RCPedia: Genes

Summary

Gene Name	RGD1566359	Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr17) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie	Rattus norvegicus
Full Name	similar to RIKEN cDNA B230219D22
Also known as	-
Coordinate	chr17:9454121-9464076
Strand	-
Gene summary	Orthologous to human C5orf24 (chromosome 5 open reading frame 24). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from RGD1566359

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
RGD1566359P1	chr1:173230991-173232748	-	Intergenic	N/A	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_003751644.4
GGCGGGCGTGCGCCTGCGCCTGCGCGAGCGGCGCTCACATTCCGGGGCTGTGGCGGTCTCTTCCTCCCGCGTCCGGGGCCCGCGGTGAGGGCTCTTGGGAGTCGGGCGCTGGCGTGGGCCTcgccgccgccgccgccggccctctgccgTGACTGGACTGGGCCGCACGGAGAGGGCGCGGCCGGACTGAACGGAACGGGCGGGGGCTTTCCTGCCTATGGGCGGCCCCTGGGCGCTCTGAGGGCCGGGCTCCGAGCGGCCGAGGAAATGATGCACCCGGTTGCAGGCGGGAACCCAGCGTTCTGCGGGCCTGGCAAGCCTCCCTGCCTCAGTGATGACGCCGCCATGAGAGCCGCTGATCAGTTTGATCTGTACTCCTCCCAGCAAAGCAAGTACAGCCACACAGTCAGCCACAAACCCATGCTCTGTCAGAGGCAAGACCCATTAAACGAAGCACACTTGCAGCCTACCAGTGGCAGAAACACAGAGATAAAAGATGAACTAAAGAAAAAGAAAAACCTCAATCGATCTGGTAAGCGAGGCCGGCCTTCGGGAACCACCAAGTCAGCAGGATACCGGACCAGCACAGGCAGACCCCTGGGAACCACCAAAGCAGCTGGATTTAAGACCAGTCCAGGCAGGCCTCTGGGTACAACCAAAGCTGCAGGATACAAAGTCAGCCCAGGCAGGCCTCCAGGTAGCATTAAAGCTCTGTCCCGTCTTGCAGATCTTGGTTATGGCTGTGGCACTGCTGCCTTTCCTTACCCTATGATGCACAGTAGAGTGGTTCACGGGGTTCAGGAAACGAGTGGTGAGGTCAAGCCACCCAGTGAATGAGCGAGACAGGAGAGCACGTGCTAGGAGCAAATTGTTAGTCACCCCAAAGCTTCTTGCTTTAATTTGACATAATCATACCACGTGGACTCCCCAGTTCTGTTTCTGTTTGCTTTCCCTCACCCCGCACTTCTTTTTCTTTCTTTTTAGCTCAGAAGCTGCCACAATTGAGAGGTGCACTTTGGGCAGGAGTAGTACATTGTGTCTGTGTTGTACACGGTTCACAGGACAGGACACTCAGCTCAGTCGTCTATGCTTTCCCTTTGGGCTGTTCTAAGTGGACTCCTTTTACTTGTGAGTAATCCAGAGCGAGGCACTGTAACTGAAGCGGGGAGCAGCAACTAGTGAGCAGATGGGCGGGGAAGGCTGTGAAATAAGACACAGCTCTCTGGATGCTTTGGAACTTAAAACACAGCTTCTTCTTTATTGATTCGCATGGCATTAGTGATCATCATTCCTAAAGCACTGTGCAGTGTCTGCCTCGAAGAGAGCATAGTTACAGGGTGTGTGTTTTCAGTTGCCTAAGAGCATATGCACCAAACACTACAAACAGCTCAAACCCTTGAGTACGTCAGAAACCTGCACAGCATATTTAATATACAAGAAAAAAGAACCCTTAGAAGTCTGCATGTAACTATAGTCATTCTGTTTTGTGTTTCATATACTTAGTATTATATTTTAAAACATTTATTACTATTGTTCATTTATTTAAAAAAATTTTTTTTTTTTTAGTTTTTCTGCGTAATTGTTATTACACTTCATTAGTACTTAATTGCATTTTCAGGTTTATACCTACCAAAGGACACAAATTGAGTGGTCAACTGCAAAATTGGTCTAAGCAGGAAGCAGTGTCCTGGCTGTCAGGACCCAAATACCAATAAATGTAACTTGGTATGCGCGAAACCTGTGAAATGAGCGCTGGGTAGCATAAAAATGGCAGCATGGCTCCAGGATGACCGTTTCTTCCAAAAGAAGGCTCCCTGGTGCGGCTTGCTTTAGACACAGTGTAGAAAAGTCAAGTACTGGGCATGAAGGTATACTCATTTAGGGTAATCTTTGGAAATGTTTCCTGTTAATACACATTTTATTTATTTTGAATTTGTTCTGAGTAAACTGTTATAAACTTTAAGATTGAAAAGCTTTCCGTGGgtcaggtatggaggcccaggaatttgattccagcatttgggaggctgaggcaggcagagctctgagtgtgtgaggtctacatagtgccaggacagccaatgctaggtagagagaccctatctttaaaaaaacaaCAAAGAAAAGCTTTTACTGAACTTAAAAAATTATGTTTTTTACTTGCATTTTAAATGCTTTTGAGAATAAAATGTAGATTTAAAGGACTTAAAAACTTTAAAAATAATCAGAAATTTAAAAGGGACACACGTACTGGTTGGTTAGGCTTGCTCTCAGTCCATGCAAACTGACTGTATGTAAATACCATGTTTCAGACCTCTGTCGGGGGACAAGCAGCAAATCTCAGGTGCCCCATGATAGCTGACACAACAGCTGGGCATCCGCTCCTGCAGTAGTACGTGCTTTATTATGTGTGGAGACTGTAACCTCAGCAGTACCAGCTTCGCACAAACCACAGGGGACAGTGAGCAATGCTGGACGACCACTGAACCAGCCTAGAATATAAAACTGAATGACTTATTCAGAACAGTGTAACTTCTGGCACATGCAGATGCTTGTCTTCATTGGCGTGTTCATCTGTCACGTAGCTGTTTCTGAAGTTGTTCAGCAGCTGGCTGTTGAGAATTCCTTGCAAGGCTAGTTCCTGAGGACAGTTGAAATAGTCTAGTCTAGAATGTCAAGGACTTGGGTGCATGTTGTGTTTCCTCATGAGTCTACATGGCATCCTTTCAGTTTGATTTCCTTCCTGATTTTCTACCTTGTCATTTCTTCTTGCCCTTTCCCACACCTATCCCCTTCCCTCAGCTCTCCAGCACATCTACTCAGTGGTGCTGTGCTGTGTGTCAGAAGATAGAGTGGGTGGCTTGTATATGTTGATGACAGTGTTTGTATTAGGAGCTTGATCCCAGGAACAGGGGTGGATGGATGGATGGCTACAGTTGTGAGTGGATGACGTCACTTAGGAAACTGCGAGCAGCACTTGGGATATGAAATGTGTGCACTGGTGAACACCTGATTCTACTTTTCTCCCTGTGGACAGTTTACCAGTGCCACGTTGGAGAGGCACGGTGAGGACAGGAAGGAAGTCTTCACATAAAAATATTTTTGCTTCTACATGATCTAAAGACTGCATTCTGCATCTTTTGTAACATGGTCCTTTGTCATGACAGACACTGAAATAGCATGTGAAACATTGCCTAGATGCCAGTATATTCAGTCGGGGAAAACTGTTGTCCCCTACCCCCACCCCACTGTATAATTGTTCCTTAAAAGGTAAATTGCTAATTTTATACTGTGTGATTCTATTCTTCATAAATAGGTTTCACTATTCTATATTAAACTTTGTCAGAAAATGATCTACTATTCAAGTAAGTTTGTTTTACTTTTTTCTGAAAAGGATATTTTACATGCCTTATTTATTATTGTTATCAAAACAAATAAGGGGTCAATACAGATGAAAATTTCACTTTCCACAGCTATCACCTTGCCTAATTAATCTTTAGTATGGGGTGATTTTGATACTATCTTTGGAGTTTTGCACTGGATATTTAAAAATATATATTGGCACAATATATTGAAAAATTAAATAGTATTTGGTTTAATTTTTAATATTTGAAACATTTTTTAATTAGTGTTTAAATCAGACTAACAATTCTTTGTATTTTTAATTACTTTTTTAAAAGGGACATCTGAAAAGTGGTATTTATTCATTCCAAACTGGTGTTTGTGTGAATTTACATATATTTTCATGAAATATGAGTAGGATTTCTTTGAGGTAAAATCTGGATCCATTTATTATCAGGTTAAAGACGCTTCATCCAGTGTAATAATAACCACAGTGTGTAAGTTTAAATGGTGAACTTCTTCATGCTTTAAGAAGCTTTAAGAGAACAGTTCAGGGGATACTAAGATGATTGCTCTGTCAGTTCCTTGTCTATATGCAGTAAAACTTTATGATCCGTTACAGCAGTGTAACAGTTCACAACAGTCTTGGGCATAAAAAGTTTTGATGCTCTTTTAATCTGTCTGTTCTAGCATAATGACTGCGTTCAAACTCTTAAGATGTATCTAAATATTTGCTTTTCTCCCTTTTCCTTCCAAGTAGACAGACCTGTGCTCTCACATACAATGTATTTAAGTTTTTAGAAGTGATGCTGTAGTAAGTCAGTCGTGTGATTTAATCAGGCCACTCTTGATTCTTTGATTCACAGTTTCCTTTTTCCACAGACAATTATGAGAAACAATTACCAGTTAACTGATAATAAGCACGTTGTCCTCTGCTGTAAAAAGTCTGAATAGATACTGTGTATGTTTCCATGTCCATGAACTTAAGCTACTCGTGTGCAGTTATGTGTATGGAATGGAGTAGTGTTCATGATTTGTATCTACATCATCATATGGATGTATATTTATTAATAAAGTCATCACTTTAAAACCA