Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name PAICS
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Pan troglodytes
Full Name phosphoribosylaminoimidazole carboxylase and phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase
Also known as -
Coordinate chr4:72428701-72454300
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PAICS

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PAICSP2 chr7:140525583-140527346 - Intergenic
N/A UCSC
PAICSP4 chr8:4727302-4728791 + Intragenic
N/A UCSC
PAICSP6 chr9:63779347-63780545 + Intergenic
N/A UCSC
PAICSP7 chrX:90115862-90116718 - Intergenic
N/A UCSC
PAICSP1 chr6:70758414-70760035 + Intragenic
N/A UCSC
PAICSP3 chr7:144423092-144423514 - Intragenic
N/A UCSC
PAICSP5 chr9:37828014-37829419 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_001140440.4
TCCCCTAAGAGCTGCCTGGAGAGCTGTATTTGCTGCACGTGGAAATCTCCGTTATTTTCCAGCACCCAACACTAGCGTAATGGGAGTAACGGACTTAACCTCATTTCTCTTTCAGAGCATTTAGCCTTCATATGCCCTTCCCTGCATGCTTCCCCCAGGCCGTCAAGACTTGGTACGCTCCAACTTCTGAGCCGCTCCCGCAGCCGAGAAGGGGCCGGGAGTTCTGCCTCGCTTCCCGGCGCGGTCGCAGCCCTCAGCCCACTCAGGATAATGGCGACAGCTGAGGTACTGAACATTGGTAAAAAATTGTATGAGGGTAAAACAAAAGAAGTCTACGAATTGTTAGATAGTCCAGGAAAAGTCCTCCTGCAGTCCAAGGACCAGATTACAGCAGGAAATGCAGCTAGAAAAAACCACCTGGAAGGAAAAGCTGCAATCTCAAATAAAATCACCAGTTGTATTTTTCGGTTATTACAGGAAGCAGGTATTAAAACTGCCTTCACCAGAAAATGTGGGGAGACAGCTTTCATTGCACCCCAGTGTGAAATGATTCCAATTGAATGGGTTTGCAGAAGAATAGCAACTGGTTCTTTTCTCAAAAGAAATCCTGGTGTCAAGGAAGGATATAAGTTTTACCCACCTAAAGTGGAGTTGTTTTTCAAGGATGATGCCAATAATGACCCACAGTGGTCTGAGGAACAGCTGATTGCTGCAAAATTTTGCTTTGCTGGACTTGTTATAGGCCAGACTGAAGTGGATATCATGAGTCATGCTACACAGGCTATATTTGAAATACTGGAGAAATCCTGGTTGCCCCAGAATTGTACACTGGTTGATATGAAGATTGAATTTGGTGTTGATGTAACCACCAAAGAAATTGTTCTTGCTGATGTTATTGACAATGATTCCTGGAGACTCTGGCCATCAGGAGATCGAAGCCAACAGAAAGACAAACAGTCTTATCGGGACCTCAAAGAAGTAACTCCTGAAGGGCTCCAAATGGTAAAGAAAAACTTTGAGTGGGTTGCAGAGAGAGTAGAGTTGCTTTTGAAATCAGAAAGTCAGTGCAGGGTTGTAGTGTTGATGGGCTCTACTTCTGATCTTGGTCACTGTGAAAAAATCAAGAAGGCCTGTGGAAGTTTTGGCATTCCATGTGAACTTCGAGTAACATCTGCACATAAAGGACCAGATGAAACTCTGAGGATTAAAGCTGAGTATGAAGGGGATGGCATTCCTACTGTATTTGTGGCAGTGGCAGGCAGAAGTAATGGTTTGGGACCAGTGATGTCTGGGAACACTGCATATCCAGTTATCAGCTGTCCTCCCCTCACACCAGACTGGGGAGCTCAGGATGTGTGGTCTTCTCTTCGACTACCCAGTGGTCTTGGCTGTTCAACCATACTTTCTCCAGAAGGATCAGCTCAATTTGCTGCTCAGATATTTGGGTTAAGCAACCATTTGGTATGGAGCAAACTGCGAGCAAGCATTTTGAACACATGGATTTCCTTGAAGCAGGCTGACAAGAAAATCAGAGAATGTAATTTATAAGAAAGAATGCCATTGAATTTTTTAGGGGAAAAACTACAAATTTCTAATTTAGCTGAAGGAAAATCAAGTAAGATGAAAAGGTAATTTTAAATTAGAGAACACAAATAAAATGTATTAGTGAATAAATGCTTCTCTAGAGCCATATTAATAAATATGAACATCTAACCCCTCCTTTCTTAGGCTAGACCCCAAGATATTTCAGCCAGCCTTTATCATTCCTCTTACTTTATCCTTTTTCCTTAAGTATTGGTGGTCACTACTATTGAGTTTCTTCCTTAACACTGATTAAATGATCTTAACTCCCTCAGCTAAAACTGGCATTACtgactcccagctatatttctccagacttgcattttttttttttttttttttttttttgagacagggtctcactgtcgcccaggctggagtgcagtggcatgatctcagttcactgctgctttccctcctgggctcaagcagttctcccacctcagcctctcgactaacagggactataatcttgcagcaccatgctgagctaattttattttttgtagagatgagctctcactatgtcacccaggttcgtctcaaactcctgaacccaagtaattctcctatctcagcctcccaaagtgctagggttacagacatgagccactgtgcctgtctagacttgtactttcaactgtccatttctccctgtctgtcccatgggcactcataaaaaaacagaatgctcccaactttattcatcttccaagcctgtaactcttggtatactcactgttgcaagtcagaagcttgatttcatcattgatgtttttctcacgtttcacatctcactcatcaccaagtcatgttggtgttaatttctgattaacccttgaatttaccgtcttctcatcctctgtacAAAAGCCTCAAGGGAGGGTCAAATTCAACATTATCCTGATCTAGACAGCCCCCATTCTCAATCCACCCTTTTCCAAGTTGATTGCCCAAGGACTTGTAACAATAAACTctcttttgcaccacagacttctttgaaaatatacatgctgttgaccctctctgtagaaaaccacacacataaaacttaccaacagatttcattggttcttgggttctcccgaagcctatccatggtttatagattaagaaTTGATGAGGTAgctgggcacagtggctcacacctacgatcacagcacttcgggaggctgaagcaagcagatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccagccgtgatgacaggcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcatgagaattgcttgaacccgggaggcggaggttgcagtgagcctagatcatgccactgcactccaacctgggcagcagagcaagactctgtctcaaaaggggaaaaaaaaaaTTGCTGATGTGACCCATGAAGGGAACTCATTTTCCTCGTAATTTTGGACTGCCACACATTGGTACCTTTAGTTCTCTGAAGGCCCACGTTTTTATCATTAAGACCTATTTGTTAGCTAGTAGAGCTTTATGTTCACTGTCCATGAAACCTTCTGTAACCACAGTGACAAGTAGTTCTTTCTCTATTGAATTATTAGGTCCAGAATAGAAGATGTCATTGTACACTTTATTTCCCTCACACTGTGTTACGCTCTGATGTGCTATGCTTAGCTATCTGTCAGAGATTAGTAAATTATAAAACTCATGTGTACTACTTAAGTTTATATCTTATGCTAGTTTATAAGAACAATTAAAAGGACTTAGAAGATTAA
>XM_001140521.5
ACGGATGCTGTAGGGTGGAGCTAGCCTTCCCCTAAGAGCTGCCTGGAGAGCTGTATTTGCTGCACGTGGAAATCTCCGTTATTTTCCAGCACCCAACACTAGCGTAATGGGAGTAACGGACTTAACCTCATTTCTCTTTCAGAGCATTTAGCCTTCATATGCCCTTCCCTGCATGCTTCCCCCAGGCCGTCAAGACTTGAGTTCTGCCTCGCTTCCCGGCGCGGTCGCAGCCCTCAGCCCACTCAGGATAATGGCGACAGCTGAGGTACTGAACATTGGTAAAAAATTGTATGAGGGTAAAACAAAAGAAGTCTACGAATTGTTAGATAGTCCAGGAAAAGTCCTCCTGCAGTCCAAGGACCAGATTACAGCAGGAAATGCAGCTAGAAAAAACCACCTGGAAGGAAAAGCTGCAATCTCAAATAAAATCACCAGTTGTATTTTTCGGTTATTACAGGAAGCAGGTATTAAAACTGCCTTCACCAGAAAATGTGGGGAGACAGCTTTCATTGCACCCCAGTGTGAAATGATTCCAATTGAATGGGTTTGCAGAAGAATAGCAACTGGTTCTTTTCTCAAAAGAAATCCTGGTGTCAAGGAAGGATATAAGTTTTACCCACCTAAAGTGGAGTTGTTTTTCAAGGATGATGCCAATAATGACCCACAGTGGTCTGAGGAACAGCTGATTGCTGCAAAATTTTGCTTTGCTGGACTTGTTATAGGCCAGACTGAAGTGGATATCATGAGTCATGCTACACAGGCTATATTTGAAATACTGGAGAAATCCTGGTTGCCCCAGAATTGTACACTGGTTGATATGAAGATTGAATTTGGTGTTGATGTAACCACCAAAGAAATTGTTCTTGCTGATGTTATTGACAATGATTCCTGGAGACTCTGGCCATCAGGAGATCGAAGCCAACAGAAAGACAAACAGTCTTATCGGGACCTCAAAGAAGTAACTCCTGAAGGGCTCCAAATGGTAAAGAAAAACTTTGAGTGGGTTGCAGAGAGAGTAGAGTTGCTTTTGAAATCAGAAAGTCAGTGCAGGGTTGTAGTGTTGATGGGCTCTACTTCTGATCTTGGTCACTGTGAAAAAATCAAGAAGGCCTGTGGAAGTTTTGGCATTCCATGTGAACTTCGAGTAACATCTGCACATAAAGGACCAGATGAAACTCTGAGGATTAAAGCTGAGTATGAAGGGGATGGCATTCCTACTGTATTTGTGGCAGTGGCAGGCAGAAGTAATGGTTTGGGACCAGTGATGTCTGGGAACACTGCATATCCAGTTATCAGCTGTCCTCCCCTCACACCAGACTGGGGAGCTCAGGATGTGTGGTCTTCTCTTCGACTACCCAGTGGTCTTGGCTGTTCAACCATACTTTCTCCAGAAGGATCAGCTCAATTTGCTGCTCAGATATTTGGGTTAAGCAACCATTTGGTATGGAGCAAACTGCGAGCAAGCATTTTGAACACATGGATTTCCTTGAAGCAGGCTGACAAGAAAATCAGAGAATGTAATTTATAAGAAAGAATGCCATTGAATTTTTTAGGGGAAAAACTACAAATTTCTAATTTAGCTGAAGGAAAATCAAGTAAGATGAAAAGGTAATTTTAAATTAGAGAACACAAATAAAATGTATTAGTGAATAAATGCTTCTCTAGAGCCATATTAATAAATATGAACATCTAACCCCTCCTTTCTTAGGCTAGACCCCAAGATATTTCAGCCAGCCTTTATCATTCCTCTTACTTTATCCTTTTTCCTTAAGTATTGGTGGTCACTACTATTGAGTTTCTTCCTTAACACTGATTAAATGATCTTAACTCCCTCAGCTAAAACTGGCATTACtgactcccagctatatttctccagacttgcattttttttttttttttttttttttttgagacagggtctcactgtcgcccaggctggagtgcagtggcatgatctcagttcactgctgctttccctcctgggctcaagcagttctcccacctcagcctctcgactaacagggactataatcttgcagcaccatgctgagctaattttattttttgtagagatgagctctcactatgtcacccaggttcgtctcaaactcctgaacccaagtaattctcctatctcagcctcccaaagtgctagggttacagacatgagccactgtgcctgtctagacttgtactttcaactgtccatttctccctgtctgtcccatgggcactcataaaaaaacagaatgctcccaactttattcatcttccaagcctgtaactcttggtatactcactgttgcaagtcagaagcttgatttcatcattgatgtttttctcacgtttcacatctcactcatcaccaagtcatgttggtgttaatttctgattaacccttgaatttaccgtcttctcatcctctgtacAAAAGCCTCAAGGGAGGGTCAAATTCAACATTATCCTGATCTAGACAGCCCCCATTCTCAATCCACCCTTTTCCAAGTTGATTGCCCAAGGACTTGTAACAATAAACTctcttttgcaccacagacttctttgaaaatatacatgctgttgaccctctctgtagaaaaccacacacataaaacttaccaacagatttcattggttcttgggttctcccgaagcctatccatggtttatagattaagaaTTGATGAGGTAgctgggcacagtggctcacacctacgatcacagcacttcgggaggctgaagcaagcagatcacttgaggtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagccagccgtgatgacaggcacctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcatgagaattgcttgaacccgggaggcggaggttgcagtgagcctagatcatgccactgcactccaacctgggcagcagagcaagactctgtctcaaaaggggaaaaaaaaaaTTGCTGATGTGACCCATGAAGGGAACTCATTTTCCTCGTAATTTTGGACTGCCACACATTGGTACCTTTAGTTCTCTGAAGGCCCACGTTTTTATCATTAAGACCTATTTGTTAGCTAGTAGAGCTTTATGTTCACTGTCCATGAAACCTTCTGTAACCACAGTGACAAGTAGTTCTTTCTCTATTGAATTATTAGGTCCAGAATAGAAGATGTCATTGTACACTTTATTTCCCTCACACTGTGTTACGCTCTGATGTGCTATGCTTAGCTATCTGTCAGAGATTAGTAAATTATAAAACTCATGTGTACTACTTAAGTTTATATCTTATGCTAGTTTATAAGAACAATTAAAAGGACTTAGAAGATTAA