Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Stt3a
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit A
Also known as Itm1|RGD1565793
Coordinate chr8:39204218-39243751
Strand -
Gene summary Predicted to enable dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity. Predicted to be involved in co-translational protein modification and protein N-linked glycosylation via asparagine. Predicted to be located in membrane. Predicted to be part of oligosaccharyltransferase III complex. Human ortholog(s) of this gene implicated in congenital disorder of glycosylation Iw. Orthologous to human STT3A (STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit A). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Stt3a

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Stt3aP1 chr15:9390353-9390548 - Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001134749.1
GGTGCGCCGCTGAACGGATGGCAGGGGGAGCAGAGTGGGTTCCGGAGGAGCATCCGTGGGGTATTTGAATATAGTCAGTTGCTACCCTTTGATGTCAAGATGACTAAGCTTGGATTTTTGCGATTGTCCTATGAGAAGCAGGACACACTTCTAAAGCTCCTCATCCTGTCGATGGCTGCTGTGTTATCTTTTTCTACTCGTCTTTTTGCTGTGCTCAGATTTGAAAGTGTCATCCATGAGTTCGATCCGTACTTTAATTATCGGACTACCCGGTTTCTGGCTGAGGAGGGGTTTTATAAATTCCATAACTGGTTTGATGACCGGGCTTGGTACCCTTTGGGCCGAATCATTGGAGGAACAATTTACCCAGGCTTAATGATCACTTCTGCTGCAATCTACCATGTACTCCATTTCTTCCATATCACCATTGACATTCGGAATGTCTGTGTTTTCCTGGCCCCTCTTTTCTCCTCCTTCACCACCATCGTTACGTACCACCTTACCAAAGAGCTCAAGGACGCAGGAGCTGGGCTTCTTGCTGCTGCCATGATTGCTGTAGTTCCCGGGTATATTTCTCGATCTGTAGCTGGCTCCTATGATAATGAAGGAATTGCTATCTTTTGCATGCTGCTTACTTACTACATGTGGATCAAGGCAGTGAAGACTGGTTCCATCTATTGGGCTGCCAAGTGTGCTCTTGCTTATTTCTACATGGTCTCGTCATGGGGAGGCTATGTGTTCCTGATCAACTTGATCCCTCTTCACGTCCTGGTGCTAATGCTCACAGGCCGTTTTTCTCACCGGATCTACGTAGCCTACTGTACTGTGTACTGCCTGGGGACCATTCTTTCCATGCAGATCTCCTTTGTTGGATTCCAGCCTGTCCTCTCATCAGAACACATGGCGGCCTTTGGAGTGTTTGGTCTGTGTCAGATCCATGCTTTTGTAGATTACCTGCGCAGCAAGTTGAATCCACAGCAATTTGAAGTTCTTTTCCGGAGTGTTATCTCCCTGGTTGGCTTCGTCCTCCTCACCGTGGGCGCTCTCCTCATGCTGACAGGAAAGATATCTCCCTGGACAGGGCGTTTCTACTCTCTGCTGGATCCCTCTTACGCTAAGAATAACATCCCCATTATTGCATCTGTGTCTGAGCACCAGCCCACGACCTGGTCCTCCTACTATTTTGATCTACAGCTCCTTGTCTTCATGTTTCCAGTTGGCCTCTATTACTGCTTTAGCAACCTGTCTGATGCTCGGATTTTTATCATCATGTATGGTGTGACCAGCATGTACTTCTCAGCTGTAATGGTGCGTCTGATGCTGGTGCTGGCACCTGTTATGTGCATTCTTTCTGGCATTGGTGTCTCCCAGGTGCTGTCCACATACATGAAAAATCTGGACATAAGTCGCCCAGACAAGAAGAGCAAGAAGCAACAGGATTCTACTTATCCTATTAAGAATGAGGTGGCAAGTGGGATGATACTGGTCATGGCTTTTTTTCTCATCACCTACACGTTTCATTCGACTTGGGTAACCAGTGAAGCCTATTCTTCTCCCTCCATTGTACTGTCTGCTCGTGGTGGGGATGGCAGTAGGATCATTTTTGATGACTTCCGGGAAGCATATTATTGGCTTCGTCACAATACTCCAGAGGATGCAAAAGTCATGTCATGGTGGGATTATGGCTACCAAATTACTGCAATGGCAAATCGGACAATCTTAGTGGATAATAACACATGGAATAATACCCACATTTCCCGAGTAGGGCAGGCAATGGCATCCACAGAAGAAAAAGCCTACGAAATCATGAGGGAGCTTGATGTCAGCTATGTGCTTGTCATTTTTGGAGGCCTTACTGGGTATTCTTCTGATGATATCAACAAGTTTCTGTGGATGGTCCGGATTGGAGGAAGCACCGAGACAGGAAGACACATCAAGGAGAATGACTACTATACTCCAACTGGGGAATTCCGTGTTGACCGTGAGGGTTCACCAGTGTTGCTCAACTGCCTTATGTACAAAATGTGTTACTACCGCTTTGGGCAGGTCTACACAGAAGCCAAGCGTCCACCAGGCTTTGACCGTGTTCGAAATGCTGAGATTGGTAATAAAGACTTTGAGCTTGATGTCCTGGAGGAAGCATATACCACAGAACATTGGCTGGTCAGGATATACAAGGTAAAGGACCTGGATAATCGAGGCTTGTCAAGGACATAAATATCGCATTGTGCCCTGATATGCTTCGCACTGAGCGCGTCTTGTTGAGGACGCTGAAGATTTTTTTTTATATGCAGTTTATAAGAACAGCCGGATGGGATTAGAATTGTCTGGAAGTTTTGCCCTGGACAGTATGGGCTGGGCCAAGTGAAATGATTTTTATAATTCTGAGCAGGTTACCAAATGAAATGTTAAGGCTTTACTTTGGTCACTTAAAAGGGGGGGGGGTGGGTATTTTTTTTAAATGTGCCTTATTTGTTTTGACTTAAATTGGCTGATATGAGGATCACAGAAGTGAACGGATGGAAGACCAAATCCATGCTCTAGGTCCCCAAATGAACCAAATGGGAGCATTCTTTCTCTCCTGTCAGCAAACTCAAGGACTAGCTCTGGTTCTACAAATATAAACAACTTTATCACACTTTTTTGTTTTTTagcacccaggacaacgattcccatatatgggtgcttaataaatttatatcaaatgaataaatGTTTCTGGGACCAGAGGAGTGCTGTTTCTGCGCAAGAAAGACAGCTTTCTTGCTATTATGTCTATGTTCTTATTGTCTATTTCTTTAGAAGTTCTTTGGCTTTATAAGGACAGAAAATTGCTGAGTATTCCCGATCTCGCCAGTATCCTTTCAAACTAATGACAGTTATTCTTTTTCTAAGCAGAAATGTGAACCAAACTAATTCAGTAGTTCTTAAGACTGAGTGAAACATATCATTCTTAGAGGAAGACACTCCTCCAACATCAGGTTGATGATCAGTAGATGTTTCTGGAATCAGATGTAATTATGTGTACCTATATGGAATTTAGGTATTTGGTATTTAAACCTAAAACACAGTAAATGGCTCTTTGCTCATTTCCTTTAGACTGCACTAAATCTCTTAGGGTTATCCACCGTGAACTTCTGTTTTTCTTAGTGTCAGTCTGCTGTGTTCATATACCACTTGAGACTTCATTACTTGGTTTTGAATCCCTTGCTAAATATATACATAGAAAGTGGGAAGTTTTGGTACTAGCAGGTACCTTGAGACCATTGCCAGTCTGCCTGCAAAAAAGAGACTTTAAAAACATTTAACTTCAGAGCACAGAGATCCCATAGATATTTTGTGTCAGGATAAATAGCTTTCTGTTCTATACAATAGGATATTTGATGCATTTTACAACATAGGACATAACCACTGATGTATATAAACCACCTTAAGATAATTATAGTGTTTCTATTTAAGAAAACAGGAGGAATTGTATGGCTTTGAGATAGTCAACAGTGGTACTCAATACATATATGCTTAGGTGTACTTGTACACCTAAGGGCTTCTCCTTCAAACAGTTTATGTACTGTGTATTTTAACTGTGGTTGGAATTTAGATTTAACAGATGATTTGATATCCTATATGTAAATACATTACTTGATTTATATGCAGAACTCCTGCCTAGTGGGAAAGGTTAACCTGAGACTTATCAATATGATTAACATTATAGGTTATTAGTAAGCTCTAACCTATAGTATAAATGGGGCACCCCTTTTTCATATCACTTTGACTCCTGGGATCTTGATACTTTCTAGTCTACACAGATTTCTTTTTTTAAGTTGATTTCATTTTCAGGTATAGTCCTCATAGTGTTAAATCCATCTCAAAAACAATTTCACATACACGcccacccacacacctacccacacaTTCCCCAGACTCTGCTTCCAGCTCTGGTGAACCTCGCATTGTGCCTCCTGCCTGATCATTAGTAACTTGCTTTGTTATGTTTTGGTGTTTTAGTTTGAGGTAACATTGATTTTTTTTTTTTAATCCgtggttctcaacagtgtgggtcatgtcctctttggcaaacctccatctccaaaaatatttatattgcaattcataacagcaaaattttagttaggtagtaacaatataagtaattttgtggatgggacatcaccataacatgaggaactgtattaaagagttgcagcatcaggaaggttgaataccactgCCTTATGTTTTGTGACACCATTTTTACTATTATCTATTACAGTTCTAATTATTTTACCTTCTGGCTATTCTTAGTTAAGATGTGTTACTTTTttttttttttgttctttttttcggagctggggaccgaacccagggccttgcgcttcctaggcaagcgctctaccactgagctaaatccccaaccccACTTTTtttttttttttttaaagatagttccatgtagctcaggccagcagctctgaactcaagatatagatgaggctggctttggactcttgatcttcctgcttctacctcccagttgtgggctactacagCTAGTTAGTTACTATTTTTCCTATATAATTTTCTAAAGGAAATACTTTAATTTTTTTGGTATTTGTTCTCTCTCCTACTCCTTTACCACTCTAGCTAGTTCTCCCTCATTTGTGCCTATTTTCTCTTACTGATCGAACACAttcattgaacaactttgggtgtttgaaacagtatcttttgtagctagggctggctttgaactcctgattcacctgcctctgtttgccaaatgctggtattaagctatatgccaccatacctaattatattgggtTAATTTTAAGAATGTCTTTGCTTTTTCAGCTTGAAATAACTCAAGTTTGTTGAATTGTATTATTTCACTGTTGTATTTGTTGATCTTTGCCATTTTCAGTGATTTGCCATTTCTTAGTACCTTATATGTAGAGGGGATACATTTCTGCAGCTCTTCTATATCATATTTAATGCACAGC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