Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name PGGT1B
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Pan troglodytes
Full Name protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta
Also known as -
Coordinate chr5:93318008-93380738
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PGGT1B

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PGGT1BP1 chr10:42178587-42187311 + Intergenic
 N/A UCSC
PGGT1BP2 chr10:75603168-75609529 + Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_526978.6
CGCTTCCGGAGCAGCATGGCGGCCACTGACGACGAGAGGCTAGCAGGGAGCGGTGAGGGAGAGCGGCTGGATTTCTTACGGGATCGGCACGTGCGATTTTTCCAGCGCTGCCTCCAGGTTTTGCCGGAGCGCTATTCTTCACTCGAGACAAGCAGGTTGACAATTGCATTTTTTGCACTCTCCGGGCTGGATATGTTGGATTCCTTAGATGTGGTGAACAAAGATGATATAATAGAGTGGATTTACTCCCTGCAGGTCCTTCCCACAGAAGACAGATCAAATCTAAATCGCTGTGGTTTCCGAGGCTCTTCATACCTGGGTATTCCGTTCAATCCATCAAAGGCTCCTGGAACAGCTCATCCTTATGATAGTGGCCACATTGCAATGACCTACACTGGCCTCTCATGCTTAGTTATTCTTGGAGACGACTTAAGCCGAGTAAATAAAGAAGCTTGCTTAGCGGGCTTGAGAGCCCTTCAGCTGGAAGATGGGAGTTTTTGTGCAGTACCTGAAGGCAGTGAAAATGACATGCGATTTGTGTACTGTGCTTCCTGTATTTGCTATATGCTCAACAACTGGTCAGGCATGGATATGAAAAAAGCCATCACCTATATTAGAAGGAGTATGTCCTATGACAATGGACTGGCACAGGGAGCTGGACTTGAATCTCATGGAGGATCAACTTTTTGTGGCATTGCCTCCCTATGTCTGATGGGTAAACTAGAAGAAGTTTTTTCAGAAAAAGAATTGAACAGGATAAAGAGGTGGTGTATAATGAGGCAACAAAATGGTTATCATGGAAGACCTAATAAGCCTGTAGACACCTGTTATTCTTTTTGGGTGGGAGCAACTCTGAAGCTTCTAAAAATTTTCCAATACACTAACTTTGAGAAAAATAGAAATTACATCTTATCAACTCAAGATCGCCTTGTAGGGGGATTTGCCAAGTGGCCAGACAGTCATCCAGATGCTTTGCATGCATACTTTGGGATCTGTGGCCTGTCACTAATGGAGGAAAGTGGAATTTGTAAAGTTCATCCTGCTCTGAATGTAAGCACACGGACTTCTGAACGCCTTCTAGATCTCCATCAAAGCTGGAAAACCAAGGACTCTAAACAATGCTCAGAGAATGTACATATCTCCACATGACTGATTTTAGATTGGGAGGGTGGGGGGATTTGTAGCATAACTGTAGCTCAAGTTTAAAAGCCATGTATAACCAAGTGTGCTCTTTTTTTAAAAGGTAGAGTCTTAAAATCAAATCTCCTGCTGATGTCACTTTGGGATATGGTCTTGAGCCAGTAATCTTTATACTGGGTTTCAAGAAAATCTTTGTTGAAGTTTGAACCACAACTTTGTCGTGGTTCTTAAATGTTTATACTGTATTTCTAAGAAGTTGTTTGAGGCAAATTAACTGTATGTGTGTAGGTTATCTTTTTAAAAACTCTTCAGTGCAAATTGTATCTTATTATAAAATGGACACAAATTTTCAAGTTTACACTTCATATAGCATTGATAATCTTCAGGTGAACACTTAGTGATCATTTAAAAAGCTCACTGCTGATCGTAGAAAATTTGCTTTAATTAATTAAGTATCTGGGATTATTCTTTGAAAACAGATGACCATAATTTTTTTTAAAGAAGAGTGACTTATTTTGTCTTATTCTTAAGTAAAGTGTGCCAATTAAACCTGTGTGGCCTATATAAATGAAGTTAATAACTTCATAGTAAGAATAAATAGGTTTAACTAATGTGATAGTTTTCTAAAAGGAGATTGTTTGAAGACAACTATTATGTAACTGAGGGAAAAGCAACTTAACTGTATGTGATTGTGAATGAGAAAGTTTTGTGCTATGTGGGTCATTTATTTAGACATTGCTGTGGTGAATACCAGTTATGTTTGATTTTATTCTCAAATCATTAGTTGCCtttttttttttttttttttttttGCTTTCTAGGGAGAAAACAATCTTTTTTATCTAGAAGGAAAGATACTTTGTGTTTTCATTTTTAGCCATTTGAATTTTTTAATTTGTTGCCCCCAGTGTGTTAGCTGCTCTAATTTCAAACTAATACTTTTCTAATTTTTTTCAAATTAAATAAGTAAAAAATACAAAAACAGAACCATTCAAACAGATTCAGTGGTGTAACTCAATACATGGTCATCTTTATTCTCATATTTTCAGGTAAGTGAAAGGGAAATGCGACCATTTAGAGGGTAAGAAATAGGGTTTTGTTTTTGTTCATTGTTTTGTTTTAAGTCTATGAACTAGCTAATTATAAAGGAGGTAGTATAAAAACTCTTCATTAGTAATTAATTTATCAATAACTCATATCCATTACTTGCTCAGTGACATTCAGAACTATTGCGTCTAGTACTGAAATGGGGAAAGAAATCTCTTCACTAAAGGAGTTGGCTTTAAGTTAGTCTTGGTGATAATAAATGTTGAAATACAAGTATCAGTATAGAAACTGGATTACTGGTATCACTGTTTAGGCATTGTAATACTTTAAATGTTATCTTTTTTTCTAAATCAGAGGAAAAAAATGTTGTGAAATAACAGTCCTTCCCAAGGGAAACACTATGTACTTGGAGAAATGATTGATTTATTATTGGCATGCTTAGTTTTAAACCTGAGTTTGCCAACTGTATGTTTTTTAATTAGAAATAAAATAAATCTTCTGATGGTGGGGGAAAAAGTAAGCTTAATAACAGATGTTATCCGTCTATGGGTTATTCCAGTTGCTACTATTTAAATCCTGGCAGATTAAGACATCCATATCTCAAACTAAGTCATCTCTTAGACATTGGAAGTTAAAGTAGCATATATATAATGGCTTTAGGACTATATAAAAAGCCCAAATTGTTTTTTCTGTATCACCAAGAAAGGTTAGAAGGCAATAAAGGTAGTAACAGTGACTTTATTCATAAATGTTAGAGAAAAATTCCAATCTAAAAGTATTTCATAAGGCTAAATATTTTCTAACTCCTTATAATTTAATACCATAAGATTATAAATTTTAGTATGCTTCTAATTGATACACTTGTGGGAGACTTTCTTGTGAAACTTTATGGACTAGTAAATGTTCACATTCCACAGCAACTGAATTGACCAGAAAATAGCAGGCCAGTGTGAATTGTGGAGAAACTATTTCTAACTTTTCTAAATAGTTATTTACAAGAAAAGTATTTATTGATTAAATAAATTATAAGCAATATTTCACATATACACTTTATTCCTTAACAGGAGCGATGTAATGAGGGAAAATATGAAGTCTGAAATCTCAAAAAGCTCATTTTCCTACTCTATACTTGTCTCCTTCCTGCCCCCTAATTTTGTGGTATTTTTTTTTTTAGAAGGTAGCAGGAGGAGCTTTATTTTGAGCATCTGTGTACAAATGAGATTAATCAGATCATATGGCCTAATTTAACCTGtttatcatttcagtgtttttagatttgatctataatatatatgtgttattagatctttagttatttatatttaATCTAAATTCATATAGAAATCTTGCTGACAGTGGTATATAATTTGAAAACTGTTGGACCTGATCATTTTTgagagacagttaatgaggaggtgctctggaatcagatgacctgggtttaaatcccagatttgccagttcagcagcatgatcttggaccctaactctgccgtggataaaataagggtaaaacctaacacacagggtttaggattaaatgagataatacagataaagcacttaggatagtacctggaatacagcaaatttcaaATTATAGGTTCTTTATAATGATCATAAAATTATTTTTGTAATTAAAACCTCTCTTCTACAACAGAAAGAGGTCTTAACAGTTTAACCTCAGGGAAAATGATGACAACAGTGTTGTTTTCTTatctccccataagaatacagagcaactaggatagccacagacactattacaacgctagatgacaaggtatctctatgaacttcagaatacaactaagtgaggacaaaccactgaaccacatagtttcagtatctgtgggaggaagtagaaggaaggcagctggtttctgacagctctgcaaattggagaactacaacactgcccacagtttctcactacaaagtgcagcgggccaatctaagaacagacactgaaactgggaagtgactacagaatctcatttgcagatgaatgttaaagcaatatgataaggtctgctgattgcattagagcagtctgggttttacgctgtgtacctcttgaagcttatgagacaaagcccagcactgaggacaaacttctagaattagaatccaaatgggcaggatgggtaaaataggacaaaagaaagacgatctagataagtattgggaagaaaggccaagacacagagacattatatatatatgtatattcatatatatatatatatattcatatatatatatatattcttttaaatcactgtgaaaatgggagctctaaggctgtgaagtcatcctagagccactccttcctcctaaaagtacagaaaaactcatttcagttaaggggaaaaaaagagtaactgagccaggattacagtccaactccagtcaaagttagtctaagaaataagagaataaatagatcaacatcctcacagacaatgaaagcacaccagaaggacatgaccacaagacagataaaaacctaatatttgccaaaaAATAAAATGCAAATATGACAGGAAATTTATAGTAATTAGTACAGTTATCAATAAAAGTAGGAAAAGGTGAAAATTAACCAAGTACCAAACACTTGGAGTAAaaagcaaaataaagcagaaggaaggaattaataaaagcaaaaaagaattactagtagaaaaccaaaacaatagaggcaataataaatccaagttggtgatgggtagtgcggggagttgagtcagataaactaccagctaacctatttaagaaaaaaaggaggaagcacaaatacaaaaatttaaatgacaagggggaaatagtaaaacaggaaatgtgtttaaattgactattttgagcaattttacacaataaattcaaaaactattttgagaaaaatgcaaattgccaaaatttactctaggtagataaagtcacaacaaaccaattaccgtagaagaaacaaatagttaaaagtaccccttaccaaaagaagcatcaagcccagattgtttcaaggggatttctaccaaaccttttaagattaaataatcccattcttgcttaaacaattgcagagactaggaaaagaatcttgaacctcaaagtgccaaaaaaaaaaaaaaaaacaaagaaagaaaaactcctaaattcattttataaaatgaatgtaatagcattgattcaaaaacctgacaaagattgtaccaaaaagaaaatatagagcaatctcatgaatattaataaaaagttttaatgataacattagcaaacaatccaacagcactttcaacaggtaatcatgactaagttgggtttattgtaagaatgcaagggtagttcaatactagataatctgttaatattcatattaagagttaaaaaatatcttcatctttgcagaaaagacatgatagaattgagcactcacttatgttaaatatactaagtagaaattgatgaataatctattaacattgtacctctacctaaaagccagcatcttaaatttcaaagcaaaagagactttccagctgaagtcaggaacaagacatgcccactaactcctctgctacttaacaatgtgttgagagttatagccaatgaagttagacaaaataaagacatgaattggaaaggaagaggtaaaactatttgcagatatgaatatgtatctagaaagcccaaaggaacttgttgaaaaactaaacaataaaagaacttagtaaagtagctattaaatacaatttacatacaaatatcaGTAGGCTTCAccagacacaagtgcatactttgattccatttcggtgaagttcaaaacatacagcatctatgtatggtgtcagaaatcagcaccctctttcagtcactacctctcttcccaaaggtaagtgctatcaaaattaccatcaattagttttgtctgtttttgaattttataagagtggaaccatatagtatacattatttttcaactggcttTAACTCAgtaggactgaaagagggtacaagggagactctgcggtgctggtaatgttctgtttcatgatctaggtgctggttacgtaggtgcattcaccttatgaatatttatcaagctgtatatgatttgtgcacttttctgtatgtataattatagctcaataaaaatgtttactaaaaaGA