAGTATTTTGGTTGCCTTTTCATTTCAACTGTGTTTTGAATTTGTCAGATCACACATATTGTGTTATTGGGCGCTGTGGTATCTTTTATAAAACCTCTTGCTTGTGTGCAAAAGTTCCTAAAAGGAAACACAAGTAATGCCTATCCATTACTAGCATGCTATGCTGCATGCTTTACTGCCATTGCTGTATGCTTTACTGTCTTTGTAAAAATCCCCCCCTCCCCTTTTCTGGTAACTGGAAAAGCATGCTAAAAATAGTCTTATATTTTCACCCCATAAGTGCAGAATCAGTAATTCCTTGGCTTAAAGCTCTTATATAATCAATATTATTGGTGGTAAATACCAAGTTTGGTGTATCATAGCTATCTTTTTTTAAAGAAATTAAGTTCTTGAAAATTTAGCCAAATCCCGTTTTATGggaatgctctttagaattcattttgttcagcccctttgttctatggttgagaaatctgaggccttacgaaggttaagagaactttccccgtgtctcacaggtaggtagaggcagagctggaactggatatctggtctgttgactctagctcagtgtcttctGGTAACTGTTGAAAATTGTCTTAGTTTGAGAGATGGCTGAAATAATGAACATAAAATGCTATTTATAATAACAAGTATATGTGAAATTTCTTATTGTAAGACTACTACCGGCTTACTGTTAAATAGTTTGGTTATAGTGTTTAGGCTAGACATGCCTCCCACATTGGTAATAAATAAACATTACAAAATACAATGTATTTTTAGGTAGGCATTTTATAAAATGCATTATGCCATGGTTGCTTTTGAGATAGATTGTAGTCTGGGTAGCATCTTTAAAACGTATGTGGGCTTAACTGTTGTTCATATCAGGAGATGCTCTGATTGTATAGGTGAGACTCTGTTTCTGTTATTTTTAATTGCTGTATGAAATGTGATCAGATTATTTTACTACCAACAGTTATAGTTTGAAAGTCCAACTGTATTAATTGACTGATAATATGATAATATAGAGATTAAATTGTTTGTCTTCATTCCTTA